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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
16/03/2017 |
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Data da última atualização: |
27/11/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
COSTA, T. S. |
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Afiliação: |
TATIANA SANTOS COSTA. |
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Título: |
Análise do perfil transcriptômico e proteômico de raízes de diferentes clones de Coffea canephora em condições de déficit hídrico. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
2014. |
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Páginas: |
235 p. |
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Descrição Física: |
il. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Tese (Doutorado) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. Orientador: Alan Carvalho Andrade, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Coorientador: Pierre Marraccini. |
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Conteúdo: |
O café é uma das principais commodities agrícolas do mundo, sendo o Brasil o maior produtor. A seca é um problema frequente no país, uma vez que é considerado um fator limitante que possibilita oscilações na produtividade do cafeeiro. Em resposta ao déficit hídrico as plantas ativam mecanismos que a auxiliam suportar períodos de seca, promovendo alterações na fotossíntese, respiração, translocação, absorção de íons, o metabolismo de nutrientes e hormônios. O presente trabalho tem por objetivo avaliar a expressão diferencial de genes e proteínas em raízes de clones de C. canephora var. Conilon, sendo o clone 22 (sensível à seca) e os clones 14, 73 e 120 (tolerantes à seca), cultivados em condições controladas em condições irrigada e sob estresse hídrico. Para cada clone e regime hídrico foi extraído o RNA total e avaliado o perfil transcriptômico e proteômico das raízes por meio do sequenciamento 454 e da espectrometria LC-MS, respectivamente. Os resultados apresentados possibilitaram uma melhor compreensão de alguns mecanismos de resposta em raízes em clones C. canephora quanto a tolerância ao déficit hídrico, por meio da diferença de expressão gênica e dos nos níveis de proteínas entre as condições avaliadas (I e NI). Foi possível verificar que, entre os clones tolerantes há diferentes mecanismos de respostas ao estresse. O pirossequenciamento 454 permitiu gerar mais de 4 milhões de reads a partir de 08 bibliotecas de raízes de C. canephora provenientes dos clones nas duas condições, o que possibilitou a ampliação dos dados de sequências para este tecido. Vários genes candidatos foram identificados e avaliados quanto à resposta da planta ao déficit hídrico, como em relação a biossíntese do ABA e aos estresses osmóticos e oxidativos. A técnica LC-MS permitiu a identificação de 598 proteínas, o que representa erca de 1% do proteoma conhecido de C. canephora. Para algumas proteínas foi possível identificar diferentes formas alélicas. De forma geral, a resposta dos clones de C. canephora ao déficit hídrico foi evidenciada neste trabalho. Na maioria dos casos há correspondência entre os resultados das técnicas ?Omicas? utilizadas. Entretanto, ainda é necessário o aprimoramento das técnicas para identificação proteica, como por meio da utilização de sequências genótipo-específicas, considerada uma alternativa para futuras análises integradas, possibilitando a compreensão dos mecanismos de regulação e dos pontos de controle do fluxo da informação gênica. Em complemento aos trabalhos anteriores, no qual foram utilizadas folhas, também foi possível identificar vários genes de tolerância à seca em raízes de cafeeiro. MenosO café é uma das principais commodities agrícolas do mundo, sendo o Brasil o maior produtor. A seca é um problema frequente no país, uma vez que é considerado um fator limitante que possibilita oscilações na produtividade do cafeeiro. Em resposta ao déficit hídrico as plantas ativam mecanismos que a auxiliam suportar períodos de seca, promovendo alterações na fotossíntese, respiração, translocação, absorção de íons, o metabolismo de nutrientes e hormônios. O presente trabalho tem por objetivo avaliar a expressão diferencial de genes e proteínas em raízes de clones de C. canephora var. Conilon, sendo o clone 22 (sensível à seca) e os clones 14, 73 e 120 (tolerantes à seca), cultivados em condições controladas em condições irrigada e sob estresse hídrico. Para cada clone e regime hídrico foi extraído o RNA total e avaliado o perfil transcriptômico e proteômico das raízes por meio do sequenciamento 454 e da espectrometria LC-MS, respectivamente. Os resultados apresentados possibilitaram uma melhor compreensão de alguns mecanismos de resposta em raízes em clones C. canephora quanto a tolerância ao déficit hídrico, por meio da diferença de expressão gênica e dos nos níveis de proteínas entre as condições avaliadas (I e NI). Foi possível verificar que, entre os clones tolerantes há diferentes mecanismos de respostas ao estresse. O pirossequenciamento 454 permitiu gerar mais de 4 milhões de reads a partir de 08 bibliotecas de raízes de C. canephora provenientes dos clones nas duas ... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Expressão gênica; Tolerância à seca. |
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Thesagro: |
Cafe; Espectrometria; Raiz. |
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Thesaurus Nal: |
Drought tolerance; Gene expression; Spectroscopy. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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500 $aTese (Doutorado) - Universidade Federal de Lavras, Lavras, MG. Orientador: Alan Carvalho Andrade, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Coorientador: Pierre Marraccini.
