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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
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Data corrente: |
26/12/2018 |
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Data da última atualização: |
24/01/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
CARVALHO, V. P.; SANT'ANNA, I. C.; NASCIMENTO, M.; NASCIMENTO, A. C. C.; CRUZ, C. D.; ARBEX, W. A.; OLIVEIRA, F. C.; SILVA, F. F. |
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Afiliação: |
V. P. CARVALHO; I. C. SANT'ANNA; M. NASCIMENTO; A. C. C. NASCIMENTO; C. D. CRUZ; WAGNER ANTONIO ARBEX, CNPGL; F. C. OLIVEIRA; F. F. SILVA. |
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Título: |
Support vector machines applied to the genetic classification problem of hybrid populations with high degrees of similarity. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Research, v. 17, n. 4, gmr18122, 2018. |
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Páginas: |
10 p. |
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DOI: |
10.4238/gmr18122 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT Selection of appropriate genitors in breeding programs increases gains due to the variability found in the divergent groups; this allows quantification of the existing variability, saving time and resources. There are many methods for quantification and evaluation of diversity in population studies, among which we highlight methods that are based on multivariate statistical analyses, such as linear discriminant analysis (LDA) and cluster analysis. Here we propose and evaluate the use of Support Vector machine (SVM) and Artificial Neural Network (ANN) in an attempt to solve the problem of genetic classification of hybrid populations with high degrees of similarity. The results obtained, in terms of the apparent error rate (APER), were compared with those obtained using ANN analysis and LDA. In general, the lowest APER values were associated with scenarios with low degrees of genetic similarity between populations. Specifically, the best results obtained through SVM (ranging from 14.44 to 67.41%) were observed when the exponential radial base kernel function was used. The APERs obtained by the ANN were even lower than those of the linear discriminant function. |
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Palavras-Chave: |
Computational Intelligence; Multivariate approach. |
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Thesaurus Nal: |
Breeding. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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520 $aABSTRACT Selection of appropriate genitors in breeding programs increases gains due to the variability found in the divergent groups; this allows quantification of the existing variability, saving time and resources. There are many methods for quantification and evaluation of diversity in population studies, among which we highlight methods that are based on multivariate statistical analyses, such as linear discriminant analysis (LDA) and cluster analysis. Here we propose and evaluate the use of Support Vector machine (SVM) and Artificial Neural Network (ANN) in an attempt to solve the problem of genetic classification of hybrid populations with high degrees of similarity. The results obtained, in terms of the apparent error rate (APER), were compared with those obtained using ANN analysis and LDA. In general, the lowest APER values were associated with scenarios with low degrees of genetic similarity between populations. Specifically, the best results obtained through SVM (ranging from 14.44 to 67.41%) were observed when the exponential radial base kernel function was used. The APERs obtained by the ANN were even lower than those of the linear discriminant function.
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Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 2. |  | MARTINS, L. A.; RIGHI, D.; SARAIVA, K. M.; PEREZ, N. B. Monitoramento da germinação de capim-anonni-2 (Eragrostis plana Nees) em campo natural infestado após a aplicação de herbicida. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 7.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 7.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 5.; MINICURSOS, 2009, Bagé. Anais... Bagé: LEB, 2009. 1 CD-ROM. Título da capa: Anais CONGREGA URCAMP 2009. Código 352.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 3. | | MARTINS, L. A.; RIGHI, D. M.; SISTI, R. N.; PEREZ, N. B. Avaliação do número de plantas de capim-annoni-2 sob efeito de sombreamento. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 8.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 8.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 6.; MINICURSOS, 2010, Bagé. Educação e sustentabilidade: anais. Bagé: LEB, 2010. Anais CONGREGA URCAMP 2010. Código 238.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 5. | | MARTINS, L. A.; RIGHI, D.; SARAIVA, K. M.; PEREZ, N. B. Potencial de produção de forragem sob regime de cortes de populações de alfafa (Medicago sativa L.) selecionadas para aptidão ao pastejo e para fenação. In: JORNADA DE PÓS-GRADUAÇÃO E PESQUISA, 7.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 7.; MOSTRA DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA JÚNIOR, 5.; MINICURSOS, 2009, Bagé. Anais... Bagé: LEB, 2009. 1 CD-ROM. Título da capa: Anais CONGREGA URCAMP 2009. Código 357. Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| Registros recuperados : 5 | |
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