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Biblioteca(s):  Embrapa Suínos e Aves.
Data corrente:  01/11/2019
Data da última atualização:  01/11/2019
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  HAACH, V.; GAVA, D.; CANTAO, M. E.; FRANCO, A. C.
Afiliação:  VANESSA HAACH, UFRGS; DANIELLE GAVA, CNPSA; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ANA CLÁUDIA FRANCO, UFRGS.
Título:  One-step multiplex RT-qPCR for the detection and subtyping of influenza A virus in swine in Brazil.
Ano de publicação:  2019
Fonte/Imprenta:  Journal of Virological Methods, v. 269, p. 43-48, 2019.
DOI:  10.1016/j.jviromet.2019.04.005
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Abstract: Pandemic H1N1, human-like H1N2 and H3N2 influenza A (IAV) viruses are co-circulating in swine herds in Brazil. The genetic analysis of the Brazilian IAVs has shown that they are genetically distinct from viruses found in swine in other countries; therefore, an update of the diagnostic assays for IAV detection and subtyping is needed. This study describes the development and validation of a TaqMan based ? one-step multiplex RT-qPCR to discriminate the hemagglutinin and neuraminidase genes of the three major IAV ubtypes circulating in pigs in Brazil. The RT-qPCR assays presented 100% (95.7?100, CI 95%) of diagnostic sensitivity in the analysis of 85 IAVs, previously characterized by sequencing. The limits of detection ranged from 5.09 × 101 to 5.09 × 103 viral RNA copies/μL. For the analytical specificity, 73 pig samples collected during 2017 and 2018 were analyzed, resulting in the identification of the subtype in 74.0% (62.9?82.7, CI 95%) of samples. From these, 46.3% were H3N2, 33.3% were H1N1, 11.1% were H1N2 and 3.7% were HxN1. Mixed viral infections (3.7%) and reassortant viruses (1.9%) were also detected by the test. This multiplex RT-qPCR assay provides a fast and specific diagnostic tool for identification of different subtypes and lineages of IAV in pigs, contributing to the monitoring of influenza in swine.
Palavras-Chave:  Diagnóstico rápido; Multiplex RT-qPCR; Rapid diagnosis; RT-qPCR multiplex; Subtipagem; Subtyping; Vírus da gripe A.
Thesagro:  Suíno.
Thesaurus Nal:  Influenza A virus; Swine.
Categoria do assunto:  --
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Suínos e Aves (CNPSA)
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1.Imagem marcado/desmarcadoCOELHO, A. A.; RUSCHEL, A. R. Dinâmica das populações de favas em áreas sob manejo na Floresta Nacional do Tapajós, PA. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA UFRA, 5.; SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL (AVALIAÇÃO - 2007), 11., 2008, Belém, PA. Mudanças climáticas globais: sustentabilidade na Amazônia: anais. Belém, PA: UFRA: Embrapa Amazônia Oriental, 2008.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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2.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, E. D. de; COELHO, A. A.; CENCI, S. A. Rendimento em suco e resíduos do maracujá em função do tamanho do fruto e do ponto de colheita para o armazenamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais... Vitória: Incaper, 2008.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos.
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3.Imagem marcado/desmarcadoCOELHO, A. A.; CENCI, S. A.; RESENDE, E. D. de. Rendimento em suco e resíduos do maracujá em função do tamanho dos frutos em diferentes pontos de colheita para o armazenamento. Revista Brasileira de Produtos Agroindustriais, Campina Grande, v. 13, n. 1, p. 55-63, 2011.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos.
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4.Imagem marcado/desmarcadoRESENDE, E. D. de; COELHO, A. A.; CENCI, S. A. Caracterização da qualidade do suco em diferentes pontos de colheita do maracujá-amarelo para armazenamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 20.; ANNUAL MEETING OF THE INTERAMERICAN SOCIETY FOR TROPICAL HORTICULTURE, 54., 2008, Vitória. Frutas para todos: estratégias, tecnologias e visão sustentável: anais... Vitória: Incaper, 2008.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos.
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5.Imagem marcado/desmarcadoCOELHO, A. A.; CENCI, S. A.; RESENDE, E. D. Qualidade do suco de maracujá-amarelo em diferentes pontos de colheita e após o amadurecimento. Ciência e Agrotecnologia, Lavras, v. 34, n. 3, p. 722-729, maio/jun. 2010. Quality of yellow passion fruit juice in different harvest points and after ripening.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 1
Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria de Alimentos.
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6.Imagem marcado/desmarcadoMENDES, A. M. S.; PETRERE, V. G.; SILVA, C. B. da; COELHO, A. A. F. Liberação de micronutrientes de coquetéis vegetais no Semiárido. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. Fortaleza: UFC: SBCS, 2009. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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7.Imagem marcado/desmarcadoRUSCHEL, A. R.; LUZ, A. dos S.; COELHO, A. A.; REIS, L. P. Distribuição e dinâmica da andiroba (Carapa guianensis Aubl.) em florestas primárias e exploradas no estado do Pará. In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 61., 2009, Manaus. Anais / resumos... Manaus: SBPC, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental.
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8.Imagem marcado/desmarcadoREIS, L. P.; RUSCHEL, A. R.; COELHO, A. A.; LUZ, A. S. da; MARTINS-DA-SILVA, R. C. V. Avaliação do potencial madeireiro na Floresta Nacional do Tapajós após 28 anos da exploração florestal. Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 30, n. 64, p. 265-281, nov./dez. 2010. Publicado também em: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 14., 2010, Belém, PA. Bolsista de iniciação científica: um aporte ao desenvolvimento da pesquisa agropecuária: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2010. 1 CD-ROM....
