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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
09/02/2009 |
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Data da última atualização: |
06/07/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
OLIVEIRA, E. J.; VIEIRA, M. L. C.; GARCIA, A. A. F.; MUNHOZ, C. F.; MARGARIDO, G. R. A.; CONSOLI, L.; MATTA, F. P.; MORAES, M. C.; ZUCCHI, M. I.; FUNGARO, M. H. P. |
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Afiliação: |
Eder Jorge de Oliveira, CNPMF; Maria Lucia C. Vieira, ESALQ/USP; Antônio Augusto F. Garcia, ESALQ/USP; Carla F. Munhoz, ESALQ/USP; Gabriel R. A. Margarido, ESALQ/USP; Luciano Consoli, ESALQ/USP; Frederico P. Matta, ESALQ/USP; Michel C. Moraes, ESALQ/USP; Maria I. Zucchi, IAC; Maria Helena P. Fungaro, UEL. |
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Título: |
An integrated molecular map yellow passion fruit based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases. |
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Ano de publicação: |
2008 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of the American Society Horticultural Science, Mount Vernon, v. 133, n. 1, p. 35-41, jan. 2008. |
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Descrição Física: |
il. |
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ISSN: |
0003-1062 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The development of genetic maps for auto-incompatible species, such as the yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) is restricted due to the unfeasibility of obtaining traditional mapping populations based on inbred lines. For this reason, yellow passion fruit linkage maps were generally constructed using a strategy known as two-way pseudo-testcross, based on monoparental dominant markers segregating in a 1:1 fashion. Due to the lack of information from these markers in one of the parents, two individual (parental) maps were obtained. However, integration of these maps is essential, and biparental markers can be used for such an operation. The objective of our study was to construct an integrated molecular map for a full-sib population of yellow passion fruit combining different loci configuration generated from amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and microsatellite markers and using a novel approach based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases, specially designed for outcrossing species. Of the total number of loci, 76%, 21%, 0.7%, and 2.3% did segregate in 1:1, 3:1, 1:2:1, and 1:1:1:1 ratios, respectively. Ten linkage groups (LGs) were established with a logarithm of the odds (LOD) score 5.0 assuming a recombination fraction 0.35. On average, 24 markers were assigned per LG, representing a total map length of 1687 cM, with a marker density of 6.9 cM. No markers were placed as accessories on the map as was done with previously constructed individual maps. MenosThe development of genetic maps for auto-incompatible species, such as the yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims f. flavicarpa Deg.) is restricted due to the unfeasibility of obtaining traditional mapping populations based on inbred lines. For this reason, yellow passion fruit linkage maps were generally constructed using a strategy known as two-way pseudo-testcross, based on monoparental dominant markers segregating in a 1:1 fashion. Due to the lack of information from these markers in one of the parents, two individual (parental) maps were obtained. However, integration of these maps is essential, and biparental markers can be used for such an operation. The objective of our study was to construct an integrated molecular map for a full-sib population of yellow passion fruit combining different loci configuration generated from amplified fragment length polymorphisms (AFLPs) and microsatellite markers and using a novel approach based on simultaneous maximum-likelihood estimation of linkage and linkage phases, specially designed for outcrossing species. Of the total number of loci, 76%, 21%, 0.7%, and 2.3% did segregate in 1:1, 3:1, 1:2:1, and 1:1:1:1 ratios, respectively. Ten linkage groups (LGs) were established with a logarithm of the odds (LOD) score 5.0 assuming a recombination fraction 0.35. On average, 24 markers were assigned per LG, representing a total map length of 1687 cM, with a marker density of 6.9 cM. No markers were placed as accessories on the map as... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
