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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
08/03/2023 |
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Data da última atualização: |
08/03/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BUSS, C. E.; AFONSO, J.; OLIVEIRA, P. S. N. DE; PETRINI, J.; TIZIOTO, P. C.; CESAR, A. S. M.; GUSTANI-BUSS, E. C.; CARDOSO, T. F.; ROVADOSKI, G. A.; DINIZ, W. J. DA S.; LIMA, A. O. DE; ROCHA, M. I. P.; ANDRADE, B. G. N.; WOLF, J. B.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
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Afiliação: |
CARLOS EDUARDO BUSS, Federal University of São Carlos; JULIANA AFONSO; PRISCILA S. N. DE OLIVEIRA, Federal University of São Carlos; JULIANA PETRINI, University of São Paulo/ESALQ, Piracicaba; POLYANA CRISTINE TIZIOTO, NGS Soluções Genômicas; ALINE S. M. CESAR, University of São Paulo/ESALQ; EMANUELE CRISTINA GUSTANI-BUSS, Mindflow Genomics, Leuven, Flanders, Belgium.; TAINÃ FIGUEIREDO CARDOSO; GREGORI A. ROVADOSKI, University of São Paulo/ESALQ; WELLISON JARLES DA SILVA DINIZ, Auburn University; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, University of Washington; MARINA IBELLI PEREIRA ROCHA, Federal University of São Carlos; BRUNO GABRIEL NASCIMENTO ANDRADE, Munster Technological University/MTU; JASON B. WOLF, University of Bath; LUIZ LEHMANN COUTINHO, University of São Paulo/ESALQ; GERSON BARRETO MOURÃO, University of São Paulo/ESALQ; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
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Título: |
Bivariate GWAS reveals pleiotropic regions among feed efficiency and beef quality-related traits in Nelore cattle. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Mammalian Genome, v. 34, p. 90-103, dec. 2022. |
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DOI: |
10.1007/s00335-022-09969-6 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Feed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement. |
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Palavras-Chave: |
Bi GWAS; Efciency and meat quality; Phenotypic variations; Pleiotropic modulation; QTL. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
LEADER 02281naa a2200385 a 4500
001 2152195
005 2023-03-08
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520 $aFeed-efcient cattle selection is among the most leading solutions to reduce cost for beef cattle production. However, technical difculties in measuring feed efciency traits had limited the application in livestock. Here, we performed a Bivariate Genome-Wide Association Study (Bi-GWAS) and presented candidate biological mechanisms underlying the association between feed efciency and meat quality traits in a half-sibling design with 353 Nelore steers derived from 34 unrelated sires. A total of 13 Quantitative Trait Loci (QTL) were found explaining part of the phenotypic variations. An important transcription factor of adipogenesis in cattle, the TAL1 (rs133408775) gene located on BTA3 was associated with intramuscular fat and average daily gain (IMF-ADG), and a region located on BTA20, close to CD180 and MAST4 genes, both related to fat accumulation. We observed a low positive genetic correlation between IMF-ADG (r=0.30±0.0686), indicating that it may respond to selection in the same direction. Our fndings contributed to clarifying the pleiotropic modulation of the complex traits, indicating new QTLs for bovine genetic improvement.
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 35 | |
| 1. |  | BARLOW, J.; PARRY, L.; GARDNER, T. A.; FERREIRA, J. N.; ARAGÃO, L. E. O. C.; CARMENTA, R.; BERENGUER, E.; VIEIRA, I. C. G.; SOUZA, C.; COCHRANE, M. A. The critical importance of considering fire in REDD+ programs. Biological Conservation, v. 154, p. 1-8, Oct. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | BERENGUER, E.; GARDNER, T. A.; FERREIRA, J. N.; ARAGÃO, L. E. O. C.; NALLY, R. M.; THOMSON, J. R.; VIEIRA, I. C. G.; BARLOW, J. Seeing the woods through the saplings: Using wood density to assess the recovery of human-modified Amazonian forests. Journal of Ecology, v. 106, n. 6, p. 2190-2203, Nov. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | MAEDA, E. E.