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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  17/07/2023
Data da última atualização:  22/08/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  ROCHA, R. de F. B.; GARCIA, A. O.; OTTO, P. I.; SANTOS, M. G. dos; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; GUIMARÃES, S. E. F.
Afiliação:  RENATA DE FÁTIMA BRETANHA ROCHA, Universidade Federal de Viçosa; ARIELLY OLIVEIRA GARCIA, Universidade Federal de Viçosa; PAMELA ITAJARA OTTO, Universidade Federal de Santa Maria; MATEUS GUIMARÃES DOS SANTOS, Universidade Federal de Viçosa; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; MARTA FONSECA MARTINS, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; SIMONE ELIZA FACIONI GUIMARÃES, Universidade Federal de Viçosa.
Título:  Single-step genome-wide association studies and post-GWAS analyses for the number of oocytes and embryos in Gir cattle.
Ano de publicação:  2023
Fonte/Imprenta:  Mammalian Genome, v. 34, p. 497-508, 2023.
DOI:  https://doi.org/10.1007/s00335-023-10009-0
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genome-Wide Association Studies (GWAS) are used for identifcation of quantitate trait loci (QTL) and genes associated with several traits. We aimed to identify genomic regions, genes, and biological processes associated with number of total and viable oocytes, and number of embryos in Gir dairy cattle. A dataset with 17,526 follicular aspirations, including the following traits: number of viable oocytes (VO), number of total oocytes (TO), and number of embryos (EMBR) from 1641 Gir donors was provided by fve diferent stock farms. A genotype fle with 2093 animals and 395,524 SNP markers was used to perform a single-step GWAS analysis for each trait. The top 10 windows with the highest percentage of additive genetic variance explained by 100 adjacent SNPs were selected. The genomic regions identifed in our work were overlapped with QTLs from QTL database on chromosomes 1, 2, 5, 6, 7, 8, 9, 13, 17, 18, 20, 21, 22, 24, and 29. These QTLs were classifed as External, Health, Meat and carcass, Production or Reproduction traits, and about 38% were related to Reproduction. In total, 117 genes were identifed, of which 111 were protein-coding genes. Exclusively associations were observed for 42 genes with EMBR, and 1 with TO. Also, 42 genes were in common between VO and TO, 28 between VO and EMBR, and four genes were in common among all traits. In conclusion, great part of the identifed genes plays a functional role in initial embryo development or general cell functions. The protein-co... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Associação genômica.
Thesagro:  Bovino; Embrião Animal; Gado Gir; Genética Animal.
Categoria do assunto:  L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL26049 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoRUBIN, S. de A. L.; LOSSO, A. C.; TOMAZZI, D. J.; ALMEIDA, L. A. de; KIIHL, R. A. de S. BRS FEPAGRO 23. Londrina: Embrapa Soja; Porto Alegre: FEPAGRO, 2003. 1 folder.
Tipo: Folder/Folheto/Cartilha
Biblioteca(s): Embrapa Soja.
