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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
10/12/2018 |
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Data da última atualização: |
08/08/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
OLIVEIRA, F. A. de. |
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Afiliação: |
Fernanda Ancelmo de Oliveira, UNICAMP. |
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Título: |
Estudos genético-genômicos em gramíneas forrageiras tropicais dos gêneros Urochloa e Paspalum. |
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Ano de publicação: |
2017 |
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Fonte/Imprenta: |
Tese (Doutorado em Genética e Biologia Molecular) - Instituto de Biologia, Universidade Estadual de Campinas, Campinas, 2017. |
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Páginas: |
212 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Co-Orientadora: Bianca Baccili Zanotto Vigna, Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Conteúdo: |
A pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. Esses foram anotados e relacionados à vias de fixação de carbono C4, síntese de lignocelulose e à resposta ao stress por alagamento. A busca por potenciais marcadores revelou 4.489 microssatélites (SSR) e 560.298 single nucleotide polymorphisms (SNP). Foram identificados genes únicos e diferencialmente expressos, corroborados por qPCR, entre os dois genótipos do banco de germoplasma da Embrapa utilizados para análise, o acesso apomítico BH16 ?cultivar BRS Tupi (CIAT 26149) e o único genótipo sexual da espécie, o acesso BH031 (CIAT 26146). Sugere-se, ainda, uma provável origem híbrida para o BH031. Para P. notatum, foi gerado um transcriptoma altamente representativo, a partir de dois tecidos (folha e flor) de seis genótipos com réplicas biológicas, que apresentam diferentes ploidias e modo de reprodução (sexual ou apomítico), resultando em mais de 100.000 unigenes montados com métricas robustas. Através de abordagens de expressão diferencial de genes entre sexuais e apomíticos, enriquecimento dos termos GO (Gene Ontology) e rede de coexpressão gênica, foram identificados genes candidatos a apomixia. Esses podem ser melhor investigados, visando elucidar esse intrigante mecanismo de reprodução, como também, desenvolver marcadores ligados a apomixia. Adicionalmente, no estudo de Paspalum, foram desenvolvidos marcadores SSR genômicos inéditos para P. plicatulum, e transferidos para outras espécies que compõem grupo botânico Plicatula, constituindo uma ferramenta valiosa para o estudo da variabilidade genética de acessos de banco de germoplasma das espécies estudadas. Ainda, buscando aprofundar o conhecimento sobre o complexo grupo Plicatula, obteve-se um expressivo conjunto de dados genômicos através de RAD-seq para as espécies. De modo que podem ser usados para auxiliar na classificação taxonômica e delimitação de espécies, bem como nos programas de coleta, conservação e melhoramento das espécies de Paspalum. MenosA pecuária bovina brasileira é baseada, predominantemente, na utilização de pastagens para a alimentação animal. Estas cobrem extensas áreas, o que viabiliza o maior rebanho comercial do mundo e a posição de maior exportador de carne bovina. U. humidicola está entre as forrageiras exóticas mais cultivadas nas pastagens brasileiras; ocorre em locais úmidos, de drenagem deficiente ou com inundação sazonal, razão pela qual ocupa extensas áreas no cerrado e na região amazônica. Espécies nativas do gênero Paspalum, apresentam potencial forrageiro e ornamental, e destacam-se pela grande variabilidade intra-específica a ser explorada. O lançamento de novas cultivares é uma alternativa para a diversificação das pastagens, e é a principal forma de atenuar problemas provenientes do monocultivo. Contudo, essas gramíneas têm seu perfil genético-molecular-genômico pouco estudado. E conhecer a extensão da variabilidade genética contida dentro dos bancos de germoplasma auxilia no planejamento de estratégias para maximizar os ganhos genéticos em programas de melhoramento. Nesse contexto, esta tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento sobre a genética e genômica de espécies desses dois importantes gêneros de forrageiras tropicais. A partir do método RNA-seq e, montagem de novo, foi obtido o perfil transcriptômico global de folha de U. humidicola e folha e flor de P. notatum. Para U. humidicola foram obtidos 35.093 unigenes, representando o primeiro transcriptoma para a espécie. ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Grupo Plicatula. |
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Thesagro: |
Gramínea Forrageira. |
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Thesaurus Nal: |
Paspalum; Urochloa. |
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Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Cutter |
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| Registros recuperados : 83 | |
