| |
|
|
|
Registro Completo |
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Florestas. |
|
Data corrente: |
20/06/2016 |
|
Data da última atualização: |
21/06/2016 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
|
Autoria: |
VIANA, A. P.; RESENDE, M. D. V. de; RIAZ, S.; WALKER, M. A. |
|
Afiliação: |
Alexandre Pio Viana, Universidade Estadual do Norte Fluminense; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; Summaira Riaz, Universidade da Califórnia; Michael Andrew Walker, Universidade da Califórinia. |
|
Título: |
Genome selection in fruit breeding: application to table grapes. |
|
Ano de publicação: |
2016 |
|
Fonte/Imprenta: |
Scientia Agricola, Piracicaba, v. 73, n. 2, p. 142-149, Mar./Apr. 2016. |
|
DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/0103-9016-2014-0323 |
|
Idioma: |
Inglês |
|
Conteúdo: |
Genomic selection (GS) has recently been proposed as a new selection strategy which represents an innovative paradigm in crop improvement, now widely adopted in animal breeding. Genomic selection relies on phenotyping and high-density genotyping of a sufficiently large and representative sample of the target breeding population, so that the majority of loci that regulate a quantitative trait are in linkage disequilibrium with one or more molecular markers and can thus be captured by selection. In this study we address genomic selection in a practical fruit breeding context applying it to a breeding population of table grape obtained from a cross between the hybrid genotype D8909-15 (Vitis rupestris × Vitis arizonica/girdiana), which is resistant to dagger nematode and Pierce?s disease (PD), and ?B90-116?, a susceptible Vitis vinifera cultivar with desirable fruit characteristics. Our aim was to enhance the knowledge on the genomic variation of agronomical traits in table grape populations for future use in marker-assisted selection (MAS) and GS, by discovering a set of molecular markers associated with genomic regions involved in this variation. A number of Quantitative Trait Loci (QTL) were discovered but this method is inaccurate and the genetic architecture of the studied population was better captured by the BLasso method of genomic selection, which allowed for efficient inference about the genetic contribution of the various marker loci. The technology of genomic selection afforded greater efficiency than QTL analysis and can be very useful in speeding up the selection procedures for agronomic traits in table grapes. MenosGenomic selection (GS) has recently been proposed as a new selection strategy which represents an innovative paradigm in crop improvement, now widely adopted in animal breeding. Genomic selection relies on phenotyping and high-density genotyping of a sufficiently large and representative sample of the target breeding population, so that the majority of loci that regulate a quantitative trait are in linkage disequilibrium with one or more molecular markers and can thus be captured by selection. In this study we address genomic selection in a practical fruit breeding context applying it to a breeding population of table grape obtained from a cross between the hybrid genotype D8909-15 (Vitis rupestris × Vitis arizonica/girdiana), which is resistant to dagger nematode and Pierce?s disease (PD), and ?B90-116?, a susceptible Vitis vinifera cultivar with desirable fruit characteristics. Our aim was to enhance the knowledge on the genomic variation of agronomical traits in table grape populations for future use in marker-assisted selection (MAS) and GS, by discovering a set of molecular markers associated with genomic regions involved in this variation. A number of Quantitative Trait Loci (QTL) were discovered but this method is inaccurate and the genetic architecture of the studied population was better captured by the BLasso method of genomic selection, which allowed for efficient inference about the genetic contribution of the various marker loci. The technology of genomic select... Mostrar Tudo |
|
Palavras-Chave: |
Genomic selection; Marker assisted selection; MAS; Melhoramento genético; SSR markers; Uva de mesa. |
|
Thesagro: |
Fruta; Marcador molecular; Melhoramento vegetal; Uva. |
|
Thesaurus Nal: |
Fruits; linkage disequilibrium; Plant breeding; Table grapes. |
|
Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/144571/1/2016-M.Deon-SA-GenomeSelection.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 02617naa a2200337 a 4500
001 2047486
005 2016-06-21
008 2016 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttp://dx.doi.org/10.1590/0103-9016-2014-0323$2DOI
100 1 $aVIANA, A. P.
245 $aGenome selection in fruit breeding$bapplication to table grapes.$h[electronic resource]
260 $c2016
520 $aGenomic selection (GS) has recently been proposed as a new selection strategy which represents an innovative paradigm in crop improvement, now widely adopted in animal breeding. Genomic selection relies on phenotyping and high-density genotyping of a sufficiently large and representative sample of the target breeding population, so that the majority of loci that regulate a quantitative trait are in linkage disequilibrium with one or more molecular markers and can thus be captured by selection. In this study we address genomic selection in a practical fruit breeding context applying it to a breeding population of table grape obtained from a cross between the hybrid genotype D8909-15 (Vitis rupestris × Vitis arizonica/girdiana), which is resistant to dagger nematode and Pierce?s disease (PD), and ?B90-116?, a susceptible Vitis vinifera cultivar with desirable fruit characteristics. Our aim was to enhance the knowledge on the genomic variation of agronomical traits in table grape populations for future use in marker-assisted selection (MAS) and GS, by discovering a set of molecular markers associated with genomic regions involved in this variation. A number of Quantitative Trait Loci (QTL) were discovered but this method is inaccurate and the genetic architecture of the studied population was better captured by the BLasso method of genomic selection, which allowed for efficient inference about the genetic contribution of the various marker loci. The technology of genomic selection afforded greater efficiency than QTL analysis and can be very useful in speeding up the selection procedures for agronomic traits in table grapes.
