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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio-Norte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
03/06/2024 |
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Data da última atualização: |
03/06/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
ORTH, D.; RAMOS, A. F.; CARVALHO, G. M. C.; BASÍLIO, L. M. S.; CAETANO, A. R.; IANELLA, P. |
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Afiliação: |
DAIZA ORTH, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALEXANDRE FLORIANI RAMOS, CENARGEN; GERALDO MAGELA CORTES CARVALHO, CPAMN; LUCAS MACEDO SANTOS BASÍLIO, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, CENARGEN; PATRICIA IANELLA, CENARGEN. |
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Título: |
Genomic characterization of the Brazilian Crioulo Lageano: insights for conservation of a Brazilian local bovine breed. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 284, 105481, 2024. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.livsci.2024.105481 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Crioulo Lageano (CLAG) is a Brazilian taurine breed traditionally raised in the native fields of mountainous regions in the states of Santa Catarina and Paraná, located in the southern region from Brazil. The present study aimed to analyze the genetic diversity and structure of the breed to provide the basis for the development of strategies for its conservation. Samples from semen and DNA previously stored in the Brazilian Animal Gene Bank (BAGB), and samples collected from eight different farms registered in the Brazilian Association of Crioulo Lageano Cattle Breeders (ABCCL), were genotyped with different panels of SNP markers containing between 50 K and 777 K markers. Obtained estimates of average expected (HE = 0.373) and observed (HO = 0.382) heterozygosities suggest the presence of high levels of genetic variability in the breed. Molecular analysis of variance (AMOVA) revealed that only 2.11 % of the observed genetic variation could be attributed to differences between analyzed populations. Obtained pairwise FST estimates varied between 0.002 and 0.056, corroborating that the degree of differentiation between populations is low. Population structure analyses showed substructures between the studied populations, which could be related to the presence/absence of horns in the animals, in addition to other factors. The estimates obtained for the effective population size (Ne) considering bulls with semen stored in BGAB and the set of samples from the eight studied farms were 6 and 22, respectively, revealing that the Ne of the breed is far below that recommended by FAO for conservation of domestic animal populations. Population structure and admixture analyses comparing CLAG with six other taurine and zebu cattle breeds routinely raised in the region revealed evidence of possible unknown introgressions from animals of indicine origin. Obtained results provide solid insights into the diversity and genetic structure of the Brazilian CLGA breed and offer strategic information for the establishment of effective genetic management strategies for production herds, for the enrichment of the BAGB by collecting germoplasm and for the long-term conservation of this breed. MenosCrioulo Lageano (CLAG) is a Brazilian taurine breed traditionally raised in the native fields of mountainous regions in the states of Santa Catarina and Paraná, located in the southern region from Brazil. The present study aimed to analyze the genetic diversity and structure of the breed to provide the basis for the development of strategies for its conservation. Samples from semen and DNA previously stored in the Brazilian Animal Gene Bank (BAGB), and samples collected from eight different farms registered in the Brazilian Association of Crioulo Lageano Cattle Breeders (ABCCL), were genotyped with different panels of SNP markers containing between 50 K and 777 K markers. Obtained estimates of average expected (HE = 0.373) and observed (HO = 0.382) heterozygosities suggest the presence of high levels of genetic variability in the breed. Molecular analysis of variance (AMOVA) revealed that only 2.11 % of the observed genetic variation could be attributed to differences between analyzed populations. Obtained pairwise FST estimates varied between 0.002 and 0.056, corroborating that the degree of differentiation between populations is low. Population structure analyses showed substructures between the studied populations, which could be related to the presence/absence of horns in the animals, in addition to other factors. The estimates obtained for the effective population size (Ne) considering bulls with semen stored in BGAB and the set of samples from the eight studied farms w... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Animal genetic resources conservation; Genetic diversity; Single nucleotide polymorphisms. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 21 | |
