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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
16/12/2025 |
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Data da última atualização: |
16/12/2025 |
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Autoria: |
HUG, L. A.; HATZENPICHLE, R.; MORARU, C.; SOARES, A. R.; MEYER, F.; HEYDER, A.; THE DATA REUSE CONSORTIUM; PROBST, A. J. |
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Afiliação: |
LAURA A. HUG, UNIVERSITY OF WATERLO; ROLAND HATZENPICHLE, MONTANA STATE UNIVERSITY; CRISTINA MORARU, UNIVERSITY ALLIANCE RUHR; ANDRÉ R. SOARES, UNIVERSITY ALLIANCE RUHR, UNIVERSITY OF DUISBURG-ESSEN; FOLKER MEYER, UNIVERSITY OF DUISBURG-ESSEN; ANKE HEYDER, RUHR UNIVERSITY BOCHUM; ALEXANDER J. PROBST, UNIVERSITY OF DUISBURG-ESSEN. |
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Título: |
A roadmap for equitable reuse of public microbiome data. |
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Ano de publicação: |
2025 |
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Fonte/Imprenta: |
Nature Microbiology, v. 10, n. 10, p. 2384-2395, Oct. 2025. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1038/s41564-025-02116-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
A pesquisadora I. R. Gerhardt, CNPTIA, faz parte de The Data Reuse Consortium. Artigo vinculado à Solução de Inovação "Microrganismos inoculantes para aumento de tolerância a estresses e de produtividade" (código SEG 20.20.00.149.00.04). |
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Conteúdo: |
Science benefits from rapid open data sharing, but current guidelines for data reuse were established two decades ago, when databases were several million times smaller than they are today. These guidelines are largely unfamiliar to the scientific community, and, owing to the rapid increase in biological data generated in the past decade, they are also outdated. As a result, there is a lack of community standards suited to the current landscape and inconsistent implementation of data sharing policies across institutions. Here we discuss current sequence data sharing policies and their benefits and drawbacks, and present a roadmap to establish guidelines for equitable sequence data reuse, developed in consultation with a data consortium of 167 microbiome scientists. We propose the use of a Data Reuse Information (DRI) tag for public sequence data, which will be associated with at least one Open Researcher and Contributor ID (ORCID) account. The machine-readable DRI tag indicates that the data creators prefer to be contacted before data reuse, and simultaneously provides data consumers with a mechanism to get in touch with the data creators. The DRI aims to facilitate and foster collaborations, and serve as a guideline that can be expanded to other data types. |
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Palavras-Chave: |
Compartilhamento de dados; Dados de sequenciamento; Dados públicos de microbioma; Data reuse; Data sharing; Reúso de dados; Sequence data. |
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Thesaurus Nal: |
Microbiome. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02450naa a2200325 a 4500
001 2182863
005 2025-12-16
008 2025 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1038/s41564-025-02116-2$2DOI
100 1 $aHUG, L. A.
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260 $c2025
500 $aA pesquisadora I. R. Gerhardt, CNPTIA, faz parte de The Data Reuse Consortium. Artigo vinculado à Solução de Inovação "Microrganismos inoculantes para aumento de tolerância a estresses e de produtividade" (código SEG 20.20.00.149.00.04).
520 $aScience benefits from rapid open data sharing, but current guidelines for data reuse were established two decades ago, when databases were several million times smaller than they are today. These guidelines are largely unfamiliar to the scientific community, and, owing to the rapid increase in biological data generated in the past decade, they are also outdated. As a result, there is a lack of community standards suited to the current landscape and inconsistent implementation of data sharing policies across institutions. Here we discuss current sequence data sharing policies and their benefits and drawbacks, and present a roadmap to establish guidelines for equitable sequence data reuse, developed in consultation with a data consortium of 167 microbiome scientists. We propose the use of a Data Reuse Information (DRI) tag for public sequence data, which will be associated with at least one Open Researcher and Contributor ID (ORCID) account. The machine-readable DRI tag indicates that the data creators prefer to be contacted before data reuse, and simultaneously provides data consumers with a mechanism to get in touch with the data creators. The DRI aims to facilitate and foster collaborations, and serve as a guideline that can be expanded to other data types.