650 $aFruits
650 $alinkage disequilibrium
650 $aPlant breeding
650 $aTable grapes
650 $aFruta
650 $aMarcador molecular
650 $aMelhoramento vegetal
650 $aUva
653 $aGenomic selection
653 $aMarker assisted selection
653 $aMAS
653 $aMelhoramento genético
653 $aSSR markers
653 $aUva de mesa
700 1 $aRESENDE, M. D. V. de
700 1 $aRIAZ, S.
700 1 $aWALKER, M. A.
773 $tScientia Agricola, Piracicaba$gv. 73, n. 2, p. 142-149, Mar./Apr. 2016.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Florestas (CNPF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
|
Registro Completo
|
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
|
Data corrente: |
19/04/2005 |
|
Data da última atualização: |
20/06/2023 |
|
Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
|
Autoria: |
ARAUJO, R. S.; HUNGRIA, M.; MENDONÇA, L. F. de; MARQUES, E. M. G.; ANDRADE, M. J. B.; PEDROSO, F. L.; ALMEIDA, V. M. de; NASCIMENTO JÚNIOR, A.; PEREIRA FILHO, I. A.; CATANHO, M do C.; ARF, O. |
|
Afiliação: |
RICARDO SILVA ARAUJO, CNPAF; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO; LUCIANO F. DE MENDONÇA, EMCAPA; EUGENIA M. G. MARQUES, EMCAPA; MESSIAS J. B. ANDRADE, UFLA; FABIO LUCIO PEDROSO, UFLA; VALTER M. DE ALMEIDA, EMPAER-MT; ALFREDO NASCIMENTO JUNIOR, EMPAER-MT; ISRAEL ALEXANDRE PEREIRA FILHO, CNPMS; MARIA DO CARMO CATANHO, IPA; ORIVALDO ARF, UNESP, Ilha Solteira-SP. |
|
Título: |
Rede nacional de ensaios para a avaliação de estirpes de Rhizobium tropici para a inoculação do feijoeiro: resultados do primeiro ano da rede. |
|
Ano de publicação: |
1996 |
|
Fonte/Imprenta: |
In: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 5., 1996, Goiânia. Anais. Goiânia: EMBRAPA-CNPAF, 1996. |
|
Volume: |
v. 1. |
|
Páginas: |
p. 140-142. |
|
Série: |
(EMBRAPA-CNPAF. Documentos, 69). |
|
ISSN: |
0101-9716 |
|
Idioma: |
Português |
|
Conteúdo: |
De acordo com a análise conjunta dos experimentos houve efeitos significativos do local de teste e do tratamento. A maior produtividade foi obtida com o tratamento com adubação nitrogenada. Não houve diferenças significativas entre as estirpes de Rhizobium tropici testadas, mas, à exceção da estirpe PR-F81, todas foram estatisticamente inferiores à adubação nitrogenada. Os resultados do primeiro ano da rede de ensaios foram apresentados na reunião da Rede de Laboratórios Recomendadores de Estirpes de Rhizobium Bradyrhizobium (RELARE), realizada em Campínas-SP, nos dias 1 e 2 de julho de 1996, recomendando-se a estirpe PR-F81 para compor o inoculante comercial para o feijoeiro, em adição à estirpe SEMIA 4077. |
|
Thesagro: |
Estirpe; Feijão; Inoculação; Phaseolus Vulgaris; Rede. |
|
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
|
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/213314/1/doc-69-p140.pdf
|
|
Marc: |
LEADER 01787nam a2200325 a 4500
001 1213314
005 2023-06-20
008 1996 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a0101-9716
100 1 $aARAUJO, R. S.
245 $aRede nacional de ensaios para a avaliação de estirpes de Rhizobium tropici para a inoculação do feijoeiro$bresultados do primeiro ano da rede.$h[electronic resource]
260 $aIn: REUNIÃO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 5., 1996, Goiânia. Anais. Goiânia: EMBRAPA-CNPAF$c1996
300 $ap. 140-142. v. 1.
490 $a(EMBRAPA-CNPAF. Documentos, 69).$vv. 1.
520 $aDe acordo com a análise conjunta dos experimentos houve efeitos significativos do local de teste e do tratamento. A maior produtividade foi obtida com o tratamento com adubação nitrogenada. Não houve diferenças significativas entre as estirpes de Rhizobium tropici testadas, mas, à exceção da estirpe PR-F81, todas foram estatisticamente inferiores à adubação nitrogenada. Os resultados do primeiro ano da rede de ensaios foram apresentados na reunião da Rede de Laboratórios Recomendadores de Estirpes de Rhizobium Bradyrhizobium (RELARE), realizada em Campínas-SP, nos dias 1 e 2 de julho de 1996, recomendando-se a estirpe PR-F81 para compor o inoculante comercial para o feijoeiro, em adição à estirpe SEMIA 4077.
650 $aEstirpe
650 $aFeijão
650 $aInoculação
650 $aPhaseolus Vulgaris
650 $aRede
700 1 $aHUNGRIA, M.
700 1 $aMENDONÇA, L. F. de
700 1 $aMARQUES, E. M. G.
700 1 $aANDRADE, M. J. B.
700 1 $aPEDROSO, F. L.
700 1 $aALMEIDA, V. M. de
700 1 $aNASCIMENTO JÚNIOR, A.
700 1 $aPEREIRA FILHO, I. A.
700 1 $aCATANHO, M do C.
700 1 $aARF, O.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
|
Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
|
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
Fechar
|
| Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|
