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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
05/03/2024 |
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Data da última atualização: |
05/03/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, H. A. P. da; CAETANO, V. S.; PESSÔA, D. D. V.; PACHECO, R. S.; MENESES, C. H. S. G.; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
HELDER ANDERSON PINTO DA SILVA, UFRJ; VANESSA SANTANA CAETANO, UFRJ; DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSÔA, UFRJ; RAFAEL SANCHES PACHECO, UFRRJ; CARLOS HENRIQUE S. G. MENESES, UEPB; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Unraveling the drought-responsive transcriptomes in nodules of two common bean genotypes during biological nitrogen fixation. |
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Ano de publicação: |
2024 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 152024, 1345379, 2024 |
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ISSN: |
1664462X |
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DOI: |
10.3389/fpls.2024.1345379 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Common bean (Phaseolus vulgaris) can efficiently fix atmospheric nitrogen when associated with Rhizobia. However, drought stress impairs plant metabolic processes, especially the biological nitrogen fixation (BNF). Here, we assessed transcriptional responses in nodules of two common bean genotypes to drought stress under BNF reliance. The RNA-Seq analysis yielded a total of 81,489,262 and 72,497,478 high quality reads for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. The reads were mapped to the Phaseolus vulgaris reference genome and expression analysis identified 145 and 1451 differentially expressed genes (DEGs) for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. Although BAT 477 had more DEGs, both genotypes shared certain drought-responsive genes, including an up-regulated heat shock protein (HSP) and a down-regulated peroxidase, indicating shared pathways activated during drought in nodule tissue. Functional analysis using MapMan software highlighted the up-regulation of genes involved in abiotic stress responses, such as HSPs and specific transcription factors (TFs), in both genotypes. There was a significant down-regulation in metabolic pathways related to antioxidant protection, hormone signaling, metabolism, and transcriptional regulation. To validate these findings, we conducted RT-qPCR experiments for ten DEGs in nodules from both genotypes, for which the expression profile was confirmed, thus reinforcing their functional relevance in the nodule responses to drought stress during BNF. BAT 477 genotype exhibited more pronounced response to drought, characterized by a high number of DEGs. The strong down-regulation of DEGs leads to transcriptional disturbances in several pathways related to stress acclimation such as hormone and antioxidant metabolism. Additionally, we identified several genes that are known to play key roles in enhancing drought tolerance, such as HSPs and crucial TFs. Our results provide new insights into the transcriptional responses in root-nodules, an underexplored tissue of plants mainly under drought conditions. This research paves the way for potential improvements in plant-bacteria interactions, contributing to common bean adaptations in the face of challenging environmental conditions MenosCommon bean (Phaseolus vulgaris) can efficiently fix atmospheric nitrogen when associated with Rhizobia. However, drought stress impairs plant metabolic processes, especially the biological nitrogen fixation (BNF). Here, we assessed transcriptional responses in nodules of two common bean genotypes to drought stress under BNF reliance. The RNA-Seq analysis yielded a total of 81,489,262 and 72,497,478 high quality reads for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. The reads were mapped