650 $aMicrobiome
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773 $tNature Microbiology$gv. 10, n. 10, p. 2384-2395, Oct. 2025.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| 1. |  | SCHEPASCHENKO, D.; CHAVE, J.; PHILLIPS, O. L.; LEWIS, S. L.; DAVIES, S. J.; RÉJOU-MÉCHAIN, M.; SIST, P.; SCIPAL, K.; PERGER, C.; HERAULT, B.; LABRIÈRE, N.; HOFHANSL, F.; AFFUM-BAFFOE, K.; ALEINIKOV, A.; ALONSO, A.; AMANI, C.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARMSTON, J.; ARROYO, L.; ASCARRUNZ, N.; AZEVEDO, C. P. de; BAKER, T.; BALAZY, R.; BEDEAU, C.; BERRY, N.; BILOUS, A. M.; BILOUS, S. Y.; BISSIENGOU, P.; BLANC, L.; BOBKOVA, K. S.; BRASLAVSKAYA, T.; BRIENEN, R.; BURSLEM, D. F. R. P.; CONDIT, R.; CUNI-SANCHEZ, A.; DANILINA, D.; TORRES, D. del C.; DERROIRE, G.; DESCROIX, L.; SOTTA, E. D.; OLIVEIRA, M. V. N. d'; DRESEL, C.; ERWIN, T.; EVDOKIMENKO, M. D.; FALCK, J.; FELDPAUSCH, T. R.; FOLI, E. G.; FOSTER, R.; FRITZ, S.; GARCIA-ABRIL, A. D.; GORNOV, A.; GORNOVA, M.; GOTHARD-BASSÉBÉ, E.; GOURLET-FLEURY, S.; GUEDES, M. C.; HAMER, K. C.; SUSANTY, F. H.; HIGUCHI, N.; CORONADO, E. N. H.; HUBAU, W.; HUBBELL, S.; ILSTEDT, U.; IVANOV, V. V.; KANASHIRO, M.; KARLSSON, A.; KARMINOV, V. N.; KILLEEN, T.; KOFFI, J. C. K.; KONOVALOVA, M.; KRAXNER, F.; KREJZA, J.; KRISNAWATI, H.; KRIVOBOKOV, L. V.; KUZNETSOV, M. A.; LAKYDA, I.; LAKYDA, P. I.; LICONA, J. C.; LUCAS, R. M.; LUKINA, N.; LUSSETTI, D.; MALHI, Y.; MANZANERA, J. A.; MARIMON, B.; MARIMON JUNIOR, B. H.; VASQUEZ MARTINEZ, R.; MARTYNENKO, O. V.; MATSALA, M.; MATYASHUK, R. K.; FREITAS, L. J. M. de; MEMIAGHE, H.; MENDOZA, C.; MONTEAGUDO MENDONZA, A.; MOROZIUK, O. V.; MUKHORTOVA, L.; MUSA, S.; NAZIMOVA, D. I.; OKUDA, T.; OLIVEIRA, L. C. de; ONTIKOV, P. V.; OSIPOV, A. F.; PIETSCH, S.; PLAYFAIR, M.; POULSEN, J.; RADCHENKO, V. G.; RODNEY, K.; ROZAK, A. H.; RUSCHEL, A. R.; RUTISHAUSER, E.; SEE, L.; SHCHEPASHCHENKO, M.; SHEVCHENKO, N.; SHVIDENKO, A.; SILVEIRA, M.; SINGH, J.; SONKÉ, B.; SOUZA, C. R. de; STERENCZAK, K.; STONOZHENKO, L.; SULLIVAN, M. J. P.; SZATNIEWSKA, J.; TAEDOUMG, H.; TER STEEGE, H.; TIKHONOVA, E.; TOLEDO, M.; TREFILOVA, O. V.; VALBUENA, R.; VALENZUELA GAMARRA, L.; VASILIEV, S.; VEDROVA, E. F.; VERHOVETS, S. V.; VIDAL, E.; VLADIMIROVA, N. A.; VLEMINCKX, J.; VOS, V. A.; VOZMITEL, F. K.; WANEK, W.; WEST, T. A. P.; WOELL, H.; WOODS, J. T.; WORTEL, V.; YAMADA, T.; HAJAR, Z. S. N.; ZO-BI, I. C. The forest observation system, building a global reference dataset for remote sensing of forest biomass. Scientific Data, v. 6, n. 198, p. 1-11, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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| 2. | | SCHEPASCHENKO, D.; CHAVE, J.; PHILLIPS, O. L.; LEWIS, S. L.; DAVIES, S. J.; RÉJOU-MÉCHAIN, M.; SIST, P.; SCIPAL, K.; PERGER, C.; HERAULT, B.; LABRIÈRE, N.; HOFHANSL, F.; AFFUM-BAFFOE, K.; ALEINIKOV, A.; ALONSO, A.; AMANI, C.