AFLP; flavicarpa; Linkage map integration; Microsatellite; Multipoint distance; Outcrossing specie; Passiflora edulis f. |
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Thesagro: |
Maracujá; Marcador Molecular. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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Biblioteca |
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Registro |
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| Registros recuperados : 38 | |
| 6. |  | VIEIRA, M. L. C.; FUNGARO, M. H. P.; JUBIER, M.-F.; LEJEUNE, B. Determination of taxonomic relationships among brazilian taxa of Stylosanthes sw., leguminosae, using rapd markers. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 32, n. 3, p. 305-310, mar. 1997. Título em português: Determinação das relações taxonômicas entre táxons brasileiros de Stylosanthes Sw., Leguminosae, usando marcadores RAPD.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | FERREIRA, M. A. J da F.; VIEIRA, M. L. C.; QUEIROZ, M. A. de; VENCOVSKY, R. Estimativa da taxa de cruzamento de uma populacao base de melancia (Citrullus lanatus), por meio de marcador molecular dominante (RAPD). Genetics and Molecular Biology, Ribeirão Preto, v. 22,n. 3, p. 679-680, 1999. Suplemento. Resumos do 45 Congresso Nacional de Genética, Gramado, 1999.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Semiárido. |
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| 11. | | GAGLIARDI, R. F.; PACHECO, G.; VALLS, J. F. M.; CARNEIRO, L. A.; VIEIRA, M. L. C.; MANSUR, E. Avaliação da estabilidade genética de plantas de Arachis retusa obtidas por micropropagação, visando à conservação de germoplasma. Horticultura Brasileira, v. 23, n. 2, p. 600, ago. 2005. Suplemento. Edição dos resumos: CONGRESSO BRASILEIRO DE OLERICULTURA, 45.; CONGRESSO BRASILEIRO DE FLORICULTURA E PLANTAS ORNAMENTAIS, 15.; CONGRESSO BRASILEIRO DE CULTURA DE TECIDOS DE PLANTAS, 2., 2005, Fortaleza, CE.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 12. | | SANTINI, L.; HANAI, L. R.; MELO, L. C.; SANTOS, J. B.; CAMARGO, L. E. A.; VIEIRA, M. L. C. Validação in silio de locos RGA (Resistance Genes Analogs) mapeados em duas populações de Phaseolus vulgaris. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 56., 2010, Guarujá. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2010. p. 156.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 13. | | HOFFMANN, L. V.; GANDER, E. S.; ALMEIDA, E. R. P. de; SILVA FILHO, M. C.; VIEIRA, M. L. C. Fatores influenciando a regeneracao de plantas e expressao transiente de GUS na tranformacao de Stylosanthes guianensis por Agrobacterium tumefaciens. Brazilian Journal of Genetics, Ribeirao Preto, v.19, n.3, p.375, 1996. Supplement.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | SANTINI, L.; HANAI, L. R.; MELO, L. C.; SANTOS, J. B.; CAMARGO, L. E. A.; VIEIRA, M. L. C. Mapeamento de locos quantitativos (QTL) estáveis e co-localizados, associados ao controle de resistência a doenças fúngicas em feijão. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 55., 2009, Águas de Lindóia, SP. Resumos... Ribeirão Preto: Sociedade Brasileira de Genética, 2009. p. 181.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 18. | | HANAI, L. R.; SANTINI, L.; MELO, L. C.; SANTOS, J. B. dos; CAMARGO, L. E. A.; VIEIRA, M. L. C. Mapeamento de QTL associados à mancha angular e ao oídio em feijão com base em um mapa de ligação enriquecido com marcadores RGA. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. 1 CD-ROM. (IAC. Documentos, 85).| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 19. | | BRAGA, M. F.; VIEIRA, M. L. C.; GAZAFFI, R.; GARCIA, A. A. F.; GIRALDI, I. O.; JUNQUEIRA, N. T. V. Mapeamento de QTL (quantitative trait loci) associados à resistência do maracujá-doce à bacteriose. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 22., 2012, Bento Gonçalves. Anais... Bento Gonçalves: SBF, 2012.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 20. | | VIEIRA, M. L. C.; OLIVEIRA, E. J. de; MATTA, F. de P.; PÁDUA, J. G.; MONTEIRO, M. Métodos biotecnológicos aplicados ao melhoramento genético do maracujá. In: FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BRAGA, M. F. (Ed.). Maracujá: germoplasma e melhoramento genético. Planaltina, DF: Embrapa Cerrados, 2005. p. 411-453| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico | Circulação/Nível: -- - -- |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 38 | |
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