to the Phaseolus vulgaris reference genome and expression analysis identified 145 and 1451 differentially expressed genes (DEGs) for Negro Argel and BAT 477 genotypes, respectively. Although BAT 477 had more DEGs, both genotypes shared certain drought-responsive genes, including an up-regulated heat shock protein (HSP) and a down-regulated peroxidase, indicating shared pathways activated during drought in nodule tissue. Functional analysis using MapMan software highlighted the up-regulation of genes involved in abiotic stress responses, such as HSPs and specific transcription factors (TFs), in both genotypes. There was a significant down-regulation in metabolic pathways related to antioxidant protection, hormone signaling, metabolism, and transcriptional regulation. To validate these findings, we conducted RT-qPCR experiments for ten DEGs in nodules from both genotypes, for which the expression profile was confirmed, thus reinforcing their functional relevance in the nodule responses to ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Candidate genes; Genetic transcript profile; RT-qPCR; Symbiotic nitrogen assimilation; Water deficit. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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URL |
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| Registros recuperados : 13 | |
| 1. |  | FAUSTINO, M. A.; JANIQUES, A. M. S.; STUMPF, V. A.; CESAR, D. E.; MEDEIROS, J. D.; RODRIGUES, E. M.; GUIMARÃES, A. S.; MENDONCA, L. C.; DEL'DUCA, A. Densidade de procariotos e temperaturas das camas de sistemas de criação de vacas leiteiras do tipo Compost Barn. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 32., 2023, Foz do Iguaçu. Resumos. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 2. | | RAMOS, R. A. do N.; RAMOS, C. A. do N.; JUSI, M. M. G.; ARAUJO, F. R.; MACHADO, R. Z.; FAUSTINO, M. A. da G.; ALVES, L. C. Polymerase chain reaction and real-time PCR for diagnosing of Leishmania infantum chagasi in dogs. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 21, n. 3, p. 192-195, jul.-set. 2012| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 3. | | PEDREIRA, C. G. S.; PEDREIRA, B. C. e; BITTAR, C. M. M.; FAUSTINO, M. G.; SANTOS, V. P. dos S.; FERREIRA, L. S.; LARA, M. A. S. Produtividade e degradabilidade ruminal da forragem de capins da espécie Panicum maximum. Nativa, MT, v. 2, n. 3, 2014| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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| 4. | | RAMOS, R.; RAMOS, C.; ARAUJO, F. R.; OLIVEIRA, R. H. M. de; SOUZA, I.; PIMENTEL, D.; GALINDO, M.; SANTAN, M.; ROSAS, E.; FAUSTINO, M.; ALVES, L. Molecular survey and genetic characterization of tick-borne pathogens in dogs in metropolitan Recife (north-eastern Brazil). Parasitology Research, v.107, n. 5, p.1115-1120, Oct. 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 5. | | PIMENTEL, D. de S.; RAMOS, C. A. do N.; RAMOS, R. A. do N.; ARAUJO, F. R.; BARBOSA, M. L.; FAUSTINO, M. A. da G.; ALVES, L. C. First report and molecular characterization of Trypanosoma vivax in cattle from state of Pernambuco, Brazil. Veterinary Parasitology, v. 185, n. 2-4, p. 286-289, abril, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 6. | | CABRAL, D. A.; ARAUJO, F. R.; RAMOS, C. A. do N.; ALVES, L. C.; PORTO, W. J. N.; FAUSTINO, M. A. da G. Serological survey of Anaplasma sp. in sheep from State of Alagoas, Brazil. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, Salvador, v. 10, n.3, p. 708-713, jul./set. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 7. | | STUMPF, V. A.; CABRAL, R. N. M.; SOUZA, C. M. A.; JANIQUES, A. M. S.; MELO, A. L.; SILVA, D. B. F.; FAUSTINO, M. A.; DEL'DUCA, A.; MEDEIROS, J. D.; GUIMARÃES, A. S.; MENDONCA, L. C.; CESAR, D. E. Distribuição temporal de bactérias potencialmente patogênicas na cama de um sistema de criação de vacas leiteiras do tipo Compost Barn. