|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Gado de Leite. Para informações adicionais entre em contato com cnpgl.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
11/08/2021 |
Data da última atualização: |
11/08/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LOPES, J. M. L.; MATOS, E. M. de; ZORZATTO, C.; AZEVEDO, A. L. S.; MACHADO, M. A.; CHESTER, M.; VICCINI, L. F. |
Afiliação: |
JULIANA MAINENTI LEAL LOPES, Universidade Federal de Juiz de Fora; ELYABE MONTEIRO DE MATOS, Universidade Federal de Juiz de Fora; CRISTIANE ZORZATTO, Universidade Federal de Juiz de Fora; ANA LUISA SOUSA AZEVEDO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MICHAEL CHESTER, Royal Botanic Gardens; LYDERSON FACIO VICCINI, Universidade Federal de Juiz de Fora. |
Título: |
Development of microsatellite markers for Lippia alba and related Lippia species. |
Ano de publicação: |
2020 |
Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4911-4915, 2020 |
DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-020-05445-z |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Microsatellite primers were developed in Lippia alba complex to better understanding the origins and evolution of the species. We sought to increase the numbers of available simple sequence repeat (SSR) markers. We performed low-coverage (~ twofold) genomic DNA sequencing of a diploid accession and generated a de novo assembly comprising 175,572 contigs. Sixteen SSR loci were selected and of these 13 SSR loci were successfully amplified in 20 L. alba tetraploid accessions and in 12 other Lippia species. Only one SSR locus was monomorphic, whereas 12 loci were polymorphic, yielding one to nine alleles. The heterozygosity was similar among markers, with values of 0.274?0.485; the polymorphism information content values varied from 0.237 to 0.367. These markers were successfully amplified in related species with 85% of transferability on average. Thus, we demonstrate the utility of including a de novo assembly step to obtain SSR markers from low-coverage genomic datasets. |
Palavras-Chave: |
Simple sequence repeat; SSR. |
Thesagro: |
Genética; Marcador Genético. |
Thesaurus Nal: |
Phyla (Verbenaceae); Polyploidy. |
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
Marc: |
null Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 10 | |
1. |  | OLIVEIRA, J. T. A. de; GONDIM, D. M. F.; CARDOSO, J. E.; VASCONCELOS, I. M. Análise comparativa de compostos constitutivos e enzimas ligadas à defesa vegetal entre os clones de cajueiro CCP 76 e BRS 226, susceptível e resistente, respectivamente, ao fungo Lasiodiplodia Theobromae. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESSO LATINO AMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: anais. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
|   |
4. |  | GONDIM, D. M. F.; TERAO, D.; MARTINS-MIRANDA, A. S.; VASCONCELOS, I. M.; OLIVEIRA, J. T. A. Indução de resistência em plantas e frutos de meloeiro var. Orange flesh utilizando-se Acibenzolar-S-methyl. Fitopatologia Brasileira, v. 32, p. 122, ago. 2007. Suplemento. Edição dos Resumos do XL Congresso Brasileiro de Fitopatologia; XL Annual Meeting of the Brazilian Phytopathological Society, Maringá, PR, ago. 2007.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
|    |
5. |  | OLIVEIRA, J. T. A.; BARRETO, A. L. H.; VASCONCELOS, I. M.; ELOY, Y. R. G.; GONDIM, D. M. F.; FERNANDES, C. F.; FREIRE-FILHO, F. R. Role of antioxidant enzymes, hydrogen Peroxide and PR-Proteins in the compatible and incompatible interactions of cowpea (Vigna unguiculata) genotypes with the fungus Colletotrichum gloeosporioides. Journal of Plant Physiology & Pathology, v. 2, n. 3, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Rondônia. |
|    |
6. |  | MARTINS-MIRANDA, A. S.; MONTEIRO JÚNIOR, J. E.; GONDIM, D. M. F.; BARRETO, A. L. H.; FREIRE FILHO, F. R.; VASCONCELOS, I. M.; OLIVEIRA, J. T. A. Benzotiadiazol (BTH) induz atividades das enzimas peroxidase, b-1,3-Glucanase e formação de lignina em feijão-caupi. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 1.; REUNIÃO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 6., 2006, Teresina. Tecnologias para o agronegócio: anais. Teresina: Embrapa Meio-Norte, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Meio-Norte. Documentos, 121).Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
|    |
7. |  | TERAO, D.; OLIVEIRA, S. M. A. de; VIANA, F. M. P.; ALVES, R. E.; ROSSETTI, A. G.; GONDIM, D. M. F. Efeito de 1-metilciclopropeno (1-MCP) combinado à refrigeração no controle de podridão pós-colheita em frutos de melão. In: ANNUAL MEETING INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 49., 2003, Fortaleza. Proceedings... Miami: ISTH, 2003. p.53-57.Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
|   |
8. |  | TERAO, D.; OLIVEIRA, S. M. A. de; VIANA, F. M. P.; SÁ, C. R. L.; MOURA, R. D.; GONDIM, D. M. F. Manejo da podridão de melão pelo controle do amadurecimento através do 1-mcp, sob duas condições de armazenamento. Summa Phytopathologica, v. 35, n. 2, p. 110-115, 2009.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical; Embrapa Semiárido. |
|    |
9. |  | CIPRIANO, A. K. A. L.; GONDIM, D. M. F.; VASCONCELOS, I. M.; MARTINS, J. A. M.; MOURA, A. A.; MORENO, F. B.; MOREIRA, A. C. O. M.; MELO, J. G. M; CARDOSO, J. E.; PAIVA, A. L. S.; OLIVEIRA, J. T. A. Proteomic analysis of responsive stem proteins of resistant and susceptible cashew plants after Lasiodiplodia theobromae infection. Journal of Proteomics, v. 113, p. 90-109, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
|    |
10. |  | SALLES, H. O.; VASCONCELOS, I. M.; SANTOS, L. F. L.; OLIVEIRA, H. D.; COSTA, P. P. C.; NASCIMENTO, N. R. F.; SANTOS, C. F.; SOUSA, D. F.; JORGE, A. R. C.; MENEZES, D. B.; MONTEIRO, H. S. A.; GONDIM, D. M. F.; OLIVEIRA, J. T. A. Towards a better understanding of Ipomoea asarifolia toxicity: evidence of the involvement of a leaf lectin. Toxicon, v. 58, p. 502-508, 2011.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
|    |
Registros recuperados : 10 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|