Data/hora: 23/06/2024 10:25:43

Biblioteca(s): 	Embrapa Agricultura Digital.	
Data corrente: 	28/01/2011	
Data da última atualização: 	13/04/2011	
Autoria: 	HIGA, R. H.; YASUDA, R. S.	
Afiliação: 	ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; RODRIGO SHIZUO YASUDA, Engenharia da Computação/UNICAMP, Estagiário/CNPTIA.	
Título: 	GenesDE. Versão 1.0.	
Ano de publicação: 	2010	
Fonte/Imprenta: 	Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2010.	
Descrição Física: 	1 CD-ROM.	
Idioma: 	Português	
Conteúdo: 	Os programas contidos nesse pacote permitem disponibilizar o resultado da análise de expressão diferencial, ou seja, a lista de genes diferencialmente expressos, por microarranjos por meio de uma tabela em uma página html. A tabela é implementada como um applet, de forma que o usuário pode interagir com a mesma para analisar a lista de genes diferencialmente expressos. Esta solução foi desenvolvida no escopo do projeto Rede Genômica Animal, mas pode ser utilizada por quaisquer projeto que deseje disponibilizar resultados de experimentos de análise de genes diferencialmente expressos via Internet. Especificamente, o pacote permite ao usuário: (i) ordenar os genes de acordo com os valores de qualquer das colunas que compõem a tabela; (ii) utilizar double click em um gene específico para verificar as informações sobre ele no site  GeneCards (http://www.genecards.org). O programa considera tabelas compostas por 2 ou 4 colunas e as linhas rotuladas de acordo com o identificador do probe no array, sendo que colunas "gene symbol" e "gene name" são obrigatórias. No caso de arquivos csv com 4 colunas, as linhas da tabela são apresentadas utilizando um degradê de cores, de  acordo como os valores de fold change e significância. Já no caso de de arquivos csv com duas colunas, as  linhas da tabela são apresentadas em dois tons de cinza alternados para faciliar a visualização. A página gerada ainda permite que especificar um arquivo zipado para que o usuário possa fazer o download de informações adicionais, como por exemplo relatórios de análise detalhados.	
Palavras-Chave: 	Análise de expressão diferencial; Genes diferencialmente expressos; Genes expressos por microarranjos; Projeto Rede Genômica Animal; Software.	
Thesaurus Nal: 	Microarray technology.	
Categoria do assunto: 	X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia	
Registro original: 	Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)	
Exemplares: 	CNPTIA - (15502-1) - UMT - SW - CD - GENESDE1.0 -  - 2011.00076 - DIS