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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
18/10/2019 |
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Data da última atualização: |
23/10/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PEREIRA, L. F. P.; SCHENK, J. C. M.; MALUF, M. P.; SANT'ANA, G. C.; NOGUEIRA, L.; PEREIRA, L. A.; SILVA, B. S. R. da; GUIMARÃES, P. de S.; GUERREIRO FILHO, O.; PADILHA, L. |
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Afiliação: |
LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; Juliana C. M. Schenk, Bolsista CNPq/INCT/Embrapa Café/IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa; Gustavo C. Sant'ana, Tropical Melhoramento & Genética - TMG; Livia Nogueira, Universidade Estadual de Londrina - UEL. Bolsista CAPES; Ligia A. Pereira, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/CPG; Bruna S. R. da Silva, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/DSc; Paula de S. Guimarães, Bolsista Consórcio Pesquisa Café/CPG; Oliveiro Guerreiro Filho, Instituto Agronômico Campinas - IAC. Bolsista CNPq DT; LILIAN PADILHA, CNPCa. |
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Título: |
Marcadores SNP avaliados em cultivares de Café Arábica. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória. Pesquisa, Inovação e Sustentabilidade dos Cafés do Brasil. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2019. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Título em inglês: SNP markers assessed in Arabica coffee cultivars. |
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Conteúdo: |
A demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para análises de pureza varietal e genética das cultivares comercializadas no país. MenosA demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para an... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Cultivar discrimination; Discriminação de cultivar; GBS. |
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Thesagro: |
Coffea Arábica. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/203198/1/Marcadores-SNP-avaliados.pdf
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Marc: |
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500 $aTítulo em inglês: SNP markers assessed in Arabica coffee cultivars.
520 $aA demanda crescente por cafés especiais e a an a t t a a a mais a participação de produtores neste segmento. Além da origem, da sustentabilidade na produção e da avaliação a diferenciados quant a a t n a a rastreabilidade da produção a a n a exigências a a a t a do produto. Dentro deste processo, a crescente demanda pelo atestado da pureza varietal vem exigindo o desenvolvimento de ferramentas que possam garantir a diferenciação inequívoca do produto comercial, e que viabilizem sua proteção intelectual. Assim, nosso objetivo foi desenvolver marcadores SNP, identificados em análises de genotipagem pelo sequenciamento (GBS), voltados à discriminação de cultivares de café arábica. Quarenta e oito cultivares foram genotipadas pelo sequenciamento em plataforma Illumina e 192.730 TAGs foram alinhadas ao genoma de Coffea arabica, gentilmente cedido pelo Consórcio Internacional de Sequenciamento do Genoma do Arabica (ACGC). Após o alinhamento ao genoma de referência de C. arabica e aplicação dos filtros de qualidade, 1.181 SNP foram obtidos e utilizados para identificar a relação entre os cultivares através da análise de componentes principais (PCA). Esses marcadores confirmaram a estreita base genética das variedades de C. arabica, e foram eficientes em separar os grupos dos Bourbons das demais cultivares, em especial, de Catuaí e Mundo Novo. Um conjunto de 18 marcadores SNP com elevado conteúdo informativo foram anotados e estão sendo validados para confirmar seu potencial para análises de pureza varietal e genética das cultivares comercializadas no país.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 100 | |
