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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
Data corrente: |
08/11/2022 |
Data da última atualização: |
27/09/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, K. J. da; GUIMARÃES, C. T.; SOUSA, S. M. de; BERNARDINO, K. da C.; TRINDADE, R. dos S.; QUEIROZ, V. A. V.; CONCEIÇÃO, R. R. P. da; GUILHEN, J. H. S.; OLIVEIRA, N. T. de; DAMASCENO, C. M. B.; NODA, R. W.; DIAS, L. A. dos S.; GUIMARAES, L. J. M.; MELO, J. de O.; PASTINA, M. M. |
Afiliação: |
KARLA JORGE DA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; CLAUDIA TEIXEIRA GUIMARAES, CNPMS; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS; KARINE DA COSTA BERNARDINO, Universidade Federal de Viçosa; ROBERTO DOS SANTOS TRINDADE, CNPMS; VALERIA APARECIDA VIEIRA QUEIROZ, CNPMS; RENATA REGINA PEREIRA DA CONCEIÇÃO; JOSÉ HENRIQUE SOLER GUILHEN; NATANAEL TAVARES DE OLIVEIRA; CYNTHIA MARIA BORGES DAMASCENO, CNPMS; ROBERTO WILLIANS NODA, CNPMS; LUIZ ANTÔNIO DOS SANTOS DIAS, Universidade Federal de Viçosa; LAURO JOSE MOREIRA GUIMARAES, CNPMS; JANAÍNA DE OLIVEIRA MELO, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri; MARIA MARTA PASTINA, CNPMS. |
Título: |
A genome-wide association study investigating fumonisin contamination in a panel of tropical maize elite lines. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Euphytica, v. 218, article 130, 2022. |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10681-022-03082-0 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Native genetic resistance is an effective and environmental-friendly alternative to control fungal infections and reduce fumonisin content in maize kernels. Marker-assisted selection can accelerate the genetic gains over breeding cycles. This study aimed to identify genomic regions and candidate genes associated to fumonisin contamination in a panel of tropical maize elite lines. A total of 205 inbred lines were grown under field conditions in Brazil to measure the fumonisin content in grains. The lines were genotyped by sequencing, generating 385,654 high-quality polymorphic single-nucleotide polymorphisms (SNPs). The Genome Wide Association Study (GWAS) identified 40 SNPs located on 19 genomic regions associated to the fumonisin contamination, of which seven were coincident with other studies. Six candidate genes localized within these QTL regions shared functions related with pathogen resistance, six shared functions related with pathogen resistance, including one associated with Fusarium ear rot also identified at bin 10.03 in a previous study. Tropical maize lines resistant to fumonisin contamination were at low frequency in the Embrapa?s panel, but most of the resistant lines shared more than 73% of the resistance alleles at SNP loci associated with the trait. Thus, favorable alleles could be potentially used to improve resistance to fumonisin contamination in maize. |
Palavras-Chave: |
Fumonisina. |
Thesagro: |
Fusarium; Gene; Micotoxina; Milho. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
LEADER 02458naa a2200361 a 4500 001 2148120 005 2023-09-27 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s10681-022-03082-0$2DOI 100 1 $aSILVA, K. J. da 245 $aA genome-wide association study investigating fumonisin contamination in a panel of tropical maize elite lines.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aNative genetic resistance is an effective and environmental-friendly alternative to control fungal infections and reduce fumonisin content in maize kernels. Marker-assisted selection can accelerate the genetic gains over breeding cycles. This study aimed to identify genomic regions and candidate genes associated to fumonisin contamination in a panel of tropical maize elite lines. A total of 205 inbred lines were grown under field conditions in Brazil to measure the fumonisin content in grains. The lines were genotyped by sequencing, generating 385,654 high-quality polymorphic single-nucleotide polymorphisms (SNPs). The Genome Wide Association Study (GWAS) identified 40 SNPs located on 19 genomic regions associated to the fumonisin contamination, of which seven were coincident with other studies. Six candidate genes localized within these QTL regions shared functions related with pathogen resistance, six shared functions related with pathogen resistance, including one associated with Fusarium ear rot also identified at bin 10.03 in a previous study. Tropical maize lines resistant to fumonisin contamination were at low frequency in the Embrapa?s panel, but most of the resistant lines shared more than 73% of the resistance alleles at SNP loci associated with the trait. Thus, favorable alleles could be potentially used to improve resistance to fumonisin contamination in maize. 650 $aFusarium 650 $aGene 650 $aMicotoxina 650 $aMilho 653 $aFumonisina 700 1 $aGUIMARÃES, C. T. 700 1 $aSOUSA, S. M. de 700 1 $aBERNARDINO, K. da C. 700 1 $aTRINDADE, R. dos S. 700 1 $aQUEIROZ, V. A. V. 700 1 $aCONCEIÇÃO, R. R. P. da 700 1 $aGUILHEN, J. H. S. 700 1 $aOLIVEIRA, N. T. de 700 1 $aDAMASCENO, C. M. B. 700 1 $aNODA, R. W. 700 1 $aDIAS, L. A. dos S. 700 1 $aGUIMARAES, L. J. M. 700 1 $aMELO, J. de O. 700 1 $aPASTINA, M. M. 773 $tEuphytica$gv. 218, article 130, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Registros recuperados : 17 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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3. |  | COSTA, L. M.; SILVA, H. O.; BRESSANI, F. A.; NOGUEIRA, A. R. de A.; NÓBREGA, J. A. Digestão de óleo lubrificante encapsulado em forno de microondas com radiação focalizada através da adição de amostra ao reagente pré-aquecido. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE DE QUÍMICA, 27.; CONGRESO LATINO AMERICANO DE QUÍMICA, 26., 2004, Salvador, BA. Livro de resumos... Salvador: SBQ, 2004.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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5. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; VIEIRA, L.; ZAROS, L. G.; MEIRELLES, S. L.; REGITANO, L. C. de A. Prospecção de SNPs no gene TNFa e sua possível associação à verminose gastrintestinal em caprinos. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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7. |  | MELLO, S. S. de; ROCHA, M. I. P.; GIGLIOTI, R.; BRESSANI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; NICIURA, S. C. M. Identificação de polimorfismos no gene da glicoproteína-P (PgP) em Haemonchus contortus: dificuldades técnicas. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 48. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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8. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; ROCHA, M. I. P.; IBELLI, A. M. G.; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Comparação de diferentes protocolos para visualização de DNA separado por eletroforese em gel de agarose utilizando-se os corantes fluorescentes brometo de etídeo e GelRedr. In: ENCONTRO NACIONAL SOBRE MÉTODOS DOS LABORATÓRIOS DA EMBRAPA, 15., 2010, Pelotas, RS. Novas perspectivas para os laboratórios da Embrapa. Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2010.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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9. |  | ROCHA, M. I. P.; MELLO, S. S. DE; BUZATTO, V. C.; OLIVEIRA, A. de L.; BRESSANI, F. A.; MALAGO JUNIOR, W.; NICIURA, S. C. M. Estudo da metilação de ilhas CpG no gene da calpastatina, relacionado à maciez de carne em bovinos de corte: resultados preliminares. In: JORNADA CIENTÍFICA - EMBRAPA SÃO CARLOS, 4., 2012, São Carlos, SP. Anais... São Carlos: Embrapa Instrumentação: Embrapa Pecuária Sudeste, 2012. p. 37. (Embrapa Instrumentação. Documentos, 56).Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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10. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; MALAGÓ JUNIOR, W.; GIGLIOTI, R.; IBELLI, A. M. G.; COUTINHO, R.; CARRILHO, E.; ZAROS, L. G.; VIEIRA, L. da S.; REGITANO, L. C. de A. Association between a SNP of IL2 gene and gastrointestinal resistance in goat. Archivos Latinoamericano de Produccion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 217, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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11. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; MALAGO JUNIOR, W.; GIGLIOTI, R.; IBELLI, A. M. G.; COUTINHO, R.; CARRILHO, E.; ZAROS, L. G.; VIEIRA, L. da S.; REGITANO, L. C. de A. Association between a SNP of IL2 gene and gastrointestinal resistance in goat. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 217, 2011Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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12. |  | TIZIOTO P. C.; MUDADO, M. de A.; MEIRELLES, S. L.; BRESSANI, F. A.; MALAGO JUNIOR, W.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; TULLIO, R. R.; REGITANO, L. C. de A. Haplotype tree of MYOD1 gene in Bos indicus beef cattle. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF BRAZIL ASSOCIATION AND COMPUTER BIOLOGY 7.; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE IBEROAMERICAN SOCIETY FOR BIOINFORMATICS, 3., 2011, Florianópolis. X-Meeting - proceeding. Florianóplis : ABC3C: SolBio, 2011. ID 127.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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13. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MEIRELLES, S. L.; MALAGO JUNIOR, W.; GIGLIOTI, R.; IBELLI, A. M. G.; GROMBONI, J. G. G.; CARRILHO, E.; ZAROS, L. G.; VIEIRA, L. da S.; REGITANO, L. C. de A. Identification of a SNP in the gene IL2 and its association with resistance against gastrointestinal infection by nematodes in goat. Journal of Animal Science v. 89, e-suppl.; Journal of Dairy Science, v. 94, e-suppl. 1, p. 280, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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14. |  | BILHASSI, T. B.; OLIVEIRA, H. N.; IBELLI, A. M. G.; GIGLIOTI, R.; REGITANO, L. C. de A.; OLIVEIRA-SIQUEIRA, T. C. G.; BRESSANI, F. A.; MALAGO JUNIOR, W.; RESENDE, F. D.; OLIVEIRA, M. C. de S. Quantitative study of Babesia bovis infection in beef cattle from São Paulo state, Brazil. Ticks and Tick-borne Diseases, v. 5, n. 3, p. 234-238, apr. 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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15. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; GIGLIOTI, R.; MEIRELLHES, S. L. C.; COUTINHO, L. L.; BENVENUTI, C. L.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; VIEIRA, L. da S.; ZAROS, L. G.; CARRILHO, E.; REGITANO, L. C. de A. Single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with gastrointestinal nematode infection in goats. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 8530-8436, Oct. 2014.Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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16. |  | BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; GIGLIOTI, R.; MEIRELLHES, S. L. C.; COUTINHO, R.; BENVENUTI, C. L.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; VIEIRA, L. C.; ZAROS, L. G.; CARRILHO, E.; REGITANO, L. C. de A. Single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with gastrointestinal nematode infection in goats. Genetics and Molecular Research, v. 13, n. 4, p. 8530-8436, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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17. |  | SOUZA, M. M.; BRESSANI, F. A.; TIZIOTO, P. C.; MALAGÓ-JR, W.; SIQUEIRA, F.; ROSA, A. do N.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; MEDEIROS, S. R. de; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; NICIURA, S. C. M.; REGITANO, L. C. de A. Searching for snp in capn1 gene and its association with shear force in nellore cattle. Archivos Latinoamericano de Producion Animal, v. 19, (supl. 1), p. 233, 2011Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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