| |
|
|
 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Hortaliças. Para informações adicionais entre em contato com cnph.biblioteca@embrapa.br. |
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Hortaliças. |
|
Data corrente: |
11/01/2022 |
|
Data da última atualização: |
11/01/2022 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
CUNHA, C. P. da; RESENDE, F. V.; ZUCCHI, M. I.; PINHEIRO, J. B. |
|
Afiliação: |
CAMILA PINTO DA CUNHA, UNICAMP; FRANCISCO VILELA RESENDE, CNPH; MARIA IMACULADA ZUCCHI, UNICAMP; JOSE BALDIN PINHEIRO, APTA. |
|
Título: |
SSR-based genetic diversity and structure of garlic accessions from Brazil. |
|
Ano de publicação: |
2014 |
|
Fonte/Imprenta: |
Genetica, v. 142, n. 5, p. 419-431, 2014. |
|
DOI: |
10.1007/s10709-014-9786-1 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Garlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide. MenosGarlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards ... Mostrar Tudo |
|
Thesagro: |
Alho; Allium Sativum; Germoplasma; Marcador Molecular. |
|
Thesaurus Nal: |
Cluster analysis; Genetic resources; Microsatellite repeats. |
|
Categoria do assunto: |
-- |
|
Marc: |
LEADER 02375naa a2200253 a 4500
001 2139018
005 2022-01-11
008 2014 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $a10.1007/s10709-014-9786-1$2DOI
100 1 $aCUNHA, C. P. da
245 $aSSR-based genetic diversity and structure of garlic accessions from Brazil.$h[electronic resource]
260 $c2014
520 $aGarlic is a spice and a medicinal plant; hence, there is an increasing interest in ?developing? new varieties with different culinary properties or with high content of nutraceutical compounds. Phenotypic traits and dominant molecular markers are predominantly used to evaluate the genetic diversity of garlic clones. However, 24 SSR markers (codominant) specific for garlic are available in the literature, fostering germplasm researches. In this study, we genotyped 130 garlic accessions from Brazil and abroad using 17 polymorphic SSR markers to assess the genetic diversity and structure. This is the first attempt to evaluate a large set of accessions maintained by Brazilian institutions. A high level of edundancy was detected in the collection (50 % of the accessions represented eight haplotypes). However, non-redundant accessions presented high genetic diversity. We detected on average five alleles per locus, Shannon index of 1.2, HO of 0.5, and HE of 0.6. A core collection was set with 17 accessions, covering 100 % of the alleles with minimum redundancy. Overall FST and D values indicate a strong genetic structure within accessions. Two major groups identified by both model-based (Bayesian approach) and hierarchical clustering (UPGMA dendrogram) techniques were coherent with the classification of accessions according to maturity time (growth cycle): early-late and midseason accessions. Assessing genetic diversity and structure of garlic collections is the first step towards an efficient management and conservation of accessions in genebanks, as well as to advance future genetic studies and improvement of garlic worldwide.
650 $aCluster analysis
650 $aGenetic resources
650 $aMicrosatellite repeats
650 $aAlho
650 $aAllium Sativum
650 $aGermoplasma
650 $aMarcador Molecular
700 1 $aRESENDE, F. V.
700 1 $aZUCCHI, M. I.
700 1 $aPINHEIRO, J. B.
