Data/hora: 12/06/2024 20:31:41

Biblioteca(s): | Embrapa Agricultura Digital.
Data corrente: | 15/03/2010
Data da última atualização: | 19/10/2010
Autoria: | HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B.
Afiliação: | ROBERTO H. HERAI, Doutorando em Genética e Biologia Molecular/UNICAMP; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA.
Título: | Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas.
Ano de publicação: | 2009
Fonte/Imprenta: | Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009.
Idioma: | Português
Notas: | Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Conteúdo: | Sequências repetitivas (SR) em lócus gênico de animais e plantas podem estar envolvidas em diversos fenômenos biológicos, como interferência por RNAi (Fire et al., 1998) e trans-splicing (Di Segni et al., 2008). A maioria das SR localiza-se em regiões de introns e, usualmente, seus estudos envolvem apenas sequências de mRNA, sendo necessário a estrutura intron-exon dos genes. Desta forma, é preciso realizar um mapeamento dos genes em seu respectivo genoma de referência para identificação de quatro tipos de SR: repetição reversa e complementar, repetição direta e complementar, repetição reversa e repetição direta. Este trabalho apresenta uma ferramenta WEB, chamada RepGraph, a qual integra algoritmos e ferramentas de bioinformática para identificar os pares que formam cada tipo de SR e uma representação gráfica para ilustrar sua relação em dois lócus gênicos.
Palavras-Chave: | Bioinformática; Ferramenta Web; Genômica; RepGraph; Sequências repetitivas em lócus gênico; Web tool.
Thesaurus Nal: | Bioinformatics; Genomics.
Categoria do assunto: | X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/17608/1/39.pdf
Registro original: | Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA)
Exemplares: | CNPTIA - (14772-1) - UPC - RA - DD -  -  -  - DIS