| 1. |  | BOTTEGA, S. P.; SILVA, C. J. da; SOUZA, L. C. F. de. Avaliação da eficiência de herbicidas aplicados em pós - emergência na cultura do girassol. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais: trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2010. v. 1 p. 563-564| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 2. | | BOTTEGA, S. P.; SILVA, C. J. da; SOUZA, L. C. F. de. Avaliação do comportamento agronômico do crambe em função de dois espaçamentos ente plantas. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais: trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2010. v. 1 p. 551-552| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 4. | | BOTTEGA, S. P.; SILVA, C. J. da; SOUZA, L. C. F. de. Comportamento de cultivares de girassol na região centro sul de Mato Grosso do Sul. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 4.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 7., 2010, Belo Horizonte. Biodiesel: inovação tecnológica e qualidade: anais: trabalhos científicos. Lavras: UFLA, 2010. v. 2| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 5. | | SILVA, D. A. da; ROSCOE, R.; SOUZA, L. C. F. de. Decomposição de cinco plantas de cobertura do solo durante o desenvolvimento do milho em plantio direto. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 10. | | KOAKOSKI, A.; SOUZA, C. M. A. de; RAFULL, L. Z. L.; SOUZA, L. C. F. de; REIS, E. F. dos. Desempenho de semeadora-adubadora utilizando-se dois mecanismos rompedores e três pressões da roda compactadora Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 42, n. 5, p. 725-731, maio 2007 Título em inglês: Performance of seeder-fertilizer using two furrow opening mechanism and three loads on soil firming mechanism.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 11. | | GARCIA FUENTES, L. F.; SOUZA, L. C. F. de; SERRA, A. P.; JERUSA RECH; VITORINO, A. C. T. Corn agronomic traits and recovery of nitrogen from fertilizer during crop season and off-season. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, n. 10, p.1158-1166, Oct. 2018. Título em português: Características agronômicas do milho e recuperação de nitrogênio do fertilizante durante a safra e a safrinha.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | GARCIA FUENTES, L. F.; SOUZA, L. C. F. de; SERRA, A. P.; RECH, J.; VITORINO, A. C. T. Corn agronomic traits and recovery of nitrogen from fertilizer during crop season and off-season. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 53, v. 10, p. 1158-1166, Oct. 2018 Título em português: Características agronômicas do milho e recuperação de nitrogênio do fertilizante durante a safra e a safrinha.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | SOUZA, L. C. F de; CRUZ, J. C.; RAMALHO, M. A. P.; SALVADOR, N.; SILVA, J. B. da. Efeito da antecedencia da gradagem ao plantio do milho no controle de plantas daninhas. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v. 31, n. 11, p. 789-793, 1996.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 16. | | LOURENTE, E. R. P.; MERCANTE, F. M.; MARCHETTI, M. E.; SOUZA, L. C. F. de; SOUZA, C. M. A. de; GONÇALVES, M. C.; FACHINELLI, R. Atributos químicos e microbiológicos do solo avaliados por meio de correlações canônicas. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa: SBCS, 2012. Fertbio. Organizado por Leila Cruz da Silva, Gilson Moura Filho, Adriano Barboza Moura, Abel Washington de Albuquerque. 4 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 17. | | SOUZA, L. C. F. de; FREITAS, M. E.; LOURENTE, E. R. P.; SERRA, A. P.; RECH, J.; FROTA, F.; LOUREIRO, G. E. S. The effects of crop rotation systems on maize agronomic traits under no-tillage in optimal and dry cropping seasons. African Journal of Agricultural Research, v. 11, n. 27, p. 2369-2377, Jul. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 18. | | FREITAS, M. E.; SOUZA, L. C. F. de; SALTON, J. C.; SERRA, A. P.; MAUAD, M.; CORTEZ, J. W.; MARCHETTI, M. E. Crop rotation affects soybean performance in no-tillage system under optimal and dry cropping seasons. Australian Journal of Crop Science, v. 10, n. 3, p. 353-361, Mar. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Gado de Corte. |
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| 19. | | SILVA, E. F. da; MARCHETTI, M. E.; SOUZA, L. C. F. de; MERCANTE, F. M.; RODRIGUES, E. T.; VITORINO, A. C. T. Inoculaçao do feijoeiro com Rhizobium Tropici associada à exsudato de Mimosa Flocculosa com diferentes doses de nitrogênio. Bragantia, Campinas, v. 68, n. 2, p. 443-451, abr./jun. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 20. | | LOURENTE, E. R. P.; MERCANTE, F. M.; MARCHETTI, M. E.; SOUZA, L. C. F. de; SOUZA, C. M. A. de; SILVA, M. A. G. Rotação de culturas e relações com atributos químicos e microbiológicos do solo e produtividade do milho. Semina: Ciências Agrárias, v. 31, n. 4, p. 829-842, out./dez. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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