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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
07/04/2021 |
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Data da última atualização: |
07/04/2021 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SADER, M.; VAIO, M.; SANTOS, L. A. C.; DORNELAS, M. C.; VIEIRA, M. L. C.; MELO, N. F. de; PEDROSA-HARAND, A. |
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Afiliação: |
MARIELA SADER; MAGDALENA VAIO; LUIZ AUGUSTO CAUZ SANTOS; MARCELO CARNIER DORNELAS; MARIA LUCIA CARNEIRO VIEIRA; NATONIEL FRANKLIN DE MELO, CPATSA; ANDREA PEDROSA-HARAND. |
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Título: |
Large vs small genomes in Passiflora: the influence of the mobilome and the satellitome. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Planta, v. 253, n. 4, 2021. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s00425-021-03598-0 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Repetitive sequences are ubiquitous and fast-evolving elements responsible for size variation and large-scale organization of plant genomes. Within Passifora genus, a tenfold variation in genome size, not attributed to polyploidy, is known. Here, we applied a combined in silico and cytological approach to study the organization and diversifcation of repetitive elements in three species of this genus representing its known range in genome size variation. Sequences were classifed in terms of type and repetitiveness and the most abundant were mapped to chromosomes. We identifed long terminal repeat (LTR) retrotransposons as the most abundant elements in the three genomes, showing a considerable variation among species. Satellite DNAs (satDNAs) were less representative, but highly diverse between subgenera. Our results clearly confrm that the largest genome species (Passifora quadrangularis) presents a higher accumulation of repetitive DNA sequences, specially Angela and Tekay elements, making up most of its genome. Passifora cincinnata, with intermediate genome and from the same subgenus, showed similarity with P. quadrangularis regarding the families of repetitive DNA sequences, but in diferent proportions. On the other hand, Passifora organensis, the smallest genome, from a diferent subgenus, presented greater diversity and the highest proportion of satDNA. Altogether, our data indicates that while large genomes evolved by an accumulation of retrotransposons, the smallest genome known for the genus has evolved by diversifcation of diferent repeat types, particularly satDNAs. MenosRepetitive sequences are ubiquitous and fast-evolving elements responsible for size variation and large-scale organization of plant genomes. Within Passifora genus, a tenfold variation in genome size, not attributed to polyploidy, is known. Here, we applied a combined in silico and cytological approach to study the organization and diversifcation of repetitive elements in three species of this genus representing its known range in genome size variation. Sequences were classifed in terms of type and repetitiveness and the most abundant were mapped to chromosomes. We identifed long terminal repeat (LTR) retrotransposons as the most abundant elements in the three genomes, showing a considerable variation among species. Satellite DNAs (satDNAs) were less representative, but highly diverse between subgenera. Our results clearly confrm that the largest genome species (Passifora quadrangularis) presents a higher accumulation of repetitive DNA sequences, specially Angela and Tekay elements, making up most of its genome. Passifora cincinnata, with intermediate genome and from the same subgenus, showed similarity with P. quadrangularis regarding the families of repetitive DNA sequences, but in diferent proportions. On the other hand, Passifora organensis, the smallest genome, from a diferent subgenus, presented greater diversity and the highest proportion of satDNA. Altogether, our data indicates that while large genomes evolved by an accumulation of retrotransposons, the smallest gen... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Escumação do genma; Evolução cromossmica; SatDNA. |
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Thesagro: |
Genoma; Maracujá; Passiflora Edulis. |
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Thesaurus Nal: |
