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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
11/11/2015 |
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Data da última atualização: |
18/05/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, G. A. F.; DANTAS, J. L. L.; OLIVEIRA, E. J. de. |
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Afiliação: |
G. A. F. OLIVEIRA, UFRB; JORGE LUIZ LOYOLA DANTAS, CNPMF; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF. |
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Título: |
Development and validation of minisatellite markers for Carica papaya. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Biologia Plantarum, v. 59, n.4, p 686-694, 2015. |
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DOI: |
10.1007/s10535-015-0551-9686 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Whereas microsatellite markers are well described, there are few studies investigating minisatellites. Therefore, this study aimed to identify, characterize, and validate minisatellite loci for papaya (Carica papaya L.). The entire papaya genome, which covers 330 Mb, was used to mine minisatellites with motifs ranging from 6 to 500 bp, and at least six replicates and 82 loci were validated in a set of 24 accessions. A total of 1 730 minisatellite loci were identified, located in 695 sequences, with an average of one minisatellite every 156 kb. Variation in GC content ranged from 0.00 to 83.84 % with an average of 28.84 % indicating that these papaya minisatellites are AT rich. Motifs of up to 20 bases represented 71.45 % of the markers. In addition, the observed variation in the number of motif repeats was from 6 to 186 with an average of 9.27 per minisatellite. Independent of the classification, the frequency of minisatellites decreased with an increase in the number of repeating units. Among the validated loci, 48.78 % were found to be polymorphic, and the number of alleles (NA) ranged from two to seven with a mean of 3.10. The average polymorphic information content (PIC), expected heterozygosity (He), and observed heterozygosity (Ho) were 0.38, 0.43, and 0.11, respectively. According to genetic diversity parameters, such as NA, He, and PIC, no significant correlations were found among the size of motifs, the number of repeats, and the GC content of these minisatellites. This study clearly demonstrates the polymorphism of minisatellites and their potential use in detection of intraspecific genetic variations in C. papaya. The results will be useful when managing genetic resources and plant breeding. MenosWhereas microsatellite markers are well described, there are few studies investigating minisatellites. Therefore, this study aimed to identify, characterize, and validate minisatellite loci for papaya (Carica papaya L.). The entire papaya genome, which covers 330 Mb, was used to mine minisatellites with motifs ranging from 6 to 500 bp, and at least six replicates and 82 loci were validated in a set of 24 accessions. A total of 1 730 minisatellite loci were identified, located in 695 sequences, with an average of one minisatellite every 156 kb. Variation in GC content ranged from 0.00 to 83.84 % with an average of 28.84 % indicating that these papaya minisatellites are AT rich. Motifs of up to 20 bases represented 71.45 % of the markers. In addition, the observed variation in the number of motif repeats was from 6 to 186 with an average of 9.27 per minisatellite. Independent of the classification, the frequency of minisatellites decreased with an increase in the number of repeating units. Among the validated loci, 48.78 % were found to be polymorphic, and the number of alleles (NA) ranged from two to seven with a mean of 3.10. The average polymorphic information content (PIC), expected heterozygosity (He), and observed heterozygosity (Ho) were 0.38, 0.43, and 0.11, respectively. According to genetic diversity parameters, such as NA, He, and PIC, no significant correlations were found among the size of motifs, the number of repeats, and the GC content of these minisatellites. ... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Carica Papaya; Mamão; Variação genética. |