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BAKER, J. C. A.; BALBINO, L. C.; MOURA, Y. M. de; NOBRE, A. D.; NUNES, M. H.; SILVA JUNIOR, C. H. L.; REIS, J. C. dos. Land use still matters after deforestation. Communications Earth & Environment, v. 4, 2023. 4 p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 4. | | HAWES, J. E.; VIEIRA, I. C. G.; MAGNAGO, L. F. S.; BERENGUER, E.; FERREIRA, J. N.; ARAGÃO, L. E. O. C.; CARDOSO, A.; LEES, A. C.; LENNOX, G. D.; TOBIAS, J. A; WALDRON, A.; BARLOW, J. A large-scale assessment of plant dispersal mode and seed traits across human-modified Amazonian forests. Journal of Ecology, v. 108, n. 4, p. 1373-1385, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | BERENGUER, E.; FERREIRA, J.; GARDNER, T. A.; ARAGÃO, L. E. O. C.; CAMARGO, P. B. de; CERRI, C. E.; DURIGAN, M.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; VIEIRA, I. C. G.; BARLOW, J. A large-scale field assessment of carbon stocks in human-modified tropical forests. Global Change Biology, v. 20, n. 12, p. 3713-3726, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | FERREIRA, J.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BARLOW, J.; BARRETO, P.; BERENGUER, E.; BUSTAMANTE, M.; GARDNER, T. A.; LEES, A. C.; LIMA, A.; LOUZADA, J.; PARDINI, R.; PARRY, L.; PERES, C. A.; POMPEU, P. S.; TABARELLI, M.; ZUANON, J. Brazil's environmental leadership at risk. Science, v. 346, n. 6210, p. 706-707, Nov. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 7. | | FONSECA, M. G.; ANDERSON, L. O. A.; ARAI, E.; SHIMABUKURO, Y. E.; XAUD, H. A. M.; XAUD, M. R.; MADANI, N.; WAGNER, F. H.; ARAGÃO, L. E. O. C. Climatic and anthropogenic drivers of northern Amazon fires during the 2015-2016 El Niño event. Ecological Applications, v. 27, n. 8, p. 2514-2527, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 8. | | BERENGUER, E.; GARDNER, T. A.; FERREIRA, J.; ARAGÃO, L. E. O. C.; CAMARGO, P. B.; CERRI, C. E.; DURIGAN, M.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C.; VIEIRA, I. C. G.; BARLOW, J. Developing cost-effective field assessments of carbon stocks in human-modified tropical forests. Plos One, v. 10, n. 8, e0133139, 2015.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | WITHEY, K.; BERENGUER, E.; PALMEIRA, A. F.; ESPÍRITO-SANTO, F. D. B.; LENNOX, G. D.; SILVA, C. V. J.; ARAGÃO, L. E. O. C.; FERREIRA, J. N.; FRANÇA, F.; MALHI, Y.; ROSSI, L. C.; BARLOW, J. Quantifying immediate carbon emissions from El Ninõ-mediated wildfires in humid tropical forests. Philosophical Transactions of the Royal Society B, v. 373, n. 1760, p. 1-11, Nov. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 10. | | ANDERSON, L. O.; BURTON, C.; REIS, J. B. C. dos; PESSÔA, A. C. M.; BETT, P.; CARVALHO, N. S.; SILVA JUNIOR, C. H. L.; WILLIAMS, K.; SELAYA, G.; ARMENTERAS, D.; BILBAO, B. A.; XAUD, H. A. M.; RIVERA-LOMBARDI, R.; FERREIRA, J. N.; ARAGÃO, L. E. O. C.; JONES, C. D.; WILTSHIRE, A. J. An alert systemfor Seasonal Fire probability forecast for South American Protected Areas. Climate Resilience and Sustainability, p. 1-19, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 11. | | ANDERSON, L. O.; BURTON, C.; REIS, J. B. C. dos; PESSÔA, A. C. M.; BETT, P.; CARVALHO, N. S.; SILVA JUNIOR, C. H. L.; WILLIAMS, K.; SELAYA, G.; ARMENTERAS, D.; BILBAO, B. A.; XAUD, H. A. M.; RIVERA-LOMBARDI, R.; FERREIRA, J. N.; ARAGÃO, L. E. O. C.; JONES, C. D.; WILTSHIRE, A. J. An alert systemfor Seasonal Fire probability forecast for South American Protected Areas. Climate Resilience and Sustainability, v. 1, n. 1, p. 1-19, Feb. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | FERREIRA, J. N.; LENNOX, G. D.; GARDNER, T. A.; THOMSON, J. R.; BERENGUER, E.; LEES, A. C.; MAC BALLY, R.; ARAGÃO, L. E. O. C.; FERRAZ, S. F. B.; LOUZADA, J.; MOURA, N. G.; OLIVEIRA, V. H. F.; PARDINI, R.; SOLAR, R. R. C.; VIEIRA, I. C. G.; BARLOW, J. Carbon-focused conservation may fail to protect the most biodiverse tropical forests. Nature Climate Change, v. 8, n. 8, p. 744-749, Aug. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 13. | | STARK, S. C.; BRESHEARS, D. D.; ARAGÓN, S.; VILLEGAS, J. C.; LAW, D. J.; SMITH, M. N.; MINOR, D. M.; ASSIS, R. L. de; ALMEIDA, D. R. A. de; OLIVEIRA, G. de; SALESKA, S. R.; SWANN, A. S.; MOURA, J. M. S.; CAMARGO, J. L.; SILVA, R. da; ARAGÃO, L. E. O. C.