BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  11/08/2021
Data da última atualização:  11/08/2021
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F.
Afiliação:  JULIANA MAINENTI LEAL LOPES, Universidade Federal de Juiz de Fora; ELYABE MONTEIRO DE MATOS, Universidade Federal de Juiz de Fora; CRISTIANE ZORZATTO, Universidade Federal de Juiz de Fora; ANA LUISA SOUSA AZEVEDO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MICHAEL CHESTER, Royal Botanic Gardens; LYDERSON FACIO VICCINI, Universidade Federal de Juiz de Fora.
Título:  Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020
DOI:  https://doi.org/10.1007/s11033-020-05445-z
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Microsatellite primers were developed in Lippia alba complex to better understanding the origins and evolution of the species. We sought to increase the numbers of available simple sequence repeat (SSR) markers. We performed low-coverage (~ twofold) genomic DNA sequencing of a diploid accession and generated a de novo assembly comprising 175,572 contigs. Sixteen SSR loci were selected and of these 13 SSR loci were successfully amplified in 20 L. alba tetraploid accessions and in 12 other Lippia species. Only one SSR locus was monomorphic, whereas 12 loci were polymorphic, yielding one to nine alleles. The heterozygosity was similar among markers, with values of 0.274?0.485; the polymorphism information content values varied from 0.237 to 0.367. These markers were successfully amplified in related species with 85% of transferability on average. Thus, we demonstrate the utility of including a de novo assembly step to obtain SSR markers from low-coverage genomic datasets.
Palavras-Chave:  Simple sequence repeat; SSR.
Thesagro:  Genética; Marcador Genético.
Thesaurus Nal:  Phyla (Verbenaceae); Polyploidy.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
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CNPGL25182 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, J. T. A. de; GONDIM, D. M. F.; CARDOSO, J. E.; VASCONCELOS, I. M. Análise comparativa de compostos constitutivos e enzimas ligadas à defesa vegetal entre os clones de cajueiro CCP 76 e BRS 226, susceptível e resistente, respectivamente, ao fungo Lasiodiplodia Theobromae. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESSO LATINO AMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: anais. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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2.Imagem marcado/desmarcadoLIMA, J. R.; GONDIM, D. M. F.; OLIVEIRA, J. T. A.; GONÇALVES, L. R. B.; VIANA, F. M. P. Use of killer yeast in the management of postharvest papaya anthracnose. Postharvest Biology and Technology, v. 83, p. 58-64, 2013.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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3.Imagem marcado/desmarcadoGONDIM, D. M. F.; TERAO, D.; MIRANDA, A. S. M; VASCONCELOS, I. M.; OLIVEIRA, J. T. A. Benzo-thiadiazole-7-carbothioic Acid S-methyl Ester does not protect melon fruits against Fusarium pallidoroseum infection but induces defence responses in melon seedlings. Journal of Phytopathology, v. 156. n. 10, p. 607-614, 2008.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: Internacional - A
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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4.Imagem marcado/desmarcadoGONDIM, D. M. F.; TERAO, D.; MARTINS-MIRANDA, A. S.; VASCONCELOS, I. M.; OLIVEIRA, J. T. A. Indução de resistência em plantas e frutos de meloeiro var. Orange flesh utilizando-se Acibenzolar-S-methyl. Fitopatologia Brasileira, v. 32, p. 122, ago. 2007. Suplemento. Edição dos Resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia; XL Annual Meeting of the Brazilian Phytopathological Society, Maringá, PR, ago. 2007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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5.Imagem marcado/desmarcadoOLIVEIRA, J. T. A.; BARRETO, A. L. H.; VASCONCELOS, I. M.; ELOY, Y. R. G.; GONDIM, D. M. F.; FERNANDES, C. F.; FREIRE-FILHO, F. R. Role of antioxidant enzymes, hydrogen Peroxide and PR-Proteins in the compatible and incompatible interactions of cowpea (Vigna unguiculata) genotypes with the fungus Colletotrichum gloeosporioides. Journal of Plant Physiology & Pathology, v. 2, n. 3, 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: C - 0
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Rondônia.
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6.Imagem marcado/desmarcadoMARTINS-MIRANDA, A. S.; MONTEIRO JÚNIOR, J. E.; GONDIM, D. M. F.; BARRETO, A. L. H.; FREIRE FILHO, F. R.; VASCONCELOS, I. M.; OLIVEIRA, J. T. A. Benzotiadiazol (BTH) induz atividades das enzimas peroxidase, b-1,3-Glucanase e formação de lignina em feijão-caupi. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 1.; REUNIÃO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 6., 2006, Teresina. Tecnologias para o agronegócio: anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 121).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte.
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7.Imagem marcado/desmarcadoTERAO, D.; OLIVEIRA, S. M. A. de; VIANA, F. M. P.; ALVES, R. E.; ROSSETTI, A. G.; GONDIM, D. M. F. Efeito de 1-metilciclopropeno (1-MCP) combinado à refrigeração no controle de podridão pós-colheita em frutos de melão. In: ANNUAL MEETING INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 49., 2003, Fortaleza. Proceedings... Miami: ISTH, 2003. p.53-57.
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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8.Imagem marcado/desmarcadoTERAO, D.; OLIVEIRA, S. M. A. de; VIANA, F. M. P.; SÁ, C. R. L.; MOURA, R. D.; GONDIM, D. M. F. Manejo da podridão de melão pelo controle do amadurecimento através do 1-mcp, sob duas condições de armazenamento. Summa Phytopathologica, v. 35, n. 2, p. 110-115, 2009.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Semiárido.
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9.Imagem marcado/desmarcadoCIPRIANO, A. K. A. L.; GONDIM, D. M. F.; VASCONCELOS, I. M.; MARTINS, J. A. M.; MOURA, A. A.; MORENO, F. B.; MOREIRA, A. C. O. M.; MELO, J. G. M; CARDOSO, J. E.; PAIVA, A. L. S.; OLIVEIRA, J. T. A. Proteomic analysis of responsive stem proteins of resistant and susceptible cashew plants after Lasiodiplodia theobromae infection. Journal of Proteomics, v. 113, p. 90-109, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical.
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10.Imagem marcado/desmarcadoSALLES, H. O.; VASCONCELOS, I. M.; SANTOS, L. F. L.; OLIVEIRA, H. D.; COSTA, P. P. C.; NASCIMENTO, N. R. F.; SANTOS, C. F.; SOUSA, D. F.; JORGE, A. R. C.; MENEZES, D. B.; MONTEIRO, H. S. A.; GONDIM, D. M. F.; OLIVEIRA, J. T. A. Towards a better understanding of Ipomoea asarifolia toxicity: evidence of the involvement of a leaf lectin. Toxicon, v. 58, p. 502-508, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos.
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