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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
07/11/2022 |
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Data da última atualização: |
07/11/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MATOS, M. K. da S.; BENKO-ISEPPON, A. M.; BEZERRA-NETO, J. P.; FERREIRA-NETO, J. R. C.; WANG, Y.; LIU, H.; PANDOLFI, V.; AMORIM, L. L. B.; WILLADINO, L.; AMORIM, T. C. do V.; KIDO, E. A.; VIANELLO, R. P.; TIMKO, M. P.; BRASILEIRO-VIDAL, A. C. |
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Afiliação: |
MITALLE KAREN DA SILVA MATOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ANA MARIA BENKO-ISEPPON, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOAO PACIFICO BEZERRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; JOSE RIBAMAR COSTA FERREIRA-NETO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; YU WANG, UNIVERSITY OF VIRGINA; HAI LIU, UNIVERSITY OF VIRGINIA; VALESCA PANDOLFI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LIDIANE LINDINALVA BARBOSA AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; LILIA WILLADINO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; THIALISSON CAACI DO VALE AMORIM, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; EDERSON AKIO KIDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF; MICHAEL P. TIMKO, UNIVERSITY OF VIRGINIA; ANA CHRISTINA BRASILEIRO-VIDAL, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PERNAMBUCO. |
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Título: |
The WRKY transcription factor family in cowpea: Genomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Gene, v. 823, 146377, May 2022. |
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ISSN: |
0378-1119 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond. MenosCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
QPCR; RNA-Seq. |
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Thesagro: |
Seca; Vigna Unguiculata. |
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Thesaurus Nal: |
Abiotic stress; Cowpeas; Drought tolerance; Gene expression. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
LEADER 02849naa a2200397 a 4500
001 2148067
005 2022-11-07
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024 7 $ahttps://doi.org/10.1016/j.gene.2022.146377$2DOI
100 1 $aMATOS, M. K. da S.
245 $aThe WRKY transcription factor family in cowpea$bGenomic characterization and transcriptomic profiling under root dehydration.$h[electronic resource]
260 $c2022
520 $aCowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] is one of the most tolerant legume crops to drought and salt stresses. WRKY transcription factor (TF) family members stand out among plant transcriptional regulators related to abiotic stress tolerance. However, little information is currently available on the expression of the cowpea WRKY gene family (VuWRKY) in response to water deficit. Thus, we analyzed genomic and transcriptomic data from cowpea to identify VuWRKY members and characterize their structure and transcriptional response under root dehydration stress. Ninety-two complete VuWRKY genes were found in the cowpea genome based on their domain characteristics. They were clustered into three groups: I (15 members), II (58), and III (16), while three genes were unclassified. Domain analysis of the encoded proteins identified four major variants of the conserved heptapeptide motif WRKYGQK. In silico analysis of VuWRKY gene promoters identified eight candidate binding motifs of cis-regulatory elements, regulated mainly by six TF families associated with abiotic stress responses. Ninety-seven VuWRKY modulated splicing variants associated with 55 VuWRKY genes were identified via RNA-Seq analysis available at the Cowpea Genomics Consortium (CpGC) database. qPCR analyses showed that 22 genes are induced under root dehydration, with VuWRKY18, 21, and 75 exhibiting the most significant induction levels. Given their central role in activating signal transduction cascades in abiotic stress response, the data provide a foundation for the targeted modification of specific VuWRKY family members to improve drought tolerance in this important climate-resilient legume in the developing world and beyond.
