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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Milho e Sorgo. Para informações adicionais entre em contato com rosangela.lacerda@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
07/08/2020 |
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Data da última atualização: |
27/10/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
PINHEIRO, D. H.; MOREIRA, R. O.; LEITE, N. A.; REDOAN, A. C.; XAVIER, A. da S.; BARROS, B. de A.; CARNEIRO, N. P. |
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Afiliação: |
Daniele Heloisa Pinheiro; Raquel Oliveira Moreira, UNESP; Natalia Alves Leite, Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Ana Carolina Redoan; Andre da Silva Xavier, Universidade Federal do Espírito Santo; BEATRIZ DE ALMEIDA BARROS, CNPMS; NEWTON PORTILHO CARNEIRO, CNPMS. |
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Título: |
Suitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera: Pentatomidae). |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v. 47, p. 4989-5000, 2020. |
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DOI: |
10.1007/s11033-020-05550-z |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. MenosThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the develop... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Gene; Inseto; Percevejo; Seleção Genética. |
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Categoria do assunto: |
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Marc: |
LEADER 02446naa a2200253 a 4500 001 2124236 005 2020-10-27 008 2020 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1007/s11033-020-05550-z$2DOI 100 1 $aPINHEIRO, D. H. 245 $aSuitable reference genes for RT-qPCR analysis in Dichelops melacanthus (Hemiptera$bPentatomidae).$h[electronic resource] 260 $c2020 520 $aThe relative quantification of gene expression is mainly realized through reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). However, the accuracy of this technique is deeply influenced by the expression stability of the reference genes used for data normalization. Therefore, the selection of suitable reference genes for a given experimental condition is a prerequisite in gene expression studies.Dichelops melacanthus(Hemiptera: Pentatomidae) is an important phloem sap-sucking insect pest of soybean, wheat, and maize in Brazil. Most of the genetic and molecular biology studies require gene expression analysis. Nevertheless, there are no reports about reference genes for RT-qPCR data normalization inD. melacanthus. In this study, we evaluated the expression stability of nine candidate reference genes (nadh,sdhb,gapdh,fau,ef1a,rpl9,ube4a,gusandrps23) in different developmental stages, body parts, sex, starvation-induced stress and dsRNA exposure by RefFinder software that integrates the statistical algorithms geNorm, NormFinder, BestKeeper, and Delta Ct method. Our results showed that ef1a and nadh are the most stable reference genes for developmental stages,fauandrps23for sex,ube4aandrps23for body parts,rpl9andfaufor starvation stress, andnadhandsdhbfor dsRNA exposure treatment. The reference genes selected in this work will be useful for further RT-qPCR analyses onD. melacanthus, facilitating future gene expression studies that can provide a better understanding of the developmental, physiological, and molecular processes of this important insect pest. Moreover, the knowledge gained from these studies can be helpful to design effective and sustainable pest management strategies. 650 $aGene 650 $aInseto 650 $aPercevejo 650 $aSeleção Genética 700 1 $aMOREIRA, R. O. 700 1 $aLEITE, N. A. 700 1 $aREDOAN, A. C. 700 1 $aXAVIER, A. da S. 700 1 $aBARROS, B. de A. 700 1 $aCARNEIRO, N. P. 773 $tMolecular Biology Reports$gv. 47, p. 4989-5000, 2020.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 62 | |
| 3. |  | LOSS, A.; PEREIRA, M. G.; GIÁCOMO, S. G.; PERIN, A.; ANJOS, L. H. C. dos. Agregação, carbono e nitrogênio em agregados do solo sob plantio direto com integração lavoura-pecuária. Pesquisa agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 10, p. 1269-1276, out. 2011 Título em inglês: Aggregation, carbon and nitrogen in soil aggregates under no?tillage with crop?livestock integration.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. |  | LOSS, A.; PEREIRA, M. G.; SCHULTZ, N.; ANJOS, L. H. C.; SILVA, E. M. R. Substâncias húmicas do solo sob manejo agrícola em diferentes sistemas de produção orgânico. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 28., REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 12., SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 10., REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 7., 2008, Londrina. FertBio 2008: desafios para o uso do solo com eficiência e qualidade ambiental: anais. Londrina: Embrapa Soja: SBCS: IAPAR, UEL, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. Parceria: UFRRJ. Organizado por: Adilson de Oliveira Júnior, Regina Maria Villas Bôas de Campos Leite, César de Castro, Fábio Álvares de Oliveira; Odilon Ferreira Saraiva.