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 32., 2023, Foz do Iguaçu. Resumos. São Paulo: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2023.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 8. | | RAMOS, R. A. N.; RAMOS, C. A. N.; ARAÚJO, F. R.; MELO, E. S. P.; ROSINHA, G. M. S.; TEMBUE, A. A. dos S. M.; FAUSTINO, M. A. da G.; ALVES, L. C. Detecção de anticorpos para Anaplasma sp. em pequenos ruminantes do semi-árido do Estado de Pernambuco, Brasil. Revista de Patologia Tropical, v. 36, 2007. Suplemento 2. Edição dos Resumos do CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA, 20., 2007, Recife. Avanços e desafios : resumos. 1 p. Resumo 900-2.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 9. | | RAMOS, R. A. N.; RAMOS, C. A. N; ARAUJO, F. R.; MELO, E. S. P.; TEMBUE, A. A. S. M.; FAUSTINO, M. A. G.; ALVES, L. C.; ROSINHA, G. M. S.; ELISEI, C.; SOARES, C. O. Detecção de anticorpos para Anaplasma sp. em pequenos ruminantes no semi-árido do Estado de Pernambuco, Brasil. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 17, n. 2, p. 115-117, abr./jun. 2008. Nota de pesquisa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - C |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 10. | | RAMOS, C. A. N.; RAMOS, R. A. N.; ARAUJO, F. R.; GUEDES JR, D. S. G.; SOUZA, I. I. F.; ONO, T. M.; VIEIRA, A. S.; PIMENTEL, D. S.; ROSAS, E. O.; FAUSTINO, M. A. G.; ALVES, L. C. Comparação de nested-PCR com o diagnóstico direto na detecção de Ehrlichia canis e Anaplasma platys em cães. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, Jaboticabal, v. 18, p. 58-62, dez. 2009. Suplemento 1.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 11. | | MELO, V. S. P. de; ALVES, L. C.; ARAUJO, F. R.; NASCIMENTO, C. A. R. do; TENÓRIO, T. G. da S.; MELO, L. H. E. de; FAUSTINO, M. A. da G.; AGUIAR, T. D. de F. Prevalência de anticorpos anti-Anaplasma marginale na Região Metropolitana do Recife utilizando ELISA rMSP2. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MEDICINA VETERINÁRIA, 36.; ENCONTRO BRASILEIRO DE MÉDICOS VETERINÁRIOS DAS FORÇAS ARMADAS, 1.; ENCONTRO DO COLÉGIO BRASILEIRO DE AQUICULTURA, 6.; ENCONTRO DE MEDICINA DE ANIMAIS AQUÁTICOS, 1.; ENCONTRO DOS MÉDICOS VETERINÁRIOS DA BAHIA, 68., 2009, Porto Seguro. Inovação e responsabilidade social: anais. Porto Seguro: SBMV, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 12. | | LIMA, M. L. F.; SOARES, P. T.; RAMOS, C. A. N.; ARAUJO, F. R.; RAMOS, R. A. N.; SOUZA, I. I. F.; FAUSTINO, M. A. G.; ALVES, L. C. A. Molecular detection of Anaplasma platys in a naturally-infected cat in Brazil. Brazilian Journal of Microbiology, v. 41, n. 2, p. 381-385, Apr./June 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 13. | | GUSMÃO, L.; ANTÃO-SOUSA, S.; FAUSTINO, M.; ABOVICH, M. A.; AGUIRRE, D.; ALGHAFRI, R.; ALVES, C.; AMORIM, A.; ARÉVALO, C.; BALDASSARRI, L.; BARLETTA-CARRILLO, C.; BERARDI, G.; BOBILLO, C.; BORJAS, L.; BRAGANHOLI, D. F.; BREHM, A.; BUILES, J. J.; CAINÉ, L.; CARVALHO, E. F.; CARVALHO, M.; CATELLI, L.; CICARELLI, R. M. B.; CONTRERAS, A.; CORACH, D.; MARCO, F. G. di; DIEDERICHE, M. V.; DOMINGUES, P.; ESPINOZA, M.; FERNANDÉZ, J. M.; GARCÍA, M. G.; GARCÍA, O.; GAVIRIA, A.; GOMES, I.; GRATTAPAGLIA, D.; HENAO, J.; HERNANDEZ, A.; IBARRA, A. A.; LIMA, G.; MANTEROLA, I. M.; MARRERO, C.; MARTINS, J. A.; MENDOZA, L.; MOSQUERA, A.; NASCIMENTO, E. C.; ONOFRI, V.; PANCORBO, M. M.; PESTANO, J. J.; PLAZA, G.; PORTO, M. J.; POSADA, Y. C.; REBELO, M. L.; RIEGO, E.; RODENBUSCH, R.; RODRÍGUEZ, A.; RODRÍGUEZ, A.; SANCHEZ-DIZ, P.; SANTOS, S.; SIMÃO, F.; SIZA FUENTES, L. M.; SUMITA, D.; TOMAS, C.; TOSCANINI, U.; TRINDADE-FILHO, A.; TURCHI, C.; VULLO, C.; YURREBASO, I.; PEREIRA, V.; PINTO, N. X-chromosomal STRs: Metapopulations and mutation rates. Forensic Science International: Genetics, v. 76, 103232, 2025.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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