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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
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Data corrente: |
11/01/2022 |
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Data da última atualização: |
11/01/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CUNHA, C. P. da; RESENDE, F. V.; ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B. |
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Afiliação: |
CAMILA PINTO DA CUNHA, UNICAMP; FRANCISCO VILELA RESENDE, CNPH; MARIA IMACULADA ZUCCHI, UNICAMP; JOSE BALDIN PINHEIRO, APTA. |
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Título: |
SSR-based genetic diversity and structure of garlic accessions from Brazil. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetica, v. 142, n. 5, p. 419-431, 2014. |
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DOI: |
10.1007/s10709-014-9786-1 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Garlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide. MenosGarlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Alho; Allium Sativum; Germoplasma; Marcador Molecular. |
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Thesaurus Nal: |
Cluster analysis; Genetic resources; Microsatellite repeats. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
LEADER 02375naa a2200253 a 4500
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520 $aGarlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide.
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700 1 $aPINHEIRO, J. B.
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Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 32 | |
| 5. |  | FONSECA, J. F. da; MATOS, L. M.; ZAMBRINI, F. N.; FERREIRA, M. I. C.; FACO, O. hCG administration in Saanen goats inseminated following synchronized estrus. Animal Reproduction, v. 11, n. 3, p. 368, Jul./Sept. 2014. Abstract A088. Proceedings of the 28th Annual Meeting of The Brazilian Embryo Technology Society - SBTE, Natal, RN, Brasil, ago. 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 6. | | FERREIRA, M. I. C.; FONSECA, J. F. da; BRUSCHI, J. H.; FACO, O.; MENDONCA, L. C. Milk production and composition of Toggenburg and Toggenburg-Anglo Nubiana crossbred goats in Southeastern Brazil. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON GOATS, 11., 2012, Gran Canaria, Spain. Book of abstract... Little Rock, Arkansas: International Goat Association, 2012. p. 245. Abstract M-47.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos; Embrapa Gado de Leite. |
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| 9. | | MACEDO JÚNIOR, G. de L.; BORGES, I. B.; CAVALCANTI, L. F. L.; SOUSA, F. A. de; FERREIRA, M. I. C. Consumo, digestibilidade aparente e glicemia de borregas nulíparas gestantes e submetidas a dois manejos nutricionais. Veterinária Notícias, Uberlândia, v. 20, n. 2, p. 57-70, jul./dez. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 10. | | PRATES, J. F.; OLIVEIRA, F. R. B. de; MAIA, A. L. R. de S.; PENIDO, P. P. do N.; FERREIRA, M. I. C.; FONSECA, J. F. da. Associação do efeito macho e duas doses cloprostenol para indução de estro sincronizados em ovelhas Santa Inês na região da Mata Atlântica de Minas Gerais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 21., 2015, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2015. p. 187.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 11. | | ROGERIO, M. C. P.; FERREIRA, M. I. C.; BORGES, I.; XIMENES, L. J. F.; SILVA, V. L.; COSTA, H. H. A.; ARAÚJO, A. R. Alimentos alternativos e alimentação de caprinos e ovinos leiteiros. In: WORKSHOP SOBRE PRODUÇÃO DE CAPRINOS NA REGIÃO DA MATA ATLÂNTICA, 11., 2014, Coronel Pacheco. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2014. p. 11-36.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 13. | | BALARO, M. F. A.; FONSECA, J. F. da; MAIA, A. L. R. S.; DELGADO, K. F.; FERREIRA, M. I. C.; BRANDÃO, F. Z. Protocolos hormonais de indução de estro sincronizado em ovelhas leiteiras na contra estação reprodutiva. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 20., 2013, Uberlandia. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2013. p. 81.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 14. | | OLIVEIRA, F. R. B. de; MATOS, L. M. de; PRATES, J. F.; MAIA, A. L. R. e S.; FERREIRA, M. I. C.; FACO, O.; FONSECA, J. F. da. hCG administration in artificially inseminated dairy goats subjected to estrous synchronization. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 21., 2015, Belo Horizonte. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2015. p. 153.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 15. | | MACEDO JUNIOR, G. de L.; BORGES, I.; FERREIRA, M. I. C.; FIGUEIREDO, F. O. M.; GOMES, M. G. T.; CAVALCANTI, L. F. L.; VIANA, M. H. Exigências em energia e proteína líquida para ovelhas da raça Santa Inês em lactação. Revista Brasileira de Saúde e Produção Animal, v. 12, n. 2, p. 389-402, abr./jun. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 16. | | GOMES, M. G. T.; MACEDO JUNIOR, G. L.; FERREIRA, M. I. C.; BORGES, I.; VARAGO, F. C.; LAGO, L. A.; HENRY, M. Some aspects of the puerperium after singleton and twin parturitions in Santa Inês ewes submitted to energy restriction during pregnancy. Small Ruminant Research, Amsterdam, v. 120, n. 2/3, p. 219-223, Aug. 2014.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
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| 17. | | ESTEVES, L. V.; BRANDÃO, F. Z.; ZAMBRINI, F. N.; SIQUEIRA, L. G. B.; FERREIRA, M. I. C.; FONSECA, J. F. da. Superovulação e coleta de embriões pela via transcervical em cabras da raça Toggenburg durante a estação reprodutiva. CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 20., 2013, Uberlandia. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2013. p. 57| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
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| 18. | | ESTEVES, L. V.; BRANDÃO, F. Z.; ZAMBRINI, F. N.; SIQUEIRA, L. G. B.; FERREIRA, M. I. C.; FONSECA, J. F. da. Superovulação e coleta de embriões pela via transcervical em cabras da raça Toggenburg durante a estação reprodutiva. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE REPRODUÇÃO ANIMAL, 20., 2013, Uberlandia. Anais... Belo Horizonte: CBRA, 2013. p. 57.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 19. | | FONSECA, J. F. da; ESTEVES, L. V.; ZAMBRINI, F. N.; FERREIRA, M. I. C.; SIQUEIRA, L. G. B.; BRANDÃO, F. Z. Superovulation and embryo recovery by transcervical technique in Toggenburg goats during seasonal anestrus. In: ANNUAL MEETING - AETE, 29., 2013, Istanbul, Turkey. Colloque cientifique. Istanbu: Association Europeenne de Transfert Embryonnaire, 2013. p. 130.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 20. | | DIAMANTINO, G. M. L.; PIEREZAN, F.; FERREIRA, M. I. C.; ROCHA, W. S. D. da; OLIVEIRA, V. M. de; MARTINS, C. E.; VEIGA, M. O.; SOTO-BLANCO, B. Photosensitization by Brachiaria ruziziensis in a sheep herd. Toxicon, v. 185, p. 1-4, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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