| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Semiárido. Para informações adicionais entre em contato com cpatsa.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite; Embrapa Semiárido. |
|
Data corrente: |
21/11/2017 |
|
Data da última atualização: |
27/01/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; SILVA, M. V. G. B.; BARBOSA, R. S.; SANTOS, G. G. dos; LEITE, R. de M. H.; PEIXOTO, M. G. C. D. |
|
Afiliação: |
JOAO CLAUDIO DO CARMO PANETTO, CNPGL; MARCO ANTONIO MACHADO, CNPGL; MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; ROSANGELA SILVEIRA BARBOSA, CPATSA; GLAUCYANA GOUVEA DOS SANTOS, CNPGL; RICARDO de M. H. LEITE, EMEPA; MARIA GABRIELA CAMPOLINA D PEIXOTO, CNPGL. |
|
Título: |
Parentage assignment using SNP markers, inbreeding and population size for the Brazilian Red Sindhi cattle. |
|
Ano de publicação: |
2017 |
|
Fonte/Imprenta: |
Livestock Science, v. 204, p. 33-38, 2017. |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Abstract Brazilian Red Sindhi was originated from a very small number of founders and showed a consistent growth during the last three decades. One relevant herd was kept without proper birth recording and the reconstruction of parentage was possible for this herd through the use of a panel with 3894 SNP markers. Pedigree errors were also identified and corrected for animals sampled in various herds distributed in different Brazilian regions. A panel containing 71 SNP markers was indicated as the minimum number for the effective parentage verification within the Red Sindhi population in Brazil. Corrected genealogy was used for the description of inbreeding and effective population size, which was accessed with the paired increases in coancestry approach. Average inbreeding was high (F = 9.03%) for 15,217 inbred animals (54.1% of the total). Nevertheless, a trend of decrease with time was observed for this parameter with the average individual increases in inbreeding approach (∆Fi). This population went through a bottleneck during the 1980s and beginning of the 1990s, reaching a minimum population size of Ne=55.86. After that period, a consistent increase in the number of breeders and animals has raised the effective population size to the current value of Ne=87.55. |
|
Palavras-Chave: |
Bottleneck; Mendelian conflicts; Raça Sindi; Red Sindhi; SNP. |
|
Thesagro: |
Produção animal. |
|
Thesaurus Nal: |
Pedigree; zebu. |
|
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
|
Marc: |
LEADER 02115naa a2200289 a 4500
001 2080343
005 2023-01-27
008 2017 bl uuuu u00u1 u #d
100 1 $aPANETTO, J. C. do C.
245 $aParentage assignment using SNP markers, inbreeding and population size for the Brazilian Red Sindhi cattle.$h[electronic resource]
260 $c2017
520 $aAbstract Brazilian Red Sindhi was originated from a very small number of founders and showed a consistent growth during the last three decades. One relevant herd was kept without proper birth recording and the reconstruction of parentage was possible for this herd through the use of a panel with 3894 SNP markers. Pedigree errors were also identified and corrected for animals sampled in various herds distributed in different Brazilian regions. A panel containing 71 SNP markers was indicated as the minimum number for the effective parentage verification within the Red Sindhi population in Brazil. Corrected genealogy was used for the description of inbreeding and effective population size, which was accessed with the paired increases in coancestry approach. Average inbreeding was high (F = 9.03%) for 15,217 inbred animals (54.1% of the total). Nevertheless, a trend of decrease with time was observed for this parameter with the average individual increases in inbreeding approach (∆Fi). This population went through a bottleneck during the 1980s and beginning of the 1990s, reaching a minimum population size of Ne=55.86. After that period, a consistent increase in the number of breeders and animals has raised the effective population size to the current value of Ne=87.55.
650 $aPedigree
650 $azebu
650 $aProdução animal
653 $aBottleneck
653 $aMendelian conflicts
653 $aRaça Sindi
653 $aRed Sindhi
653 $aSNP
700 1 $aMACHADO, M. A.
700 1 $aSILVA, M. V. G. B.
700 1 $aBARBOSA, R. S.
700 1 $aSANTOS, G. G. dos
700 1 $aLEITE, R. de M. H.
700 1 $aPEIXOTO, M. G. C. D.
