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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
03/11/2022 |
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Data da última atualização: |
27/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MARINHO, J. de S. R.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; PAVANELLI, I.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
JULIANA DE SOUZA RODRIGUES MARINHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ISABELA PAVANELLI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Molecular markers for assessing the inter- and intra-racial genetic diversity and structure of common bean. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetic Resources and Crop Evolution, v. 70, n. 1, p. 263-279, Jan. 2023. |
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ISSN: |
0925-9864 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10722-022-01432-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Early access July 2022. |
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Conteúdo: |
The Mesoamerican and Andean gene pools of the common bean are distinguished into specific races. Knowledge of their structure and genetic diversity is an important prerequisite for plant conservation and breeding. The aim of this study was to estimate the inter- and intra-racial genetic diversity of genotypes representative of the six common bean races using simple sequence repeats (SSRs) and single nucleotide polymorphism (SNPs). Ninety-four accessions were genetically analyzed, using 24 SSR and 4.820 SNPs markers with minor allele frequencies (MAF)>- 5%. Based on SSR, 163 alleles were identified (13.8 alleles/marker). For the whole samples, the average values for expected (He) and observed heterozygosity (Ho) were 0.780 and 0.045, respectively, and 5.5 × 10-31 for probability of identity (PI). While for the gene pools analyzed separately, similar He estimates were obtained for the Andean (He = 0.731) and Mesoamerican gene pools (He = 0.733). Population structure and clustering analyses revealed subdivision predominantly by gene pool (K = 2). The overall linkage disequilibrium extension (r2sv) was 58 kb. Estimated He was 0.327 and Ho 0.025, with slightly higher values for the Mesoamerican (He= 0.303) when compared to its Andean counterpart (He = 0.269). Population structure was observed in the Andean (K = 2 and K = 3) and Mesoamerican (K = 2) gene pools. The molecular analyses did not reveal clear differentiation between the bean races. Although sampling may be having an effect on the analysis, our results reinforce that distinction among races appeared to have resulted from selection caused by domestication. MenosThe Mesoamerican and Andean gene pools of the common bean are distinguished into specific races. Knowledge of their structure and genetic diversity is an important prerequisite for plant conservation and breeding. The aim of this study was to estimate the inter- and intra-racial genetic diversity of genotypes representative of the six common bean races using simple sequence repeats (SSRs) and single nucleotide polymorphism (SNPs). Ninety-four accessions were genetically analyzed, using 24 SSR and 4.820 SNPs markers with minor allele frequencies (MAF)>- 5%. Based on SSR, 163 alleles were identified (13.8 alleles/marker). For the whole samples, the average values for expected (He) and observed heterozygosity (Ho) were 0.780 and 0.045, respectively, and 5.5 × 10-31 for probability of identity (PI). While for the gene pools analyzed separately, similar He estimates were obtained for the Andean (He = 0.731) and Mesoamerican gene pools (He = 0.733). Population structure and clustering analyses revealed subdivision predominantly by gene pool (K = 2). The overall linkage disequilibrium extension (r2sv) was 58 kb. Estimated He was 0.327 and Ho 0.025, with slightly higher values for the Mesoamerican (He= 0.303) when compared to its Andean counterpart (He = 0.269). Population structure was observed in the Andean (K = 2 and K = 3) and Mesoamerican (K = 2) gene pools. The molecular analyses did not reveal clear differentiation between the bean races. Although sampling may be having an ef... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Genetic diversity; SNP genotyping; SSR genotyping. |
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Thesagro: |
Feijão; Genética Molecular; Marcador Molecular; Raça. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Molecular genetics; Races; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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Biblioteca |