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 126 | |
| 101. |  | TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MENDES, T. D.; DAMASO, M. C. T.; BOM, E. P. S.; SILVA, A. S.; GOTTSCHALK, L. M. F.; NORONHA, E. F.; FAVARO, L. C. de L. Enhancement of Trichoderma harzianum CFAM-422 for cellulase and hemicellulase production by deletion of the carbon catabolite repressor gene cre1. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 21.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 12., 2017, Aracaju, SE. [Proceedings ...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2017. Não paginado. SINAFERM; SHEB. 3 a 6 de setembro. Seção Trabalhos. Ref. 59019.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Agroindústria de Alimentos. |
|    |
| 102. | | PEIXOTO, J. S. G.; JARAMILLO, P. M. D.; PEREIRA, V. M.; TAMIETTI, M. S.; AZEVEDO, J. L.; PEREIRA, J. O.; FILHO, S. A.; MELO, I. S.; FAVARO, L. C. de L.; MACHADO, F. Endophytic fungi of Paullinia cupana and Rhizophora mangle and their potential for lignocellulolytic enzymes production. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 21.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 12., 2017, Aracajú, SE. [Anais ...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2017. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 103. | | CARNEIRO, A. A. J.; SOUTO, A. L.; SOUSA, G. P.; MENDES, T. D.; FAVARO, L. C. de L.; SALUM, T. F. C.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M.; DAMASO, M. C. T. Evaluation of fungal strains for bioconversion of crude glycerin from palm oil and soybean into polyols. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 21.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 12., 2017, Aracajú, SE. [Anais ...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2017. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 104. | | SANTIAGO, T. R.; PEREIRA, V. M.; SOUZA, W. R.; STEINDORFF, A. S.; DIAS, B. B. A.; GASPAR, M.; FAVARO, L. C. de L.; FORMIGHIERI, E. F.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C. Genome-wide identification, characterization and expression profile analysis of expansins gene family in sugarcane (Saccharum spp.). PLoS One, v. 13, n. 1, artigo e0191081, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 105. | | PEIXOTO, J. de S. G.; RODRIGUES, K. B.; MENINO, G. S.; MENDES, T. D.; GOMES, H. A. R.; LOPES, R. S.; GONCALVES, S. B.; SILVA, F. M.; FAVARO, L. C. de L. Produção de uma Beta-expansina de cana-de-açúcar por Komagataella phaffii. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 37.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 106. | | TAMIETTI, M. S.; MIDORIKAWA, G. E. O.; MENDES, T. D.; DAMASO, M. C. T.; BOM, E. P. S.; SILVA, A. S.; GOTTSCHALK, L. M. F.; NORONHA, E. F.; FAVARO, L. C. de L. Disruption of the glucose repressor gene cre1 in Trichoderma harzianum CFAM-422 and its effect on plant cell wall degrading enzymes production. In: FUNGAL GENETICS CONFERENCE, 29., 2017, Pacific Grove. Abstract book ... Bethesda: Genetics Society of America, 2017. p. 107.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 107. | | ANDRADE, J. K. B.; TOMM, C. M.; SERRA, S. A.; ALENCAR, J. S.; TAMIETTI, M. S.; ARAÚJO, J. C.; MENDES, T. D.; SILVA, A. S.; BON, E. P. S.; DAMASO, M. C. T.; FAVARO, L. C. de L. Melhoramento genético de Trichoderma harzianum CFAM-422 por mutação-seleção recorrente e avaliação do perfil enzimático de mutantes selecionados In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 20.