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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agroenergia. |
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Data corrente: |
23/03/2020 |
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Data da última atualização: |
27/04/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, C. de O. G.; TEIXEIRA, S. T.; RODRIGUES, K. B.; SOUZA, A. A.; MONCLARO, A. V.; MENDES, T. D.; RIBEIRO, J. A. de A.; SIQUEIRA, F. G. de; FAVARO, L. C. de L.; ABDELNUR, P. V. |
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Afiliação: |
Caio de Oliveira Gorgulho Silva; Tallyta Santos Teixeira, Universidade Federal de Tocantins; Kelly Barreto Rodrigues; Amanda Araujo Souza; Antonielle Vieira Monclaro; THAIS DEMARCHI MENDES, CNPAE; JOSE ANTONIO DE AQUINO RIBEIRO, CNPAE; FELIX GONCALVES DE SIQUEIRA, CNPAE; LEIA CECILIA DE LIMA FAVARO, CNPAE; PATRICIA VERARDI ABDELNUR, CNPAE. |
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Título: |
Combination of MALDI-TOF MS and UHPLC-ESI-MS for the characterization of lytic polysaccharide monooxygenase activity. |
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Ano de publicação: |
2020 |
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Fonte/Imprenta: |
Analytical Methods, n. 2, 2020. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Lytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs) are redox enzymes of high biotechnological interest due to their capacity to degrade recalcitrant polysaccharides, such as cellulose, by an oxidative mechanism. The characterization of LPMOs is challenging since they generate a variety of catalytic products which include native oligosaccharides (non-oxidized) and oligosaccharides oxidized at the reducing end (C1 position), the non-reducing end (C4 position), or both ends, with different degrees of polymerization. Moreover, oxidized products exist in equilibrium with their hydrated forms, which further complicates their identification. The lack of commercial analytical standards for all these possible forms of oxidized oligosaccharides and the low concentration of these products make LPMO functional characterization dependent on advanced mass spectrometry techniques capable of identifying the profile of oxidized products. Here, a new approach for the characterization of cellulose-active LPMOs based on the combination of MALDI-TOF MS and hydrophilic interaction UHPLC-ESI-MS was proposed and optimized. The LPMO TrAA9A from Trichoderma reesei was used as a model enzyme to develop and test the MS methods. MALDI-TOF MS and UHPLC-ESI-MS methods were both capable of identifying putative C1, C4 and C1/C4 oxidized cello-oligosaccharides