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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia. |
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Data corrente: |
09/06/2021 |
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Data da última atualização: |
09/11/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PESSOA, D. D. V.; SANTOS, C. M. dos; VIDAL, M. S.; BALDANI, J. I.; TADRA-SFEIR, M. Z.; SOUZA, E. M. de; ARAUJO, J. L. S. de. |
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Afiliação: |
DANIELLA DUARTE VILLARINHO PESSOA, UFRRJ; CARLOS MAGNO DOS SANTOS, UFRRJ; MARCIA SOARES VIDAL, CNPAB; JOSE IVO BALDANI, CNPAB; MICHELLE ZIBETTI TADRA-SFEIR, UFPR; EMANUEL MALTEMPI DE SOUZA, UFPR; JEAN LUIZ SIMOES DE ARAUJO, CNPAB. |
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Título: |
Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 expression profile in response to sugarcane apoplastic fluid. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
3 Biotech, v. 11, Article number 292, 2021. |
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ISSN: |
2190-5738 |
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DOI: |
10.1007/s13205-021-02848-y |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Bacterial transcriptome profiling in the presence of plant fluids or extracts during microbial growth may provide relevant information on plant?bacteria interactions. Here, RNA sequencing (RNA-Seq) was used to determine the transcriptomic profile of Herbaspirillum seropedicae strain HRC54 at the early stages of response to sugarcane apoplastic fluid. Differentially expressed gene (DEG) analysis was performed using the DESeq2 and edgeR packages, followed by functional annotation using Blast2GO and gene ontology enrichment analysis using the COG and KEGG databases. After 2 h of sugarcane apoplastic fluid addition to the H. seropedicae HRC54 culture, respectively, 44 and 45 genes were upregulated and downregulated. These genes were enriched in bacterial metabolism (e.g., oxidoreductase and transferase), ABC transporters, motility, secretion systems, and signal transduction. RNA-Seq expression profiles of 12 genes identified in data analyses were verified by RT-qPCR. The results suggested that H. seropedicae HRC54 recognized sugarcane apoplastic fluid as the host signal, and some DEGs were closely involved at the early stages of the establishment of plant?bacteria interactions. |
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Palavras-Chave: |
Plant bacteria interactions. |
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Thesaurus Nal: |
Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agrobiologia (CNPAB) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | BEZERRA, L. A.; MONTEIRO JÚNIOR, A. L.; CARDOSO, N. R. P.; MAUES, M. M. Efeito da polinização assistida no dendê (Elaeis Guineensis Jacq). In: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 13., 2015, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Universidade Federal Rural da Amazônia, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 2. | | FRÓES JÚNIOR, P. S. M.; CARDOSO, N. R. P.; REBELLO, F. K.; HOMMA, A. K. O.; LOPES, M. L. B. Aspectos da produção, comercialização e desenvolvimento da cultura da pitaya no estado do Pará. Enciclopédia Biosfera, v. 16, n. 29, p. 264-279, 2019.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 3. | | BEZERRA, L. A.; MONTEIRO JUNIOR, A. L.; CARDOSO, N. R. P.; BRITO, T. F.; MAUES, M. M. Polinizadores associados as inflorescências femininas da palma de óleo e híbrido interespecífico (HIE) BRS Manicoré em Moju, PA, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 26.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 9., 2016, Maceió. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 264.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 4. | | MONTEIRO JÚNIOR, A. L.; BEZERRA, L. A.; CARDOSO, N. R. P.; BRITO, T. F.; MAUÉS, M. M. Variação temporal de curculionídeos emergidos de inflorescências masculinas do dendê e híbrido interespecífico (HIE) BRS Manicoré em Moju, PA, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 26.; CONGRESSO LATINO-AMERICANO DE ENTOMOLOGIA, 9., 2016, Maceió. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 264.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | FUJIYAMA, B. S.; SILVA, A. R. B. e; SILVA JÚNIOR, M. L. da; CARDOSO, N. R. P.; FONSECA, A. B. da; VIANA, R. G.; SAMPAIO, L. S. Boron fertilization enhances photosynthesis and water use efficiency in soybean at vegetative growth stage. Journal of Plant Nutrition, v. 42, n. 19, p. 2498-2506, 2019.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | REBELLO, F. K.; CARDOSO, N. R. P.; HOMMA, A. K. O.; SANTOS, M. A. S. dos; JESUS, A. P. M. de. Frutas potenciais da Amazônia: análise da preferência dos consumidores no município de Belém, estado do Pará. Revista Orbis Latina, v. 12, n. 3, p. 177-196, jul./dez. 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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