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Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Solos. |
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Data corrente: |
10/11/2009 |
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Data da última atualização: |
28/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
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Autoria: |
ENCINAS, O. C.; TEIXEIRA, W. G.; MARTINS, G. C.; MACEDO, R. S.; FERRAZ, R. P. D.; RODRIGUES, M. do R. L.; SILVA, E. F. da; SOUZA, A. C. G. de. |
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Afiliação: |
Omar Cubas Encinas, mestrando Inpa; WENCESLAU GERALDES TEIXEIRA, CNPS; GILVAN COIMBRA MARTINS, CPAA; Rodrigo Santana Macedo, bolsista CPAA; Rodrigo Peçanha Demonte Ferraz, CNPS; MARIA DO ROSARIO LOBATO RODRIGUES, CPAA; Enio Fraga da Silva, CNPS; Adriana Costa Gil de Souza, bolsista CPAA. |
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Título: |
Teores totais e disponíveis de elementos de alguns perfis de solo da Província Petrolífera de Urucu, Coari - AM. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
In: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Os teores totais, trocáveis e disponíveis de elementos minerais no solo são de suma importância em estudos tanto de contaminação, como de manejo do solo e caracterização pedológica. Sabendo-se que o conhecimento geoquímico dos elementos no ambiente é fundamental para a escolha de práticas de manejo, o presente trabalho tem por objetivo avaliar o comportamento dos teores totais e disponíveis de elementos minerais no solo de dois perfis na Província Petrolífera de Urucu, Coari ? AM. Foram amostrados um perfil de Argissolo Vermelho-Amarelo Alumínico típico e um Cambissolo Háplico Ta Distrófico. Foram realizadas análises de teores totais de 19 elementos com digestão por água régia e determinação por plasma de acoplamento indutivo (ICP). As análises químicas de Ca, Mg, K, Na e Al trocáveis e P, Fe, Mn, Cu e Zn disponíveis no solo foram realizadas conforme Embrapa (1997). Os baixos teores trocáveis de Ca, Mg, K, Na e P e Mn disponível, bem como, os elevados teores de Al trocável e Fe disponível, estão correlacionados com seus teores totais no solo. O perfil de Argissolo Vermelho-Amarelo exibe maiores concentrações de todos os elementos, com destaque para Ba, Cr, Pb, V e Zr. |
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Palavras-Chave: |
Argissolo vermelho-amarelo; Cambissolo Háplico; Elementos-traço; ICP. |
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Categoria do assunto: |
--
P Recursos Naturais, Ciências Ambientais e da Terra |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/112008/1/2851.pdf
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/574434/1/Teores-totais-e-disponiveis-de-elementos-de-alguns-perfis-de-solo-2009.pdf
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Marc: |
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260 $aIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE CIÊNCIA DO SOLO, 32., 2009, Fortaleza. O solo e a produção de bioenergia: perspectivas e desafios. [Viçosa, MG]: SBCS; Fortaleza: UFC, 2009. 1 CD-ROM.$c2009
520 $aOs teores totais, trocáveis e disponíveis de elementos minerais no solo são de suma importância em estudos tanto de contaminação, como de manejo do solo e caracterização pedológica. Sabendo-se que o conhecimento geoquímico dos elementos no ambiente é fundamental para a escolha de práticas de manejo, o presente trabalho tem por objetivo avaliar o comportamento dos teores totais e disponíveis de elementos minerais no solo de dois perfis na Província Petrolífera de Urucu, Coari ? AM. Foram amostrados um perfil de Argissolo Vermelho-Amarelo Alumínico típico e um Cambissolo Háplico Ta Distrófico. Foram realizadas análises de teores totais de 19 elementos com digestão por água régia e determinação por plasma de acoplamento indutivo (ICP). As análises químicas de Ca, Mg, K, Na e Al trocáveis e P, Fe, Mn, Cu e Zn disponíveis no solo foram realizadas conforme Embrapa (1997). Os baixos teores trocáveis de Ca, Mg, K, Na e P e Mn disponível, bem como, os elevados teores de Al trocável e Fe disponível, estão correlacionados com seus teores totais no solo. O perfil de Argissolo Vermelho-Amarelo exibe maiores concentrações de todos os elementos, com destaque para Ba, Cr, Pb, V e Zr.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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