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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Pecuária Sudeste. |
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Data corrente: |
10/08/2018 |
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Data da última atualização: |
24/09/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
NICIURA, S. C. M.; CRUVINEL, G. G.; MORAES, C. V.; DONATONI, F. A. B.; MALAGO JUNIOR, W.; BENAVIDES, M. V.; CHAGAS, A. C. de S. |
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Afiliação: |
SIMONE CRISTINA MEO NICIURA, CPPSE; Giovanna Gabrielle Cruvinel, UNICEP; Caroline Valério Moraes, UFSCar; FLAVIA ALINE BRESSANI DONATONI, CPPSE; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MAGDA VIEIRA BENAVIDES, CPPSUL; ANA CAROLINA DE SOUZA CHAGAS, CPPSE. |
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Título: |
PCR-based genotyping of SNP markers in sheep. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Molecular Biology Reports, v.45, n.4, p.651-654, aug. 2018. |
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ISSN: |
1573-4978 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s11033-018-4206-8 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) are the main type of variation in genome, enabling them to be associated with traits of economic importance in livestock. Genome-wide association studies (GWAS) have led to the discovery of SNPs associated with desirable traits in sheep. However, in these studies, SNPs are genotyped by high-throughput methods in genome scale, which are expensive and require sophisticated equipment and analysis methods. Therefore, the goal of this study was to develop a reliable, rapid, and inexpensive polymerase chain reaction (PCR)-based method to genotype a medium number of animals for a few candidate SNPs previously associated with desirable phenotypes in sheep by GWAS, using markers associated with gastrointestinal nematode resistance as a model. DNA extracted from white-blood cells of 150 sheep was submitted to PCR amplification followed by agarose gel electrophoresis and determination of banding pattern. Tetra-primer ARMS-PCR was successfully optimized after changes in annealing temperature; annealing and extension times; concentration of MgCl2 and DNA; ratios of inner, outer, forward and reverse primer; and addition of adjuvants, for genotyping the OAR2_14765360, OAR6_81718546, OAR11_62887032, and OAR12_69606944 SNPs in sheep. An extensive optimization of tetra-primer ARMS-PCR resulted in a suitable, simple, cost-effective PCR-based method of genotyping four SNP markers previously detected by chip arrays. |
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Palavras-Chave: |
PCR RFLP; Resistência nematódeo gastrintestinal; Tetra primer ARMS PCR. |
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Thesagro: |
Marcador Molecular; Ovino. |
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Thesaurus Nal: |
Genome. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Pecuária Sudeste (CPPSE) |
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Biblioteca |
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Registro |
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Status |
URL |
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| Registros recuperados : 99 | |
| 1. |  | FACO, O.; BOZZI, R.; MARTINS FILHO, R.; LOBO, R. N. B.; MALHADO, C. H. M. Efeitos da eliminação das lactações curtas e do ajuste da produção de leite pela duração da lactação sobre a comparação do desempenho produtivo de vacas de seis grupos genéticos Holandês x Gir. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 41., 2004, Campo Grande, MS. A produção animal e a segurança alimentar: anais dos simpósios e dos resumos. Campo Grande, MS: Sociedade Brasileira de Zootecnia: Embrapa Gado de Corte, 2004. 5 f. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 3. | | AMBROSINI, D. P.; MALHADO, C. H. M.; MARTINS FILHO, R.; CARNEIRO, P. L. S. Interação genótipo x ambiente via modelos de normas de reação para características de crescimento em bovinos Nelore. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 2, p. 177-186, fev. 2016. Título em inglês: Genotype x environment interaction via models of reaction norms for growth traits in Nelore cattle.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 4. | | REZENDE, M. P. G. de; FERRAZ, P. C.; CARNEIRO, P. L. S.; MALHADO, C. H. M. Phenotypic diversity in buffalo cows of the Jafarabadi, Murrah, and Mediterranean breeds. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 52, n. 8, p. 663-669, fev. 2017. Título em português: Diversidade fenotípica em búfalas Jafarabadi, Murrah e Mediterrâneo.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 5. | | MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MARTINS FILHO, R.; AZEVEDO, D. M. M. R. Histórico genético e populacional do rebanho Nelore Puro de Origem no Sertão Nordestino. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 7, p. 713-718, jul. 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 6. | | MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; PEREIRA, D. G.; MARTINS FILHO, R. Progresso genético e estrutura populacional do rebanho Nelore no Estado da Bahia. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 43, n. 9, p. 1163-1169, set. 2008. Título em inglês: Genetic progress and population structure in Nellore cattle in Bahia State, Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | MALHADO, C. H. M.; RAMOS, A. de A.; CARNEIRO, P. L. S.; AZEVEDO, D. M. M. R.; MARTINS FILHO, R. Distribuição univariada e bivariada das características de crescimento de bubalinos de corte no Brasil. Revista Científica de Produção Animal, Teresina, v. 10, n. 1, p. 69-80, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 5 |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 9. | | SANTOS, L. H. dos; MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; MARTINS FILHO, R.; AZEVÊDO, D. M. M. R. Curva de crescimento em bovinos da raça Nelore no Estado da Bahia. In: CONGRESSO NORDESTINO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 5.; SIMPÓSIO NORDESTINO DE ALIMENTAÇÃO DE RUMINANTES, 11.; SIMPÓSIO SERGIPANO DE PRODUÇÃO ANIMAL, 1., 2008, Aracaju. Anais... Aracaju: Sociedade Nordestina de Produção Animal: Embrapa Tabuleiros Costeiros, 2008. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 12. | | OLIVEIRA, C. G. de; CUNHA, E. E.; CARNEIRO, P. L. S.; EUCLYDES, R. F.; MALHADO, C. H. M. Comparação de métodos de seleção em populações simuladas de frangos de corte. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 40, n. 10, p. 969-974, out. 2005 Título em inglês: Comparison of selection methods in simulated populations of broilers.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | RAMOS, A. de A.; MALHADO, C. H. M.; CARNEIRO, P. L. S.; GONÇALVES, H. C.; AZEVEDO, D. M. M. R. Caracterização fenotípica e genética da produção de leite e do intervalo entre partos em bubalinos da raça Murrah. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.41, n. 8, p.1261-1267, ago. 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 14. | | ALMEIDA, E. C. de J.; CARNEIRO, P. L. S.; WENCESLAU, A. A.; FARIAS FILHO, R. V.; MALHADO, C. H. M. Características de carcaça de galinha naturalizada Peloco comparada a linhagens de frango caipira. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 11, p. 1517-1523, nov. 2013. Título em inglês: Carcass characteristics of Peloco naturalized chicken compared to free?range broiler lineages.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 15. | | SOUZA, J. C. de; SILVA, L. O. C. da; PEROTTO, D.; MALHADO, C. H. M.; FERRAZ FILHO, P. B. Estimativas parâmetros genéticos diretos e maternos e da tendência genética, para mães e filhas da raça guzerá. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 40., 2003, Santa Maria, RS. Otimizando a produção animal: anais. Santa Maria, RS: SBZ, 2003. 4 p. CNPGC.| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 16. | | AMBROSINI, D. P.; CARNEIRO, P. L. S.; BRACCINI NETO, J.; MALHADO, C. H. M.; MARTINS FILHO, R.; CARDOSO, F. F. Interação genótipo × ambiente para peso ao ano em bovinos Nelore Mocho no Nordeste do Brasil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 10, p. 1489-1495, out. 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sul. |
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| 17. | | AMBROSINI, D. P.; CARNEIRO, P. L. S.; BRACCINI NETO, J.; MALHADO, C. H. M; MARTINS FILHO, R.; CARDOSO, F. F. Interação genótipo x ambiente para peso ao ano em bovinos nelore mocho no nordeste do Brasil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 47, n. 10, p. 1489-1495, out. 2012. Título em inglês: Genotype × environment interaction for yearling weight in Polled Nellore cattle in Northeast Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 18. | | RODRIGUES, F. B.; CARNEIRO, P. L. S.; RAMOS, A. de A.; AMBROSINI, D. P.; MALHADO, C. H. M. Interação genótipo x ambiente para peso aos 365 dias em bubalinos da raça Mediterrâneo. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 50, n. 7, p. 615-621, jul. 2015. Título em inglês: Genotype x environment interaction for weight at 365 days in Mediterranean buffaloes.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 19. | | TEIXEIRA NETO, M. R.; CRUZ, J. F. da; CARNEIRO, P. L. S.; MALHADO, C. H. M.; FARIA, H. H. N. Parâmetros populacionais da raça ovina Santa Inês no Brasil. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 48, n. 12, p. 1589-1595, dez. 2013. Título em inglês: Population parameters of the sheep breed Santa Inês in Brazil.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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