BDPA - Bases de Dados da Pesquisa Agropecuária Embrapa
 






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Biblioteca(s):  Embrapa Amazônia Oriental.
Data corrente:  22/04/2020
Data da última atualização:  28/12/2023
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  BOURGOIN, C.; BETBEDER, J.; COUTERON, P.; BLANC, L.; DESSARD, H.; OSZWALD, J.; LE ROUX, R.; CORNU, G.; REYMONDIN, L.; FREITAS, L. J. M. de; SIST, P.; LÄDERACH, P.; GOND, V.
Afiliação:  Clément Bourgoin, CIRAD / Univ Montpellier / CIAT; Julie Betbeder, CIRAD / Univ Montpellier / CATIE; Pierre Couteron, UMR AMAP-IRD; Lilian Blanc, CIRAD / Univ Montpellier; Hélène Dessard, CIRAD / Univ Montpellier; Johan Oszwald, Université de Rennes 2; Renan Le Roux, CIRAD / Univ Montpellier; Guillaume Cornu, CIRAD / Univ Montpellier; Louis Reymondin, CIAT; LUCAS JOSE MAZZEI DE FREITAS, CPATU; Plinio Sist, CIRAD / Univ Montpellier; Peter Läderach, CIAT; Valéry Gond, CIRAD / Univ Montpellier.
Título:  UAV-based canopy textures assess changes in forest structure from long-term degradation.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Ecological Indicators, v. 115, 106386, Aug. 2020.
DOI:  https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2020.106386
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Degraded tropical forests dominate agricultural frontiers and their management is becoming an urgent priority. This calls for a better understanding of the different forest cover states and cost-efficient techniques to quantify the impact of degradation on forest structure. Canopy texture analyses based on Very High Spatial Resolution (VHSR) optical imagery provide proxies to assess forest structures but the mechanisms linking them with degradation have rarely been investigated. To address this gap, we used a lightweight Unmanned Aerial Vehicle (UAV) to map 739 ha of degraded forests and acquire both canopy VHSR images and height model. Thirty-three years of degradation history from Landsat archives allowed us to sample 40 plots in undisturbed, logged, over-logged and burned and regrowth forests in tropical forested landscapes (Paragominas, Pará, Brazil). Fourier (FOTO) and lacunarity textures were used to assess forest canopy structure and to build a typology linking degradation history and current states. Texture metrics capture canopy grain, heterogeneity and openness gradients and correlate with forest structure variability (R2 = 0.58). Similar structures share common degradation history and can be discriminated on the basis of canopy texture alone (accuracy = 55%). Over-logging causes a lowering in forest height, which brings homogeneous textures and of finer grain. We identified the major changes in structures due to fire following logging which changes heterogeneous a... Mostrar Tudo
Palavras-Chave:  Degradação florestal.
Thesagro:  Degradação Ambiental; Floresta Tropical; Sensoriamento Remoto.
Thesaurus Nal:  Remote sensing; Texture; Tropical forests.
Categoria do assunto:  K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Amazônia Oriental (CPATU)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CPATU56357 - 1UPCAP - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoZERLOTINI NETO, A.; CINTRA, L. C. Análise de dados de RNA-Seq utilizando o Galaxy. Campinas: Embrapa informática Agropecuária, 2016. 36 p. il. (Embrapa informática Agropecuária. Documentos, 149).
Tipo: Documentos
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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2.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. Machado: a genomic data integration framework for Chado developed with Django. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 15., 2019, Campos do Jordão. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2019. p. 6. X-Meeting 2019.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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3.Imagem marcado/desmarcadoMUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. Machado: open source genomics data integration framework. GigaScience, v. 9, n. 9, p. 1-16, Sept. 2020. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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4.Imagem marcado/desmarcadoHIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. flanSnps. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2012. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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5.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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6.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Utilização da plataforma Galaxy na análise de dados de RNAseq. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 175-178.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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7.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. Reconstructing the whole mitochondrial DNA (mtDNA) from nuclear genome. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 42. X-meeting 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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8.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, F. D.; MOURA, D. G. de; SILVA, D. F.; HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A. BDGF: um sistema web para recuperação de informação de genótipos e fenótipos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas. Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Campinas: Editora da Unicamp: Embrapa Informática Agropecuária, 2017. p. 429-438. SBIAgro 2017. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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9.Imagem marcado/desmarcadoNAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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10.Imagem marcado/desmarcadoVIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. Plant Co-expression Annotation Resource: a web server for identifying targets for genetically modified crop breeding pipelines. BMC Bioinformatics, v. 22, article 46, 2021. Article 46. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo.
