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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
Data corrente: |
18/06/2012 |
Data da última atualização: |
13/07/2017 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F. |
Afiliação: |
LEANDRO COSTA DO NASCIMENTO, UNICAMP; GUSTAVO GILSON LACERDA COSTA, UNICAMP; ELISEU BINNECK, CNPSO; GONÇALO AMARANTE GUIMARÃES PEREIRA, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP. |
Título: |
A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression. |
Palavras-Chave: |
Bioinformática; Expressão genética. |
Thesagro: |
Gene; Soja. |
Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Gene expression; Genes; Soybeans. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/61065/1/gmb.web-based.v35n1s.203-211.2012.pdf
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Marc: |
LEADER 01639naa a2200265 a 4500 001 1926586 005 2017-07-13 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aNASCIMENTO, L. C. do 245 $aA web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project$bdatabases and pipelines. 260 $c2012 520 $aThe Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression. 650 $aBioinformatics 650 $aGene expression 650 $aGenes 650 $aSoybeans 650 $aGene 650 $aSoja 653 $aBioinformática 653 $aExpressão genética 700 1 $aCOSTA, G. G. L. 700 1 $aBINNECK, E. 700 1 $aPEREIRA, G. A. G. 700 1 $aCARAZZOLLE, M. F. 773 $tGenetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto$gv. 35, n. 1, suppl., p. 203-211, May 2012.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registros recuperados : 758 | |
701. | | CUNHA, G. A. P. da; REINHARDT, D. H.; SOUZA, L. F. da S.; MATOS, A. P. de; ALVES, A. de A.; SANCHES, N. F.; CABRAL, J. R. S.; RITZINGER, C. H. S. P.; SANTOS, A. C. F. Cultura do abacaxi: sistema de produção para Itaberaba, BA. Cruz das Almas: Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, 2004. 35 p. ( Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. Documentos, 138).Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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702. | | ALVES, A. C.; RIBEIRO, D. B. de C. L.; COTRIN, J. V.; RESENDE, H. R. A. de; DRUMMOND, C. D.; ALMEIDA, F. R. C. L. de; VICENTE NETO, J.; SOUSA, R. V. de. Descrição morfológica do coração e dos vasos da base do jacaré-do-pantanal (Caiman yacare Daudin, 1802) proveniente de zoocriadouro. Pesquisa Veterinária Brasileira, Brasília, DF, v. 36 (supl. 1), p. 8-14, jun. 2016.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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703. | | OLIVEIRA, A. L. B. de; MACEDO, G. C. de; ROSINHA, G. M. S.; MELGAREJO, J. L.; ALVES, A. G. L.; BARRETO, W. T. G.; SANTOS, F. M.; CAMPOS, J. B. V.; HERRERA, H. M.; OLIVEIRA, C. E. de. Detection of Brucella spp. in dogs at Pantanal wetlands. Brazilian Journal of Microbiology, v. 50, n. 1, p. 307-312, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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704. | | ROGERIO, M. C. P.; MARTINS, E. C.; SHIOTSUKI, L.; POMPEU, R. C. F. F.; MUIR, J. P.; ARAÚJO, A. R.; OLIVEIRA, D. de S.; MAGALHÃES, J. L. L.; CAMPOS, W. E.; FACO, O.; ALVES, A. A. Economic viability of finishing lambs in the feedlot using bovine cheese whey as a dietary ingredient. Small Ruminant Research, v. 170, p. 131-136, Jan. 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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705. | | GARCIA, R. M.; RATTES, J. F.; GARCIA, I. M.; RODRIGUES, M. A. F.; MARQUES, A. F.; CASTRO, D. F. de; SILVA, C. M.; SOUZA, C. R. de; RIBEIRO, J. S. GUERRA, G. M.; ALVES, A. F.; MARINHO, J. A. A. Eficácia do Zetacipermetrina e Bifentrina no controle de Spodoptera eridanea na cultura do algodoeiro na região Sudoeste do Estado de Goiás. In: CONGRESSO BRASILEIRO DO ALGODÃO, 6., 2007, Uberlândia. Resumos... Uberlândia, 2007. p. 1-4 1 CD-ROMBiblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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709. | | VISOLI, M. C.; GONZALES, L. E.; LEMOS, T. V. A.; ALVES, A. A.; BERTIN, P. R. B.; SILVA, A. R. da; SIMAO, V. P. M.; VACARI, I.; PRAXEDES, M. G. G. Infoteca-e: Repositório de Informação Tecnológica da Embrapa. Versão 2.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2017.Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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713. | | FARIAS, M. P. de; CAPDEVILLE, G. de; FALCAO, R.; MORAES, P. B. de; LEAO, A. P.; CAMILLO, J.; CUNHA, R. N. V. da; ALVES, A. A.; SOUZA JUNIOR, M. T. Microscopic characterization of American oil palm (Elaeis oleifera (Kunth) Cortés) floral development. Flora, v. 243, p. 88-100, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Amazônia Ocidental. |
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714. | | CARRIERO, M. M.; HENRIQUE SILVA, F.; MEIRA, C. M.; GATO, I. M. Q.; CAETANO, A. R.; LOBO, F. P.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; MAIA, A. A. M. Molecular characterization and gene expression analysis of the pro-inflammatory cytokines IL-1beta and IL-8 in the South American fish Piaractus mesopotamicus challenged with Aeromonas dhakensis. Genetics and Molecular Biology, v. 43, n. 4, e20200006, 2020.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
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Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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717. | | ALVES, A. A.; LAVIOLA, B. G.; GURGEL, F. de L.; ROSADO, T. B.; ROCHA, R. B.; BHERING, L. L.; COSTA, J. Z.; COSTA, R. D.; OLIVEIRA, F. S.; TRENHAGO, E. D. Ganhos genéticos preditos com a seleção precoce de indivíduos de maior rendimento no banco de germoplasma de Pinhão Manso (Jatropha curcas L.). In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil. [Búzios]: SBMP, 2011. Não paginado.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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718. | | CAMILLO, J.; LEAO, A. P.; ALVES, A. A.; FORMIGHIERI, E. F.; AZEVEDO, A. L. S.; NUNES, J. D.; CAPDEVILLE, G. de; MATTOS, J. K. de A.; SOUZA JUNIOR, M. T. Reassessment of the genome size in elaeis guineensis and elaeis oleifera, and its interspecific hybrid. Genomics Insights, v. 7, p. 13-22, 2014.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
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Biblioteca(s): Embrapa Roraima. |
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720. | | ROGERIO, M. C. P.; FERNANDES, F. E. P.; POMPEU, R. C. F. F.; GUEDES, F. L.; ALVES, A. A.; CARVALHO, W. F. de; OLIVEIRA, D. de S.; ARAÚJO, A. R.; MEMÓRIA, H. de Q. Potencial forrageiro da vegetação nativa da Caatinga para o pastejo de ovinos. Sobral: Embrapa Caprinos e Ovinos, 2020. 46 p. (Embrapa Caprinos e Ovinos. Documentos, 139).Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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