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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
27/04/2026 |
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Data da última atualização: |
27/04/2026 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
THORNBURG, Z. R.; MAYTIN, A.; KWON, J.; BRIER, T. A.; GILBERT, B. R.; FU, E.; GAO, Y.-L.; QUENNEVILLE, J.; WU, T.; LI, H.; LONG, T.; PEZESHKIAN, W.; SUN, L.; BITTENCOURT, D. M. de C.; GLASS, J. I.; MEHTA, A. P.; HA, T.; LUTHEY-SCHULTEN, Z. |
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Afiliação: |
ZANE R. THORNBURG, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; ANDREW MAYTIN, NSF SCIENCE AND TECHNOLOGY CENTER FOR QUANTITATIVE CELL BIOLOGY; JIWOONG KWON, JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE; TROY A. BRIER, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; BENJAMIN R. GILBERT, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; ENGUANG FU, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; YANG-LE GAO, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; JORDAN QUENNEVILLE, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; TIANYU WU, NSF SCIENCE AND TECHNOLOGY CENTER FOR QUANTITATIVE CELL BIOLOGY; HENRY LI, NSF SCIENCE AND TECHNOLOGY CENTER FOR QUANTITATIVE CELL BIOLOGY; TALIA LONG, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; WERIA PEZESHKIAN, UNIVERSITY OF COPENHAGEN; LIJIE SUN, J. CRAIG VENTER INSTITUTE; DANIELA MATIAS DE CARVALHO BITTENCOURT, CENARGEN; JOHN I. GLASS, J. CRAIG VENTER INSTITUTE; ANGAD P. MEHTA, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN; TAEKJIP HA, JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE; ZAIDA LUTHEY-SCHULTEN, UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA-CHAMPAIGN. |
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Título: |
Bringing the genetically minimal cell to life on a computer in 4D. |
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Ano de publicação: |
2026 |
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Fonte/Imprenta: |
Cell, 189, 2026. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.cell.2026.02.009 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
We present a whole-cell spatial and kinetic model for the 100 min cell cycle of the genetically minimal bacterium JCVI-syn3A. We simulate the complete cell cycle in 4D (space and time), including all genetic information processes, metabolic networks, growth, and cell division. By integrating hybrid computational methods, we model the dynamics of morphological transformations. Growth is driven by insertion of lipids and membrane proteins and constrained by fluorescence imaging data. Chromosome replication and segregation are controlled by the essential structural maintenance of chromosome proteins, analogous to condensin (SMC) and topoisomerase proteins in Brownian dynamics simulations, with replication rates responding to deoxyribonucleotide triphosphate (dNTP) pools from metabolism. The model captures the origin-to-terminus ratio measured in our DNA sequencing and recovers other experimental measurements, such as doubling time, mRNA half-lives, protein distributions, and ribosome counts. Because of stochasticity, each replicate cell is unique. We predict not only the average behavior of partitioning to daughter cells but also the heterogeneity among them. |
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Palavras-Chave: |
DNA sequencing; Fluorescence imaging; Lattice Microbes; Minimal cell; Whole-cell modeling. |
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Thesaurus Nal: |
Cell cycle. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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| Registros recuperados : 26 | |