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11.Imagem marcado/desmarcadoVIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. Plant Co-expression Annotation Tool: a tool to identify targets for proof of concept in Genetically Modified crop breeding pipelines. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 15., 2019, Campos do Jordão. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2019. p. 42. X-Meeting 2019
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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12.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, S. S.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Predição in silico de efetores de Fusarium decemcellulare, agente causal do superbrotamento do guaranazeiro. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 105. CDMICRO 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.
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13.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, S. S.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Predição in silico de efetores de Fusarium decemcellulare, agente causal do superbrotamento do guaranazeiro. In: OLIVEIRA, L. A. de; OLIVEIRA, J. G. de S.; GASPAROTTO, L.; BENTES, J. L. da S.; ROCHA, L. C. da; JESUS, M. A. de; ANDRADE, S. L. de; CRUZ, K. S.; SOUZA, A. Q. L. de (ed.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Editora do INPA, 2024. v. 4, p. 367-379.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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14.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, V. M. da S.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Predição in silico de efetores do patógeno foliar do guaranazeiro Neopestalotiopsis formicidarum (Maharachch., K.D. Hyde & Crous, 2014). In: OLIVEIRA, L. A. de; OLIVEIRA, J. G. de S.; GASPAROTTO, L.; BENTES, J. L. da S.; ROCHA, L. C. da; JESUS, M. A. de; ANDRADE, S. L. de; CRUZ, K. S.; SOUZA, A. Q. L. de (ed.). Diversidade microbiana da Amazônia. Manaus: Editora do INPA, 2024. v. 4, p. 380-389.
Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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15.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, V. M. da S.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Predição in silico de efetores do patógeno foliar do guaranazeiro Neopestalotiopsis formicidarum. In: CONGRESSO SOBRE DIVERSIDADE MICROBIANA DA AMAZÔNIA, 8., 2023, Manaus. Diversidade microbiana: desafios e oportunidades: anais. Manaus: UFAM: EMBRAPA: UFRR, 2023. p. 111. CDMICRO 2023.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Amazônia Ocidental.
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16.Imagem marcado/desmarcadoSIMÕES, M.; BAHIA, D.; TORRES, K.; ZERLOTINI NETO, A.; ARTIGUENAVE, F.; FALCAO, P. R. K.; NESHICH, G.; OLIVEIRA, G. SNP identification in Schistosoma mansoni expressed genes. In: X-MEETING; INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 1., 2005, Caxambu. [Proceedings...]. [S.l.]: Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional, 2005. p. 131. X-meeting 2005. Presented Posters. Na publicação: Paula Kuser.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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17.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, F. D.; MOURA, D. G. de; SILVA, D. F. da; HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A. BDGF: a database and web-based information retrieval system for genotype and phenotype. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 12., 2016, Belo Horizonte. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2016. p. 238. X-Meeting 2016.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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18.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, S. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Cazymes, peptidases e lipases secretadas do fungo fitopatogênico Pseusopestalotiopsis gilvanii (CPAA222): uma abordagem genômica. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 6.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental.
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19.Imagem marcado/desmarcadoCHAGAS, S. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; ZERLOTINI NETO, A.; SILVA, G. F. da; CANIATO, F. F. Cazymes, peptidases e lipases secretadas do fungo fitopatogênico Pseusopestalotiopsis gilvanii (CPAA222): uma abordagem genômica. In: SIMPÓSIO DE BIOTECNOLOGIA DA UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS, 1., 2022, Manaus. Anais [recurso eletrônico]: resumos expandidos. Manaus: EDUA, 2022. p. 6.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital.
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20.Imagem marcado/desmarcadoCONTEVILLE, L. C.; ANDRADE, B. G.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. Carbohydrate active enzymes in metagenome-assembled genomes from ruminal and stool microbiomes of nelore cattle. In: BRAZILIAN CONGRESS OF GENETICS, 67., 2022, Natal. [Abstracts]. Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2022. p. 426. e-book. Na publicação: Adhemar Zerlotini, Luciana de Almeida Regitano.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Pecuária Sudeste.
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