as well as their native counterparts generated after cellulose treatment with LPMO, which allows their utilization to characterize type I (C1-oxidizer), type II (C4-oxidizer) and type III (C1- and C4-oxidizer) LPMOs. Moreover, both methods were complementary since MALDI-TOF MS was capable of detecting oligosaccharides with higher degrees of polymerization (DP3?DP10), while UHPLC-ESI-MS allowed the evaluation of smaller oligosaccharides (DP1?DP5). The combined use of both methods offers a comprehensive description of LPMO catalytic products. MenosLytic polysaccharide monooxygenases (LPMOs) are redox enzymes of high biotechnological interest due to their capacity to degrade recalcitrant polysaccharides, such as cellulose, by an oxidative mechanism. The characterization of LPMOs is challenging since they generate a variety of catalytic products which include native oligosaccharides (non-oxidized) and oligosaccharides oxidized at the reducing end (C1 position), the non-reducing end (C4 position), or both ends, with different degrees of polymerization. Moreover, oxidized products exist in equilibrium with their hydrated forms, which further complicates their identification. The lack of commercial analytical standards for all these possible forms of oxidized oligosaccharides and the low concentration of these products make LPMO functional characterization dependent on advanced mass spectrometry techniques capable of identifying the profile of oxidized products. Here, a new approach for the characterization of cellulose-active LPMOs based on the combination of MALDI-TOF MS and hydrophilic interaction UHPLC-ESI-MS was proposed and optimized. The LPMO TrAA9A from Trichoderma reesei was used as a model enzyme to develop and test the MS methods. MALDI-TOF MS and UHPLC-ESI-MS methods were both capable of identifying putative C1, C4 and C1/C4 oxidized cello-oligosaccharides as well as their native counterparts generated after cellulose treatment with LPMO, which allows their utilization to characterize type I (C1-oxidizer), type... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Caracterização de LPMOs. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agroenergia (CNPAE) |
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| 1. |  | ANTONIOLLI, L. R.; SHARROCK, K. R.; CLARK, C. J.; MCDONALD, R. M.; SEELYE, R. J.; WANG, Y. M.; FEISST, N. P. Amadurecimento e qualidade pós-colheita de kiwis gold3. Bento Gonçalves, RS: Embrapa Uva e Vinho, 2015. (Embrapa Uva e Vinho. Circular Técnica, 121).| Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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| 2. | | BASTIN, J. F.; RUTISHAUSER, E.; KELLNER, J. R.; SAATCHI, S.; PÉLISSIER, R.; HÉRAULT, B.; SLIK, F.; BOGAERT, J.; DE CANNIÈRE, C.; MARSHALL, A. R.; POULSEN, J.; ALVAREZ-LOYAYZA, P.; ANDRADE, A.; ANGBONGA-BASIA, A.