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSA, 11., 2015, Fortaleza, CE. [Anais ...]. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2015.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 108. | | ALMEIDA, J. R. M. de; FRANCO, P. F.; POLETTO, C. M.; MENDES, T. D.; SALUM, T. F. C.; ARAUJO, W. A.; PIZZIRANI-KLEINER, A. A.; FAVARO, L. C. de L.; LOPES, L. G. New yeast strains for production of fuels and chemicals. In: INTERNATIONAL CONGRESS ON YEASTS, 2012, Madison, US. [Anais...]. [S.l.]: Lesaffre, 2012.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 109. | | LIMA, L. B. M.; CARATTI, M. F.; SILVA, A. C. M. G.; SALUM, T. F. C.; ARAÚJO, W. L.; QUECINE, M. C.; QUIRINO, B. F.; FAVARO, L. C. de L. Prospecção de bactérias endofíticas de plantas nativas e cultivadas e seu potencial para a descontrução de biomassa lignocelulósica. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 2., 2015, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2015. p. 51-53| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 110. | | LIMA, L. B. M.; CARATTI, M. F.; SILVA, A. C. M. G.; SALUM, T. F. C.; ARAÚJO, W. L.; QUECINE, M. C.; QUIRINO, B. F.; FAVARO, L. C. de L. Prospecção de bactérias endofíticas e seu potencial para a desconstrução de biomassa lignocelulósica. In: SIMPÓSIO DE RECURSOS GENÉTICOS PARA A AMÉRICA LATINA E CARIBE, 10., 2015, Bento Gonçalves. Recursos genéticos no século 21: de Vavilov a Svalbard. Anais... [s.l.]: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 111. | | MENDES, T. D.; MORAIS, K. dos S.; MENEZES, B. dos S.; QUIRINO, B. F.; RODRIGUES, D. de S.; FAVARO, L. C. de L.; ARAUJO, W. L. de; MELO, I. S. de; SALUM, T. F. C. Produção de celulases por novas cepas fúngicas isoladas de biomas brasileiros. In: SEMINÁRIO BRASILEIRO DE TECNOLOGIA ENZIMÁTICA, 12., 2014, Rio de Janeiro. Anais... São Paulo: Croda; São Paulo: Analítica, 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 112. | | RODRIGUES, K. B.; MACÊDO, J. K. A.; TEIXEIRA, T.; BARROS, J. S.; ARAÚJO, A. C. B.; SANTOS, F. P.; QUIRINO, B. F.; BRASIL, B. dos S. A. F.; SALUM, T. F. C.; ABDELNUR, P. V.; FAVARO, L. C. de L. Recombinant expression of Thermobifida fusca E7 LPMO in Pichia pastoris and Escherichia coli and their functional characterization. Carbohydrate Research, v. 448, p. 175-181, 2017.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
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| 113. | | RODRIGUES, K. B.; MACÊDO, J. K. A.; BARROS, J. S.; ARAÚJO, A. C. B.; SANTOS, F. P.; QUIRINO, B. F.; BRASIL, B. dos S. A. F.; SALUM, T. F. C.; ABDELNUR, P. V.; FAVARO, L. C. de L. Recombinant expression of Thermobifida fusca E7 LPMO in Pichia pastoris and Escherichia coli and their funstional characterization. In: SYMPOSIUM ON THE CHEMISTRY, BIOLOGY AND APPLICATION OF LYTIC POLYSACCHARIDE MONOOXYGENASES, 2016, Copenhagen, Denmark. [Proceedings ...]. Hellerup: Novo Nordisk Fonden, 2016. Não paginado. Resumo nº 20.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 114. | | MENDES, T. D.; PACHECO, T. F.; BRAGA, S. C.; NAKAI, D. K.; MIDORIKAWA, G. E. O.; GONCALVES, S. B.; SALUM, T. F. C.; FAVARO, L. C. de L.; DAMASO, M. C. T. Selection of fungal strains for the bioconversion of biodiesel crude glycerol into citric acid. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 23.; SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSAS, 14,; SEMINÁRIO BRASILEIRO DE TECNOLOGIA ENZIMÁTICA, 14., 2022, Búzios. São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química, 2022. 