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| 5. | | SILVEIRA, C. S.; DIEFENBACH, A.; MISTIERI, M. L.; MACHADO, I. R. L.; ANJOS, B. L. Dioctophyma renale em 28 cães: aspectos clinicopatológicos e ultrassonográficos. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 11, p. 899-905, nov. 2015.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | LOPES, L. C.; MACHADO, I. S.; MAGOGA, E. C.; ANDRADE, J. G. DE; PENNA, H. C.; MORAES, L. E. F. Cultura de embrião e indução de brotos in vitro para micropropagação do pinhão-manso. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 7, p. 902-907, jul, 2012. Título em inglês: Embryo culture and in vitro induction of shoots for micropropagation of physic nut.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 9. | | PINHEIRO MACHADO, I.; WENTZ, I.; BORTOLOZZO, F. P.; PENZ JUNIOR, A. M.; UEMOTO, D. A.; BEVILAQUA, V.; GUIDONI, A. L. Efeito da suplementacao de picolinato de cromo na racao sobre indices reprodutivos de leitoas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE VETERINARIOS ESPECIALISTAS EM SUINOS, 8., 1997, Foz do Iguacu, PR. Anais... Concordia: EMBRAPA-CNPSA, 1997. p.283-284| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 10. | | MAUES, M. M.; VARASSIN, I. G.; FREITAS, L.; MACHADO, I. C. S.; OLIVEIRA, P. E. A. M. de. A importância dos polinizadores nos biomas brasileiros, conhecimento atual e perspectivas futuras para conservação. In: IMPERATRIZ-FONSECA, V. L.; CANHOS, D. A. L.; ALVES, D. de A.; SARAIVA, A. M. (Org.). Polinizadores no Brasil: contribuição e perspectivas para a biodiversidade, uso sustentável, conservação e serviços ambientais. São Paulo: EDUSP, 2012. p. 49-66.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | MACHADO, I. E. S.; TAVARES, M. E. F.; MEDEIROS, P. C. A. de O.; GIONGO, M.; SOUZA, P. B. de; BATISTA, A. C. Florística e fitossociologia de um fragmento de Cerrado lato sensu, Gurupi, TO. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 39, e201801685, 2019. 12 p.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 14. | | MACHADO, I. L. S. S.; MACHADO, H. B.; SAKUMA, G. M. do V.; LUNZ, A. M.; SCHWARTZ, G.; CASTRO, G. L. S.; BATISTA, T. F. V. Diversity of hemipterans in Eucalyptus spp. plantations in Southeastern Pará, Eastern Amazon, Brazil. Neotropical Entomology, v. 54, n. 1, 14 p, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 15. | | WEIRICH, D. T.; DUCATI, C.; SILVA, G. M. da; LIPSCH, R. R.; NERES, M. A.; OLIVEIRA, P. S. R. de; PASQUALOTTO, M.; MACHADO, I. W. J. Composição fibrosa e mineral da aveia cultivada solteira ou em associação com cornichão. In: SIMPÓSIO SOBRE SUSTENTABILIDADE DA PECUÁRIA LEITEIRA NA REGIÃO SUL DO BRASIL, 5., 2012, Maringá. Anais... Maringá: UEM/CCA Departamento de Zootecnia/NUPEL/Embrapa Gado de Leite, 2012. SUL-LEITE.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 16. | | DUCATI, C.; MECABÔ, C. A.; LIPSCH, R. R.; CASTAGNARA, D. D.; NERES, M. A.; OLIVEIRA, P. S. R. de; SILVA, G. M. da; MACHADO, I. W. J. Características estruturais e produtivas da aveia preta em cultivo solteiro ou consorciado. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 23., 2013, Foz do Iguaçu. Zootecnia do futuro: produção animal sustentável. Foz do Iguaçu: ABZ: Unioeste: UTFPR, 2013. p. 1588-1590. ZOOTEC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 17. | | COSTA, J. J. F.; GIASSON, E.; SILVA, E. B. da; CAMPOS, A. R.; MACHADO, I. R.; BONFATTI, B. R.; BACIC, I. L. Z. Individualization of soil classes by disaggregation of physiographic map polygons. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 54, e00290, 2019. Título em português: Individualização de classes de solos por desagregação de polígonos de mapa fisiográfico.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 18. | | SARTO, M. T.; SANTOS, J. da S. dos; MACHADO, I. E. da F.; FERNANDO, J. A.; HEIDEN, G.; DUTRA, L. F. Indução de calos in vitro em Solanum calvescens (Solanaceae). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 5., 2018, Fortaleza. Anais... Fortaleza: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2018. p. 438| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 19. | | TIMM, T. G.; TIMM, T. G.; PITZ, M. A. C.; HELM, C. V.; ALBERTON, M. D.; TAVARES, L. B. B.; MACHADO, I. D. Immunomodulatory properties of a β-glucan-rich bioflour of Bactris gasipaes shells colonized by Lentinula edodes. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, v. 66, 103594, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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