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARROYO, L.; AYYAPPAN, N.; AZEVEDO, C. P. de; BANKI, O.; BARBIER, N.; BARROSO, J. G.; BEECKMAN, H.; BITARIHO, R.; BOECKX, P.; BOEHNING-GAESE, K.; BRANDÃO, H.; BREARLEY, F. Q.; HOCKEMBA, M. B. N.; BRIENEN, R.; CAMARGO, J. L. C.; CAMPOS-ARCEIZ, A.; CASSART, B.; CHAVE, J.; CHAZDON, R.; CHUYONG, G.; CLARK, D. B.; CLARK, C. J.; CONDIT, R.; CORONADO, E. N. H.; DAVIDAR, P.; HAULLEVILLE, T. de; DESCROIX, L.; DOUCET, J-L.; DOURDAIN, A.; DROISSART, V.; DUNCAN, T.; ESPEJO. J. S.; ESPINOSA, S.; FARWIG, N.; FAYOLLE, A.; FELDPAUSCH, T. R.; FERRAZ, A.; FLETCHER, C.; GAJAPERSAD, K.; GILLET, J-F.; AMARAL, I. L. do; GONMADJE, C.; GROGAN, J.; HARRIS, D.; HERZOG, S. K.; HOMEIER, J.; HUBAU, W.; HUBBELL, S. P.; HUFKENS, K.; HURTADO, J.; KAMDEM, N. G.; KEARSLEY, E.; KENFACK, D.; KESSLER, M.; LABRIÈRE, N.; LAUMONIER, Y.; LAURANCE, S.; LAURANCE, W. F.; LEWIS, S. L.; LIBALAH, M. B.; LIGOT, G.; LLOYD, J.; LOVEJOY, T. E.; MALHI, Y.; MARIMON, B. S.; JUNIOR, B. H. M.; MARTIN, E. H.; MATIUS, P.; MEYER, V.; BAUTISTA, C. M.; MONTEAGUDO-MENDOZA, A.; MTUI, A.; NEILL, D.; GUTIERREZ, G. A. P.; PARDO, G.; PARREN, M.; PARTHASARATHY, N.; PHILLIPS, O. L.; PITMAN, N. C. A.; PLOTON, P.; PONETTE, Q.; RAMESH, B. R.; RAZAFIMAHAIMODISON, J-C.; RÉJOU-MÉCHAIN, M.; ROLIM, S. G.; SALTOS, H. R.; ROSSI, L. M. B.; SPIRONELLO, W. R.; ROVERO, F.; SANER, P.; SASAKI, D.; SCHULZE, M.; SILVEIRA, M.; SINGH, J.; SIST, P.; SONKE, B.; SOTO, J. D.; SOUZA, C. R. de; STROPP, J.; SULLIVAN, M. J. P.; SWANEPOEL, B.; STEEGE, H. ter.; TERBORGH, J.; TEXIER, N.; TOMA, T.; VALENCIA, R.; VALENZUELA, L.; FERREIRA, L. V.; VALVERDE, F. C.; ANDEL, T. R. van.; VASQUE, R.; VERBEECK, H.; VIVEK, P.; VLEMINCKX, J.; VOS, V. A.; WAGNER, F. H.; WARSUDI, P. P.; WORTEL, V.; ZAGT, R. J.; ZEBAZE, D. Pan-tropical prediction of forest structure from the largest trees. Global Ecology and Biogeography, v. 27, n. 11, p. 1366-1383, Nov. 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Florestas. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Roraima. |
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| 5. | | MO, L.; CROWTHER, T. W.; MAYNARD, D. S.; HOOGEN, J. V. D.; MA, H.; BIALIC-MURPHY, L.; LIANG, J.; DE-MIGUEL, S.; NABUURS, G.; REICH, P. B.; PHILLIPS, O. L.; ABEGG, M.; YAO, Y. C. A.; ALBERTI, G.; ZAMBRANO, A. M. A.; ALVARADO, B. V.; ALVAREZ-DÁVILA, E.; ALVAREZ-LOAYZA, P.; ALVES, L. F.; AMARAL, I.; AMMER, C.; ANTÓN-FERNÁNDEZ, C.