520 $aO café é uma das principais commodities agrícolas do mundo, sendo o Brasil o maior produtor. A seca é um problema frequente no país, uma vez que é considerado um fator limitante que possibilita oscilações na produtividade do cafeeiro. Em resposta ao déficit hídrico as plantas ativam mecanismos que a auxiliam suportar períodos de seca, promovendo alterações na fotossíntese, respiração, translocação, absorção de íons, o metabolismo de nutrientes e hormônios. O presente trabalho tem por objetivo avaliar a expressão diferencial de genes e proteínas em raízes de clones de C. canephora var. Conilon, sendo o clone 22 (sensível à seca) e os clones 14, 73 e 120 (tolerantes à seca), cultivados em condições controladas em condições irrigada e sob estresse hídrico. Para cada clone e regime hídrico foi extraído o RNA total e avaliado o perfil transcriptômico e proteômico das raízes por meio do sequenciamento 454 e da espectrometria LC-MS, respectivamente. Os resultados apresentados possibilitaram uma melhor compreensão de alguns mecanismos de resposta em raízes em clones C. canephora quanto a tolerância ao déficit hídrico, por meio da diferença de expressão gênica e dos nos níveis de proteínas entre as condições avaliadas (I e NI). Foi possível verificar que, entre os clones tolerantes há diferentes mecanismos de respostas ao estresse. O pirossequenciamento 454 permitiu gerar mais de 4 milhões de reads a partir de 08 bibliotecas de raízes de C. canephora provenientes dos clones nas duas condições, o que possibilitou a ampliação dos dados de sequências para este tecido. Vários genes candidatos foram identificados e avaliados quanto à resposta da planta ao déficit hídrico, como em relação a biossíntese do ABA e aos estresses osmóticos e oxidativos. A técnica LC-MS permitiu a identificação de 598 proteínas, o que representa erca de 1% do proteoma conhecido de C. canephora. Para algumas proteínas foi possível identificar diferentes formas alélicas. De forma geral, a resposta dos clones de C. canephora ao déficit hídrico foi evidenciada neste trabalho. Na maioria dos casos há correspondência entre os resultados das técnicas ?Omicas? utilizadas. Entretanto, ainda é necessário o aprimoramento das técnicas para identificação proteica, como por meio da utilização de sequências genótipo-específicas, considerada uma alternativa para futuras análises integradas, possibilitando a compreensão dos mecanismos de regulação e dos pontos de controle do fluxo da informação gênica. Em complemento aos trabalhos anteriores, no qual foram utilizadas folhas, também foi possível identificar vários genes de tolerância à seca em raízes de cafeeiro.
650 $aDrought tolerance
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 3. |  | PINHEIRO, F. F.; LOPES, J. F.; GOMES, E. M. L.; NASCIMENTO, W. M. Utilização do ethephon na produção de sementes híbridas de abóbora tipo tetsukabuto. Informativo Abrates, Londrina, v. 13, n. 3, p. 433, set. 2003. Trabalho apresentado no 13º Congresso Brasileiro de Sementes, 2003. Resumo.| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 5. | | BOLFE, E. L.; CARNEIRO, I. R. F.; WERNECK, G. O.; SANTOS, I.; MUSTEFAGA, P.; PORTOCARRERO, M.; RATI, F.; MATTOSO, M.; GUIMARÃES, D. D.; SILVA, M.; MENEZES, J.; WOLF, K.; FERREIRA, P. H.; CRAPINA, P. A.; RITT, E.; PRESOTTO, D.; PINHEIRO, F. F.; OLIVEIRA, M. O. M. de; RISSO, J.; ALVES JUNIOR, X. Potencialidades das certificações e da rastreabilidade para explicitar a sustentabilidade, qualidade e agregar maior valor à produção agrícola brasileira. In: BRASIL. Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Secretaria de Inovação, Desenvolvimento Sustentável e Irrigação. Potencialidades e desafios do Agro 4.0: GT III "Cadeias Produtivas e Desenvolvimento de Fornecedores" Câmara do Agro 4.0 (MAPA/MCTI). Brasília, DF, 2021. cap. III, p. 41-62.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 6. | | BOEGER, W. A.; VALIM, M. P.; ZAHER, H.; RAFAEL, J. A.; FORZZA, R. C.; PERCEQUILLO, A. R.; SEREJO, C. S.; GARRAFFONI, A. R. S.; SANTOS, A. J.; SLIPINSKI, A.; LINZMEIER, A. M.; CALOR, A. R.; GARDA, A. A.; KURY, A. B.; FERNANDES, A. C. S.; AGUDO-PADRÓN, A. I.; AKAMA, A.; SILVA NETO, A. M. da; BURBANO, A. L.; MENEZES, A.; PEREIRA-COLAVITE, A.; ANICHTCHENKO, A.; LEES, A. C.; BEZERRA, A. M. R.; DOMAHOVSKI, A. C.; PIMENTA, A. D.; ALEIXO, A. L. P.; MARCENIUK, A. P.; PAULA, A. S. de; SOMAVILLA, A.; SPECHT, A.; CAMARGO, A.; NEWTON, A. F.; SILVA, A. A. S.; SANTOS, A. B. dos; TASSI, A. D.; ARAGÃO, A. C.; SANTOS, A. P. M.; MIGOTTO, A. E.; MENDES, A. C.; CUNHA, A.; CHAGAS JÚNIOR, A.; SOUSA, A. A. T. de; PAVAN, A. C.; ALMEIDA, A. C. S.; PERONTI, A. L. B. G.; HENRIQUES-OLIVEIRA, A. L.; PRUDENTE, A. L.; TOURINHO, A. L.; PES, A. M. O.; CARMIGNOTTO, A. P.; WENGRAT, A. P. G. da S.; DORNELLAS, A. P. S.; MOLIN, A. D.; PUKER, A.; MORANDINI, A. C.; FERREIRA, A. da S.; MARTINS, A. L.; ESTEVES, A. 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C.; LUCINDA, P.; COSTA, P. M. S.; ALVES, P. P.; ROTH, P. R. de O.; COELHO, P. R. S.; DUARTE, P. R. M.; CARVALHO, P. F. de; GNASPINI, P.; SOUZA-DIAS, P. G. B.; LINARDI, P. M.; BARTHOLOMAY, P. R.; DEMITE, P. R.; BULIRSCH, P.; BOLL, P. K.; PEREIRA, R. M. M.; SILVA, R. A. P. F.; MOURA, R. B. de; BOLDRINI, R.; SILVA, R. A. da; FALASCHI, R. L.; CORDEIRO, R. T. S.; MELLO, R. J. C. L.; SINGER, R. A.; QUERINO, R. B.; HELEODORO, R. A.; CONSTANTINO, R.; GUEDES, R. C.; CARRENHO, R.; GOMES, R. S.; GREGORIN, R.; MACHADO, R. J. P.; BÉRNILS, R. S.; CAPELLARI, R. S.; SILVA, R. B.; KAWADA, R.; DIAS, R. M.; SIEWERT, R.; BRUGNERA, R.; LESCHEN, R. A. B.; CONSTANTIN, R.; ROBBINS, R.; PINTO, R. R.; REIS, R. E. dos; RAMOS, R. T. da C.; CAVICHIOLI, R. R.; BARROS, R. C. de; CAIRES, R. A.; SALVADOR, R. B.; MARQUES, R. C.; ARAÚJO, R. C.; ARAUJO, R. de O.; DIOS, R. de V. P.; JOHNSSON, R.; FEITOSA, R. M.; HUTCHINGS, R. W.; LARA, R. I. R.; ROSSI, R. V.; GERSTMEIER, R.; OCHOA, R.; HUTCHINGS, R. S. G.; ALE-ROCHA, R.; ROCHA, R. M. da; TIDON, R.; BRITO, R.; PELLENS, R.; SANTOS, S. R. dos; SANTOS, S. D. dos; PAIVA, S. V.; SANTOS, S.; OLIVEIRA, S. S. de; COSTA, S. C.; GARDNER, S. L.; LEAL, S. A. M.; ALOQUIO, S.; BONECKER, S. L. C.; BUENO, S. L. de S.; ALMEIDA, S. M. de; STAMPAR, S. N.; ANDENA, S. R.; POSSO, S. R.; LIMA, S. P.; GADELHA, S. de S.; THIENGO, S. C.; COHEN, S. C.; BRANDÃO, S. N.; ROSA, S. P.; RIBEIRO, S. L. B.; LETANA, S. D.; SANTOS, S. B. dos; ANDRADE, S. C. S.; DÁVILA, S.; VAZ, S.; PECK, S. B.; CHRISTO, S. W.; CUNHA, S. B. Z.; GOMES, S. R.; DUARTE, T.; MADEIRA-OTT, T.; MARQUES, T.; ROELL, T.; LIMA, T. C. de; SEPULVEDA, T. A.; MARIA, T. F.; RUSCHEL, T. P.; RODRIGUES, T.; MARINHO, T. A.; ALMEIDA, T. M. de; MIRANDA, T. P.; FREITAS, T. R. O.; PEREIRA, T. P. L.; ZACCA, T.; PACHECO, T. L.; MARTINS, T. F.; ALVARENGA, T. M.; CARVALHO, T. R. de; POLIZEI, T. T. S.; MCELRATH, T. C.; HENRY, T.; PIKART, T. G.; PORTO, T. J.; KROLOW, T. K.; CARVALHO, T. P.; LOTUFO, T. 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| Biblioteca(s): Embrapa Florestas; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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