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 8. |  | FONTANA, A.; PEREIRA, M. G.; SALTON, J. C.; LOSS, A.; CUNHA, T. J. F. Fósforo remanescente e correlação com as substâncias húmicas em um latossolo vermelho sob diferentes sucessões de cultura em plantio direto. Revista Brasileira de Agrociência, Pelotas, v. 14, n. 1, p. 161-166, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 9. |  | LOSS, A.; VALLADARES, G. S.; PEREIRA, M. G.; ANJOS, L. H. C.; BENITES, V. M. Fracionamento quantitativo da matéria orgânica de organossolos e solos afins de diferentes regiões do Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 30., 2005, Recife. Anais eletrônicos: Solos, sustentabilidade e qualidade ambiental. Recife: SBCS, 2005. 4 p. (1 CD-ROM) 4 p. 1 CD-ROM| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Territorial. |
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| 10. |  | TEIXEIRA, M. B.; LOSS, A.; ROSSI, C. Q.; PEREIRA, M. G.; POLIDORO, J. C.; PIMENTEL, C. Decomposição e liberação de nutrientes da fitomassa de plantas de milheto e sorgo. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 11. |  | MORAES, L. F. D. de; CAMPELLO, E. F. C.; PEREIRA, M. G.; LOSS, A. Características do solo na restauração de áreas degradadas na reserva biológica de Poço das Antas, RJ. Ciência Florestal, Santa Maria, v. 18, n. 2, p. 193-206, abr./jun. 2008. Parceria: IBAMA; UFRRJ.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 12. |  | PEREIRA, M. G.; LOSS, A.; BEUTLER, S. J.; TORRES, J. L. R. Carbono, matéria orgânica leve e fósforo remanescente em diferentes sistemas de manejo do solo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 45, n. 5, p. 508-514, maio. 2010 Título em inglês: Carbon, light organic matter and remaining phosphorus in different soil management systems.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 14. |  | ANJOS, L. H. C. dos; PEREIRA, M. G.; FONTANA, A.; COSTA, A. M. da; LOSS, A. Síntese das discussões e recomendações da XIV Reunião Brasileira de Classificação e Correlação de Solos (XIV RCC) para o aprimoramento do Sistema Brasileiro de Classificação de Solos (SiBCS). In: SANTOS, G. G.; OLIVEIRA, V. A. de; LUMBRERAS, J. F.; COELHO, M. R.; ALMEIDA, R. E. M. de; MADARI, B. E. (ed.). Guia de campo da XIV Reunião Brasileira de Classificação e Correlação de Solos: RCC de Goiás e Tocantins. Brasília, DF: Embrapa, 2023. E-book. cap. 23.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 16. |  | FONTANA, A.; SILVA, C. F. da; PEREIRA, M. G.; LOSS, A.; BRITO, R. J. de; BENITES, V. de M. Avaliação dos compartimentos da matéria orgânica em área de Mata Atlântica. Acta Scientiarum Agronomy, Maringá, v. 33, n. 3, p. 545-550, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Solos. |
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| 17. |  | LOSS, A.; PEREIRA, M. G.; SCHULTZ, N.; ANJOS, L. H. C. dos; SILVA, E. M. R. da. Agregação do solo e índice de sensibilidade em áreas sob diferentes sistemas de produção orgânica. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE MANEJO E CONSERVAÇÃO DO SOLO E DA ÁGUA, 17., 2008, Rio de Janeiro. Manejo e conservação do solo e da água no contexto das mudanças ambientais. Rio de Janeiro: SBCS: Embrapa Solos: Embrapa Agrobiologia, 2008. 4 p. 1 CD-ROM. (Embrapa Solos. Documentos, 101). Parceria: UFRRJ.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 18. |  | LOSS, A.; PEREIRA, M. G.; SCHULTZ, N.; ANJOS, L. H. C. dos; SILVA, E. M. R. da. Atributos químicos e físicos de um argissolo vermelho-amarelo em sistema integrado de produção agroecológica. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.44, n. 1, p. 68-75, jan. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 19. |  | ANGELINI, G. A. R.; LOSS, A.; LOUREIRO, D. C.; SILVA, E. M. R. da; SAGGIN JUNIOR, O. J. Atividade microbiana do solo sob agrofloresta e pastagem em áreas de manejo agroecológico, em Seropédica, RJ. Cadernos de Agroecologia, v. 6, p. 1-5, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| 20. |  | SILVA, C. F. da; PEREIRA, M. G.; LOSS, A.; SILVA, E. M. R. da; CORREIA, M. E. F. Alterações químicas e físicas do solo em áreas de agricultura no entorno do Parque Estadual da serra do Mar, Ubatuba (SP). Revista de Ciências Agrárias, Belém, n. 46, p. 9-28, jul./dez. 2006. Parceria: UENF; UFRRJ.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Agrobiologia. |
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| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
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