23º SINAFERM; 14º SHEB; 14º ENZITEC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 115. | | ALVES, L. M.; MENDES, T. D.; CARVALHO, F. B. de P.; MEDEIROS, M. R. G.; NAKAI, D. K.; DAMASO, M. C. T.; SALUM, T. F. C.; FAVARO, L. C. de L. Selection of fungi for the production of enzymes with potential for industrial application. In: SIMPÓSIO NACIONAL DE BIOPROCESSOS, 23., SIMPÓSIO DE HIDRÓLISE ENZIMÁTICA DE BIOMASSAS, 14.; SEMINÁRIO BRASILEIRO DE TECNOLOGIA ENZIMÁTICA, 14, 2022, Búzios. [Anais...] São Paulo: Associação Brasileira de Engenharia Química , 2022. 23º SINAFERM; 14º SHEB; 14º ENZITEC.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 116. | | PANSA, C. C.; BONONI L.; SILVA, J. L. da; CASTELIANI, A. G.; SILVA, J. S.; PAMPLONA, R. C. A.; MORAIS, J. F. A.; NASCIMENTO, R. dos S.; FAVARO, L. C. de L.; MELO, I. S. de. Screening of Highly Cellulolytic Trichoderma spp. from the Amazon Forest. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA, 28., 2015, Florianópolis. Resumos. Florianópolis: Sociedade Brasileira de Microbiologia, 2015.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 117. | | TEIXEIRA, T.; RODRIGUES, K.; MENDES, T. D.; SILVA, C.; SOUZA, A.; MENINO, G.; LO SCIUTO, D.; LOPES, R.; SANTANA, M.; MELLO, V.; RIBEIRO, J. A. de A.; SALUM, T. F. C.; DAMASO, M. C. T.; SIQUEIRA, F. G. de; RODRIGUES, D. de S.; ABDELNUR, P. V.; FAVARO, L. C. de L. Functional studies of Thermobifida fusca (E7) and Trichoderma reesei (Cel61A) LPMOs produced by Komagataella phaffii and their application in saccharification of sorghum and sugarcane bagasse. In: LPMO SYMPOSIUM, 2., 2018, Marseille, France. Proceedings ...]. [S.l]: LPMO, 2018.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 118. | | FAVARO, L. C. de L.; GOMES, A. de P. G.; QUIRINO, B. F.; BRASIL, B. dos S. A. F.; SIQUEIRA, F. G. de; ALMEIDA, J. R. M. de; DAMASO, M. C. T.; COSTA, P. P. K. G.; SALUM, T. F. C. Conservação e caracterização da ?coleção de microrganismos e microalgas aplicados à agroenergia e biorrefinarias ? CMMAABIO. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 4., 2016, Curitiba, PR. Recursos genéticos no Brasil: a base para o desenvolvimento sustentável. Brasília, DF: Sociedade Brasileira de Recursos Genéticos, 2016. Não paginado.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 119. | | ARANTES, A. F. B.; TAMIETTI, M. S.; ARAUJO, A. C. B. de; BRUNALE, P. P. de B.; MORAES, B. R. de L.; FRANCO, P. F.; COSTA, P. P. K. G.; JARAMILLO, P. M. D.; QUIRINO, B. F.; SOUTO, B. de M.; SOARES, I. P.; FAVARO, L. C. de L. Contaminação microbiana de biodiesel (B100), diesel (B0), e blendas (B7) comercializadas no Estado de Goiás e no Distrito Federal. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 4.,2017, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 10-15.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 120. | | CARNEIRO, A. A. J.; SOUTO, A. L.; SOUSA, G. P. de; RIBEIRO, J. A. de A.; COSTA, P. P. K. G.; MENDES, T. D.; FAVARO, L. C. de L.; SALUM, T. F. C.; ABDELNUR, P. V.; RODRIGUES, C. M.; DAMASO, M. C. T. Uso da glicerina bruta de palma como fonte de carbono para obtenção de polióis utilizando fungos filamentosos. In: CONGRESSO DA REDE BRASILEIRA DE TECNOLOGIA DE BIODIESEL, 6.; CONGRESSO BRASILEIRO DE PLANTAS OLEAGINOSAS, ÓLEOS, GORDURAS E BIODIESEL, 9., 2016, Natal, RN. Biodiesel: 10 anos de pesquisa, desenvolvimento e inovação no Brasil: anais. Lavras: UFLA, 2016. Não paginado.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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