773 $tGenetica$gv. 142, n. 5, p. 419-431, 2014.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Hortaliças (CNPH) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
| Registros recuperados : 26 | |
| 2. |  | MANSUR, T. O. F.; POZZA, E. A.; ZACARONI, A. B.; SUSSEL, A. A. B. Avaliação de fungicidas no crescimento micelial de Phyllachorabalansae. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, 2011. p. 1412 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
|    |
| 3. | | SOUZA, R. M.; ZACARONI, A. B.; ISHIDA, A. K. N.; RESENDE, M. L. V. Acibenzolar-S-metil (ASM), silicatos, fosfitos e Ecolife® no controle da mancha angular do algodoeiro em casa-de-vegetação. Tropical Plant Pathology, v. 34, Supl., p. S15, ago. 2009. Resumos do 42º Congresso Brasileiro de Fitopatologia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
|  |
| 4. | | ZACARONI, A. B.; SOUZA, R. M.; ISHIDA, A. K. N.; RESENDE, M. L. V. Efeito do acibenzolar-S-metil (ASM), extrato de folhas de graviola, extratos de folha de goiaba, Niphokam® e Agro-Mos® no controle da mancha angular do algodoeiro em casa-de-vegetação. Tropical Plant Pathology, v. 34, Supl., p. S8, ago. 2009. Resumos do 42º Congresso Brasileiro de Fitopatologia.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 8. | | ZACARONI, A. B.; SOUZA, R. M.; ISHIDA, A. K. N.; RESENDE, M. L. V. Extratos de folhas de café puros e em mistura com ASM, fertilizantes foliares e óleo mineral no controle da mancha angular do algodoeiro, altura de plantas e massa seca da parte aérea. Tropical Plant Pathology, Lavras, MG, v. 35, p. S32, Aug. 2010. Suplemento. Edição dos resumos do XLIII Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Cuiabá, ago. 2010.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 9. | | ZACARONI, A. B.; POZZA, E. A.; MANSUR, T. de O. F.; SUSSEL, A. A. B. Occurrence of Phyllachora balansae in Toona ciliata in southern Minas Gerais state, Brazil. Summa phytopathologica, Botucatu, v. 39, n. 3, p. 219-220, jul./set.2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 10. | | FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; JUNQUEIRA, K. P.; GONTIJO, G. M.; ZACARONI, A. B. Seleção de recursos genéticos de maracujazeiro-azedo em plantações comerciais no Distrito Federal e obtenção de híbridos intra e inter-específicos. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 3., 2014, Santos, SP. Resumos... Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2014. Acompanha Poster apresentado no Congresso.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 11. | | SUSSEL, A. A. B.; ZACARONI, A. B.; GUIMARAES, T. G.; BARROS, V. D. M.; SANTOS, H. T. G. Análise temporal da verrugose do maracujazeiro em quatro variedades de maracujazeiro no Distrito Federal. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 36, 2011. p. 1411 1 CD-ROM. Suplemento. Edição dos resumos do 44º Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 2011, Bento Gonçalves.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 13. | | LUCAS, C. G.; ALVES, E.; PEREIRA, R. B.; ZACARONI, A. B.; PERINA, F. J.; SOUZA, R. M. de. Indian clove essential oil in the control of tomato bacterial spot. Journal of Plant Pathology, v. 94, n. 1, p. 45-51, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
| |
| 14. | | ZACARONI, A. B.; POZZA, E. A.; MANSUR, T. O. F.; SUSSEL, A. A. B.; STEHLING, E. C. Influência de diferentes temperaturas no crescimento micelial e formação de proto-peritécios de Phyllachora balansae. In: Tropical Plant Pathology, v. 35, supl., p. S135, ago. 2010. Edição dos resumos do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, 43. p. S135| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
| 16. | | DEUNER, C. C.; SOUZA, R. M. de; ISHIDA, A. K. N.; ZACARONI, A. B.; PINHO, E. V. de R. von; MACHADO, J. da C.; CAMERA, J. N. Inoculação de Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens em sementes de feijão por meio da técnica de condicionamento fisiológico. Revista Brasileira de Sementes, v. 33, n. 1, p. 9-20, 2011.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 17. | | ZACARONI, A. B.; SOUZA, R. M.; ISHIDA, A. K. N.; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; AMARAL, D. R.; RESENDE, M. L. V. Época de aplicação de acibenzolar-S-metil no controle de crestamento bacteriano comum do feijoeiro. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S89, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos do XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago. 2008. BAC-003.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 18. | | ISHIDA, A. K. N.; SOUZA, C. A. A.; TREMACOLDI, C. R.; POLTRONIERI, L. S.; RESENDE, M. L. V.; ZACARONI, A. B. Extrato vegetal e fertilizantes foliares na indução de resistência à Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae em maracujazeiro. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE DEFENSIVOS AGRÍCOLAS NATURAIS, 4., 2008, Belém, PA. Anais... Belém, PA: Embrapa Amazônia Oriental, 2008. p. 49. Resumos.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 19. | | SOUZA, R. M.; ZACARONI, A. B.; ISHIDA, A. K. N.; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; AMARAL, D. R.; RESENDE, M. L. V. Oxicloreto de cobre e acibenzolar-S-metil (ASM) na indução de respostas de defesa do algodoeiro contra Xanthomonas axonopodis pv. malvacearum. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S97, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos do XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago. 2008. BAC-035.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| 20. | | ZACARONI, A. B.; SOUZA, R. M.; ISHIDA, A. K. N.; RIBEIRO JÚNIOR, P. M.; AMARAL, D. R.; RESENDE, M. L. V. Oxicloreto de cobre e acibenzolar-S-metil (ASM) na indução de respostas de defesa do feijoeiro contra Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 33, p. S89, ago. 2008. Suplemento. Edição dos Resumos do XLI Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Belo Horizonte, ago. 2008. BAC-004.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
| |
| Registros recuperados : 26 | |
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
