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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
09/01/2020 |
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Data da última atualização: |
09/01/2020 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
IANELLA, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
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Afiliação: |
PATRICIA IANELLA, Cenargen; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; EDUARDO SOUSA VARELA, CNPASA; LUCIANA CRISTINE VASQUES VILLELA, CNPASA; SAMUEL REZENDE PAIVA, Cenargen; ALEXANDRE RODRIGUES CAETANO, Cenargen. |
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Título: |
Tambaqui (Colossoma macropomum) single nucleotide polymorphism discovery by reduced representation library deep sequencing. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
In: AQUACULTURE, 2019, New Orleans. Aquaculture: the big choice! abstracts. [S.l.: s.n.], 2019. |
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Páginas: |
p. 491. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most important native freshwater fish farmed in Brazil. Production and supply chains are consistently growing, while current yearly production levels of this species exceed 200.000mt. Recent efforts of our research team have produced a draft genome sequence for this species. Here we describe results from SNP discovery efforts using deep sequencing of reduced representation libraries (RRLs) of varying fragment sizes. Ten micrograms of bulked DNA samples from 63 unrelated fish (males and females) were completely digested with HaeIII. Fragments between 400?500bp; 500?650 bp; and 650?850bp representing around 12% of the tambaqui genome were sequenced with a depth of >100x. Nearly 720 million reads (2x150bp) were generated with a HiSeq2000 using TruSeq v3 chemistry, 2.444.604 putative SNPs were identified and their allele frequencies estimated. A total of 2.011.219 SNPs were observed with read depths RD>150 and minor allele frequencies >0.05 (Fig. 1). This represents the first report of an extensive effort to identify SNP markers for this species and will be a valuable source of information for designing marker panels with varying applications. These results can affect the use of genomic tools in broodstock management, assisted genetic evaluations and breeding for tambaqui. |
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Palavras-Chave: |
Bioinformática; Polimorfismo de nucleotídeo único. |
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Thesagro: |
Colossoma Macropomum; Tambaqui. |
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Thesaurus Nal: |
Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
08/01/2015 |
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Data da última atualização: |
06/05/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
OLIVEIRA, L. D. da S.; SOUZA, L. S. B. de; MOURA, M. S. B. de; RODRIGUES, G. D. da S. |
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Afiliação: |
LEIDE DAYANE DA SILVA OLIVEIRA, UNIVERSIDADE DE PERNAMBUCO; LUCIANA SANDRA BASTOS DE SOUZA, UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DE PERNAMBUCO; MAGNA SOELMA BESERRA DE MOURA, CPATSA; GILSON DENNYS DA SILVA RODRIGUES, UNIVERSIDADE DE PERNAMBUCO. |
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Título: |
Efeito do aumento da temperatura na classificação climática do município de Nossa Senhora da Glória, SE. |
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Ano de publicação: |
2014 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO INTERNACIONAL DA REALIDADE SEMIÁRIDA, 2.; SIMPÓSIO ALAGOANO SOBRE ECOSSISTEMAS DO SEMIÁRIDO, 3., 2014, Delmiro Gouveia. Anais... Delmiro Gouveia: UFLA, Campus do Sertão, 2014. |
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Descrição Física: |
1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Estudos do Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas (IPCC) tem sugerido um incremento da temperatura do ar, que em regiões Semiáridas pode oscilar entre 2 e 5°C (IPCC, 2007). Estas alterações podem ser grandes o suficiente para promover mudanças na tipologia climática de determinados locais e consequentemente na dinâmica dos ecossistemas predominantes, cuja magnitude dos impactos ainda são desconhecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi analisar o impacto do aumento da temperatura na classificação climática do município de Nossa Senhora da Glória ? SE. Para tanto, foram utilizados dados das normais climatológicas de temperatura e precipitação referentes ao período de 1950-2003, para o processamento do balanço hídrico climatológico. A classificação climática adotada foi a de Thornthwaite, sendo analisados neste caso três cenários distintos: Cenário C1: cenário atual (1950-2003); Cenário C2: atual + 1,3°C, e Cenário C3: atual + 3°C. Para os três cenários climáticos em estudo, os dados mensais de precipitação pluviométrica não foram alterados em função da grande variabilidade da