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARROYO, L.; AVITABILE, V.; AYMARD, G. A.; BAKER, T. R.; BAŁAZY, R.; BANKI, O.; BARROSO, J. G.; BASTIAN, M. L.; BASTIN, J.; BIRIGAZZI, L.; BIRNBAUM, P.; BITARIHO, R.; BOECKX, P.; BONGERS, F.; BOONMAN, C. C. F.; BOURIAUD, O.; BRANCALION, P. H. S.; BRANDL, S.; BREARLEY, F. Q.; BRIENEN, R.; BROADBENT, E. N.; BRUELHEIDE, H.; BUSSOTTI, F.; GATTI, R. C.; CÉSAR, R. G.; CESLJAR, G.; CHAZDON, R.; CHEN, H. Y. H.; CHISHOLM, C.; CHO, H.; CIENCIALA, E.; CLARK, C.; CLARK, D.; COLLETTA, G. D.; COOMES, D. A.; VALVERDE, F. C.; CORRAL-RIVAS, J. J.; CRIM, P. M.; CUMMING, J. R.; DAYANANDAN, S.; GASPER, A. L. de; DECUYPER, M.; DERROIRE, G.; DEVRIES, B.; DJORDJEVIC, I.; DOLEZAL, J.; DOURDAIN, A.; OBIANG, N. L. E.; ENQUIST, B. J.; EYRE, T. J.; FANDOHAN, A. B.; FAYLE, T. M.; FELDPAUSCH, T. R.; FERREIRA, L. V.; FINÉR, L.; FISCHER, M.; FLETCHER, C.; FRIZZERA, L.; GAMARRA, J. G. P.; GIANELLE, D.; GLICK, H. B.; HARRIS, D. J.; HECTOR, A.; HEMP, A.; HENGEVELD, G.; HÉRAULT, B.; HERBOHN, J. L.; HEROLD, M.; HIETZ, P.; HILLERS, A.; CORONADO, E. N. H.; HUI, C.; IBANEZ, T.; IMAI, N.; JAGODZIŃSKI, A. M.; JAROSZEWICZ, B.; JOHANNSEN, V. K.; JOLY, C. A.; JUCKER, T.; JUNG, I.; KARMINOV, V.; KARTAWINATA, K.; KEARSLEY, E.; KENFACK, D.; KENNARD, D. K.; KEPFER-ROJAS, S.; KEPPEL, G.; KHAN, M. L.; KILLEEN, T. J.; KIM, H. S.; KITAYAMA, K.; KÖHL, M.; KORJUS, H.; KRAXNER, F.; KUCHER, D.; LAARMANN, D.; LANG, M.; LEWIS, S. L.; LI, Y.; LOPEZ-GONZALEZ, G.; LU, H.; LUKINA, N. V.; MAITNER, B. S.; MALHI, Y.; MARCON, E.; MARIMON, B. S.; MARIMON-JUNIOR, B. H.; MARSHALL, A. R.; MARTIN, E. H.; MCCARTHY, J. K.; MEAVE, J. A.; MELO-CRUZ, O.; MENDOZA, C.; MENDOZA-POLO, I.; MISCICKI, S.; MEROW, C.; MENDOZA, A. M.; MORENO, V. S.; MUKUL, S. A.; MUNDHENK, P.; NAVA-MIRANDA, M. G.; NEILL, D.; NELDNER, V. J.; NEVENIC, R. V.; NGUGI, M. R.; NIKLAUS, P. A.; ONTIKOV, P.; ORTIZ-MALAVASI, E.; PAN, Y.; PAQUETTE, A.; PARADA-GUTIERREZ, A.; PARFENOVA, E. I.; PARK, M.; PARREN, M.; PARTHASARATHY, N.; PERI, P. L.; PFAUTSCH, S.; PICARD, N.; PIEDADE, M. T. F.; PIOTTO, D.; PITMAN, N. C. A.; POORTER, L.; POULSEN, A. D.; POULSEN, J. R.; PRETZSCH, H.; AREVALO, F. R.; RESTREPO-CORREA, Z.; RICHARDSON, S. J.; RODEGHIERO, M.; ROLIM, S. G.; ROOPSIND, A.; ROVERO, F.; RUTISHAUSER, E.; SAIKIA, P.; SALAS-ELJATIB, C.; SANER, P.; SCHALL, P.; SCHELHAAS, M.; SCHEPASCHENKO, D.; SCHERER-LORENZEN, M.; SCHMID, B.; SCHÖNGART, J.; SEARLE, E. B.; SEBEN, V.; SERRA-DIAZ, J. M.; SHEIL, D.; SHVIDENKO, A. Z.; SILVA, A. C. da; SILVA-ESPEJO, J. E.; SILVEIRA, M.; SINGH, J.; SIST, P.; SLIK, F.; SONKÉ, B.; SOSINSKI