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARMSTON, J.; ARROYO, L.; ASCARRUNZ, N.; AZEVEDO, C. P. de; BAKER, T.; BALAZY, R.; BEDEAU, C.; BERRY, N.; BILOUS, A. M.; BIOLUS, S. Y.; BISSIENGOU, P.; BLANC, L.; BOBKOVA, K. S.; BRASLAVSKAYA, T.; BRIENEN, R.; BURSLEM, D. F. R. P.; CONDIT, R.; CUNI-SANCHEZ, A.; DANILINA, D.; TORRES, D. del C.; DERROIRE, G.; DESCROIX, L.; SOTTA, E. D.; OLIVEIRA, M. V. N. d'; DRESEL, C.; ERWIN, T.; EVDOKIMENKO, M. D.; FALCK, J.; FELDSPAUSCH, T. R.; FOLI, E. G.; FOSTER, R.; FRITZ, S.; GARCIA-ABRIL, A. D.; GORNOV, A.; GORNOVA, M.; GOTHARD-BASSÉBÉ, E.; GOURLET-FLEURY, S.; GUEDES, M. C.; HAMER, K. C.; SUSANTY, F. H.; HIGUCHI, N.; CORONADO, E. N. H.; HUBAU, W.; HUBBELL, S.; ILSTEDT, U.; IVANOV, V. V.; KANASHIRO, M.; KARLSSON, A.; KARMINOV, V. N.; KILLEEN, T.; KOFFI, J. C. K.; KONOVALOVA, M.; KRAXNER, F.; KREJZA, J.; KRISNAWATI, H.; KRIVOBOKOV, L. V.; KUZNETSOV, M. A.; LAKYDA, I.; LAKYDA, P. I.; LICONA, J. C.; LUCAS, R. M.; LUKINA, N.; LUSSETTI, D.; MALHI, Y.; MANZANERA, J. A.; MARIMON, B.; MARIMON JUNIOR, B. H.; VASQUEZ MARTINEZ, R.; MARTYNENKO, O. V.; MATSALA, M.; MATYASHUK, R. K.; FREITAS, L. J. M. de; MEMIAGHE, H.; MENDONZA, C.; MONTEAGUDO MENDONZA, A.; MOROZIUK, O. V.; MUKHORTOVA, L.; MUSA, S.; NAZIMOVA, D. I.; OKUDA, T.; OLIVEIRA, L. C. de; ONTIKOV, P. V.; OSIPOV, A. F.; PIETSCH, S.; PLAYFAIR, M.; POULSEN, J.; RADCHENKO, V. G.; RODNEY, K.; ROZAK, A. H.; RUSCHEL, A. R.; RUTISHAUSER, E.; SEE, L.; SHCHEPASHCHENKO, M.; SHEVCHENKO, N.; SHVIDENKO, A.; SILVEIRA, M.; SINGH, J.; SONKÉ, B.; SOUZA, C. R. de; STERENCZAK, K.; STONOZHENKO, L.; SULLIVAN, M. J. P; SZATNIEWSKA, J.; TAEDOUMG, H.; STEEGE, H. ter; TIKHONOVA, E.; TOLEDO, M.; TREFILOVA, O. V.; VALBUENA, R.; VALENZUELA GAMARRA, L.; VASILIEV, S.; VEDROVA, E. F.; VERHOVETS, S. V.; VIDAL, E.; VLADIMIROVA, N. A.; VLEMINCKX, J.; VOS, V. A.; VOZMITEL, F. K.; WANEK, W.; WEST, T. A. P.; WOELL, H.; WOODS, J. T.; WORTEL, V.; YAMADA, T.; HAJAR, Z. S. N.; ZO-BI, I. C. The Forest Observation System, building a global reference dataset for remote sensing of forest biomass. Scientific Data, v. 6, n. 198, p. 1-11, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Oriental. |
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