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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Milho e Sorgo. |
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Data corrente: |
01/12/2016 |
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Data da última atualização: |
01/12/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
GIUSEPPE, P. O. de; SANTOS, M. L. dos; SOUSA, S. M. de; KOCH, K. E.; YUNES, J. A.; APARICIO, R.; MURAKAMI, M. T. |
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Afiliação: |
Priscila Oliveira de Giuseppe, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM; Marcelo Leite dos Santos, Universidade de Campinas; SYLVIA MORAIS DE SOUSA TINOCO, CNPMS; Karen E. Koch, Universidade da Florida; José Andrés Yunes, Universidade de Campinas; Ricardo Aparicio, Universidade de Campinas; Mario Tyago Murakami, Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais - CNPEM. |
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Título: |
A comparative structural analysis reveals distinctive features of cofactor binding and substrate specificity in plant aldo-keto reductases. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
Biochemical and Biophysical Research Communications, v. 474, p. 696-701, 2016. |
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DOI: |
10.1016/j.bbrc.2016.05.011 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Plant aldo-keto reductases of the AKR4C subfamily play key roles during stress and are attractive targets for developing stress-tolerant crops. However, these AKR4Cs show little to no activity with previouslyenvisioned sugar substrates. We hypothesized a structural basis for the distinctive cofactor binding and substrate specificity of these plant enzymes. To test this, we solved the crystal structure of a novel AKR4C subfamily member, the AKR4C7 from maize, in the apo form and in complex with NADPþ. The binary complex revealed an intermediate state of cofactor binding that preceded closure of Loop B, and also indicated that conformational changes upon substrate binding are required to induce a catalyticallyfavorable conformation of the active-site pocket. Comparative structural analyses of homologues (AKR1B1, AKR4C8 and AKR4C9) showed that evolutionary redesign of plant AKR4Cs weakened interactions that stabilize the closed conformation of Loop B. This in turn decreased cofactor affinity and altered configuration of the substrate-binding site. We propose that these structural modifications contribute to impairment of sugar reductase activity in favor of other substrates in the plant AKR4C subgroup, and that catalysis involves a three-step process relevant to other AKRs. |
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Thesagro: |
Enzima; Reductase. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
LEADER 02042naa a2200229 a 4500
001 2057658
005 2016-12-01
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1016/j.bbrc.2016.05.011$2DOI
100 1 $aGIUSEPPE, P. O. de
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260 $c2016
520 $aPlant aldo-keto reductases of the AKR4C subfamily play key roles during stress and are attractive targets for developing stress-tolerant crops. However, these AKR4Cs show little to no activity with previouslyenvisioned sugar substrates. We hypothesized a structural basis for the distinctive cofactor binding and substrate specificity of these plant enzymes. To test this, we solved the crystal structure of a novel AKR4C subfamily member, the AKR4C7 from maize, in the apo form and in complex with NADPþ. The binary complex revealed an intermediate state of cofactor binding that preceded closure of Loop B, and also indicated that conformational changes upon substrate binding are required to induce a catalyticallyfavorable conformation of the active-site pocket. Comparative structural analyses of homologues (AKR1B1, AKR4C8 and AKR4C9) showed that evolutionary redesign of plant AKR4Cs weakened interactions that stabilize the closed conformation of Loop B. This in turn decreased cofactor affinity and altered configuration of the substrate-binding site. We propose that these structural modifications contribute to impairment of sugar reductase activity in favor of other substrates in the plant AKR4C subgroup, and that catalysis involves a three-step process relevant to other AKRs.
650 $aEnzima
650 $aReductase
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700 1 $aMURAKAMI, M. T.
773 $tBiochemical and Biophysical Research Communications$gv. 474, p. 696-701, 2016.
