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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
14/10/2024 |
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Data da última atualização: |
14/10/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ROSA, J. da; VIANA, A. J. C.; FERREIRA, F. R. A.; KOLTUN, A.; MERTZ-HENNING, L. M.; MARIN, S. R. R.; RECH FILHO, E. L.; NEPOMUCENO, A. L. |
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Afiliação: |
JULIANA DA ROSA, LONDRINA STATE UNIVERSITY; AMÉRICO JOSÉ CARVALHO VIANA; FERNANDO RAFAEL ALVES FERREIRA; ALESSANDRA KOLTUN; LILIANE MARCIA MERTZ HENNING, CNPSO; SILVANA REGINA ROCKENBACH MARIN, CNPSO; ELIBIO LEOPOLDO RECH FILHO, CENARGEN; ALEXANDRE LIMA NEPOMUCENO, CNPSO. |
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Título: |
Optimizing dsRNA engineering strategies and production in E. coli HT115 (DE3). |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, v. 51, kuae028, 2024. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1093/jimb/kuae028 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Na publicação: Elibio Leopoldo Rech. |
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Conteúdo: |
Producing double-stranded RNA (dsRNA) represents a bottleneck for the adoption of RNA interference technology in agriculture, and the main hurdles are related to increases in dsRNA yield, production efficiency, and purity. Therefore, this study aimed to optimize dsRNA production in E. coli HT115 (DE3) using an in vivo system. To this end, we designed a new vector, pCloneVR_2, which resulted in the efficient production of dsRNA in E. coli HT115 (DE3). We performed optimizations in the culture medium and expression inducer in the fermentation of E. coli HT115 (DE3) for the production of dsRNA. Notably, the variable that had the greatest effect on dsRNA yield was cultivation in TB medium, which resulted in a 118% increase in yield. Furthermore, lactose induction (6 g/L) yielded 10 times more than IPTG. Additionally, our optimized up-scaled protocol of the TRIzol™ extraction method was efficient for obtaining high-quality and pure dsRNA. Finally, our optimized protocol achieved an average yield of 53.3 µg/mL after the production and purification of different dsRNAs, reducing production costs by 72%. |
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Palavras-Chave: |
Bacterial dsRNA production; Lactose induction; RNAi. |
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Thesaurus Nal: |
Double-stranded RNA. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 01991naa a2200277 a 4500
001 2168059
005 2024-10-14
008 2024 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1093/jimb/kuae028$2DOI
100 1 $aROSA, J. da
245 $aOptimizing dsRNA engineering strategies and production in E. coli HT115 (DE3).$h[electronic resource]
260 $c2024
500 $aNa publicação: Elibio Leopoldo Rech.
520 $aProducing double-stranded RNA (dsRNA) represents a bottleneck for the adoption of RNA interference technology in agriculture, and the main hurdles are related to increases in dsRNA yield, production efficiency, and purity. Therefore, this study aimed to optimize dsRNA production in E. coli HT115 (DE3) using an in vivo system. To this end, we designed a new vector, pCloneVR_2, which resulted in the efficient production of dsRNA in E. coli HT115 (DE3). We performed optimizations in the culture medium and expression inducer in the fermentation of E. coli HT115 (DE3) for the production of dsRNA. Notably, the variable that had the greatest effect on dsRNA yield was cultivation in TB medium, which resulted in a 118% increase in yield. Furthermore, lactose induction (6 g/L) yielded 10 times more than IPTG. Additionally, our optimized up-scaled protocol of the TRIzol™ extraction method was efficient for obtaining high-quality and pure dsRNA. Finally, our optimized protocol achieved an average yield of 53.3 µg/mL after the production and purification of different dsRNAs, reducing production costs by 72%.
650 $aDouble-stranded RNA
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653 $aLactose induction
653 $aRNAi
700 1 $aVIANA, A. J. C.
700 1 $aFERREIRA, F. R. A.
700 1 $aKOLTUN, A.
700 1 $aMERTZ-HENNING, L. M.
