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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
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Data corrente: |
26/07/2018 |
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Data da última atualização: |
26/07/2018 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
DUNLAP, C. A.; RAMIREZ, J. L.; MASCARIN, G. M.; LABEDA, D. P. |
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Afiliação: |
CHRISTOPHER C DUNLAP, ARS-USDA; JOSE LUIS RAMIREZ, ARS-USDA; GABRIEL MOURA MASCARIN, CNPMA; DAVID P LABEDA, ARS-USDA. |
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Título: |
Entomopathogen ID: a curated sequence resource for entomopathogenic fungi. |
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Ano de publicação: |
2018 |
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Fonte/Imprenta: |
Antonie van Leeuwenhoek, v. 111, n. 6, p. 897?904, 2018. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10482-017-0988-2 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Abstract: We report the development of a publicly accessible, curated nucleotide sequence database of hypocrealean entomopathogenic fungi. The goal is to provide a platform for users to easily access sequence data from taxonomic reference strains. The database can be used to accurately identify unknown entomopathogenic fungi based on sequence data for a variety of phylogenetically informative loci. The database provides full multi-locus sequence alignment capabilities. The initial release contains data compiled for 525 strains covering the phylogenetic diversity of three important entomopathogenic families: Clavicipitaceae, Cordycipitaceae, and Ophiocordycipitaceae. Furthermore, Entomopathogen ID can be expanded to other fungal clades of insect pathogens, as sequence data becomes available. The database will allow isolate characterisation and evolutionary analyses. We contend that this freely available, web-accessible database will facilitate the broader community to accurately identify fungal entomopathogens, which will allow users to communicate research results more effectively. |
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Palavras-Chave: |
MLSA. |
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Thesagro: |
Base de Dados; Fungo Entomógeno. |
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Thesaurus Nal: |
Beauveria; Cordyceps; Entomopathogenic fungi; Genetic databases; Isaria; Metacordyceps; Metarhizium. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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Marc: |
LEADER 01922naa a2200289 a 4500
001 2093594
005 2018-07-26
008 2018 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1007/s10482-017-0988-2$2DOI
100 1 $aDUNLAP, C. A.
245 $aEntomopathogen ID$ba curated sequence resource for entomopathogenic fungi.$h[electronic resource]
260 $c2018
520 $aAbstract: We report the development of a publicly accessible, curated nucleotide sequence database of hypocrealean entomopathogenic fungi. The goal is to provide a platform for users to easily access sequence data from taxonomic reference strains. The database can be used to accurately identify unknown entomopathogenic fungi based on sequence data for a variety of phylogenetically informative loci. The database provides full multi-locus sequence alignment capabilities. The initial release contains data compiled for 525 strains covering the phylogenetic diversity of three important entomopathogenic families: Clavicipitaceae, Cordycipitaceae, and Ophiocordycipitaceae. Furthermore, Entomopathogen ID can be expanded to other fungal clades of insect pathogens, as sequence data becomes available. The database will allow isolate characterisation and evolutionary analyses. We contend that this freely available, web-accessible database will facilitate the broader community to accurately identify fungal entomopathogens, which will allow users to communicate research results more effectively.
650 $aBeauveria
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700 1 $aMASCARIN, G. M.
700 1 $aLABEDA, D. P.
773 $tAntonie van Leeuwenhoek$gv. 111, n. 6, p. 897?904, 2018.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
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URL |
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| Registros recuperados : 5 | |
| 1. |  | OLIVEIRA, N. A.; SANTANA, P. A.; GUEDES, M. N. S.; PARRELLA, N. N. L. D.; PARRELLA, R. A. C. Testes de vigor na avaliação de sementes de linhagens macho estéreis e mantenedoras de sorgo sacarino. Informativo ABRATES, Brasília, v. 25, n. 2, set. 2015. 1 CD-ROM. Edição dos Anais do XIX Congresso Brasileiro de Sementes, Foz do Iguaçu, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 2. | | SANTANA, P. A; GUEDES, M. N. S.; PARRELLA, N. N. L. D.; PARRELLA, R. A. da C.; OLIVEIRA, N. A. Qualidade de sementes de linhagens macho estéril e mantenedoras de sorgo sacarino. Informativo ABRATES, Brasília, v. 25, n. 2, set. 2015. 1 CD-ROM. Edição dos Anais do XIX Congresso Brasileiro de Sementes, Foz do Iguaçu, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 3. | | SANTANA, P. A.; PINTO, M. de O.; SANTOS, C. V. dos; MENEZES, C. B. de; MAGALHAES, J. V. de; SCHAFFERT, R. E. Seleção assistida por marcadores moleculares para o desenvolvimento de sorgo sacarino tolerante ao alumínio. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 30.; SIMPÓSIO SOBRE LEPDÓPTEROS COMUNS A MILHO, SOJA E ALGODÃO, 1., 2014, Salvador. Eficiência nas cadeias produtivas e o abastecimento global: resumos expandidos. Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 4. | | SANTANA, P. A.; MORAIS, E. G. F. de; PICANÇO, M. C.; CAMPOS, S. O.; MOREIRA, S. S.; SILVA, D. J. H. Flutuação populacional de Myzus persicae na cultura do repolho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 51., 2011, Viçosa. Anais... Viçosa: ABH, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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| 5. | | BARBOSA, M. V.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; SANTANA, P. A.; CALDEIRA, D. C. D.; MATTOS, B. B.; BARACHO, A. de O.; VIANA, J. H. M.; MARRIEL, I. E. Incorporação de novos acessos de microrganismos solubilizadores de fosfato à coleção de microrganismos multifuncionais da Embrapa Milho e Sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 29., 2012, Águas de Lindóia. Diversidade e inovações na era dos transgênicos: resumos expandidos. Campinas: Instituto Agronômico; Sete Lagoas: Associação Brasileira de Milho e Sorgo, 2012. p. 1758-1763. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| Registros recuperados : 5 | |
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