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Registro original: |
Embrapa Milho e Sorgo (CNPMS) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
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Data corrente: |
14/10/2011 |
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Data da última atualização: |
17/10/2011 |
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Autoria: |
LIMA, R. B. de A.; SILVA, J. A. A. da; MARANGON, L. C.; FERREIRA, R. L. C.; SILVA, R. K. S. da. |
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Afiliação: |
ROSIVAL BARROS DE ANDRADE LIMA, UFRPE; JOSÉ ANTÔNIO ALEIXO DA SILVA, UFRPE; LUIZ CARLOS MARANGON, UFRPE; RINALDO LUIZ CARACIOLO FERREIRA, UFRPE; ROSEANE KARLA SOARES DA SILVA, UFRPE. |
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Título: |
Sucessão ecológica de um trecho de Floresta Ombrófila Densa de Terras Baixas, Carauari, Amazonas. |
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Ano de publicação: |
2011 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Florestal Brasileira, Colombo, v. 31, n. 67, p. 161-172, jul./set. 2011. |
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DOI: |
10.4336/2011.pfb.31.67.161 |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O presente trabalho foi realizado em um trecho de Floresta Ombrofila Densa de Terras Baixas no Municipio de Carauari, Amazonas, tendo como objetivo estimar a composicao floristica do estrato arboreo e classificar as especies nos respectivos grupos ecologicos, a fim de se obter informacoes sobre a atual situacao do fragmento florestal, para embasar estrategias de conservacao e preservacao, bem como embasar a formulacao de pesquisas que visem a disseminacao do conhecimento e sua aplicacao na producao sustentavel. O inventario florestal foi realizado em uma area de 275 ha, cortada por tres transectos (822 m, 1.265 m e 2.349 m), totalizando 4.436 m. Foram instaladas parcelas de 20 m x 25 m, equidistantes a cada 50 m e intercaladas a direita e a esquerda da linha do transecto, totalizando 66 unidades amostrais. Foram identificados e medidos todos os individuos arboreos que apresentaram circunferencia a 1,30 m do solo (CAP) ? 25 cm. Registraram-se 3.050 individuos, distribuidos em 133 especies, 93 generos e 49 familias. Quanto a classificacao sucessional, as especies de inicio de sucessao (pioneiras + secundarias iniciais) foram em maior numero, demonstrando caracteristicas de uma floresta em estagio inicial no desenvolvimento sucessional. |
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Palavras-Chave: |
Florística; Grupo ecológico. |
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Thesaurus NAL: |
Amazonia. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/43305/1/Sucessao-ecologica-de-um-trecho-de-Floresta-Ombrofila-Densa-de-Terras-Baixas-Carauari-Amazonas.pdf
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Marc: |
LEADER 01956naa a2200217 a 4500
001 1903074
005 2011-10-17
008 2011 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.4336/2011.pfb.31.67.161$2DOI
100 1 $aLIMA, R. B. de A.
245 $aSucessão ecológica de um trecho de Floresta Ombrófila Densa de Terras Baixas, Carauari, Amazonas.$h[electronic resource]
260 $c2011
520 $aO presente trabalho foi realizado em um trecho de Floresta Ombrofila Densa de Terras Baixas no Municipio de Carauari, Amazonas, tendo como objetivo estimar a composicao floristica do estrato arboreo e classificar as especies nos respectivos grupos ecologicos, a fim de se obter informacoes sobre a atual situacao do fragmento florestal, para embasar estrategias de conservacao e preservacao, bem como embasar a formulacao de pesquisas que visem a disseminacao do conhecimento e sua aplicacao na producao sustentavel. O inventario florestal foi realizado em uma area de 275 ha, cortada por tres transectos (822 m, 1.265 m e 2.349 m), totalizando 4.436 m. Foram instaladas parcelas de 20 m x 25 m, equidistantes a cada 50 m e intercaladas a direita e a esquerda da linha do transecto, totalizando 66 unidades amostrais. Foram identificados e medidos todos os individuos arboreos que apresentaram circunferencia a 1,30 m do solo (CAP) ? 25 cm. Registraram-se 3.050 individuos, distribuidos em 133 especies, 93 generos e 49 familias. Quanto a classificacao sucessional, as especies de inicio de sucessao (pioneiras + secundarias iniciais) foram em maior numero, demonstrando caracteristicas de uma floresta em estagio inicial no desenvolvimento sucessional.
650 $aAmazonia
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653 $aGrupo ecológico
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700 1 $aMARANGON, L. C.
700 1 $aFERREIRA, R. L. C.
700 1 $aSILVA, R. K. S. da
773 $tPesquisa Florestal Brasileira, Colombo$gv. 31, n. 67, p. 161-172, jul./set. 2011.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
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