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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
21/03/2005 |
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Data da última atualização: |
15/08/2024 |
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Autoria: |
CASTRO, C. S. P. de; SOUZADE, J. R.; BLOCH JUNIOR, C. |
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Título: |
Mechanism of DNA cleavage catalyzed by mung bean nuclease. |
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Ano de publicação: |
2004 |
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Fonte/Imprenta: |
Inorganica Chimica Acta, v. 357, n. 9, p. 2579-2592, 2004. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The interaction of zinc with different forms of DNA ( phage DNA, ss-oligo, ds-oligo) and Mung Bean Nuclease was studied by voltammetric techniques in order to investigate the mechanism of DNA cleavage catalyzed by a zinc metalloenzyme. Stoichiometry, dissociation constant, zinc binding sites and functions were determined for these systems. Two zinc ions were found to be involved in stabilization of a 19 mer ds-oligodeoxyribonucleotide, which was synthesized by the phosphoramidite method and used as a DNA model in the studies. Three zinc ions (Zn1, Zn2, and Zn3), which have different roles in ds-oligo cleavage, were identified in the active site of Mung Bean Nuclease. A concerted SN2 mechanism, which assigns a catalytic function to Zn2 and structural functions to Zn1 and Zn3, was proposed. The hydrolysis of phosphodiester bonds proceeds with inversion of configuration at the phosphorus center, forming a pentacoordinate transition state, which is stabilized by an arginine. Zn2 supplies the nucleophile, which is oriented by an aspartic acid, and activates the ds-oligo by its coordination to the phosphate free oxygen of the phosphodiester bond. Zn1 and Zn3 ions, besides stabilizing the tertiary structure of Mung Bean Nuclease, bind to the leaving group, blocking the cleavage reverse reaction. |
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Palavras-Chave: |
Clivagem; Zinco Nuclease mung bean. |
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Thesagro: |
DNA; Zinco. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
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| Registros recuperados : 22 | |
| 1. |  | FREIRE, K. C. S.; MUNIZ, A. V. C. da S.; SANTANA, J. G. S.; RANGEL, M. S. A. Introdução e caracterização inicial de acessos de nim indiano. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 7. | | ARAUJO, A. G. de; LEDO, A. da S.; RIBEIRO, M. M. de J.; ALMEIDA, C. S.; SANTANA, J. G. S. Propagação in vitro de abacaxizeiro Vitória a partir de brotos estiolados. In: CICLO DE PALESTRAS SOBRE CULTIVO IN VITRO DE PLANTAS, 3., 2012, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 9. | | RIBEIRO, M. M. de J.; ARAUJO, A. G. de; LEDO, A. da S.; SANTANA, J. G. S.; ALMEIDA, C. S.; SANTOS, J. E. dos. Otimização do processo de micropropagação de abacaxizeiro cv. Imperial. In: CICLO DE PALESTRAS SOBRE CULTIVO IN VITRO DE PLANTAS, 3., 2012, Aracaju. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 10. | | SANTANA, J. G. S.; NASCIMENTO, A. L. S.; COSTA, T. S.; ALMEIDA, T. M. B. de; RABBANI, A. R. C.; MUNIZ, A. V. C. da S. Estimation of genetic diversity in a natural population of cambui tree (Myrciaria tenella O. Berg) using ISSR markers. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 15, n. 4, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 11. | | SANTANA, J. G. S.; SANTOS, P. S.; FREITAS, L. S.; SOARES, F. S.; AMBROSIO, M.; MUNIZ, E. N.; LEDO, A. da S.; SILVA, A. V. C. da. Phenotypic characterisation of the germplasm bank of mangaba (Hancornia speciosa Gomes), a unique Brazilian native fruit, with emphasis on its high vitamin C content. New Zeland Journal of Crop and Horticultural Science, v. 49, n. 4, p. 361-373, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 12. | | SANTOS, P. S.; FREITAS, L. dos S.; SANTANA, J. G. S.; MUNIZ, E. N.; RABBANI, A. R. C.; MUNIZ, A. V. C. da S. Genetic diversity and the quality of Mangabeira tree fruits (Hancornia speciosa Gomes Apocynaceae), a native species from Brazil. Scientia Horticulturae, v. 226, p. 372-378, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 13. | | FREIRE, K. C. S.; MUNIZ, A. V. C. da S.; SANTANA, J. G. S.; LEDO, A. da S.; SILVA JUNIOR, J. F. da. Caracterização morfo-agronômica inicial de acessos de mangabeira oriundos da Bahia, Sergipe e Minas Gerais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). Editora técnica Clara Oliveira Goedert. Resumo simples.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 14. | | VITORIA, M. F. da; AMORIM, J. A. E.; SANTANA, J. G. S.; MUNIZ, A. V. C. da S.; SILVA JUNIOR, J. F. da. Caracterização morfológica de mangabeiras nativas de Sergipe. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 15. | | SANTANA, J. G. S.; AMORIM, J. A. E.; SILVA FILHO, F. E. da; VITORIA, M. F. da; LEDO, A. da S.; MUNIZ, A. V. C. da S. Caracterização de frutos de mangabeira em uma população isolada no litoral cearense. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 16. | | SANTANA, J. G. S.; SOARES, A. N. R.; OLIVIERA, A. C. A. de; SOUSA, J. L.; ANDRADE, L. A. R. de; COPERLAND, K. K. P.; LEDO, A. da S. Efeito do BAP na propagação in vitro de catingueira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos. Anais... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 17. | | SANTOS, P. S.; SANTANA, J. G. S.; FREITAS, L. dos S.; BATISTA, M. C. de A.; MITTARAQUIS, A. S. P.; MUNIZ, E. N.; MUNIZ, A. V. C. da S. Caracterização pós-colheita de acessos de mangaba. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA A AMÉRICA LATINA E CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Recursos genéticos no século 21: de Vavilov a Svalbard: anais... [S.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2015. Editores técnicos: Rodrigo Cezar Franzon, Caroline Marques Castro, Alexandre Floriani Ramos, Sueli Correa Marques de Mello. SIRGEALC.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 18. | | AMBRÓSIO, M.; DAHER, R. F.; SANTOS, R. M.; SANTANA, J. G. S.; VIDAL, A. K. F.; NASCIMENTO, M. R.; LEITE, C. L.; SOUZA, A. G. de; FREITAS, R. S.; STIDA, W. F.; FARIAS, J. E. C.; SOUZA FILHO, B. F. de; MELO, L. C.; SANTOS, P. R. dos. Multi-trait index: selection and recommendation of superior black bean genotypes as new improved varieties. BMC Plant Biology, v. 24, 525, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 19. | | VIDAL, A. K. F.; DAHER, R. F.; AMBRÓSIO, M.; SANTANA, J. G. S.; FREITAS, R. S.; GRAVINA, G. de A.; RODRIGUES, E. V.; STIDA, W. F.; SOUZA, A. G. de; LEITE, C. L.; FARIAS, J. E. C.; RANGEL, L. H.; PEREIRA, A. V. Estimation of repeatability and genotypic superiority of elephant grass half-sib families for energy purposes using mixed models. Scientia Agricola, v. 80, e20220103, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 20. | | AMBRÓSIO, M.; DAHER, R. F.; SANTOS, R. M.; SANTANA, J. G. S.; VIDAL, A. K. F.; NASCIMENTO, M. R.; LEITE, C. L.; SOUZA, A. G. de; FREITAS, R. S.; STIDA, W. F.; FARIAS, J. E. C.; SOUZA FILHO; MELO, L. C.; SANTOS, P. R. dos. Adaptability and stability of black bean genotypes with normal and early cycle. Euphytica, v. 220, 22, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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