700 1 $aMARIN, S. R. R.
700 1 $aRECH FILHO, E. L.
700 1 $aNEPOMUCENO, A. L.
773 $tJournal of Industrial Microbiology and Biotechnology$gv. 51, kuae028, 2024.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Registro |
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| Registros recuperados : 12 | |
| 1. |  | CHAGAS, K.; ALEXANDRE, R. S.; SCHIMILDT, E. R.; BRUCKNER, C. H.; FALEIRO, F. G. Divergência genética em genótipos de maracujazeiro azedo, com base em características físicas e químicas dos frutos. Revista Ciência Agronômica, v. 47, n. 3, p. 524-531, jul.-set. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 2. | | ALEXANDRE, R. S.; WAGNER JÚNIOR, A.; NEGREIROS, J. R. da S.; PARIZZOTTO, A.; BRUCKNER, C. Germinação de sementes de genótipos de maracujazeiro. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 39, n. 12, p. 1239-1245, dezembro 2004 Título em inglês: Seed germination of yellow passion fruit genotypes.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | PARTELLI, F. L.; COVRE, A. M.; OLIVEIRA, M. G.; ALEXANDRE, R. S.; VITÓRIA, E. L. da; SILVA, M. B. da. Root system distribution and yield of 'Conilon' coffee propagated by seeds or cuttings. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 49, n. 5, p. 349-355, maio. 2014. Título em português: Distribuição do sistema radicular e produtividade do café 'Conilon' propagado por sementes ou estaquia.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | OLIVEIRA, J. P. B. de; ALEXANDRE, R. S.; NEGREIROS, J. R. da S.; LOPES, J. C.; BRUCKNER, C. H. Lipid peroxidation and seed emergency in progenies of the yellow passion fruit plant. Revista Brasileira de Fruticultura, Jaboticabal, v. 34, n. 3, p. 711-718, set. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 7. | | VENIAL, L. R.; ALEXANDRE, R. S.; CAMATA, H. C.; LOPES, J. C.; ZANOTTI, R. F.; FERREIRA, A.; AGUILAR, M. A. G. Biometria e armazenamento de sementes de genótipos de cacaueiro. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 37, n. 89, p. 39-46, jan./mar. 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 8. | | WAGNER JÚNIOR, A.; NEGREIROS, J. R. da S.; ALEXANDRE, R. S.; PIMENTEL, L. D.; MORGADO, M. A. D.; BRUCKNER, C. H. Substratos no desenvolvimento inicial de quatro cultivares de pessegueiro e uma nectarineira. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 32, n. 4, p. 1322-1328, jul/ago. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 9. | | ARAÚJO, E. F.; GIBSON, E. L.; SANTOS, A. R. dos; GONÇALVES, E. de O.; WENDLING, I.; ALEXANDRE, R. S.; PAOLA, L. A. V. Mini-cutting technique for vegetative propagation of Paratecoma peroba. Cerne, v. 25, n. 3, p. 314-325, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 10. | | WAGNER JUNIOR, A.; SANTOS, C. E. M. dos; ALEXANDRE, R. S.; SILVA, J. O. da C. e; NEGREIROS, J. R. da S.; PIMENTEL, L. D.; ALVARES, V. de S.; BRUCKNER, C. H. Efeito da pré-embebição das sementes e do substrato na germinação e no desenvolvimento inicial do maracujazeiro-doce. Revista Ceres, Viçosa, v. 54, n. 311, jan./fev. 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
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| 11. | | SIMÕES, I. M.; ARAÚJO, C. P. de; MELLO, T. de; ROSA, T. L. M.; OLIVEIRA, N. V. de; CLADEIRA, M. V. W.; SCHMILDT, E. R.; LOPES, J. C.; OTONI, W. C.; ALEXANDRE, R. S. In vitro organogenesis as an efficient method for the propagation of Dalbergia nigra. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02766, 2022. Título em português: Organogênese in vitro como método eficiente para a propagação de Dalbergia nigra.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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