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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Rondônia. |
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Data corrente: |
09/12/2020 |
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Data da última atualização: |
09/03/2022 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
SILVA, G. P. da; PRADO, R. de M.; WADT, P. G. S.; SILVA, F. C. da; VAZ, G. J.; MODA, L. R.; CAIONE, G. |
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Afiliação: |
GILMARA PEREIRA DA SILVA, Unemat; RENATO DE MELLO PRADO, Unesp; PAULO GUILHERME SALVADOR WADT, CPAF-RO; FABIO CESAR DA SILVA, CNPTIA; GLAUBER JOSE VAZ, CNPTIA; LEANDRO ROSSATO MODA, Unesp; GUSTAVO CAIONE, Unemat. |
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Título: |
Accuracy measures for phosphorus in assessing the nutritional status of sugarcane using the comprehensive integrated diagnosis and recommendation system (DRIS). |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Journal of Plant Nutrition, v. 44, n. 9, p. 1287-1299, 2021. |
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ISSN: |
0190-4167 (print) / 1532-4087 (online) |
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DOI: |
https://doi.org/10.1080/01904167.2020.1849299 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
ABSTRACT. The use of different criteria for the definition of the reference population, combined with measures of accuracy of nutritional diagnoses, can enable the definition of the best set of Integrated Diagnosis and Recommendation System (DRIS) standards for sugarcane. In this context, the objective was to use the accuracy measures proposed by Wadt and Lemos to define the best criterion for defining the reference population for the DRIS method in sugarcane, based on the nutritional status for phosphorus. The database was created based on productivity and leaf contents of N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn for sugar cane, considered in two agricultural years (2013 and 2014), making a total of 1,224 samples, composed of five reference populations that showed productivity above 172; 193; 214; 235 and 256 t ha1. The Average Nutritional Balance Index (NBIm), DRIS index and
productivity were studied; degree of agreement between standards and measures of accuracy of nutritional diagnoses for phosphorus. The measures of global accuracy, excess and nutritional deficiency, showed diagnostic performance below 50% in the 2013 and 201 harvests. The accuracy for balance, sufficiency and nutritional toxicity showed high performance of the nutritional diagnoses regardless of the harvest. The analysis of the accuracy of the nutritional diagnoses for phosphorus identified low performance of all sets of DRIS standards, however, with better performance of the standards derived from reference populations of average productivity + 1.0 standard deviation in the 2013 and 2014 harvests. MenosABSTRACT. The use of different criteria for the definition of the reference population, combined with measures of accuracy of nutritional diagnoses, can enable the definition of the best set of Integrated Diagnosis and Recommendation System (DRIS) standards for sugarcane. In this context, the objective was to use the accuracy measures proposed by Wadt and Lemos to define the best criterion for defining the reference population for the DRIS method in sugarcane, based on the nutritional status for phosphorus. The database was created based on productivity and leaf contents of N, P, K, Ca, Mg, S, B, Cu, Fe, Mn and Zn for sugar cane, considered in two agricultural years (2013 and 2014), making a total of 1,224 samples, composed of five reference populations that showed productivity above 172; 193; 214; 235 and 256 t ha1. The Average Nutritional Balance Index (NBIm), DRIS index and
productivity were studied; degree of agreement between standards and measures of accuracy of nutritional diagnoses for phosphorus. The measures of global accuracy, excess and nutritional deficiency, showed diagnostic performance below 50% in the 2013 and 201 harvests. The accuracy for balance, sufficiency and nutritional toxicity showed high performance of the nutritional diagnoses regardless of the harvest. The analysis of the accuracy of the nutritional diagnoses for phosphorus identified low performance of all sets of DRIS standards, however, with better performance of the standards derived from ref... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
