Data/hora: 22/06/2024 01:18:04

Biblioteca(s): | Embrapa Café.
Data corrente: | 17/11/2011
Data da última atualização: | 17/11/2011
Autoria: | CAÇÃO, S. M. B.; DINIZ, L. E. C.; SILVA, N. V.; VENIKY, F.; ANDRADE, A. C.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E.
Afiliação: | SANDRA M. B. CAÇÃO, IAPAR; LEANDRO E. C. DINIZ, IAPAR; NATHALIA V. SILVA, IAPAR; FILIPE VENIKY, CENARGEN; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; LUIZ GONZAGA E. VIEIRA, IAPAR.
Título: | Construção de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arabica.
Ano de publicação: | 2007
Fonte/Imprenta: | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.
Idioma: | Português
Conteúdo: | A produção de mapas físicos em plantas tem grande importância para estudos de genética e melhoramento. O passo inicial para produção destes mapas é a construção de bibliotecas genômicas com largos fragmentos de DNA, em vetores do tipo cromossomo artificial de bactéria (BAC) ou de levedura (YAC). Visando a produção de um mapa físico, o objetivo deste trabalho foi construir uma biblioteca genômica de BAC de café. Fragmentos de DNA de alto peso molecular de C. arabica híbrido de Timor cv. 832/2 foram clonados no vetor pCC1BAC e transformados em E. coli DH10B. Após transformação 57000 clones foram inicialmente obtidos e ordenados manualmente em placas de 96 poços. A biblioteca foi transferida em triplicata para placas de 384 poços, com equipamento Q-BOT, resultando em 55.778 clones em 148 placas. A verificação do tamanho do inserto de 130 clones revelou tamanho médio de 115-120 Kb. A cobertura do genoma haplóide estimada para C.arabica foi de cinco vezes. A validação da biblioteca presença de DNA de cloroplasto e mitocôndria, assim como a seleção inicial com sondas para iniciar o mapeamento físico, está sendo realizada através de hibridização de colônias em membranas contendo 18.462 clones em duplicata.
Palavras-Chave: | BAC; Mapeamento.
Thesagro: | Clonagem.
Thesaurus Nal: | Coffea.
Categoria do assunto: | --
URL: | http://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/46896/1/Construcao-de-uma-biblioteca.pdf
Registro original: | Embrapa Café (CNPCa)
Exemplares: | CNPCa - (453-1) - UPC - AA - DD -  -  -  - DIS