| 41. |  | FERREIRA, F. A.; SILVA, A. A. da; COBUCCI, T.; FERREIRA, L. R.; JAKELAITIS, A. Manejo de plantas daninhas. 2. ed. In: VIEIRA, C.; PAULA JÚNIOR, T. J. de; BORÉM, A. (ed.). Feijão. Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2006. p. 309-340. il.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 42. | | FERREIRA, F. A.; SILVA, A. A. da; COBUCCI, T.; FERREIRA, L. R.; JAKELAITIS, A. Manejo de plantas daninhas. In: VIEIRA, C.; PAULA JÚNIOR, T. J. de; BORÉM, A. (ed.). Feijão. 2. ed. atual. Viçosa, MG: UFV, 2013. p. 309-340.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 43. | | SILVA, A. A. da; D'ANTONINO, L.; SILVA, A. F. da; VARGAS, L. Manejo de plantas daninhas. In: BORÉM, A.; GALVÃO, J. C. C.; PIMENTEL, M. A. (Ed.). Milho: do plantio à colheita. 2. ed. atual. ampl. Viçosa, MG: UFV, 2017. cap. 11, p. 247-277.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 44. | | SILVA, A. A. da; D'ANTONIO, L.; SILVA, A. F. da; VARGAS, L. Manejo de plantas daninhas. In: GALVÃO, J. C. C.; BORÉM, A.; PIMENTEL, M. A. (Ed.). Milho: do plantio à colheita. Viçosa, MG: UFV, 2015. cap. 11, p. 242-272.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 46. | | FERREIRA, E. A.; CONCENÇO, G.; VARGAS, L.; SILVA, A. A. da. Manejo de plantas daninhas tolerantes ou resistentes ao glyphosate no Brasil. In: VELINI, E. D.; MESCHEDE, D. K.; CARBONARI, C. A.; TRINDADE, M. L. B. (Ed.). Glyphosate. Botucatu: FEPAF, 2009. Cap. 15, p. 357-400.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 51. | | ARCHANGELO, E. R.; SILVA, J. B. da; SILVA, A. A. da; FERREIRA, L. R.; KARAM, D. Tolerância do sorgo forrageiro ao herbicida Primestra SC. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 1, n. 2, p. 59-66, 2002.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 52. | | SILVA, W. da; FERREIRA, L. R.; SILVA, A. A. da; FIRMINO, L. E. Taxa transpiratória de mudas de eucalipto em resposta a níveis de água no solo e a convivência com Braquiária. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 35, n. 5, p. 923-928, maio, 2000. Título em inglês: Transpiratory rate of eucalypt seedlings in response to water levels in the soil and to association with brachiaria.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 55. | | DAL MAGRO, T.; REZENDE, S. T. de; AGOSTINETTO, D.; VARGAS, L.; SILVA, A. A. DA; FALKOSKI, D. L. Propriedades enzimáticas da enzima ALS de Cyperus difformis e mecanismo de resistência da espécie ao herbicida pyrazosulfuron-ethyl. Ciência Rural, Santa Maria, v. 40, n. 12, p. 2439-2445, 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 56. | | PROCOPIO, S. de O.; SILVA, A. A. da; FERREIRA, E. A.; SILVA, A. F. da; GALON, L. Plantas daninhas. In: SANTOS, F.; BORÉM, A. (Ed.). Cana-de-açúcar: do plantio à colheita. Viçosa, MG: UFV, 2013. cap. 6, p. 117-152.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 57. | | SOUSA, P. G. de; LAZZAROTTO, C.; SILVA, A. A. da; SILVA, G. C. da; FERREIRA, M. S. Resultados de pesquisa com trigo, triticale e aveia branca em Dourados, MS, safras 2001 a 2004. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2005. 55 p. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 72).| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste. |
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| 58. | | SILVA, A. A. da; ANDRADE, M. C.; CARVALHO, R. de C.; NEIVA, I. P.; SANTOS, D. C.; MALUF, W. R. Resistência à Helicoverpa armigera em genótipos de tomateiro obtidos do cruzamento de Solanum lycopersicum com Solanum galapagense. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 7, p. 801-808, jul. 2016. Título em inglês: Resistance to Helicoverpa armigera in tomato genotypes obtained from the crossing of Solanum lycopersicum x Solanum galapagense.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 59. | | JAQUES, R. J. S.; PROCOPIO, S. de O.; SANTOS, J. B.; KASUYA, M. C. M.; SILVA, A. A. da. Sensibilidade de estirpes de Bradyrhizobium ao glyphosate. Revista Ceres, Viçosa. v. 57, n. 1, p. 28-33, jan./fev., 2010.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 3 |
| Biblioteca(s): Embrapa Tabuleiros Costeiros. |
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| 60. | | RAMBO, L.; SILVA, P. R. F. DA; STRIEDER, M. L.; SILVA, A. A. DA; SANGOI, L.; VIEIRA, V. M. Índices nutricionais de N e produtividade de milho em diferentes níveis de manejo e de adubação nitrogenada. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 46, n. 4, p. 390-397, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo; Embrapa Unidades Centrais. |
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