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de. Reframing tropical savannization: linking changes in canopy structure to energy balance alterations that impact climate. Ecosphere, v. 11, n. 9, e03231, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 14. | | SILVA, C. V. J.; ARAGÃO, L. E. O. C.; YOUNG, P. J.; ESPIRITO-SANTO, F.; BERENGUER, E.; ANDERSON, L. O.; BRASIL, I.; PONTES-LOPES, A.; FERREIRA, J. N.; WITHEY, K.; FRANÇA, F.; GRAÇA, P. M. L. A.; KIRSTEN, L.; XAUD, H. A. M.; SALIMON, C.; SCARANELLO, M. A.; CASTRO, B.; SEIXAS, M.; FARIAS, R.; BARLOW, J. Estimating the multi-decadal carbon deficit of burned Amazonian forests. Environmental Research Letters, v. 15, Article 114023, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Roraima. |
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| 15. | | MOURA, Y. M. de; GALVÃO, L. S.; HILKER, T.; WU, J.; SALESKA, S.; AMARAL, C. H. do; NELSON, B. W.; LOPES, A. P.; WIEDEMAN, K. K.; PROHASKA, N.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; MACHADO, C. B.; ARAGÃO, L. E. O. C. Spectral analysis of amazon canopy phenology during the dry season using a tower hyperspectral camera and modis observations. ISPRS Journal of Photogrammetry and Remote Sensing, v. 131, p. 52-64, Sept. 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 16. | | BERENGUER, E.; LENNOX, G. D.; FERREIRA, J. N.; MALHI, Y.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BARRETO, J. R.; ESPÍRITO-SANTO, F. del B.; FIGUEIREDO, A. E. S.; FRANÇA, F.; GARDNER, T. A.; JOLY, C. A.; PALMEIRA, A. F.; QUESADA, C. A.; ROSSI, L. C.; SEIXAS, M. M. M. de; SMITH, C. C.; WITHEY, K.; BARLOW, J. Tracking the impacts of El Niño drought and fire in human-modified Amazonian forests. PNAS, v. 118, n. 30, e201937711, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 17. | | SILVA, C. V. J.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BARLOW, J.; ESPIRITO-SANTO, F.; YOUNG, P. J.; ANDERSON, L. O.; BERENGUER, E.; BRASIL, I.; BROWN, I. F.; CASTRO, B.; FARIAS, R.; FERREIRA, J. N.; FRANÇA, F.; GRAÇA, P. M. L. A.; KIRSTEN, L.; LOPES, A. P.; SALIMON, C.; SCARANELLO, M. A.; SEIXAS, M.; SOUZA, F. C.; XAUD, H. A. M. Drought-induced Amazonian wildfires instigate a decadal-scale disruption of forest carbon dynamics. Philosophical Transactions of the Royal Society B, v. 373, n. 1760, p. 1-12, Nov. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Roraima. |
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| 18. | | LENNOX, G. D.; GARDNER, T. A.; THOMSON, J. R.; FERREIRA, J. N.; BERENGUER, E.; LEES, A. C.; NALLY, R. M.; ARAGÃO, L. E. O. C.; FERRAZ, S. F. B.; LOUZADA, J.; MOURA, N. G.; OLIVEIRA, V. H. F.; PARDINI, R.; SOLAR, R. R. C.; MELLO, F. Z. V. de; VIEIRA, I. C. G.; BARLOW, J. Second rate or a second chance? Assessing biomass and biodiversity recovery in regenerating Amazonian forests. Global Change Biology, v. 24, n. 12, p. 5680-5694, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 19. | | VEDOVATO, L. B.; CARVALHO, L. C. S.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BIRD, M.; PHILLIPS, O. L.; ALVAREZ, P.; BARLOW, J.; BARTHOLOMEW, D. C.; BERENGUER, E.; CASTRO, W.; FERREIRA, J. N.; FRANÇA, F. M.; MALHI, Y.; MARIMON, B.; MARIMON JÚNIOR, B. H.; MONTEAGUDO, A.; OLIVEIRA, E. A.; PEREIRA, L. O.; PONTES-LOPES, A.; QUESADA, C. A.; SILVA, C. V. J.; ESPEJO, J. E. S.; SILVEIRA, M.; FELDPAUSCH, T. R. Ancient fires enhance Amazon forest drought resistance. Frontiers in Forests and Global Change, v. 6, 1024101, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 20. | | NUNES, C. A.; BERENGUER, E.; FRANÇA, F.; FERREIRA, J. N.; LEES, A. C.; LOUZADA, J.; SAYER, E. J.; SOLAR, R.; SMITH, C. C.; ARAGÃO, L. E. O. C.; BRAGA, D. de L.; CAMARGO, P. B. de; CERRI, C. E. P.; OLIVEIRA JUNIOR, R. C. de; DURIGAN, M.; MOURA, N.; OLIVEIRA, V. H. F.; RIBAS, C.; VAZ-DE-MELLO, F.; VIEIRA, I.; ZANETTI, R.; BARLOW, J. Linking land-use and land-cover transitions to their ecological impact in the Amazon. PNAS, v. 119, n. 27, e2202310119, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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