| 4. |  | CARDOSO, L. G. R.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; ROCHA, T. T. Avaliação do desenvolvimento de brotações após a realização de cortes em ramos de Pilocarpus microphyllus stapf ex wardleworth. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 5. | | RIBEIRO, F. N.; LAMEIRA, O. A.; ROCHA, T. T.; AZULAY, L. B. O. Avaliação do desenvolvimento de mudas de andiroba sob a influência da adubação mineral e orgânica. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 15., 2011, Belém, PA. A ciência de fazer ciência: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2011. 1 CD-ROM. PIBIC-2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 6. | | RIBEIRO, F. N. S.; LAMEIRA, O. A.; ROCHA, T. T.; SILVA, C. S. A. da. Avaliação de distâncias de cortes em ramos de jaborandi. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 7. | | RIBEIRO, F. N. S.; LAMEIRA, O. A.; CARDOSO, L. G. R.; FAÇANHA, T. P. Avaliação fenológica de duas espécies da família Myrtaceae. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 8. | | NEVES, R. L. P.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; PORTAL, R. K. V. P. Avaliação fenológica da espécie Morinda citrifolia Linn. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 17.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 1., 2013, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2013. 1 CD-ROM. PIBIC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 9. | | ASSIS, R. M. A. de; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; NUNES, R. L. P. Avaliação fenológica da espécie Petiveria alliacea L. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 17.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 1., 2013, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2013. 1 CD-ROM. PIBIC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 10. | | NEVES, R. L. P.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; PORTAL, R. K. V. P. Avaliação fenológica da espécie Piper callosus L. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 17.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 1., 2013, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2013. 1 CD-ROM. PIBIC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 11. | | FAÇANHA, T. P.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; BATISTA, W. R. Avaliação fenológica de Gossypium hirsutum L. E Hibiscus sabdariffa L. pertencentes à família Malvaceae. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 12. | | AZULAY, L. B. O.; LAMEIRA, O. A.; ROCHA, T. T.; RIBEIRO, F. N. S. Avaliação fenológica e screening fitoquímico de Averrhoa carambola L.- Oxalidaceae. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 15., 2011, Belém, PA. A ciência de fazer ciência: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2011. 1 CD-ROM. PIBIC-2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 13. | | FAÇANHA, T. P.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; COSTA, T. C. da. Avaliação fenológica e screening fitoquímico de duas espécies da família Fabaceae. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA, 16., 2012, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2012. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 14. | | AZULAY, L. B. O.; LAMEIRA, O. A.; ROCHA, T. T.; RIBEIRO, F. N. S. Avaliação fenológica e screening fitoquímico de Mansoa alliacea (LAM.) A. Gentry - Bignoniaceae. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 15., 2011, Belém, PA. A ciência de fazer ciência: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2011. 1 CD-ROM. PIBIC-2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 15. | | PORTAL, R. K. V. P.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N. S.; NUNES, R. L. P. Avaliação fenológica do urucum (Bixa orellana L.). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 17.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 1., 2013, Belém, PA. Anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2013. 1 CD-ROM. PIBIC 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 16. | | RIBEIRO, F. N.; LAMEIRA, O. A.; ROCHA, T. T.; AZULAY, L. B. O. Avaliação da regeneração de ramos de jaborandi (Pilocarpus microphyllus Stapf ex wardleworth). In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 15., 2011, Belém, PA. A ciência de fazer ciência: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2011. 1 CD-ROM. PIBIC-2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 17. | | ROCHA, T. T.; LAMEIRA, O. A.; RIBEIRO, F. N.; AZULAY, L. B. O. Avaliação do período de floração e frutificação do banco ativo de germoplasma do jaborandi. In: SEMINÁRIO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA AMAZÔNIA ORIENTAL, 15., 2011, Belém, PA. A ciência de fazer ciência: anais. Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2011. 1 CD-ROM. PIBIC-2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 19. | | MEHTA, A.; ANDRADE, A. E.; OLIVEIRA, A. C.; RIBEIRO, F. N. S.; EIRA, M. T. S. Expressão diferencial de proteínas em sementes de Coffea arabica submetidas ao estresse hídrico. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 50., 2004, Costão do Santinho, Florianópolis. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2004. p. 1166.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
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