| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Suínos e Aves. Para informações adicionais entre em contato com cnpsa.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Suínos e Aves. |
|
Data corrente: |
31/03/2015 |
|
Data da última atualização: |
29/06/2015 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
PACCHION, R. G.; CARVALHO, F. M.; THOMPSON, C. E.; FAUSTINO, A. L. F.; NICOLINI, F.; PEREIRA, T. S.; SILVA, R. C. B.; CANTAO, M. E.; GERBER, A.; VASCONCELOS, A. T. R.; AGNEZ-LIMA, L. F. |
|
Afiliação: |
RALFO G. PACCHION, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; FABÍOLA M. CARVALHO, Laboratório Nacional de Computação Científica; CLAUDIA E. THOMPSON, UFRGS; ANDRE, L. F. FAUSTINO, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; FERNANDA NICOLINI, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; TATIANA S. PEREIRA, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; RITA C. B. SILVA, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ALEXANDRA GERBER, Laboratório Nacional de Computação Científica; ANA T. R. VASCONCELOS, Laboratório Nacional de Computação Científica; LUCYMARA F. AGNEZ-LIMA, UFRN/Departamento de Genética e Biologia Celular. |
|
Título: |
Taxonomic and functional profiles of soil samples from Atlantic Forest and caatinga biomes in northeastern Brazil |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
MicrobiologyOpen, Brussels, v. 3, n. 3, p. 299-315, 2014. DOI: 10.1002/mbo3.169. |
|
DOI: |
10.1002/mbo3.169 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Although microorganisms play crucial roles in ecosystems, metagenomic analyses of soil samples are quite scarce, especially in the Southern Hemisphere. In this work, the microbial diversity of soil samples from an Atlantic Forest and Caatinga was analyzed using a metagenomic approach. Proteobacteria and Actinobacteria were the dominant phyla in both samples. Among which, a significant proportion of stress-resistant bacteria associated to organic matter degradation was found. Sequences related to metabolism of amino acids, nitrogen, and DNA and stress resistance were more frequent in Caatinga soil, while the forest sample showed the highest occurrence of hits annotated in phosphorous metabolism, defense mechanisms, and aromatic compound degradation subsystems. The principal component analysis (PCA) showed that our samples are close to the desert metagenomes in relation to taxonomy, but are more similar to rhizosphere microbiota in relation to the functional profiles. The data indicate that soil characteristics affect the taxonomic and functional distribution; these characteristics include low nutrient content, high drainage (both are sandy soils), vegetation, and exposure to stress. In both samples, a rapid turnover of organic matter with low greenhouse gas emission was suggested by the functional profiles obtained, reinforcing the importance of preserving natural areas. |
|
Palavras-Chave: |
Bioinformática. |
|
Thesagro: |
Microbiologia do solo. |
|
Thesaurus Nal: |
Metagenomics; Soil biology. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02320naa a2200301 a 4500
001 2012489
005 2015-06-29
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1002/mbo3.169$2DOI
100 1 $aPACCHION, R. G.
245 $aTaxonomic and functional profiles of soil samples from Atlantic Forest and caatinga biomes in northeastern Brazil$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aAlthough microorganisms play crucial roles in ecosystems, metagenomic analyses of soil samples are quite scarce, especially in the Southern Hemisphere. In this work, the microbial diversity of soil samples from an Atlantic Forest and Caatinga was analyzed using a metagenomic approach. Proteobacteria and Actinobacteria were the dominant phyla in both samples. Among which, a significant proportion of stress-resistant bacteria associated to organic matter degradation was found. Sequences related to metabolism of amino acids, nitrogen, and DNA and stress resistance were more frequent in Caatinga soil, while the forest sample showed the highest occurrence of hits annotated in phosphorous metabolism, defense mechanisms, and aromatic compound degradation subsystems. The principal component analysis (PCA) showed that our samples are close to the desert metagenomes in relation to taxonomy, but are more similar to rhizosphere microbiota in relation to the functional profiles. The data indicate that soil characteristics affect the taxonomic and functional distribution; these characteristics include low nutrient content, high drainage (both are sandy soils), vegetation, and exposure to stress. In both samples, a rapid turnover of organic matter with low greenhouse gas emission was suggested by the functional profiles obtained, reinforcing the importance of preserving natural areas.
650 $aMetagenomics
650 $aSoil biology
650 $aMicrobiologia do solo
653 $aBioinformática
700 1 $aCARVALHO, F. M.
700 1 $aTHOMPSON, C. E.
700 1 $aFAUSTINO, A. L. F.
700 1 $aNICOLINI, F.
700 1 $aPEREIRA, T. S.
700 1 $aSILVA, R. C. B.
700 1 $aCANTAO, M. E.
700 1 $aGERBER, A.
700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R.
700 1 $aAGNEZ-LIMA, L. F.
773 $tMicrobiologyOpen, Brussels$gv. 3, n. 3, p. 299-315, 2014. DOI: 10.1002/mbo3.169.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Suínos e Aves (CNPSA) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Amazônia Oriental. Para informações adicionais entre em contato com cpatu.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Oriental. |
|
Data corrente: |
31/05/2016 |
|
Data da última atualização: |
19/05/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Circulação/Nível: |
A - 1 |
|
Autoria: |
SALESKA, S. R.; WU, J.; GUAN, K.; ARAUJO, A. C.; HUETE, A.; NOBRE, A. D.; RESTREPO-COUPE, N. |
|
Afiliação: |
Scott R. Saleska, University of Arizona; Jin Wu, University of Arizona; Kaiyu Guan, Stanford University; ALESSANDRO CARIOCA DE ARAUJO, CPATU; Alfredo Huete, University of Technology Sydney; Antonio D. Nobre, INPE / INPA; Natalia Restrepo-Coupe, University of Technology Sydney. |
|
Título: |
Dry-season greening of Amazon forests. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
Nature, v. 531, n. 7594, p. E4-E5, Mar. 2016. |
|
DOI: |
10.1038/nature16457 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Thesagro: |
Floresta Tropical; Seca. |
|
Thesaurus NAL: |
Amazonia. |
|
Categoria do assunto: |
K Ciência Florestal e Produtos de Origem Vegetal |
|
Marc: |
LEADER 00603naa a2200229 a 4500
001 2045944
005 2022-05-19
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1038/nature16457$2DOI
100 1 $aSALESKA, S. R.
245 $aDry-season greening of Amazon forests.$h[electronic resource]
260 $c2016
650 $aAmazonia
650 $aFloresta Tropical
650 $aSeca
700 1 $aWU, J.
700 1 $aGUAN, K.
700 1 $aARAUJO, A. C.
700 1 $aHUETE, A.
700 1 $aNOBRE, A. D.
700 1 $aRESTREPO-COUPE, N.
773 $tNature$gv. 531, n. 7594, p. E4-E5, Mar. 2016.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Expressão de busca inválida. Verifique!!! |
|
|
