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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pesca e Aquicultura. |
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Data corrente: |
25/07/2025 |
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Data da última atualização: |
25/07/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
LEMOS, C. G.; GARCIA, B. F.; SILVA FILHO, M. S.; ARANGO, J. R.; BUTZGE, A. J.; SHIOTSUKI, L.; FREITAS, L. E. L.; REZENDE, F. P.; URBINATI, E. C.; ROSA, G. J. M.; HASHIMOTO, D. T. |
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Afiliação: |
CELMA G. LEMOS, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; BALTASAR F. GARCIA, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; MARCELO SOUZA SILVA FILHO, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; JAIRO R. ARANGO, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; ARNO J. BUTZGE, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; LUCIANA SHIOTSUKI, CNPASA; LUIZ EDUARDO LIMA DE FREITAS, CNPASA; FABRICIO PEREIRA REZENDE, CNPASA; ELISABETH C. URBINATI, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA; GUILHERME J. M. ROSA, UNIVERSITY OF WISCONSIN; DIOGO T. HASHIMOTO, UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA. |
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Título: |
Deep learning approach for genetic selection of stress response in the Amazon fish Colossoma macropomum. |
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Ano de publicação: |
2025 |
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Fonte/Imprenta: |
Aquaculture, v. 609, 742848, 2025. |
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ISSN: |
0044-8486 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2025.742848 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study examined skin color variation in tambaqui (Colossoma macropomum) in response to stress, focusing on morphological and physiological color change mechanisms. A computer vision system (CVS) based on the DeepLab V3 model with ResNet-50 was developed to automate countershading intensity detection. Images from 3780 fish across two populations were used to train a model and estimate genetic parameters for countershading intensity. Morphological color changes were induced in confinement tanks, with countershading intensity observed after 10 days. Physiologically, the α-MSH hormone expanded melanophores by 80 %, intensifying countershading. The CVS achieved high accuracy (88.2 %) for large-scale phenotyping, with moderate to high heritability estimates for color phenotypes: 0.456 ± 0.122 for black pixel percentage, 0.494 ± 0.128 for mean pixel intensity, and 0.192 ± 0.059 for the number of pixels. Low correlations with growth traits suggest that countershading selection can occur without affecting growth, highlighting its potential in breeding programs to improve appearance and stress resilience. |
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Palavras-Chave: |
Breeding programs; Countershading. |
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Thesagro: |
Colossoma Macropomum; Método de Melhoramento; Peixe; Seleção Genética; Tambaqui. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding; Computer vision; Stress response. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pesca e Aquicultura (CNPASA) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 24 | |
| 3. |  | BRAGA, M. F.; VIEIRA, M. L. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GIRALDI, I. O.; JUNQUEIRA, N. T. V. Mapeamento de QTL (quantitative trait loci) associados à resistência do maracujá-doce à bacteriose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 4. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; GARCIA, A. A. F.; COUTINHO, L. L. Base genética da correlação entre características de desempenho e de rendimento de carcaça no cromossomo 1 da galinha. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 2011, Santos, SP. Anais... Santos: FACTA, 2011. Trabalhos de Pesquisa José Maria Lamas da Silva. 1 CD-ROM. Projeto: 02.09.07.006.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 5. | | ANONI, C. A.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield related trait in a biparental cross of sugarcane. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 60., 2014, Guarujá. Resumos. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2014. p. 126.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 6. | | ROSÁRIO, M. F.; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. QTLs associados a características de carcaça na galinha: mapeamento por intervalo vs mapeamento por intervalo composto. In: CONFERÊNCIA FACTA DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA AVÍCOLAS, 27., 2009, Porto Alegre. Anais [dos] trabalhos de pesquisa José Maria Lamas de Silva. [Campinas]: FACTA, 2009. Projeto/Plano de Ação: 01.02.10.210-10. Publicado em CD-ROM (CD00156).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 7. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; LEDUR, M. C.; MOURA, A. S. A. M. T.; BOSCHIERO, C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. F. G. QTL's mapeados para características de desempenho na galinha através do mapeamento por intervalo composto com modelo misto. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 7., 2008, São Carlos, SP. Anais. São Carlos, SP: SBMA, 2008. 