773 $tLivestock Science$gv. 204, p. 33-38, 2017.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 18 | |
| 3. |  | PINEROS, M. A.; SHAFF, J. E.; MANSLANK, H. S.; ALVES, V. M. C.; KOCHIAN, L. V. Aluminum resistance in maize cannot be solely explained by root organic acid exudation. A comparative physiological study. Plant Physiology, Bethesda, v. 137, n. 1, p. 231-241, 2005.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|    |
| 4. | | ALVES, V. M. C.; MAGALHAES, J. V. de; SHAFF, J.; GUIMARÃES, C. T.; KOCHIAN, L. V. Exsudação de citrato e tolerância a alumínio em milho. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|  |
| 5. | | ALVES, V. M. C.; MAGALHAES, J. V. de; SHAFF, J.; SCHAFFERT, R. E.; GUIMARAES, C. T.; KOCHIAN, L. V. Exsudação de citrato e tolerância ao alumínio em sorgo. In: CONGRESSO NACIONAL DE MILHO E SORGO, 26.; SIMPÓSIO BRASILEIRO SOBRE A LAGARTA-DO-CARTUCHO, SPODOPTERA FRUGIPERDA, 2.; SIMPÓSIO SOBRE COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, 1., 2006, Belo Horizonte. Inovação para sistemas integrados de produção: trabalhos apresentados. [Sete Lagoas]: ABMS, 2006. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 6. | | HUFNAGEL, B.; GUIMARÃES, C. T.; CRAFT, E. J.; SHAFF, J. E.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V. Exploiting sorghum genetic diversity for enhanced aluminum tolerance: allele mining based on the AltSB locus. Scientific Reports, v. 8, p. 1-13, July 2018. Article number: 10094.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 7. | | LIU, J.; LUO, X.; SHAFF, J.; LIANG, C.; JIA, X.; LI, Z.; MAGALHAES, J.; KOCHIAN, L. V. A promoter-swap strategy between the AtALMT and AtMATE genes increased Arabidopsis aluminum resistance and improved carbon-use efficiency for aluminum resistance. The Plant Journal, Oxford, v. 71, p. 327-337, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 8. | | KOCHIAN, L.; MAGALHAES, J.; LIU, J.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; SCHAFFERT, R. E.; SHAFF, J.; ALVES, V. Molecular approaches to rhizosphere research: identification and characterization of aluminum tolerance genes and their use to improve acid soil tolerance. In: INTERNATIONAL CONFERENCE RHIZOSPHERE , 2., 2007, Montpellier. Book of abstracts... Montpellier: INRA, 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 9. | | ALVES, V. M. C.; GUIMARAES, C. T.; SHAFF, J.; KOCHIAN, L.; PARENTONI, S. N.; SCHAFFERT, R. E.; MAGALHÃES, J. Molecular and physiological analysis of aluminum tolerance in maize recombinant inbreds. In: INTERNATIONAL PLANT NUTRITION COLLOQUIUM, 16., 2009, Sacramento, California. Proceedings... Davis: University of California, 2009.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 10. | | CANÇADO, G. M. A.; PINEROS, M. A.; MARON, L. G.; SHAFF, J.; CAMARGO, S. R.; MENOSSI, M.; ALVES, V. M. C.; KOCHIAN, L. V. Cloning and characterization of an ALMT1 homologue gene in Maize. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
|  |
| 11. | | KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; GUIMARAES, C. T.; ALVES, V. M. C.; MARON, L.; SHAFF, J.; LYI, M.; SCHAFFERT, R. E. Elucidating the molecular determinants of aluminum tolerance in sorghum and maize. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 12. | | MATONYEI, T. K.; CHEPROT, R. K.; LIU, J.; PIÑEROS, M. A.; SHAFF, J. E.; GUDU, S.; WERE, B.; MAGALHAES, J. V.; KOCHIAN, L. V. Physiological and molecular analysis of aluminum tolerance in selected Kenyan maize lines. Plant and Soil, Dordrecht, v. 377, p. 357-367, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 13. | | LIU, J.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. de P.; HOEKENGA, O.; SHAFF, J.; PINEROS, M.; WANG, Y.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. Molecular cloning and characterization of AltSB, a major aluminum tolerance gene in sorghum. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 15., 2007, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2007.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 14. | | MARON, L. G.; PIÑEROS, M. A.; GUIMARAES, C. T.; MAGALHAES, J. V. de; PLEIMAN, J. K.; MAO, C.; SHAFF, J.; BELICUAS, S. N. J; KOCHIAN, L. V. Two functionally distinct members of the MATE (multi-drug and toxic compound extrusion) family of transporters potentially underlie two major aluminum tolerance QTLs in maize. The Plant Journal, Oxford, v. 61, n. 5, p. 728-740, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 15. | | ALVES, V. M. C.; MAGALHAES, J. V. de; SHAFF, J. E.; PINEROS, M. A.; PURCINO, A. A. C.; PARENTONI, S. N.; PITTA, G. V. E.; PRATES, H. T.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V. Exsudação de ácidos orgânicos como mecanismo de tolerância a alumínio em milho. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FISIOLOGIA VEGETAL, 8., 2001, Ilhéus. Anais... Ilhéus: SBFV, 2001. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 16. | | MAGALHAES, J. V. de; KOCHIAN, L.; LIU, J.; GUIMARAES, C.; LANA, U.; ALVES, V.; WANG, Y.; SCHAFFERT, R. E.; HOEKENGA, O.; PINEROS, M.; SHAFF, J.; KLEIN, P.; CARNEIRO, N.; COELHO, C.; TRICK, H.; CANIATO, F.; KRESOVICH, S.; MITCHELL, S. Positional cloning and association analysis of a mate gene that confers aluminum tolerance in sorghum via the AltSB locus. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOMES CONFERENCE, 16., 2008, San Diego, CA. [Proceedings...]. [S. l.: s.n.], 2008. p. 13.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 17. | | MAGALHAES, J. V. de; LIU, J.; GUIMARAES, C. T.; LANA, U. G. de P.; ALVES, V. M. C.; WANG, Y-H.; SCHAFFERT, R. E.; HOEKENGA, O. A.; PINEROS, M. A.; SHAFF, J. E.; KLEIN, P. E.; CARNEIRO, N. P.; COELHO, C. M.; TRICK, H. N.; KOCHIAN, L. V. A gene in the multidrug and toxic compound extrusion (MATE) family confers aluminum tolerance in sorghum. Nature Genetics, New York, v. 39, n. 9, p. 1156-1161, 2007.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Internacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| 18. | | HUFNAGEL, B.; SOUSA, S. M. de; ASSIS, L.; GUIMARAES, C. T.; LEISER, W.; AZEVEDO, G. C.; NEGRI, B.; LARSON, B. G.; SHAFF, J. E.; PASTINA, M. M.; BARROS, B. A.; WELTZIEN, E.; RATTUNDE, H. F. W.; VIANA, J. H.; CLARK, R. T.; FALCÃO, A.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V. Duplicate and conquer: multiple homologs of PHOSPHORUS-STARVATION TOLERANCE1 enhance phosphorus acquisition and sorghum performance on low-phosphorus soils. Plant Physiology, Bethesda, v. 166, p. 659-677, Oct. 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
| |
| Registros recuperados : 18 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