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 4
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Florestas.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. J. R. da; MARINI, F. S.; PAULA, A. C. de; COELHO, A. A.; SANTOS, A. da S. dos. Agricultores familiares e cientistas: diálogo de saberes sobre as variedades crioulas de milho no Estado da Paraíba. Ciência e Cultura, São Paulo, v. 26, n. 2, abr./jun. 2017.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros.
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10.Imagem marcado/desmarcadoTRINDADE, J. P. P.; VOLK, L. B. da S.; QUADROS, F. L. F. de; COELHO, A. A.; PINHEIRO, C. L. Massa de forragem e taxa de acúmulo de campo nativo em sistemas de produção de pecuária familiar da Serra do Sudeste do Rio Grande do Sul. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOTECNIA, 26., 2016, Santa Maria. Cinquenta anos de zootecnia no Brasil: anais. Santa Maria: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2016. Zootec.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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11.Imagem marcado/desmarcadoVOLK, L. B. da S.; TRINDADE, J. P. P.; COELHO, A. A.; QUADROS, F. L. F. de. Funções ecossistêmicas em vegetação campestre de dupla estrutura acentuada. In: REUNIÓN DEL GRUPO TÉCNICO EN FORRAJERAS DEL CONO SUR, 24., 2017, Tacuarembó. Bioma Campos: retomando un camino de oportunidades para una producción ganadera sustentable: memorias. [Tacuarembó]: INIA: UDELAR, 2017. p. 106-108.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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12.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, C. B. da; COELHO, A. A. F.; PETRERE, V. G.; MENDES, A. M. S.; CUNHA, T. J. F. Decomposição de adubos verdes em condições de casa de vegetação. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMI-ÁRIDO, 4., 2009, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semi-Árido, 2009. p. 42-48. (Embrapa Semi-Árido. Documentos, 221)
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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13.Imagem marcado/desmarcadoMOREIRA, A. G. L.; COELHO, A. A. C.; LABUQUERQUE, L. F. G.; MOREIRA, R. T.; FARIAS, W. R. L. Efeito do eugenol como agente mitigador do estresse no transporte de juvenis de tilápia do Nilo. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 11, p. 893-898, nov. 2015.
Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais.
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14.Imagem marcado/desmarcadoCOELHO, A. A.; TRINDADE, J. P. P.; VOLK, L. B. da S.; PINHEIRO, C. L.; QUADROS, F. L. F. de. Vegetation composition and forage mass in grassland with a double structure under two winter grazing regimes. Ciência Rural, v. 48, n. 6, e20170154, jun. 2018.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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15.Imagem marcado/desmarcadoGIONGO, V.; MENDES, A. M. S.; SILVA, D. J.; CUNHA, T. J. F.; COELHO, A. A. F. Composição mineral e liberação de nutrientes de coquetéis vegetais no cultivo de mangueiras no Semiárido Tropical brasileiro. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 29.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 13.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 11.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 8., 2010, Guarapari. Fontes de nutrientes e produção agrícola: modelando o futuro: anais. Viçosa, MG: SBCS, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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16.Imagem marcado/desmarcadoPETRERE, V. G.; MENDES, A. M. S.; CUNHA, T. J. F.; BRAGA, M. B.; SILVA, C. B. da; COELHO, A. A. F. Liberação de macronutrientes de adubos verdes em condições de casa de vegetação. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. Fortaleza: UFC: SBCS, 2009.  1 CD-ROM.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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17.Imagem marcado/desmarcadoCOELHO, A. A.; TRINDADE, J. P. P.; VOLK, L. B. da S.; SILVA, R. D. D.; QUADROS, F. L. F. de. A ciência sobre os campos sul-brasileiros. In: REUNIÓN DEL GRUPO TÉCNICO EN FORRAJERAS DEL CONO SUR, 24., 2017, Tacuarembó. Bioma Campos: retomando un camino de oportunidades para una producción ganadera sustentable: memorias. [Tacuarembó]: INIA: UDELAR, 2017. p. 177-179.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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18.Imagem marcado/desmarcadoHELLMEISTER, P. F.; COELHO, A. A. D.; SAVINO, V. J. M.; CUSTODIO, R. W. S.; SOUZA, A. P. de; OTTOBONI, L. M. M.; SCHMIDT, G. S. Utilizacao de DNA fingerprinting na introgressao de genes maiores em galinhas de corte. In: SIMPOSIO DE INICIACAO CIENTIFICA, 4., 1996, Sao Paulo, SP. [Anais]. Sao Paulo: USP, 1996. v.1 p.489
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves.
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19.Imagem marcado/desmarcadoFURQUIM F. F.; OVERBECK G. E.; DUTRA, G. M.; COELHO, A. A.; PINHEIRO, C. L.; TRINDADE, J. P. P.; QUADROS, F. L. F. Vegetation patterns according to Saccharum angustifolium size in South Brazilian Campos. Boletín de la Sociedad Argentina de Botánica, Córdoba, v. 52, sept. 2017. p. 125-126. Suplemento. Edição da XXXVI Jornadas Argentinas de Botánica. Patrones de vegetación de acuerdo com el tamaño de Saccharum angustifolium en campos del Sur del Brazil.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul.
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20.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, C. B. da; GIONGO, V.; MENDES, A. M. S.; COELHO, A. A. F.; GALVÃO, S. R.; SILVA, D. J.; CUNHA, T. J. F. Taxa de liberação de carbono e nitrogênio de coquetéis vegetais no cultivo irrigado de mangas no Semiárido tropical brasileiro. In: JORNADA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA SEMIÁRIDO, 5., 2010, Petrolina. Anais... Petrolina: Embrapa Semiárido, 2010. (Embrapa Semiárido. Documentos, 228.).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Semiárido.
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