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2.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; ROSA, A.; LOSSO, A. C.; LERINO, A. J.; SOUSA, C. N. A. de; TOMAZZI, D. J.; OZELANE, G.; DIDONÉ, I. A.; PIRES, J. L. F.; DEL DUCA, L. de J. A.; FEDERIZZI, L. C.; SVOBODA, L. H.; SÓ e SILVA, M.; BARNI, N. A.; GABE, N. L.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; SCHEEREN, P. L. Estabilidade e adaptabilidade das cultivares de trigo avaliadas no ensaio estadual em 2003. In: REUNIÃO DA COMISSÃO SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 36.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 2004, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Sul-Brasileira de Pesquisa de Trigo, 2004. p. 30. (Embrapa Trigo. Documentos online, 38).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; ROSA, A.; LOSSO, A. C.; LERINO, A. J.; SOUSA, C. N. A. de; TOMAZZI, D. J.; OZELANE, G.; DIDONÉ, I. A.; PIRES, J. L. F.; DEL DUCA, L. de J. A.; FEDERIZZI, L. C.; SVOBODA, L. H.; SÓ e SILVA, M.; BARNI, N. A.; GABE, N. L.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S. Resultados do ensaio estadual de cultivares de trigo no Rio Grande do Sul, em 2003. In: REUNIÃO DA COMISSÃO SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO, 36.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 2004, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Sul-Brasileira de Pesquisa de Trigo, 2004. p. 29. (Embrapa Trigo. Documentos online, 38).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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4.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERÃO, E.; BARNI, N. A.; CAETANO, V. da R.; CARBONERA, R.; DIDONÉ, I. A.; FEDERIZZI, L. C.; GABE, N. L.; LOPES, E. J. C.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; MISSIO, E.; PACHECO, M. T.; PIRES, J. L. F.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D.; WENDT, W.; ZANOTTELLI, V. Adaptabilidade e estabilidade das cultivares de trigo avaliadas no Ensaio Estadual do Rio Grande do Sul, no ano 2006. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 1.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 7., 2007, Londrina. Ata, resumos e palestras... Londrina: Embrapa Soja: Fundação Meridional: IAPAR, 2007. p. 278-282. (Embrapa Soja. Documentos, 293).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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5.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERÃO, E.; ALMEIDA, J. L. de; BARNI, N. A.; CAETANO, V. da R.; CARBONERA, R.; FEDERIZZI, L. C.; GABE, N. L.; LOPES, E. J. C.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; MISSIO, E.; PACHECO, M. T.; PIRES, J. L. F.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D.; WENDT, W.; ZANOTELLI, V. Adaptabilidade e estabilidade das cultivares de trigo avaliadas no ensaio estadual do Rio Grande do Sul, no ano 2007. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 2., 2008, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Embrapa Trigo: Embrapa Transferência de Tecnologia, 2008. 5 p. I CD-ROM. Melhoramento, 55. Área: Melhoramento, Aptidão Industrial e Sementes.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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6.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; ROSA, A.; LOSSO, A. C.; LERINO, A. J.; CAIERÃO, E.; MISSIO, E.; DIDONÉ, I. A.; PIRES, J. L. F.; DEL DUCA, L. de J. A.; MARCHIORO, L. A.; FEDERIZZI, L. C.; SVOBODA, L. H.; SÓ e SILVA, M.; BARNI, N. A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; SCHEEREN, P. L.; RUBIN, S. de A. L.; ZANOTELLI, V.; CAETANO, V. da R.; TONON, V. D.; MARCHIORO, V. S.; WENDT, W. Estabilidade e adaptabilidade das cultivares de trigo avaliadas no ensaio estadual, em 2005. In: REUNIÃO DA COMISSÃO SUL-BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E DE TRITICALE, 38.; REUNIÃO DA COMISSÃO CENTRO-SUL BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E DE TRITICALE, 21., 2006. Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Embrapa Trigo: Comissão Sul-brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Comissão Centro-Sul Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale, 2006. melho17. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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7.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERÃO, E.; BARNI, N. A.; CAETANO, V. da R.; CARBONERA, R.; DIDONÉ, I. A.; FEDERIZZI, L. C.; GABE, N. L.; LOPES, E. J. C.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; MISSIO, E.; PACHECO, M. T.; PIRES, J. L. F.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D.; WENDT, W. Resultados do Ensaio Estadual de Cultivares de Trigo no Rio Grande do Sul, em 2006. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 1.; SEMINÁRIO TÉCNICO DO TRIGO, 7., 2007, Londrina. Ata, resumos e palestras... Londrina: Embrapa Soja: Fundação Meridional: IAPAR, 2007. p. 272-277. (Embrapa Soja. Documentos, 293).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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8.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERÃO, E.; ALMEIDA, J. L. de; BARNI, N. A.; CAETANO, V. da R.; CARBONERA, R.; FEDERIZZI, L. C.; GABE, N. L.; LOPES, E. J. C.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; MISSIO, E.; PACHECO, M. T.; PIRES, J. L. F.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D.; WENDT, W.; ZANOTELLI, V. Resultados do ensaio estadual de cultivares de trigo no Rio Grande do Sul, em 2007. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 2., 2008, Passo Fundo. Atas e resumos... Passo Fundo: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Embrapa Trigo: Embrapa Transferência de Tecnologia, 2008. 3 p. 1 CD-ROM. Melhoramento, 54. Área: Melhoramento, Aptidão Industrial e Sementes.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Trigo.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERÃO, E.; ALMEIDA, J. L. de; BARNI, N. A.; BEGNINI, J. C.; CAETANO, V. da R.; CARBONERA, R.; COLLARES, A. L.; FEDERIZZI, L. C.; FRANCO, F. de A.; GABE, N. L.; GONÇALVES, J. A.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; OZELAME, J. G.; PACHECO, M. T.; PIRES, J. L. F.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D. Adaptabilidade e estabilidade das cultivares de trigo avaliadas no ensaio estadual do Rio Grande do Sul, no ano 2008. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 3., 2009, Veranópolis. Ata e resumos... Porto Alegre: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Fepagro; Veranóplis: ASAV; Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2009. Melhoramento, trabalho 99. 3 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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10.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERAO, E.; PIRES, J. L. F.; PASINATO, A.; ALMEIDA, J. L. de; CAETANO, V. da R.; BARNI, N. A.; COLLARES, A. L.; FRANCO, F. de A.; GABE, N. L.; GARRAFA, M.; GONÇALVES, J. A.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; OZELAME, J. G.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SANTOS, F. M. dos; SCHEEREN, P. L.; SILVA, M. S. e; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D.; WORDELL FILHO, J. A. Adaptabilidade e estabilidade das cultivares de trigo avaliadas no Ensaio Estadual do Rio Grande do Sul, no ano 2009. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 4., 2010, Cascavel. Ata e resumos... Cascavel: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Coodetec, 2010. 3 p. 1 CD ROM. Organizado por Volmir Sergio Marchioro, Francisco de Assis Franco, Andrelise Daltoé
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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11.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERÃO, E.; ALMEIDA, J. L. de; BARNI, N. A.; BEGNINI, J. C.; CAETANO, V. da R.; CARBONERA, R.; COLLARES, A. L.; FEDERIZZI, L. C.; FRANCO, F. de A.; GABE, N. L.; GONÇALVES, J. A.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; OZELAME, J. G.; PACHECO, M. T.; PIRES, J. L. F.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SCHEEREN, P. L.; SÓ e SILVA, M.; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D. Resultados do ensaio estadual de cultivares de trigo no Rio Grande do Sul, em 2008. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 3., 2009, Veranópolis. Ata e resumos... Porto Alegre: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Fepagro; Veranóplis: ASAV; Passo Fundo: Embrapa Trigo, 2009. Melhoramento, trabalho 98. 3 p.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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12.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, R. L. de; CAIERAO, E.; PIRES, J. L. F.; PASINATO, A.; ALMEIDA, J. L. de; BARNI, N. A.; CAETANO, V. da R.; COLLARES, A. L.; FRANCO, F. de A.; GABE, N. L.; GARRAFA, M.; GONÇALVES, J. A.; LOSSO, A. C.; MARCHIORO, V. S.; OZELAME, J. G.; ROSA, A.; ROSA, O. de S.; ROSA FILHO, O. de S.; RUBIN, S. de A. L.; SANTOS, F. M. dos; SCHEEREN, P. L.; SILVA, M. S. e; SVOBODA, L. H.; TOIGO, M. de C.; TONON, V. D.; WORDELL FILHO, J. A. Resultados do Ensaio Estadual de Cultivares de Trigo no Rio Grande do Sul, em 2009. In: REUNIÃO DA COMISSÃO BRASILEIRA DE PESQUISA DE TRIGO E TRITICALE, 4., 2010, Cascavel. Ata e resumos... Cascavel: Comissão Brasileira de Pesquisa de Trigo e Triticale: Coodetec, 2010. 4 p. 1 CD ROM. Organizado por Volmir Sergio Marchioro, Francisco de Assis Franco, Andrelise Daltoé.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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