JUNIOR, E. E.; SOUZA, A. F.; STEREŃCZAK, K. J.; SVENNING, J.; SVOBODA, M.; SWANEPOEL, B.; TARGHETTA, N.; TCHEBAKOVA, N.; STEEGE, H. T.; THOMAS, R.; TIKHONOVA, E.; UMUNAY, P. M.; USOLTSEV, V. A.; VALENCIA, R.; VALLADARES, F.; BODEGOM, P. M. V.; PLAS, F. V. D.; DO, T. V.; NULAND, M. E. V.; VASQUEZ, R. M.; VERBEECK, H.; VIANA, H.; VIBRANS, A. C.; VIEIRA, S.; GADOW, K. V.; WANG, H.; WATSON, J. V.; WERNER, G. D. A.; WITTMANN, F.; WOELL, H.; WORTEL, V.; ZAGT, R.; ZAWIŁA-NIEDŹWIECKI, T.; ZHANG, C.; ZHAO, X.; ZHOU, M.; ZHU, Z.; ZO-BI, I. C.; ZOHNER, C. M. The global distribution and drivers of wood density and their impact on forest carbon stocks. Nature Ecology & Evolution, v. 8, n. 12, p. 2195-2212, 2024.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | COOPER, D. L. M.; LEWIS, S. L.; SULLIVAN, M. J. P.; PRADO, P. I.; STEEGE, H. T.; BARBIER, N.; SLIK, F.; SONKÉ, B.; EWANGO, C. E. N.; ADU-BREDU, S.; AFFUM-BAFFOE, K.; AGUIAR, D. P. P.; REATEGUI, M. A. A.; AIBA, S.-I.; ALBUQUERQUE, B. W.; MATOS, F. D. de A.; ALONSO, A.; AMANI, C. A.; AMARAL, D. D. do; AMARAL, I. L. do; ANDRADE, A.; MIRANDA, I. P. de A.; ANGOBOY, I. B.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARBOLEDA, N. C.; ARROYO, L.; AYMARD C, G. A.; BAIDER, C.; BAKER, T. R.; BALINGA, M. P. B.; BALSLEV, H.; BANIN, L. F.; BÁNKI, O. S.; BARALOTO, C.; BARBOSA, E. M.; BARBOSA, F. R.; BARLOW, J.; BASTIN, J.-F.; BEECKMAN, H.; BEGNE, S.; BENGONE, N. N.; BERENGUER, E.; BERRY, N.; BITARIHO, R.; BOECKX, P.; BOGAERT, J.; BONYOMA, B.; BOUNDJA, P.; BOURLAND, N.; BOSELA, F. B.; BRAMBACH, F.; BRIENEN, R.; BURSLEM, D. R. R. P.; CAMARGO, J. L.; CAMPELO, W.; CANO, A.; CÁRDENAS, S.; LÓPEZ, D. C.; CARPANEDO, R. de S.; MÁRQUEZ, Y. A. C.; CARVALHO, F. A.; CASAS, L. F.; CASTELLANOS, H.; CASTILHO, C. V. de; CERÓN, C.; CHAPMAN, C. A.; CHAVE, J.; CHHANG, P.; CHUTIPONG, W.; CHUYONG, G. B.; CINTRA, B. B. L.; CLARK, C. J.; SOUZA, F. C. de; COMISKEY, J. A.; COOMES, D. A.; VALVERDE, F. C.; CORREA, D. F.; COSTA, F. R. C.; COSTA, J. B. P.; COUTERON, P.; CULMSEE, H.; CUNI-SANCHEZ, A.; DALLMEIER, F.; DAMASCO, G.; DAUBY, G.; DÁVILA, N.; DOZA, H. P. D.; ALBAN, J. D. T. de; ASSIS, R. L. de; CANNIERE, C. de; HAULLEVILLE, T. de; CARIM, M. de J. V.; DEMARCHI, L. O.; DEXTER, K. G.; FIORE, A. di; DIN, H. H. M.; DISNEY, M. I.; DJIOFACK, B. Y.; DJUIKOUO, M.-N. K.; DO, T. van; DOUCET, J.-L.; DRAPER, F. C.; DROISSART, V.; DUIVENVOORDEN, J. F.; ENGEL, J.; ESTIENNE, V.; FARFAN-RIOS, W.; FAUSET, S.; FEELEY, K. J.; FEITOSA, Y. O.; FELDPAUSCH, T. R.; FERREIRA, C.; FERREIRA, J. N.; FERREIRA, L. V.; FLETCHER, C. D.; FLORES, B. M.; FOFANAH, A.; FOLI, E. G.; FONTY, E.; FREDRIKSSON, G. M.; FUENTES, A.; GALBRAITH, D.; GONZALES, G. P. G.; GARCIA-CABRERA, K.; GARCÍA-VILLACORTA, R.; GOMES, V. H. F.; GÓMEZ, R. 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| Biblioteca(s): Embrapa Amapá; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Roraima. |
