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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Café; Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
20/04/2010 |
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Data da última atualização: |
10/03/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MISSIO, R. F.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S. |
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Afiliação: |
ROBSON FERNANDO MISSIO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; LAÉRCIO ZAMBOLIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
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Título: |
Development and validation of SSR markers for Coffea arabica L. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In.: CROP BREEDING AND APPLIED BIOTECHNOLOGY. v.9, p.361-371, 2009. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
With the objective of developing new SSR markers for Coffea arabica, two enriched genomic libraries with probes (GT)15 and (AGG)10 were constructed. A total of 835 clones were sequenced and 756 presented good quality sequences. Redundant sequences were observed for 113 clones (14.94%). SSRs were found in 287 clones (38%). An estimated size of 417.5Kb of the C. arabica genome was sampled, with an average of one SSR per 1.46Kb. Dinucleotide repeats were more frequent than trinucleotides. Four repeat sequences, (AG/CT)n, (AC/GT)n, (AAG/CTT)n, and (AGG/CCT)n represented 61.1% of the total observed. A total of 96 SSR primers were designed and tested by PCR for two C. arabica genotypes. Ninety new SSR markers were validated for further genetic studies of C. arabica. |
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Palavras-Chave: |
Biblioteca genômica enriquecida; Coffea arabica L; Coffee; Enriched genomic library; Marcador microssatélite; Molecular marker; SSR marker. |
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Thesagro: |
Café; Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/29283/1/Development-and-validation.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 6 | |
| 1. |  | OLIVEIRA, R. A. de; DAROS, E.; BESPALHOK-FILHO, J. C.; ZAMBON, J. L. C.; IDO, O. T.; WEBER, H.; RESENDE, M. D. V. de; ZENI-NETO, H. Seleção de famílias de cana-de-açúcar via modelos mistos. Scientia Agraria, Curitiba, v. 9, n. 3, p. 269-274, 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - B |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 2. | | OLIVEIRA, R. A. de; DAROS, E.; BESPALHOK-FILHO, J. C.; RESENDE, M. D. V. de; ZAMBON, J. L. C.; IDO, O. T.; WEBER, H.; ZENI-NETO, H. Seleção via procedimento BLUPIS versus seleção massal em cana-de-açúcar. In: CONGRESSO NACIONAL DA STAB, 9., 2008, Maceió. Anais.[S.l.]: Sociedade dos Técnicos Açucareiros e Alcooleiros do Brasil, 2008. p. 537-550.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 3. | | MOIANA, L. D.; VIDIGAL FILHO, P. S.; GONÇALVES-VIDIGAL, M. C.; LACANALLO, G. F.; GALVÁN, M. Z.; CARVALHO, L. P. de; MALEIA, M. P.; PACHECO, C. M.; RIBEIRO, T.; ZENI NETO, H.; COIMBRA, G. K. Genetic diversity and population structure of cotton ( Gossypium hirsutum L. race latifolium H.) using microsatellite markers. African Journal of Biotechnology, v. 11, n. 54, p. 11640-11647, jul. 2012| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Algodão. |
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| 4. | | OLIVEIRA, R. A. de; DAROS, E.; BUSO, P. H. de M.; ZAMBON, J. L. C.; BESPALHOK FILHO, J. C; WEBER, H.; IDO, T.; ZENI NETO, H.; GRACIANO, P. A.; SILVA, S. D. do A. e.; EMYGDIO, B. M. Ganho genético com a seleção de clones potenciais RB "República Brasil", de ciclo médio/tardio, para cultivo no estado do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA, 2.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE AGROENERGIA, 2., 2008, Porto Alegre. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 5. | | OLIVEIRA, R. A. de; DAROS, E.; BUSO, P. H. de M.; ZAMBON, J. L. C.; BESPALHOK FILHO, J. C; WEBER, H.; IDO, T.; ZENI NETO, H.; GRACIANO, P. A.; SILVA, S. D. do A. e.; EMYGDIO, B. M. Ganho genético com a seleção de clones potenciais RB "República Brasil", de ciclo precoce, para cultivo no estado do Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA, 2.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE AGROENERGIA, 2., 2008, Porto Alegre. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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| 6. | | BUSO, P. H. de M.; DAROS, E.; OLIVEIRA, R. A de; ZAMBOM, J. L. C.; BESPALHOK FILHO, J. C.; WEBER, H.; IDO, O. T.; RUARO, L.; ZENI NETO, H.; GRACIANO, P. F.; UENO, B.; SILVA, S. D. dos A. e.; ASAGRANDE JÚNIOR, J. G. Incidência e severidade da ferrugem em clones de ciclo médio/tardio RB "República Brasil" de cana-de-açúcar cultivados no Rio Grande do Sul. In: SIMPÓSIO ESTADUAL DE AGROENERGIA, 2.; REUNIÃO TÉCNICA ANUAL DE AGROENERGIA, 2., 2008, Porto Alegre. Anais... Pelotas: Embrapa Clima Temperado, 2008. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Clima Temperado. |
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