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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
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Data corrente: |
17/12/2020 |
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Data da última atualização: |
17/12/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
LAGOS, E. B. |
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Afiliação: |
ESSAMAI BRIZOLA LAGO, UEPG. |
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Título: |
Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores únicos e múltiplos. 2020. 116 f. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
2020. |
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Páginas: |
116 f. |
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Descrição Física: |
Dissertação (Mestrado em Zootecnia) - Universidade Estadual de Ponta Grossa, Ponta Grossa, PR. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Coorientação Mônica Corrêa Ledur |
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Conteúdo: |
Resumo: Existem vários defeitos congênitos que afetam a suinocultura mundial, dentre elas a criptorquidia, pernas abertas, tremor congênito, intersexualidade, atresia anal e hérnias. A hérnia umbilical (HU) é um dos defeitos congênitos mais comuns em suínos, ocasionado pela protusão do conteúdo intestinal pelo canal umbilical. A presença de hérnias causa prejuízos ao bem-estar dos animais e pode ocasionar perdas econômicas devido ao menor crescimento e pior conversão alimentar. Além disto, as hérnias também podem gerar danos no momento do abate, contaminando a carcaça caso ocorra o rompimento das alças intestinais. A etiologia deste defeito congênito é multifatorial, envolvendo dentre eles fatores genéticos, existentes em diferentes raças suínas. Por isto, é importante para a indústria suinícola, a identificação de marcadores no genoma suíno que possam estar relacionados a hérnia umbilical e, possam ser utilizados no processo de seleção de progenitores, evitando a ocorrência da anomalia. O desenvolvimento de tecnologias de sequenciamento de nova geração levou a identificação de muitos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), tornando possível estudos de análise de associação genômica ampla (GWAS), que envolvem milhares de variantes em todo o genoma, utilizadas para identificar as associadas com características de interesse. Para este tipo de estudo, várias metodologias podem ser utilizadas, entre elas a de único marcador que avalia o efeito individual de cada SNP e a de múltiplos marcadores, que analisa os haplótipos. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi avaliar regiões genômicas associadas ao desenvolvimento de hérnia umbilical em suíno por meio de duas metodologias estatísticas, utilizando único e múltiplos marcadores. Foram avaliados e genotipados 325 animais (92 casos e 233 controles) advindos de granjas de Santa Catarina, sendo híbridos da genética Agroceres Pic®, utilizando GGP Porcine Bead Chip (Neogen, Lincon, NE, EUA). Foram encontrados 10 SNPs significativos pela análise de único marcador contando com 23 transcritos de conhecimento biológico na extensão das regiões. Com a análise de múltiplos marcadores foram observados 401 SNPs distribuídos em 51 regiões do genoma contando com 116 transcritos conhecidos. Os processos biológicos significativamente associados a estes genes foram aqueles relacionados ao desenvolvimento da musculatura esquelética, a ocorrência da angiogênese, bem como o recrutamento de citocinas para combate inflamatório e cicatrização umbilical. De acordo com nossos resultados foram considerados fortes candidatos ao desenvolvimento de hérnia umbilical em suínos segundo a metodologia utilizando único marcador, os genes MTM1 e MTMR1, segundo a metodologia de múltiplos marcadores, os genes EP300, MSTN e EYA2, e por ambas as metodologias os genes GJA5, BCL9, ACP6 e WARS2. Assim, pôde-se conhecer melhor os fatores genéticos associados a hérnia umbilical, demonstrando que genes relacionados ao desenvolvimento da musculatura esquelética, e processos ligados a matriz extracelular e ao sistema imune, podem estar intimamente relacionados a distúrbios que levam a predisposição da ocorrência de hérnia umbilical em suínos comerciais. MenosResumo: Existem vários defeitos congênitos que afetam a suinocultura mundial, dentre elas a criptorquidia, pernas abertas, tremor congênito, intersexualidade, atresia anal e hérnias. A hérnia umbilical (HU) é um dos defeitos congênitos mais comuns em suínos, ocasionado pela protusão do conteúdo intestinal pelo canal umbilical. A presença de hérnias causa prejuízos ao bem-estar dos animais e pode ocasionar perdas econômicas devido ao menor crescimento e pior conversão alimentar. Além disto, as hérnias também podem gerar danos no momento do abate, contaminando a carcaça caso ocorra o rompimento das alças intestinais. A etiologia deste defeito congênito é multifatorial, envolvendo dentre eles fatores genéticos, existentes em diferentes raças suínas. Por isto, é importante para a indústria suinícola, a identificação de marcadores no genoma suíno que possam estar relacionados a hérnia umbilical e, possam ser utilizados no processo de seleção de progenitores, evitando a ocorrência da anomalia. O desenvolvimento de tecnologias de sequenciamento de nova geração levou a identificação de muitos polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), tornando possível estudos de análise de associação genômica ampla (GWAS), que envolvem milhares de variantes em todo o genoma, utilizadas para identificar as associadas com características de interesse. Para este tipo de estudo, várias metodologias podem ser utilizadas, entre elas a de único marcador que avalia o efeito individual de cada SNP e a de mú... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Defeito congênito; Genômica. |
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Thesagro: |
Genética Animal; Marcador Genético; Suinocultura. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
null
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Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
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Registro |
Volume |
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URL |
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| Registros recuperados : 7 | |
| 1. |  | SILVA FILHO, G. N.; VIDOR, C. Atividade de microrganismos solubilizadores de fosfatos na presença de nitrogênio, ferro, cálcio e potássio. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 36, n. 12, p. 1495-1508, dez. 2001 Título em inglês: Phosphate solubilizing activity of microorganisms in the presence of nitrogen, iron, calcium and potassium.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 2. | | SILVA FILHO, G. N.; NARLOCH, C.; SHART, R. Solubilização de fosfatos naturais por microrganismos isolados de cultivos de Pinus e Eucalyptus de Santa Catarina. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 37, n. 6, p. 847-854, jun. 2002 Título em inglês: Solubilization of natural phosphates by microorganisms isolated from Pinus and Eucalyptus plantations in Santa Catarina, Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | NARLOCH, C.; OLIVERIA, V. L. de; ANJOS, J. T. dos; SILVA FILHO, G. N. Respostas da cultura do rabanete à inoculação de fungos solubilizadores de fosfatos. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 37, n. 6, p. 841-845, jun. 2002 Título em inglês: Responses of radish culture to phosphate-solubilizing fungi.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | SOUZA, L. A. B. de; BONNASSIS, P. A. P.; SILVA FILHO, G. N.; OLIVEIRA, V. L. de. New isolates of ectomycorrhizal fungi and the growth of eucalypt. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 2, p. 235-241, fev. 2008 Título em português: Novos isolados de fungos ectomicorrízicos e o crescimento de eucalipto.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | COSTA, N. de L.; SILVA FILHO, G. N.; SENA, J. O. A. de; RODRIGUES, A. N. A.; ANGHINONI, I. Mecanismos de suprimento e eficiencia de absorcao de potassio em soja, milho, milheto, colza e lab-lab. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.23, n.5, p.463-468, maio 1988.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Rondônia. |
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| 7. | | COSTA, N. de L.; SILVA FILHO, G. N.; SENA, J. O. A. de; RODRIGUES, N. A.; ANGHINONI, I. Mecanismo de Suprimento e Eficiência de Absorção de Potássio em Soja, Milho, Milheto, Colza e Lab-Lab. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.23, n.5, p. 463-468, maio 1988| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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