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| 7. | | BLUNDO, C.; CARILLA, J.; GRAU, R.; MALIZIA, A.; MALIZIA, L.; OSINAGA-ACOSTA, O.; BIRD, M.; BRADFORD, M.; CATCHPOLE, D.; FORD, A.; GRAHAM, A.; HILBERT, D.; KEMP, J.; LAURANCE, S.; LAURANCE, W.; ISHIDA, F. Y.; MARSHALL, A.; WAITE, C.; WOELL, H.; BASTIN, J.; BAUTERS, M.; BEECKMAN, H.; BOECKX, P.; BOGAERT, J.; DE CANNIERE, C.; DE HAULLEVILLE, T.; DOUCET, J.; HARDY, O.; HUBAU, W.; KEARSLEY, E.; VERBEECK, H.; VLEMINCKX, J.; BREWER, S. W.; ALARCÓN, A.; ARAUJO-MURAKAMI, A.; ARETS, E.; ARROYO, L.; CHAVEZ, E.; FREDERICKSEN, T.; GUILLÉN VILLAROEL, R.; GUTIERREZ SIBAUTY, G.; KILLEEN, T.; CARLOS LICONA, J.; LLEIGUE, J.; MENDOZA, C.; MURAKAMI, S.; PARADA GUTIERREZ, A.; PARDO, G.; PEÑA-CLAROS, M.; POORTER, L.; TOLEDO, M.; VILLALOBOS CAYO, J.; VISCARRA, L. J.; VOS, V.; AHUMADA, J.; ALMEIDA, E.; ALMEIDA, J.; OLIVEIRA, E. A. de; CRUZ, W. A. da; OLIVEIRA, A. A. de; CARVALHO, F. A.; OBERMULLER, F. A.; ANDRADE, A.; CARVALHO, F. A.; VIEIRA, S. A.; AQUINO, A. C.; ARAGÃO, L.; ARAÚJO, A. 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R.; FRANÇA, F.; GALBRAITH, D.; GILPIN, M.; GLOOR, E.; GRACE, J.; HAMER, K.; HARRIS, D.; JEFFERY, K.; JUCKER, T.; KALAMANDEEN, M.; KLITGAAD, B.; LEVESLEY, A.; LEWIS, S. L.; LINDSELL, J.; LOPEZ-GONZALEZ, G.; LOVETT, J.; MALHI, Y.; MARTHEWS, T.; MCINTOSH, E.; MELGAÇO, K.; MILLIKEN, W.; MITCHARD, E.; MOONLIGHT, P.; MOORE, S.; MOREL, A.; PEACOCK, J.; PEH, K. S.-H.; PENDRY, C.; PENNINGTON, R. T.; PEREIRA, L. de O.; PERES, C.; PHILLIPS, O. L.; PICKAVANCE, G.; PUGH, T.; QIE, L.; RIUTTA, T.; ROUCOUX, K.; RYAN, C.; SARKINEN, T.; VALERIA, C. S.; SPRACKLEN, D.; STAS, S.; SULLIVAN, M.; SWAINE, M.; TALBOT, J.; TAPLIN, J.; HEIJDEN, G. van der; VEDOVATO, L.; WILLCOCK, S.; WILLIAMS, M.; ALVES, L.; LOAYZA, P. A.; ARELLANO, G.; ASA, C.; ASHTON, P.; ASNER, G.; BRNCIC, T.; BROWN, F.; BURNHAM, R.; CLARK, C.; COMISKEY, J.; DAMASCO, G.; DAVIES, S.; DI FIORE, T.; ERWIN, T.; FARFAN-RIOS, W.; HALL, J.; KENFACK, D.; LOVEJOY, T.; MARTIN, R.; MONTIEL, O. M.; PIPOLY, J.; PITMAN, N.; POULSEN, J.; PRIMACK, R.; SILMAN, M.; STEININGER, M.; SWAMY, V.; TERBORGH, J.; THOMAS, D.; UMUNAY, P.; URIARTE, M.; TORRE, E. V.; WANG, O.; YOUNG, K.; AYMARD C. G. A.; HERNÁNDEZ, L.; HERRERA FERNÁNDEZ, R.; RAMÍREZ-ANGULO, H.; SALEDO, P.; SANOJA, E.; SERRANO, J.; TORRES-LEZAMA, A.; LE, T. C.; LE, T. T.; TRAN, H. D. Taking the pulse of earth's tropical forests using networks of highly distributed plots. Biological Conservation, v. 260, 108849, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Roraima; Embrapa Semiárido. |
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| Registros recuperados : 7 | |
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