4 p. Projeto/Plano de Ação: 01.02.102.10-10.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 8. | | VIGNA, B. B. Z.; SANTOS, J. C.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; MOLLINARI, M.; CANCADO, L. J.; VALLE, C. B. do; ANTONIO AUGUSTO FRANCO GARCIA; SOUZA, A. P. The Preliminary Genetic Linkage Map of hexaploid Brachiaria humidicola Based on Microsatellite Markers. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FORAGE BREEDING, 3., 2011, Bonito, MS. Breeding forage for climate change adaptation and mitigation - eco-efficient animal produtction: proceedings. [Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte], 2011. 42-45 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; GARCIA, A. A. S. Composite interval mapping and mixed models reveal QTL associated with performance and carcass traits on chicken chromosomes 1, 3, and 4. Journal of Applied Genetics, Pozna, on line 28 nov. 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 11. | | FREITAS, E. G. de; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; PINTO, L. R.; XAVIER, M. A.; LANDELL, M. G. de A.; GARCIA, A. A. F. Modelos mistos para seleção de genótipos superiores e de futuros genitores de cana-de-açúcar. In: REUNIÃO ANUAL DA REGIÃO BRASILEIRA DA SOCIEDADE INTERNACIONAL DE BIOMETRIA, 58.; SIMPÓSIO DE ESTATÍSTICA APLICADA À EXPERIMENTAÇÃO AGRONÔMICA, 15., 2013, Campina Grande. Modelagem estatística em áreas multidisciplinares: impactos causados pelas mudanças climáticas na Região Nordeste: anais. Campina Grande: Sociedade Internacional de Biometria, 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 12. | | ROSÁRIO, M. F. do; GAZAFFI, R.; MOURA, A. S. A. M. T.; LEDUR, M. C.; NONES, K.; GARCIA, A.; COUTINHO, L. L. Multitrait composite interval mapping reveals pleiotropic QTL on chicken chromosome 1. In: CONFERENCE OF THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR ANIMAL GENETICS, 33., 2012, Cairns. Programme and abstract book... Cairns: ISAG, 2012. p.40.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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| 13. | | LIMA, B. M.; TEIXEIRA, J. E. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GRATTAPAGLIA, D.; VALLE, R. K. D.; CAMARGO, L. E. A. Identification of a novel QTL contributing to rust resistance in Eucalyptus. BMC Proceedings 2011, v. 5, Suppl 7, p. P32, 2011. Edição dos resumos do IUFRO Tree Biotechnology Conference 2011: From Genomes to Integration, 2011 Arraial d?Ajuda, Bahia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 14. | | SILVA, F. E. de J.; GUIDO, L. N.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; LEDUR, M. C.; COUTINHO, L. L.; ROSÁRIO, M. F. do. Regiões genômicas associadas a características de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens brasileiras de galinha. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 3, p. 229-238, 2011. Projeto: 01.06.01.006.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | COSTA, E. A.; ANONI, C. O.; MANCINI, M. C.; SANTOS, F. R. C.; MARCONI, T. G.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; PERECIN, D.; MOLINARI, M.; XAVIER, M. A.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping including codominant SNP markers with ploidy level information in a sugarcane progeny. Euphytica, Dordrecht, v. 211, n. 1, p. 1-16, 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 16. | | ANONI, C. O.; GAZAFFI, R.; PASTINA, M. M.; MANCINI, M. C.; COSTA, E. A.; MOLLINARI, M.; MARCONI, T. G.; PINTO, L. R.; SOUZA, A. P.; GARCIA, A. A. F. QTL mapping for yield components in a sugarcane commercial cross. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 59., 2013, Águas de Lindóia. Resumos... Ribeirão Preto: SBG, 2013. p. 55.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 17. | | MORAIS, L. K. de; CURSI, D. E.; SANTOS, J. M. dos; SAMPAIO, M.; CAMARA, T. M. M.; SILVA, P. de A.; BARBOSA, G. V.; HOFFMANN, H. P; CHAPOLA, R. G.; FERNANDES JUNIOR, A. R.; GAZAFFI, R. Melhoramento genético da cana-de-açúcar. Aracaju: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2015. 40 p. (Embrapa Tabuleiros Costeiros. Documentos, 200).| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 18. | | PEREIRA, G. S.; NUNES, E. S.; LAPERUTA, L. D. C.; BRAGA, M. F.; PENHA, H. A.; DINIZ, A. L.; MUNHOZ, C. F.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. Molecular polymorphism and linkage analysis in sweet passion fruit, an outcrossing species. Annals of Applied Biology, v. 162, n. 3, p. 347-361, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 19. | | PERSEGUINI, J. M. C. K.; CHIORATTO, A. F.; ZUCCHI, M. I.; COLOMBO, C. A.; CARBONELL, S. A. M.; MONDEGO, J. M. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; CAMPOS, T. de; SOUZA, A. P. de; RUBIANO, L. B. Genetic diversity in cultivated carioca common beans based on molecular marker analysis. Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 34, n. 1, p. 88-102, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 20. | | PEREIRA, G. da S.; LAPERUTA, L. D. C.; NUNES, E. S.; CHAVARRIA, L.; PASTINA, M. M.; GAZAFFI, R.; GERALDI, I. O.; GARCIA, A. A. F.; VIEIRA, M. L. C. The sweet passion fruit (Passiflora alata) crop: genetic and phenotypic parameter estimates and QTL mapping for fruit traits. Tropical Plant Biology, v. 10, n. 1, p. 18-29, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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