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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
17/11/2011 |
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Data da última atualização: |
17/11/2011 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
CAÇÃO, S. M. B.; DINIZ, L. E. C.; SILVA, N. V.; VENIKY, F.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E. |
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Afiliação: |
SANDRA M. B. CAÇÃO, IAPAR; LEANDRO E. C. DINIZ, IAPAR; NATHALIA V. SILVA, IAPAR; FILIPE VENIKY, CENARGEN; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; LUIZ GONZAGA E. VIEIRA, IAPAR. |
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Título: |
Construção de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arabica. |
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Ano de publicação: |
2007 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
A produção de mapas físicos em plantas tem grande importância para estudos de genética e melhoramento. O passo inicial para produção destes mapas é a construção de bibliotecas genômicas com largos fragmentos de DNA, em vetores do tipo cromossomo artificial de bactéria (BAC) ou de levedura (YAC). Visando a produção de um mapa físico, o objetivo deste trabalho foi construir uma biblioteca genômica de BAC de café. Fragmentos de DNA de alto peso molecular de C. arabica híbrido de Timor cv. 832/2 foram clonados no vetor pCC1BAC e transformados em E. coli DH10B. Após transformação 57000 clones foram inicialmente obtidos e ordenados manualmente em placas de 96 poços. A biblioteca foi transferida em triplicata para placas de 384 poços, com equipamento Q-BOT, resultando em 55.778 clones em 148 placas. A verificação do tamanho do inserto de 130 clones revelou tamanho médio de 115-120 Kb. A cobertura do genoma haplóide estimada para C.arabica foi de cinco vezes. A validação da biblioteca presença de DNA de cloroplasto e mitocôndria, assim como a seleção inicial com sondas para iniciar o mapeamento físico, está sendo realizada através de hibridização de colônias em membranas contendo 18.462 clones em duplicata. |
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Palavras-Chave: |
BAC; Mapeamento. |
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Thesagro: |
Clonagem. |
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Thesaurus Nal: |
Coffea. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46896/1/Construcao-de-uma-biblioteca.pdf
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Marc: |
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520 $aA produção de mapas físicos em plantas tem grande importância para estudos de genética e melhoramento. O passo inicial para produção destes mapas é a construção de bibliotecas genômicas com largos fragmentos de DNA, em vetores do tipo cromossomo artificial de bactéria (BAC) ou de levedura (YAC). Visando a produção de um mapa físico, o objetivo deste trabalho foi construir uma biblioteca genômica de BAC de café. Fragmentos de DNA de alto peso molecular de C. arabica híbrido de Timor cv. 832/2 foram clonados no vetor pCC1BAC e transformados em E. coli DH10B. Após transformação 57000 clones foram inicialmente obtidos e ordenados manualmente em placas de 96 poços. A biblioteca foi transferida em triplicata para placas de 384 poços, com equipamento Q-BOT, resultando em 55.778 clones em 148 placas. A verificação do tamanho do inserto de 130 clones revelou tamanho médio de 115-120 Kb. A cobertura do genoma haplóide estimada para C.arabica foi de cinco vezes. A validação da biblioteca presença de DNA de cloroplasto e mitocôndria, assim como a seleção inicial com sondas para iniciar o mapeamento físico, está sendo realizada através de hibridização de colônias em membranas contendo 18.462 clones em duplicata.
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700 1 $aVIEIRA, L. G. E.
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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 | Acesso ao texto completo restrito à biblioteca da Embrapa Mandioca e Fruticultura. Para informações adicionais entre em contato com cnpmf.biblioteca@embrapa.br. |
Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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Data corrente: |
03/12/2012 |
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Data da última atualização: |
03/12/2012 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
REIS, R. V. dos; PIO VIANA, A.; OLIVEIRA, E. J. de; SILVA, M. G. M. |
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Afiliação: |
RONALDO VIANA DOS REIS, UFV; ALEXANDRE PIO VIANA, UENF; EDER JORGE DE OLIVEIRA, CNPMF; MARCELO GERALDO DE MORAES SILVA, IFNMG. |
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Título: |
Phenotypic and molecular selection of yellow passion fruit progenies in the second cycle of recurrent selection. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
Crop Breeding and Applied Biotechnology, v. 12, n.1, p. 191-198, march, 2012. |
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ISSN: |
1518-7853 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
The purpose of this study was to evaluate the efficiency of selection of a population of yellow passion fruit in the second cycle of recurrent selection, based on molecular and agronomic data. In 39 full-sib progenies, genotyped using microsatellite markers, 11 agronomic traits were evaluated. The progenies were selected based on the genetic distance matrix and the selection efficiency was confirmed based on the most important agronomic traits of yellow passion fruit. Only 12 of the 25 best progenies were identified by all three selection strategies (agronomic, molecular and combined selection). No significant correlation was observed between the genetic distance matrices and the molecular x agronomic data. The progenies selected by molecular markers had the highest mean yield and fruit number. Results indicate the possibility of applying this combined selection procedure based on agronomic as well as molecular data to optimize genetic gain for the traits under selection. |
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Palavras-Chave: |
Marcadores moleculares; Melhoramento genético; Variabilidade genética. |
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Thesagro: |
Maracujá; Passiflora Edulis. |
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Thesaurus NAL: |
Breeding and Genetic Improvement; Genetic variation; Microsatellite repeats. |
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Categoria do assunto: |
G Melhoramento Genético |
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Marc: |
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245 $aPhenotypic and molecular selection of yellow passion fruit progenies in the second cycle of recurrent selection.
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520 $aThe purpose of this study was to evaluate the efficiency of selection of a population of yellow passion fruit in the second cycle of recurrent selection, based on molecular and agronomic data. In 39 full-sib progenies, genotyped using microsatellite markers, 11 agronomic traits were evaluated. The progenies were selected based on the genetic distance matrix and the selection efficiency was confirmed based on the most important agronomic traits of yellow passion fruit. Only 12 of the 25 best progenies were identified by all three selection strategies (agronomic, molecular and combined selection). No significant correlation was observed between the genetic distance matrices and the molecular x agronomic data. The progenies selected by molecular markers had the highest mean yield and fruit number. Results indicate the possibility of applying this combined selection procedure based on agronomic as well as molecular data to optimize genetic gain for the traits under selection.
650 $aBreeding and Genetic Improvement
650 $aGenetic variation
650 $aMicrosatellite repeats
650 $aMaracujá
650 $aPassiflora Edulis
653 $aMarcadores moleculares
653 $aMelhoramento genético
653 $aVariabilidade genética
700 1 $aPIO VIANA, A.
700 1 $aOLIVEIRA, E. J. de
700 1 $aSILVA, M. G. M.
773 $tCrop Breeding and Applied Biotechnology$gv. 12, n.1, p. 191-198, march, 2012.
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Registro original: |
Embrapa Mandioca e Fruticultura (CNPMF) |
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