Passion fruits; Retrotransposons. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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520 $aRepetitive sequences are ubiquitous and fast-evolving elements responsible for size variation and large-scale organization of plant genomes. Within Passifora genus, a tenfold variation in genome size, not attributed to polyploidy, is known. Here, we applied a combined in silico and cytological approach to study the organization and diversifcation of repetitive elements in three species of this genus representing its known range in genome size variation. Sequences were classifed in terms of type and repetitiveness and the most abundant were mapped to chromosomes. We identifed long terminal repeat (LTR) retrotransposons as the most abundant elements in the three genomes, showing a considerable variation among species. Satellite DNAs (satDNAs) were less representative, but highly diverse between subgenera. Our results clearly confrm that the largest genome species (Passifora quadrangularis) presents a higher accumulation of repetitive DNA sequences, specially Angela and Tekay elements, making up most of its genome. Passifora cincinnata, with intermediate genome and from the same subgenus, showed similarity with P. quadrangularis regarding the families of repetitive DNA sequences, but in diferent proportions. On the other hand, Passifora organensis, the smallest genome, from a diferent subgenus, presented greater diversity and the highest proportion of satDNA. Altogether, our data indicates that while large genomes evolved by an accumulation of retrotransposons, the smallest genome known for the genus has evolved by diversifcation of diferent repeat types, particularly satDNAs.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 48 | |
| 2. |  | SANTANA, T. C. J.; FERNANDES, C. de F.; SILVA, A. G.; SILVA, D. S. G. da; FACUNDO, V. A. Atividade antifúngica do óleo essencial de citronela (Cymbopogon nardus) sobre Thanatephorus cucumeris e Fusarium oxysporum in vitro. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 31, p. S208, ago. 2006. Suplemento. Resumo 0348. Trabalho apresentado no 39. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 3. | | BRAGA, A. G. S.; BARBIERI, F. da S.; BRITO, L. G.; CELESTINO, C. O.; COSTA, T. S.; FACUNDO, V. A. Atividade pesticida de extratos de Piper tuberculatum jacq sobre Haematobia irritans L. Biota Amazônia, v. 7, n. 1, p. 54-57, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 4. | | LIMA, R. A.; SANTOS, M. R. A. dos; SILVA, A. G.; TEIXEIRA, C. A. D.; FACUNDO, V. A. Atividade de repelência do extrato acetônico de raízes de Piper hispidum H.B.K. sobre Hypothenemus hampei Ferrari. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESSO LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: anais. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008. 1 CD-ROM. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 5. | | LIMA, R. A.; SANTOS, M. R. A. dos; SILVA, A. G.; TEIXEIRA, C. A. D.; FACUNDO, V. A. Atividade repelente do extrato acetônico das folhas de Piper hispidum H.P.K. sobre Hypothenemus hampei Ferrari. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 59.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 31.; CONGRESSO LATINOAMERICANO Y DEL CARIBE DE CACTÁCEAS Y OTRAS SUCULENTAS, 4.; CONGRESS OF INTERNATIONAL ORGANIZATION FOR SUCULENT PLANT STUDY, 30., 2008, Natal. Atualidades, desafios e perspectivas da botânica no Brasil: anais. Natal: UFERSA: UFRN: SBB, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 6. | | SILVA, A. G.; SANTOS, M. R. A. dos; FERNANDES, C. de F.; LIMA, R. A; FACUNDO, V. A. Atividade fungicida do óleo essencial de Hedychium coronarium J. Koening sobre Thanatephorus cucumeris e Fusarium oxysporium in vitro. Fitopatologia Brasileira, Brasília, DF, v. 31, p. S218, ago. 2006. Suplemento. Resumo 0385. Trabalho apresentado no 39. Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2006, Salvador.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | SANTOS, M. R. A. dos; LIMA, R. A.; FERNANDES, C. de F.; SILVA, A. G.; FACUNDO, V. A. Atividade fungicida do óleo essencial de Piper marginatum L. (PIPERACEAE) sobre Fusarium oxysporum (SCHLECHT) in vitro. Separata de: Saúde e Pesquisa, Maringá, v. 4, n. 1, p. 09-14, jan./abr. 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 8. | | LIMA, R. A.; SILVA, A. G.; SANTOS, M. R. A. dos; TEIXEIRA, C. A. D.; FACUNDO, V. A. Atividade inseticida do óleo essencial de folhas de Schinus terebinthifolius RADDI (família: Anacardiaceae) sobre Hypothenemus hampei Ferrari (Coleoptera: Scolytidae). In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA DA EMBRAPA RONDÔNIA, 1., 2010, Porto Velho. Anais... Porto Velho: Embrapa Rondônia, 2010. p. 29. (Embrapa Rondônia. Documentos, 140).| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 10. | | SANTOS, M. R. A. dos; LIMA, R. A.; FERNANDES, C. de F.; BRAGA, A. G. S. B.; FACUNDO, V. A. Antifungal activity of Hedychium coronarium J. König essential oil against Fusarium oxysporum Schlecht and Thanatephorus cucumeris (A.B. Frank) Donk in vitro. Ciência e Natura, Santa Maria, v. 36, Ed. Especial II, p. 683-687, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 11. | | RAMOS, M. B.; LACERDA, C. L.; BEZERRA, W. S. M.; BARBIERI, F. da S.; FACUNDO, V. A.; BRITO, L. G. Efeito pesticida de extratos de Piper aduncum em adultos de Haematobia irritans. Pesticide effect of piper aduncum extracts in adult haematobia irritans. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 19; NOVEL APPROACHES TO THE CONTROL OF HELMINTH PARASITES OF LIVESTOCK, 8, 2016, Belém, PA. Anais... Jaboticabal: CBPV, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 12. | | LIMA, R. A.; SANTOS, M. R. A. dos; SILVA, A. G.; FERNANDES, C. de F.; FACUNDO, V. A. Efeito in vitro de óleos essenciais de plantas medicinais utilizadas no controle de Fusarium oxysporum. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 60.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 32.; ERBOT - ENCONTRO REGIONAL DE BOTÂNICOS - MG, BA , ES, 29., 2009, Feira de Santana. Botânica brasileira: futuro e compromissos. Feira de Santana: SBB: UEFS, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 13. | | LIMA, R. A.; SANTOS, M. R. A. dos; SILVA, A. G.; FERRER HERNANDÉZ, A. E.; FACUNDO, V. A. Composição química do óleo essencial das folhas de Schinus terebinthifolius Raddi. In: CONGRESSO NACIONAL DE BOTÂNICA, 60.; REUNIÃO NORDESTINA DE BOTÂNICA, 32.; ERBOT - ENCONTRO REGIONAL DE BOTÂNICOS - MG, BA , ES, 29., 2009, Feira de Santana. Botânica brasileira: futuro e compromissos. Feira de Santana: SBB: UEFS, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 14. | | LACERDA, C. L.; RAMOS, M. B.; BEZERRA, W. S. M.; BARBIERI, F. da S.; FACUNDO, V. A.; BRITO, L. G. Efeito acaricida de extratos de piper aduncun em larvas de rhipicephalus microplus.Acaricida effect of extractus piper aduncum in larvae of rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 19.; NOVEL APPROACHES TO THE CONTROL OF HELMINTH PARASITES OF LIVESTOCK, 8., 2016, Belém, PA. Anais... Jaboticabal: CBPV, 2016.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 15. | | SALLET, L. A. P.; TEIXEIRA, C. A. D.; LIMA, D. K. S.; GAMA, F. de C.; FACUNDO, V. A.; COSTA, J. N. M. Ação biocida do extrato etanólico de frutos de Piper tuberculatum (JACQ) sobre Hypothenemus hampei (FERRARI). In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 10., 2007, Brasília, DF. Inovar para preservar a vida. Resumos... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007. 1 CD ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 16. | | REIS, N. D.; TAGLIANI, L. A. A.; FERNANDES, C. de F.; VIEIRA JUNIOR, J. R.; SANTOS, M. R. A. dos; FERNANDES, C. F. C.; FACUNDO, V. A. Atividade antibacteriana do óleo essencial de Schinus terebinthifolius Raddi. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO À PESQUISA E EXTENSÃO DA FIMCA, 1, 2008, Porto Velho. [Resumos...]. Porto Velho: FIMCA, 2008. Versão eletrônica.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 17. | | REIS, N. D.; VIEIRA JÚNIOR, J. R.; FERNANDES, C. de F.; ANTUNES JÚNIOR, H.; PACIULLO, D. S. C.; SANTOS, M. R. A. dos; FACUNDO, V. A. Atividade antifúngica do óleo essencial de Piper permucronatum no controle da ferrugem do cafeeiro in vitro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 12., 2009, Fortaleza. Desafios para produção de alimentos e bioenergia. Fortaleza: SBFV: UFC: Embrapa Agroindústria Tropical, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 18. | | BARBIERI, F. da S.; CELESTINO, C. O.; BRITO, L. G.; BRAGA, A. G. S.; LACERDA, G. L.; RAMOS, M. B.; FACUNDO, V. A. Avaliação da atividade acaricida de extratos de folhas de piper tuberculatum em larvas de rhipicephalus microplus. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 19; NOVEL APPROACHES TO THE CONTROL OF HELMINTH PARASITES OF LIVESTOCK, 8, 2016, Belém, PA. Anais... Jaboticabal: CBPV, 2016| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 19. | | BARBIERI, F. da S.; BRAGA, A. G. S.; BRITO, L. G.; CELESTINO, C. O.; RAMOS, M. B.; LACERDA, C. L.; CAMPOS, E.; FACUNDO, V. A. Atividade inseticida de diferentes extratos de piper tuberculatum JACQ sobre adultos de haematobia irritans L. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA, 19; NOVEL APPROACHES TO THE CONTROL OF HELMINTH PARASITES OF LIVESTOCK, 8, 2016, Belém, PA. Anais... Jaboticabal: CBPV, 2016| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 20. | | SALLET, L. A. P.; TEIXEIRA, C. A. D.; LIMA, D. K. S.; GAMA, F. de C.; FACUNDO, V. A.; COSTA, J. N. M. Atividade inseticida de extrato etanólico de frutos de Piper tuberculatum Jacq sobre Hypothenemus hampei Ferrari. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE PESQUISAS CAFEEIRAS, 32., 2006, Poços de Caldas, MG. Trabalhos apresentados. Poços de Caldas, MG: Ministério da Agricultura e Pecuária, SARC/PROCAFÉ, 2006. p. 285.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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