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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
13/08/2021 |
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Data da última atualização: |
13/08/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, A. A.; SILVA, D. A.; SILVA, F. F.; COSTA, C. N.; SILVA, H. T.; LOPES, P. S.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. |
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Afiliação: |
ALESSANDRA ALVES SILVA, Universidade Federal de Viçosa; DELVAN ALVES SILVA, Universidade Federal de Viçosa; FABYANO FONSECA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; CLAUDIO NAPOLIS COSTA, CNPGL; HUGO TEIXEIRA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; PAULO SÁVIO LOPES, Universidade Federal de Viçosa; RENATA VERONEZE, Universidade Federal de Viçosa; GERTRUDE THOMPSON, Universidade do Porto; JULIO CARVALHEIRA, Universidade do Porto. |
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Título: |
GWAS and gene networks for milk-related traits from test-day multiple lactations in Portuguese Holstein cattle. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Applied Genetics, v. 61, p. 465-476, 2020. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s13353-020-00567-3 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
This study focused on the identification of QTL regions, candidate genes, and network related genes based on the first 3 lactations (LAC3) of milk, fat, and protein yields, and somatic cell score (SCS) in Portuguese Holstein cattle. Additionally, the results were compared with those from only first lactation (LAC1) data. The analyses were performed using the weighted single-step GWAS under an autoregressive test-day (TD) multiple lactations model. A total of 11,434,294 and 4,725,673 TD records from LAC3 and LAC1, respectively, including 38,323 autosomal SNPs and 1338 genotyped animals were used inGWAS analyses. A total of 51 (milk), 5 (fat), 24 (protein), and 4 (SCS) genes were associated to previously annotated relevant QTL regions for LAC3. The CACNA2D1 at BTA4 explained the highest proportion of genetic variance respectively for milk, fat, and protein yields. For SCS, the TRNAG-CCC at BTA14, MAPK10, and PTPN3 genes, both at BTA6 were considered important candidate genes. The accessed network refined the importance of the reported genes. CACNA2D1 regulates calcium density and activation/inactivation kinetics of calcium transport in the mammary gland; whereas TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3 are directly involved with inflammatory processes widely derived from mastitis. In conclusion, potential candidate genes (TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3) associated with somatic cell were highlighted, which further validation studies are needed to clarify its mechanism action in response to mastitis. Moreover, most of the candidate genes identified were present in both (LAC3 and LAC1) for milk, fat and protein yields, except for SCS, in which no candidate genes were shared between LAC3 and LAC1. The larger phenotypic information provided by LAC3 dataset was more effective to identify relevant genes, providing a better understanding of the genetic architecture of these traits over all lactations simultaneously. MenosThis study focused on the identification of QTL regions, candidate genes, and network related genes based on the first 3 lactations (LAC3) of milk, fat, and protein yields, and somatic cell score (SCS) in Portuguese Holstein cattle. Additionally, the results were compared with those from only first lactation (LAC1) data. The analyses were performed using the weighted single-step GWAS under an autoregressive test-day (TD) multiple lactations model. A total of 11,434,294 and 4,725,673 TD records from LAC3 and LAC1, respectively, including 38,323 autosomal SNPs and 1338 genotyped animals were used inGWAS analyses. A total of 51 (milk), 5 (fat), 24 (protein), and 4 (SCS) genes were associated to previously annotated relevant QTL regions for LAC3. The CACNA2D1 at BTA4 explained the highest proportion of genetic variance respectively for milk, fat, and protein yields. For SCS, the TRNAG-CCC at BTA14, MAPK10, and PTPN3 genes, both at BTA6 were considered important candidate genes. The accessed network refined the importance of the reported genes. CACNA2D1 regulates calcium density and activation/inactivation kinetics of calcium transport in the mammary gland; whereas TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3 are directly involved with inflammatory processes widely derived from mastitis. In conclusion, potential candidate genes (TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3) associated with somatic cell were highlighted, which further validation studies are needed to clarify its mechanism action in response to m... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Gene function; Regiões QTL. |
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Thesagro: |
