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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
10/08/2021 |
Data da última atualização: |
10/08/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SILVA, H. T.; LOPES, P. S.; COSTA, C. N.; SILVA, A. A.; SILVA, D. A.; SILVA, F. F.; VERONEZE, R.; THOMPSON, G.; CARVALHEIRA, J. |
Afiliação: |
HUGO TEIXEIRA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; PAULO SÁVIO LOPES, Universidade Federal de Viçosa; CLAUDIO NAPOLIS COSTA, CNPGL; ALESSANDRA ALVES SILVA, Universidade Federal de Viçosa; DELVAN ALVES SILVA, Universidade Federal de Viçosa; FABYANO FONSECA SILVA, Universidade Federal de Viçosa; RENATA VERONEZE, Universidade Federal de Viçosa; GERTRUDE THOMPSON, Universidade do Porto; JÚLIO CARVALHEIRA, Universidade do Porto. |
Título: |
Autoregressive single-step model for genomic evaluation of longitudinal reproductive traits in portuguese holstein cattle. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 138, n. 3, p. 349-359, 2021. |
DOI: |
https://doi.org/10.1111/jbg.12515 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
We investigated the applicability of ssGBLUP methodology under the autoregressive model (H-AR) for genomic evaluation of longitudinal reproductive traits in Portuguese Holstein cattle. The genotype data of 1,230 bulls and 1,645 cows were considered in our study. The reproductive traits evaluated were interval from calving to first service (ICF), calving interval (CI) and daughter pregnancy rate (DPR) measured during the first four parities. Reliability and rank correlation were used to compare the H-AR with the traditional pedigree-based autoregressive models (A-AR). In addition, a validation study was performed considering different scenarios. Higher genomic estimated breeding values (GEBV) reliabilities were obtained for genotyped bulls when evaluated under the H-AR model, with emphasis on bulls with less than 9 daughters. For this group, the averages of GEBV reliabilities corresponded to 0.62, 0.69 and 0.62 for ICF, CI and DPR, respectively, while the averages obtained by the A-AR model were 0.27, 0.15 and 0.16. The validation study was favourable to H-AR. The best results were observed in the scenario where genotyped cows were combined with contributing bulls (genotyped bulls with daughter or relationship information in the population). Overall, the results suggest that ssGBLUP methodology under the autoregressive model is a feasible and applicable approach to be used in genomic analyses of longitudinal reproductive traits in Portuguese Holstein cattle. |
Palavras-Chave: |
Autorregressão; Avaliação genômica; Previsão genômica; SsGBLUP. |
Thesagro: |
Bovino; Gado Leiteiro. |
Categoria do assunto: |
-- |
Marc: |
LEADER 02394naa a2200301 a 4500 001 2133407 005 2021-08-10 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1111/jbg.12515$2DOI 100 1 $aSILVA, H. T. 245 $aAutoregressive single-step model for genomic evaluation of longitudinal reproductive traits in portuguese holstein cattle.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aWe investigated the applicability of ssGBLUP methodology under the autoregressive model (H-AR) for genomic evaluation of longitudinal reproductive traits in Portuguese Holstein cattle. The genotype data of 1,230 bulls and 1,645 cows were considered in our study. The reproductive traits evaluated were interval from calving to first service (ICF), calving interval (CI) and daughter pregnancy rate (DPR) measured during the first four parities. Reliability and rank correlation were used to compare the H-AR with the traditional pedigree-based autoregressive models (A-AR). In addition, a validation study was performed considering different scenarios. Higher genomic estimated breeding values (GEBV) reliabilities were obtained for genotyped bulls when evaluated under the H-AR model, with emphasis on bulls with less than 9 daughters. For this group, the averages of GEBV reliabilities corresponded to 0.62, 0.69 and 0.62 for ICF, CI and DPR, respectively, while the averages obtained by the A-AR model were 0.27, 0.15 and 0.16. The validation study was favourable to H-AR. The best results were observed in the scenario where genotyped cows were combined with contributing bulls (genotyped bulls with daughter or relationship information in the population). Overall, the results suggest that ssGBLUP methodology under the autoregressive model is a feasible and applicable approach to be used in genomic analyses of longitudinal reproductive traits in Portuguese Holstein cattle. 650 $aBovino 650 $aGado Leiteiro 653 $aAutorregressão 653 $aAvaliação genômica 653 $aPrevisão genômica 653 $aSsGBLUP 700 1 $aLOPES, P. S. 700 1 $aCOSTA, C. N. 700 1 $aSILVA, A. A. 700 1 $aSILVA, D. A. 700 1 $aSILVA, F. F. 700 1 $aVERONEZE, R. 700 1 $aTHOMPSON, G. 700 1 $aCARVALHEIRA, J. 773 $tJournal of Animal Breeding and Genetics$gv. 138, n. 3, p. 349-359, 2021.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Registros recuperados : 3 | |
1. |  | FAVORETO, C. M.; SAAB, S. C.; MILORI, D. M. B. P.; ROSA, J. A.; BRINATTI, A. M.; GONÇALVES, D.; LEITE, W. C. Determinação da humificação da matéria orgânica de um latossolo e de suas frações organo-minerais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado, RS. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. Livro de resumos... Porto Alegre: SBCS, 2007. p. 346Tipo: Resumo em Anais de Congresso | Circulação/Nível: -- - -- |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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2. |  | FAVORETTO, C. M.; GONCALVES, D.; MILORI, D. M. B. P.; ROSA, J. A.; LEITE, W. C.; BRINATTI, A. M.; SAAB, S. da C. Determinação da humificação da matéria orgânica de um latossolo e de suas frações organo-minerais. Química Nova, São Paulo, v. 31, n. 8, p. 1994-1996, 2008.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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3. |  | FAVORETTO, C. M.; SAAB, S. C.; MILORI, D. M. B. P.; ROSA, J. A.; BRINATTI, A. M.; GONÇALVES, D.; LEITE, W. C. Determinação da humificação da matéria orgânica de um latossolo e de suas frações organo-minerais. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 31., 2007, Gramado, RS. Conquistas e desafios da ciência do solo brasileira. Anais... Porto Alegre: SBCS, 2007. não paginado. 1 CD-ROM.Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
Biblioteca(s): Embrapa Instrumentação. |
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Registros recuperados : 3 | |
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