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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
07/08/2020 |
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Data da última atualização: |
27/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. |
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Afiliação: |
Daniele Heloisa Pinheiro; Raquel Oliveira Moreira, UNESP; Natalia Alves Leite, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Ana Carolina Redoan; Andre da Silva Xavier, Universidade Federal do Espírito Santo; BEATRIZ DE ALMEIDA BARROS, CNPMS; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS. |
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Título: |
Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020. |
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DOI: |
10.1007/s11033-020-05550-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. MenosThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the develop... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Gene; Inseto; Percevejo; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
LEADER 02446naa a2200253 a 4500 001 2124236 005 2020-10-27 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11033-020-05550-z$2DOI 100 1 $aPINHEIRO, D. H. 245 $aSuitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera$bPentatomidae).$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. 650 $aGene 650 $aInseto 650 $aPercevejo 650 $aSeleção Genética 700 1 $aMOREIRA, R. O. 700 1 $aLEITE, N. A. 700 1 $aREDOAN, A. C. 700 1 $aXAVIER, A. da S. 700 1 $aBARROS, B. de A. 700 1 $aCARNEIRO, N. P. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 47, p. 4989-5000, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
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| Registros recuperados : 47 | |
| 2. |  | MENDES, R.; NUNES, C. C.; LIMA, F. V. de; SILVA, V. C. da; ALVES, S. A. M. Efeito da temperatura na produção de conídios e peritécios de Neonectria ditissima em ramos destacados de macieira. In: ENCONTRO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA UVA E VINHO, 12., ENCONTRO DE PÓS-GRADUANDOS DA EMBRAPA UVA E VINHO, 8., 2014, Bento Gonçalves. Resumos... Bento Gonçalves: Embrapa Uva e Vinho, 2014. p. 22| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 7. |  | ARAÚJO, W. P.; PEREIRA, J. R.; LIMA, F. V. de; ARAÚJO, V. L.; CARVALHO JUNIOR, G. S.; ALEXANDRIA JÚNIOR, F. F. de. Adubação do algodoeiro herbáceo colorido BRS Rubi em sistema agroecológico com esterco bovino no município de Itaporanga, PB. 1. Características agronômicas. Agropecuária Técnica, v. 32, n. 1, p. 88-94, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 8. |  | PEREIRA, J. R.; ARAÚJO, W. P.; LIMA, F. V. de; ARAÚJO, V. L.; CARVALHO JUNIOR, G. S.; ALEXANDRIA, A. G. L. Adubação do algodoeiro herbáceo colorido BRS Rubi em sistema agroecológico com esterco bovino no município de Itaporanga, PB. 2. Características tecnológicas das fibras. Agropecuária Técnica, v. 32, n. 1, p. 95-101, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 9. |  | ALEXANDRIA JUNIOR, F. F. de; PEREIRA, J. R.; ARAÚJO, W. P.; FERREIRA, M. M. M.; LEITE, A. G.; LIMA, F. V. de. Análise foliar como ferramenta de avaliação do estado nutricional do algodoeiro herbáceo colorido BRS rubi adubado com esterco bovino como fonte de nutrientes. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 8.; COTTON EXPO, 1., 2011, São Paulo. Evolução da cadeia para construção de um setor forte: Anais. Campina Grande, PB: Embrapa Algodão, 2011. p.1503-1507| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 10. |  | LIMA, F. V. de; PEREIRA, J. R.; ALMEIDA, E. S. A. B. de; ARAÚJO, V. L.; ARAÚJO, W. P.; SOUZA JUNIOR, S. P. de. Avaliação sazonal do estado nutricional do algodoeiro herbáceo colorido BRS RubI. Revista Brasileira de Ciências Agrárias, v.9, n.4, p.500-505, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 11. |  | CARVALHO JÚNIOR, G. S.; PEREIRA, J. R.; CASTRO, M. A. do N.; QUESADO, F. das C.; ABDALA, C. S.; LIMA, F. V. de; ARAÚJO, W. P. Crescimento e desenvolvimento da mamona BRS energia em diferentes lâminas de irrigação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MAMONA, 4.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE OLEAGINOSAS ENERGÉTICAS, 1., 2010, João Pessoa. Inclusão social e energia: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 12. |  | ARAÚJO, W. P.; PEREIRA, J. R.; ALMEIDA, E. S. A. B. de; ARAÚJO, V. L.; LIMA, F. V. de; CORDÃO SOBRINHO, F. P. Componentes da fibra de cultivares de algodoeiro herbáceo sob lâminas de água. Revista Educação Agrícola Superior, v. 28, n. 1, p.78-81, 2013.| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 13. |  | LIMA, F. V. de; PEREIRA, J. R.; ARAÚJO, W. P.; ARAÚJO, V. L.; ALMEIDA, E. S. A. de; LEITE, A. G. Definição de espaçamentos para o gergelim irrigado. Educação Agrícola Superior, v.26, n.1, p.10-16, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 14. |  | AGUILA, J. S. D.; GAZZOLA, A. E.; LIMA, F. V. de; ORTEGA, E. M. M.; AGUILA, L. S. H. D.; KLUGE, R. A. Dois métodos de avaliação de firmeza de manga 'tommy atkins' tratada ou não com diferentes concentrações de etileno exógeno. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA PARA O PROGRESSO DA CIÊNCIA, 63., 2011, Goiânia. Anais... Goiânia-GO: SBPC, 2011. v. 1. p. 1-2.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 16. |  | PEREIRA, J. R.; ARAÚJO, W. P.; FERREIRA, M. M. M.; LIMA, F. V. de; ARAÚJO, V. L.; SILVA, M. N. B. da. Doses de esterco bovino nas características agronômicas e de fibras do algodoeiro herbáceo BRS Rubi. Agro@mbiente On-line, v. 6, n. 3, p. 195-204, set./dez. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 17. |  | PEREIRA, J. R.; ALBUQUERQUE, F. A. de; OLIVEIRA, G. dos S.; SANTOS, J. W. dos; ARAÚJO, W. P.; LIMA, F. V. de; CARVALHO JÚNIOR, G. S. Entomofauna de dois sistemas de manejo do algodoeiro colorido BRS 200 semiperene. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 7., 2009, Foz do Iguaçu. Sustentabilidade da cotonicultura brasileira e expansão dos mercados: anais. Campina Grande: Embrapa Algodão, 2009. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 18. |  | ALEXANDRIA JÚNIOR, F. F. de; ARAÚJO, W. P.; LEITE, A. G.; ARAÚJO, V. L.; LIMA, F. V. de; PEREIRA, J. R. Fitotoxicidade do herbicida glifosato em enfra doses na mamoneira (RICINUS COMMUNIS L.) cultivar BRS ENERGIA. Educação Agrícola Superior, v.26, n.1, p.30-35, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 19. |  | ARAÚJO, V. L.; ARAÚJO, W. P.; LIMA, F. V. de; LEITE, A. G.; PEREIRA, J. R.; BELTRAO, N. E. de M. Fontes de matéria orgânica e períodos de incubação na mamoneira BRS Energia. Educação Agrícola Superior, v. 27, n.1, p. 35-38, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
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| 20. |  | AGUILA, J. S. D.; SILVA, M. M. da; LIMA, F. V. de; ORTEGA, E. M. M.; AGUILA, L. S. H. D.; KLUGE, R. A. Qualidade de manga 'tommy atkins' tratada ou não com diferentes tempos de aplicação de etileno exógeno. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE PÓS-COLHEITA DE FRUTAS, HORTALIÇAS E FLORES, 3., 2011, Nova Friburgo. Anais... Nova Friburgo-RJ: Embrapa, 2011. p. 748-751.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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