Bovino; Gado Holandês; Gado Leiteiro; Gene; Produção Leiteira. |
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Thesaurus Nal: |
Milk yield; Somatic cells. |
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Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
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Marc: |
LEADER 02891naa a2200337 a 4500
001 2133544
005 2021-08-13
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520 $aThis study focused on the identification of QTL regions, candidate genes, and network related genes based on the first 3 lactations (LAC3) of milk, fat, and protein yields, and somatic cell score (SCS) in Portuguese Holstein cattle. Additionally, the results were compared with those from only first lactation (LAC1) data. The analyses were performed using the weighted single-step GWAS under an autoregressive test-day (TD) multiple lactations model. A total of 11,434,294 and 4,725,673 TD records from LAC3 and LAC1, respectively, including 38,323 autosomal SNPs and 1338 genotyped animals were used inGWAS analyses. A total of 51 (milk), 5 (fat), 24 (protein), and 4 (SCS) genes were associated to previously annotated relevant QTL regions for LAC3. The CACNA2D1 at BTA4 explained the highest proportion of genetic variance respectively for milk, fat, and protein yields. For SCS, the TRNAG-CCC at BTA14, MAPK10, and PTPN3 genes, both at BTA6 were considered important candidate genes. The accessed network refined the importance of the reported genes. CACNA2D1 regulates calcium density and activation/inactivation kinetics of calcium transport in the mammary gland; whereas TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3 are directly involved with inflammatory processes widely derived from mastitis. In conclusion, potential candidate genes (TRNAG-CCC, MAPK10, and PTPN3) associated with somatic cell were highlighted, which further validation studies are needed to clarify its mechanism action in response to mastitis. Moreover, most of the candidate genes identified were present in both (LAC3 and LAC1) for milk, fat and protein yields, except for SCS, in which no candidate genes were shared between LAC3 and LAC1. The larger phenotypic information provided by LAC3 dataset was more effective to identify relevant genes, providing a better understanding of the genetic architecture of these traits over all lactations simultaneously.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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| Registros recuperados : 67 | |
| 5. |  | NASCIMENTO, E. V. S. do; BRASIL, E. C.; SILVA, G. R. da; MONTEIRO, E. M. M.; ASSUNÇÃO, E. A. Efeito de diferentes frações granulométricas da escória de siderúrgica nos atributos do solo, na produção e nos teores de Ca e Mg no milho. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 18., 2010, Teresina. Novos caminhos para a agricultura conservacionista no Brasil. Teresina: Embrapa Meio-Norte: Universidade Federal do Piauí, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; DANTAS, J. A. da S.; SILVA, A. V. da; MONTEIRO, E. M. M. Potencial nutritivo da silagem de sorgo. In: WORKSHOP SOBRE PRODUÇÃO DE SILAGEM NA AMAZÔNIA, 1., 2004, Belém, PA. Anais do... Belém, PA: UFRA, 2004. p. 83-100. Editado por Almir Vieira Silva e José de Brito Lourenço Júnior.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 7. | | DANTAS, J. A. da S.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; SILVA, A. V. da; MONTEIRO, E. M. M. Silagem de sorgo influenciando no desempenho de bovinos e búfalos. In: WORKSHOP SOBRE PRODUÇÃO DE SILAGEM NA AMAZÔNIA, 1., 2004, Belém, PA. Anais do... Belém, PA: UFRA, 2004. p. 101-117. Editado por Almir Vieira Silva e José de Brito Lourenço Júnior.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 8. | | LOURENCO JUNIOR, J. de B.; COSTA, N. A. da; LOURENÇO, V. V.; MONTEIRO, E. M. M.; AVIZ, M. A. B. de; SANTOS, N. de F. A. dos. Avaliação de carcaça e aproveitamento de cortes secundários de carne de baby búfalo criados em pastagem cultivada na Amazônia Oriental. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: Unesp: SBZ, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | MONTEIRO, E. M. M.; BRASIL, E. C.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; OLIVEIRA, C. do S. B. de; COSTA, E. de J. F. Avaliação da composição bromatológica da forrageira Brachiaria humidicola adubada com dois resíduos orgânicos oriundos da siderurgia e criação avícola. In: CONGRESSO DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE SISTEMAS DE PRODUÇÃO, 8., 2010, São Luís. Agricultura familiar: crise alimentar e mudanças climáticas globais: anais. São Luís, MA: UEMA: Embrapa, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 10. | | COSTA, D. A. da; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; FERREIRA, G. D. G.; SANTOS, N. de F. A. dos; GARCIA, A. R.; MONTEIRO, E. M. M. Avaliação nutricional da torta de dendê para suplementação de ruminantes na Amazônia Oriental. Amazônia: Ciência & Desenvolvimento, Belém, PA, v. 4, n. 8, p. 83-101, jan./jun. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 11. | | VIEIRA, L. C.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; ALVES, O. dos S.; MONTEIRO, E. M. M.; SANTOS, N. de F. A. dos. Doce de leite pastoso e em tabletes fabricado com leite de búfalas. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 7.; CONGRESSO NACIONAL DE ZOOTECNIA, 10.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 11.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNIA, 28.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 1., 2005, Campo Grande, MS. Produção animal e responsabilidade: [anais]. Campo Grande, MS: ABZ: UEMS: UFMS: CPAP: MAPA, 2005. Zootec 2005.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 13. | | SANTOS, N. de F. A. dos; LOURENCO JUNIOR, J. de B.; MONTEIRO, E. M. M.; AVIZ, M. A. B. de; ARAÚJO, C. V. de. Cratylia argentea (Desv.) O. Kuntze – Avaliação do consumo e digestibilidade aparente da matéria seca, proteína bruta e energia bruta. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 44., 2007, Jaboticabal. Anais... Jaboticabal: Unesp: SBZ, 2007.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 14. | | MONTEIRO, E. M. M.; BRASIL, E. C.; LOURENÇO JÚNIOR, J. de B.; COSTA, N. A. da; OLIVEIRA, C. do S. B. de; COSTA, E. de J. F. Dinâmica da produção da forragem Brachiaria humidicola em função da aplicação de produtos orgânicos e fósforo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. Fortaleza: SBCS, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 15. | | SOUZA JUNIOR, L.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; GARCIA, A. R.; NAHUM, B. de S.; SANTOS, N. de F. A. dos; MONTEIRO, E. M. M. Efeito dietético da inclusão de níveis crescentes da fibra da torta de coco sobre o consumo voluntário de ovinos. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém, PA. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém, PA: SBZ, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 16. | | DANTAS, J. A. da S.; LOURENCO JUNIOR, J. de B.; CASTRO, A. C.; ALVES, O. dos S.; SANTOS, N. de F. A. dos; MONTEIRO, E. M. M. Influência de variáveis climáticas sobre a concepção de búfalas Mediterrâneo, criadas sob pastejo rotacionado flexível, em Belém, Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOMETEOROLOGIA, 4., 2006, Ribeirão Preto. Mudanças climáticas: impacto sobre homens, plantas e animais: anais. Ribeirão Preto: Instituto de Zootecnia, 2006.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 17. | | DANTAS, J. A. da S.; LOURENCO JUNIOR, J. de B.; CASTRO, A. C.; ALVES, O. dos S.; SANTOS, N. de F. A. dos; MONTEIRO, E. M. M. Influência de variáveis climáticas sobre a concepção de búfalas Murrah, criadas sob pastejo rotacionado intensivo em Belém, Pará. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE BIOMETEOROLOGIA, 4., 2006, Ribeirão Preto. Mudanças climáticas: impacto sobre homens, plantas e animais: anais. Ribeirão Preto: Instituto de Zootecnia, 2006.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 18. | | BATISTA, H. A. M.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; COSTA, N. A. da; ALVES, O. dos S.; MONTEIRO, E. M. M.; SANTOS, N. de F. A. dos. Influência de sêmen importado da Itália no peso ao nascer de búfalos mediterrâneo. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 7.; CONGRESSO NACIONAL DE ZOOTECNIA, 10.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 11.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNIA, 28.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 1., 2005, Campo Grande, MS. Produção animal e responsabilidade: [anais]. Campo Grande, MS: ABZ: UEMS: UFMS: CPAP: MAPA, 2005. Zootec 2005.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 19. | | BATISTA, H. A. M.; LOURENÇO JUNIOR, J. de B.; COSTA, N. A. da; MONTEIRO, E. M. M.; ALVES, O. dos S.; SANTOS, N. de F. A. dos. Influência de sêmen italiano no desempenho ponderal de búfalos mediterrâneo. In: CONGRESSO INTERNACIONAL DE ZOOTECNIA, 7.; CONGRESSO NACIONAL DE ZOOTECNIA, 10.; REUNIÃO NACIONAL DE ENSINO DE ZOOTECNIA, 11.; FÓRUM DE ENTIDADES DE ZOOTECNIA, 28.; FÓRUM DE COORDENADORES DE CURSOS DE ZOOTECNIA DAS UNIVERSIDADES BRASILEIRAS, 1., 2005, Campo Grande, MS. Produção animal e responsabilidade: [anais]. Campo Grande, MS: ABZ: UEMS: UFMS: CPAP: MAPA, 2005. Zootec 2005.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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| 20. | | MONTEIRO, E. M. M.; LOURENÇO JÚNIOR, J. de B.; SANTOS, N. de F. A. dos; ARAÚJO, C. V.; FATURI, C.; GARCIA, A. R. Influência da digestibilidade aparente da matéria seca, matéria orgânica e proteína bruta nos consumos voluntários da leguminosa Pueraria Phaseoloides (Roxb.) Benth na dieta de ovinos. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1. 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal; Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. p. 1-3.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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