precipitação, e principalmente devido às grandes incertezas dos modelos climáticos em simular a precipitação. O clima de Nossa Senhora da Glória foi classificado de acordo com o método de Thornthwaite como sub-úmido seco, com pequeno ou nenhum excesso de água durante o ano, megatérmico, com concentração da evapotranspiração potencial nos meses de novembro, dezembro e janeiro; d) para o cenário de aquecimento de 3,0oC sobre a temperatura média mensal, o clima do município poderá se tornar semiárido, podendo necessitar da adoção de medidas de adaptação dos sistemas de produção agropecuários ao clima mais quente e seco. MenosEstudos do Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas (IPCC) tem sugerido um incremento da temperatura do ar, que em regiões Semiáridas pode oscilar entre 2 e 5°C (IPCC, 2007). Estas alterações podem ser grandes o suficiente para promover mudanças na tipologia climática de determinados locais e consequentemente na dinâmica dos ecossistemas predominantes, cuja magnitude dos impactos ainda são desconhecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi analisar o impacto do aumento da temperatura na classificação climática do município de Nossa Senhora da Glória ? SE. Para tanto, foram utilizados dados das normais climatológicas de temperatura e precipitação referentes ao período de 1950-2003, para o processamento do balanço hídrico climatológico. A classificação climática adotada foi a de Thornthwaite, sendo analisados neste caso três cenários distintos: Cenário C1: cenário atual (1950-2003); Cenário C2: atual + 1,3°C, e Cenário C3: atual + 3°C. Para os três cenários climáticos em estudo, os dados mensais de precipitação pluviométrica não foram alterados em função da grande variabilidade da precipitação, e principalmente devido às grandes incertezas dos modelos climáticos em simular a precipitação. O clima de Nossa Senhora da Glória foi classificado de acordo com o método de Thornthwaite como sub-úmido seco, com pequeno ou nenhum excesso de água durante o ano, megatérmico, com concentração da evapotranspiração potencial nos meses de novembro, dezembro e janeiro; d) para o cenár... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Classificação climática; Impacto do aumento da temperatura; Nossa Senhora da Glória; Região semiárida; Sergipe. |
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Thesagro: |
Balanço Hídrico; Clima; Precipitação Pluvial. |
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Thesaurus NAL: |
Climate. |
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Categoria do assunto: |
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/115137/1/Magna-3.pdf
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Marc: |
LEADER 02758nam a2200265 a 4500
001 2004819
005 2024-05-06
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100 1 $aOLIVEIRA, L. D. da S.
245 $aEfeito do aumento da temperatura na classificação climática do município de Nossa Senhora da Glória, SE.
260 $aIn: CONGRESSO INTERNACIONAL DA REALIDADE SEMIÁRIDA, 2.; SIMPÓSIO ALAGOANO SOBRE ECOSSISTEMAS DO SEMIÁRIDO, 3., 2014, Delmiro Gouveia. Anais... Delmiro Gouveia: UFLA, Campus do Sertão$c2014
300 $c1 CD-ROM.
520 $aEstudos do Painel Intergovernamental de Mudanças Climáticas (IPCC) tem sugerido um incremento da temperatura do ar, que em regiões Semiáridas pode oscilar entre 2 e 5°C (IPCC, 2007). Estas alterações podem ser grandes o suficiente para promover mudanças na tipologia climática de determinados locais e consequentemente na dinâmica dos ecossistemas predominantes, cuja magnitude dos impactos ainda são desconhecidos. Assim, o objetivo deste trabalho foi analisar o impacto do aumento da temperatura na classificação climática do município de Nossa Senhora da Glória ? SE. Para tanto, foram utilizados dados das normais climatológicas de temperatura e precipitação referentes ao período de 1950-2003, para o processamento do balanço hídrico climatológico. A classificação climática adotada foi a de Thornthwaite, sendo analisados neste caso três cenários distintos: Cenário C1: cenário atual (1950-2003); Cenário C2: atual + 1,3°C, e Cenário C3: atual + 3°C. Para os três cenários climáticos em estudo, os dados mensais de precipitação pluviométrica não foram alterados em função da grande variabilidade da precipitação, e principalmente devido às grandes incertezas dos modelos climáticos em simular a precipitação. O clima de Nossa Senhora da Glória foi classificado de acordo com o método de Thornthwaite como sub-úmido seco, com pequeno ou nenhum excesso de água durante o ano, megatérmico, com concentração da evapotranspiração potencial nos meses de novembro, dezembro e janeiro; d) para o cenário de aquecimento de 3,0oC sobre a temperatura média mensal, o clima do município poderá se tornar semiárido, podendo necessitar da adoção de medidas de adaptação dos sistemas de produção agropecuários ao clima mais quente e seco.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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