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Thesaurus Nal: |
Genetic variation. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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001 2028333
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650 $aGenetic variation
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700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Cutter |
Registro |
Volume |
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URL |
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| Registros recuperados : 36 | |
| 1. |  | NASCIMENTO, M. L.; HAJI, F. N. P.; CRUZ, I. Controle biológico da lagarta do cartucho do milho Spodoptera frugiperda (J.Smith, 1797) (Lep.: Noctuidae) com uso de vírus da poliedrose nuclear (VPN) na região do submédio São Francisco- PE. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 15.; ENCONTRO NACIONAL DE FITOSSANITARISTAS, 6.; SIMPÓSIO INTEGRADO DE MANEJO DE PRAGAS, 2., 1995, Caxambu, MG. Resumos. [Caxambu]: Sociedade Entomologica do Brasil; Lavras: ESAL, 1995. p. 354.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 3. | | CHAVES, A. S.; NASCIMENTO, M. L.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; ALENCAR, M. M. de; LANNA, D. P. Relationship of efficiency indices with performance, heart rate, oxygen consumption, blood parameters, and estimated heat production in Nellore steers. Journal of Animal Science, v. 93, n. 10, p. 5036?5046, October 2015| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 4. | | CHAVES, A. S.; NASCIMENTO, M. L. do; TULLIO, R. R.; BERNDT, A.; ALENCAR, M. M. de; LANNA, D. P. D. Desempenho e características de carcaça de bovinos Nelore em função do consumo alimentar residual. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 5. | | CAVALI, J.; PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; SALES, M. F. L.; NASCIMENTO, M. L.; ACEDO, T. S. Ofertas de suplementos múltiplos para tourinhos na fase de recria, em pastagens durante o período da seca: desempenho produtivo. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., 2012, Brasília. A produção animal no mundo em transformação: anais. Brasília, DF: SBZ, 2012. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 6. | | NASCIMENTO, M. L.; CAPALBO, D. M. F.; MORAES, G. J.; NARDO, E. A. B. de; LUIZ, A. J. B. Avaliação do efeito de um produto a base de Bacillus thuringiensis sobre o predador Podisus nigrispinus. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 5., 1996, Foz do Iguaçu, PR. Anais: sessão de posters. Londrina: EMBRAPA-CNPSo/COBRAFI, 1996. p.295.| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 7. | | CAVALI, J.; PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; SALES, M. F. L.; NASCIMENTO, M. L.; RODRIGUES, J. F. H. Associações de fontes energéticas e protéicas em suplementos múltiplos para tourinhos na fase de recria em pastagens, durante o período de transição seca-águas: desempenho produtivo. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém. Anais... Belém: SBZ, 2011.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 8. | | PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; CAVALI, J.; SALES, M. F. L.; NASCIMENTO, M. L.; BARROS, L. V. de. Fontes energéticas e protéicas em suplementos múltiplos para tourinhos na fase de recria em pastagens, durante o período de transição seca-águas: digestibilidade. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 48., 2011, Belém. O desenvolvimento da produção animal e a responsabilidade frente a novos desafios: anais. Belém: SBZ, 2011. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 9. | | CHAVES, A. S.; NASCIMENTO, M. L. do; TULLIO, R. R.; BERNDT, A.; ALENCAR, M. M. de; LANNA, D. P. D. Qualidade de carne de bovinos Nelore em função do consumo alimentar residual. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 49., Brasília, DF. A produção animal no mundo em transformação: Anais. Brasília: SBZ, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 10. | | RODRIGUES, A. B. B.; DIESEL, T.; SILVA, M. L. P. da; PAÇÓ, A. L.; NASCIMENTO, M. L. do; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de. Rendimento de cortes cárneos de bovinos cruzados, filhos de touros Angus e Limousin terminados em confinamento. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE CARNES, 6., Campinas. Trabalhos científicos.... Campinas: ITAL: CTC, 2011.| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 11. | | CHAVES, A. S.; NASCIMENTO, M. L.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; ROSA, A. do N.; LANNA, D. P. D. Relationship of feed efficiency indexes and profitability in Nellore steers. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 51., 2014, Barra dos Coqueiros. A produção animal frente às mudanças climáticas e tecnológicas - anais. Barra dos coqueiros: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 12. | | NASCIMENTO, M. L.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; LIMA, J. S.; VIEIRA, L. D. C.; SILVA, M. L. P.; LANNA, D. P. D. Residual feed intake in progeny of Nellore bulls. Journal of Animal Science, v. 88, (E-Suppl. 2), p. 699, 2010; Journal of Dairy Science, v. 93, (E-Suppl. 1), p. 699, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 14. | | TULLIO, R. R.; VIEIRA, L. D. do C.; ALENCAR, M. M. de; MANCINI, P. C.; NASCIMENTO, M. L. do; CRUZ, G. M. da. Desempenho de bovinos, machos e fêmeas, filhos de vacas cruzadas ½ Angus + ½ Nelore e ½ Simental + ½ Nelore acasaladas com touros das raças Angus e Wagyu, terminados em confinamento. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA ZOOTECNIA, 47., 2010, Salvador. Empreendorismo e progresso científicos na zootecnia brasileira de vanguarda - anais. Salvador: SBZ: UFBA, 2010.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 15. | | OLIVEIRA, P. S. N.; MALAGO JUNIOR, W.; TIZIOTO, P. C.; NASCIMENTO, M. L. do; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A. NEUROD1 gene is not associated with feed efficiency in Nellore cattle. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON ANIMAL FUNCTIONAL GENOMICS, 5., 2013, Guarujá. Abstract... Guarujá:[ s.n.], 2013. AB.28.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 16. | | PORTO, M. O.; PAULINO, M. F.; DETMANN, E.; VALADARES FILHO, S. de C.; SALES, M. F. L.; CAVALI, J.; NASCIMENTO, M, L. do; ACEDO, T. S. Ofertas de suplementos múltiplos para tourinhos Nelore na fase de recria em pastagens durante o período da seca: desempenho produtivo e características nutricionais. Revista Brasileira de Zootecnia, Viçosa, MG, v. 40, n. 11, p. 2548-2557, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre. |
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| 17. | | NASCIMENTO, M. L.; TULLIO, R. R.; ALENCAR, M. M. de; LIMA, J. S.; VIEIRA, L. D. C.; SILVA, M. L. P.; LANNA, D. P. D. Performance, feed intake, residual feed intake and feed: again ratio in progeny of Nellore steers housed in individual or group pens. Journal of Animal Science, v. 88, (E-Suppl. 2), p. 699, 2010; Journal of Dairy Science, v. 93, (E-Suppl. 1), p. 699, 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 18. | | NASCIMENTO, M. L.; MORAES, G. J. de; CAPALBO, D. M. F.; MAIA, A. de H. N.; OLIVEIRA, R. C. A. L. Efeito de Bacillus thuringiensis na biologia de Podisus nigrispinus (HETEROPTERA: PENTATOMIDAE). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ENTOMOLOGIA, 16.; ENCONTRO NACIONAL DE FITOSSANITARISTAS, 7., 1997, Salvador. Resumos. Salvador: SEB / EMBRAPA-CNPMF, 1997. p.236| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 19. | | NASCIMENTO, M. L.; CAPALBO, D. M. F.; MORAES, G. J. de; MAIA, A. de H. N.; NARDO, E. A. B. de. Efeito de produto a base de Bacillus thuringiensis var. kurstaki na longevidade, sobrevivência e preferência alimentar de Podisus nigrispinus. In: SIMPÓSIO DE CONTROLE BIOLÓGICO, 6., 1998, Rio de Janeiro. Anais: sessões de pôsteres. Rio de Janeiro: FIOCRUZ/EMBRAPA, 1998. p.93.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio Ambiente. |
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| 20. | | BORGES, M. de F.; GARRUTI, D. dos S.; ARAUJO, I. M. da S.; NASCIMENTO, M. L. C.; WURLITZER, N. J.; BENEVIDES, S. D. Stability of a mixed tropical fruit juice with functional properties. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA E TECNOLOGIA DE ALIMENTOS, 24., 2014, Aracaju. Anais... Aracaju: sbCTA, 2014. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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