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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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Data corrente: |
29/11/2024 |
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Data da última atualização: |
08/01/2025 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CASTRO, G. dos S.; SOUSA, T. F.; SILVA, I. J. S. da; RAPOSO, D. S.; SILVA, J. C. I. da; PEÑALOZA, E.; GARRETT, R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; KOOLEN, H. H. F. |
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Afiliação: |
GLEUCINEI DOS SANTOS CASTRO, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; THIAGO FERNANDES SOUSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; INGRIDE JARLINE SANTOS DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; DÉBORA SENA RAPOSO, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; JOSÉ CARLOS IPUCHIMA DA SILVA, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS; EVELYN PEÑALOZA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO; RAFAEL GARRETT, UNIVERSIDADE FEDERAL DO RIO DE JANEIRO; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; HECTOR HENRIQUE FERREIRA KOOLEN, UNIVERSIDADE DO ESTADO DO AMAZONAS. |
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Título: |
Amazonins: new peptaibol sequences from an endophytic strain of Trichoderma amazonicum. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Chemistry & Biodiversity, v. 21, n. 12, e202400611, Dec. 2024. |
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DOI: |
doi.org/10.1002/cbdv.202400611 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Three new putative sequences of 14‐residue peptaibols, named amazonins I–III were characterized from the endophytic fungus Trichoderma amazonicum via genome mining, high‐performance liquid chromatography coupled to high‐resolution tandem mass spectrometry (LC–MS/MS), and molecular networking. Bioinformatic analysis of the T. amazonicum genome assembly revealed 63 clusters of biosynthetic genes (BGCs) related to secondary metabolites, including a nonribosomal peptide synthetase accountable for the biosynthesis of the discovered peptide sequences. Analysis of the adenylation domains, along with manual interpretation of MS/MS spectra, allowed extensive annotation of the new peptaibol sequences. The combination of bioinformatic tools and LC–MS/MS provides a better opportunity to characterize and identify new peptaibol sequences. Thus, the importance of studies on the production and characterization of peptaibols produced by Trichoderma species from the Amazon region is highlighted. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Biosynthetic gene clusters; Endophytic; LC–MS/MS; Peptaibols; Trichoderma amazonicum. |
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Thesagro: |
Trichoderma. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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| Registros recuperados : 1 | |
| 1. |  | BALOTA, E. L.; NOGUEIRA, M. A.; MENDES, I. C.; HUNGRIA, M.; FAGOTTI, D. S. L.; MELO, G. M. P.; SOUZA, R. C.; MELO, W. J. de. Enzimas e seu papel na qualidade do solo. In: ARAÚJO, A. P.; ALVES, B. J. R. (Ed.). Tópicos em ciência do solo. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2013. v. 8. p. 189-249.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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