DRIS; Integrated Diagnosis and Recommendation System; População de referência; Reference population; Saccharum spp; Validação; Validation. |
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Thesagro: |
Cana de Açúcar; Estado Nutricional; Fertilidade do Solo; Fósforo; Medição; Saccharum Officinarum. |
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Thesaurus Nal: |
Accuracy; Analytical methods; Diagnosis and Recommendation Integrated System; Measurement; Nutritional status; Phosphorus; Soil fertility; Sugarcane. |
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Categoria do assunto: |
--
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Rondônia (CPAF-RO) |
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Biblioteca |
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Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Café. |
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Data corrente: |
16/03/2016 |
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Data da última atualização: |
16/03/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
COTTA, M. G.; BOCS, S.; REGO, E. C. S.; COSTA, T. S.; AQUINO, S. O. de; CARNEIRO, F. De A.; THIS, D.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C. |
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Afiliação: |
MICHELLE GUITTON COTTA, Bolsista CAPES; STÉPHANIE BOCS, CIRAD/UMR/AGAP; ERICA CRISTINA SILVA REGO, Bolsista Consório Pesquisa Café; TATIANA SANTOS COSTA, Bolsista CAPES; SINARA OLIVEIRA DE AQUINO, Bolsista CAPES; FERMAMDA De ARAÚJO CARNEIRO, Bolsista CAPES; DOMINIQUE THIS, CIRAD/UMR/AGAP; PIERRE MARRACCINI, CIRAD/UMR/AGAP; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN. |
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Título: |
Estudo das famílias gênicas CcPYL, CcPP2C e CcSnRK2: componentes centrais na via aba-dependente para a resposta ao déficit hídrico em Coffea Canephora. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 9., Curitiba. Brasília, DF: Embrapa Café, 2015. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
O déficit hídrico e altas temperaturas são consequências atuais e diretas do aquecimento global e fatores-chave que afetam o desenvolvimento e a produtividade cafeeira. Apesar das complexas estratégias utilizadas por plantas perenes para adaptarem-se à seca, existe no gênero Coffea variabilidade genética que pode ser utilizada como ferramenta para potencializar a tolerância das plantas a esse estresse. O Ácido abscísico (ABA) é o hormônio central que regula a fisiologia da planta na resposta ao déficit hídrico. O objetivo do presente trabalho foi identificar e caracterizar os genes componentes do sistema tripartite (PYL-PP2C-SnRK2) de percepção e transdução de sinal de ABA em Coffea canephora. Clones tolerantes (14, 73 e 120) de C. canephora Conilon têm sido caracterizados como plantas vigorosas com alta produtividade durante anos em regime de escassez hídrica e apresentam-se como valiosos modelos de estudo. Receptores intracelulares (PYR/PYL/RCAR) envolvidos na percepção do sinal de ABA foram recentemente identificados em plantas. Um mecanismo de transdução de sinal de ABA foi proposto, envolvendo tais receptores interagindo com fosfatases do tipo PP2C e quinases SnRK2. Neste trabalho, as sequências proteicas de Arabidopsis, citros, arroz, uva, tomate foram escolhidos como query para a busca das respectivas sequências ortólogas de café em bancos de dados. Essa abordagem permitiu identificar 24 genes candidatos (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs e 9 SnRK2) no genoma de C. canephora. Os domínios protéicos específicos de cada família gênica foram verificados nas sequencias aminoacídicas preditas o que permitiu caracterizá-las como receptores (PYR/PYL/RCAR), fosfatases (PP2C) ou quinases (SnRK2) da via de sinalização de ABA. Análises filogenéticas permitiram classificar as sequências polipeptídicas nas subclasses e subfamílias esperadas. As estruturas gênicas (éxons, íntrons e UTRs) foram funcionalmente anotadas no genoma de C. canephora (Coffea Genome Hub: http://coffee-genome.org/). Expressão diferencial foi observada in silico para esses genes nos órgãos (folha, semente, raiz e órgãos florais) de C. canephora. Em condições de déficit hídrico, dados de transcriptoma de raiz mostraram diferentes perfis de expressão entre os clones tolerantes (14, 73 e 120) e o sensível (22). Os resultados de qPCR evidenciaram perfis transcriptômicos diferenciais inclusive entre os clones tolerantes sugerindo a existência de múltiplos mecanismos biológicos para a tolerância à seca por meio da via dependente de ABA no cafeeiro. Outros resultados enfatizaram mecanismos comuns de indução gênica para todos os clones na condição não-irrigada. Tais informações podem ser úteis na identificação do determinismo genético da tolerância à seca no cafeeiro e para obtenção de marcadores moleculares visando auxiliar programas de melhoramento. MenosO déficit hídrico e altas temperaturas são consequências atuais e diretas do aquecimento global e fatores-chave que afetam o desenvolvimento e a produtividade cafeeira. Apesar das complexas estratégias utilizadas por plantas perenes para adaptarem-se à seca, existe no gênero Coffea variabilidade genética que pode ser utilizada como ferramenta para potencializar a tolerância das plantas a esse estresse. O Ácido abscísico (ABA) é o hormônio central que regula a fisiologia da planta na resposta ao déficit hídrico. O objetivo do presente trabalho foi identificar e caracterizar os genes componentes do sistema tripartite (PYL-PP2C-SnRK2) de percepção e transdução de sinal de ABA em Coffea canephora. Clones tolerantes (14, 73 e 120) de C. canephora Conilon têm sido caracterizados como plantas vigorosas com alta produtividade durante anos em regime de escassez hídrica e apresentam-se como valiosos modelos de estudo. Receptores intracelulares (PYR/PYL/RCAR) envolvidos na percepção do sinal de ABA foram recentemente identificados em plantas. Um mecanismo de transdução de sinal de ABA foi proposto, envolvendo tais receptores interagindo com fosfatases do tipo PP2C e quinases SnRK2. Neste trabalho, as sequências proteicas de Arabidopsis, citros, arroz, uva, tomate foram escolhidos como query para a busca das respectivas sequências ortólogas de café em bancos de dados. Essa abordagem permitiu identificar 24 genes candidatos (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs e 9 SnRK2) no genoma de C. canephora. Os do... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Déficit hídrico; PP2C e SnRK2; PYR/PYL/RCAR. |
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Thesaurus NAL: |
Abscisic acid; Drought. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/141277/1/Estudo-das-familias.pdf
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Marc: |
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520 $aO déficit hídrico e altas temperaturas são consequências atuais e diretas do aquecimento global e fatores-chave que afetam o desenvolvimento e a produtividade cafeeira. Apesar das complexas estratégias utilizadas por plantas perenes para adaptarem-se à seca, existe no gênero Coffea variabilidade genética que pode ser utilizada como ferramenta para potencializar a tolerância das plantas a esse estresse. O Ácido abscísico (ABA) é o hormônio central que regula a fisiologia da planta na resposta ao déficit hídrico. O objetivo do presente trabalho foi identificar e caracterizar os genes componentes do sistema tripartite (PYL-PP2C-SnRK2) de percepção e transdução de sinal de ABA em Coffea canephora. Clones tolerantes (14, 73 e 120) de C. canephora Conilon têm sido caracterizados como plantas vigorosas com alta produtividade durante anos em regime de escassez hídrica e apresentam-se como valiosos modelos de estudo. Receptores intracelulares (PYR/PYL/RCAR) envolvidos na percepção do sinal de ABA foram recentemente identificados em plantas. Um mecanismo de transdução de sinal de ABA foi proposto, envolvendo tais receptores interagindo com fosfatases do tipo PP2C e quinases SnRK2. Neste trabalho, as sequências proteicas de Arabidopsis, citros, arroz, uva, tomate foram escolhidos como query para a busca das respectivas sequências ortólogas de café em bancos de dados. Essa abordagem permitiu identificar 24 genes candidatos (9 PYL/RCAR, 6 PP2Cs e 9 SnRK2) no genoma de C. canephora. Os domínios protéicos específicos de cada família gênica foram verificados nas sequencias aminoacídicas preditas o que permitiu caracterizá-las como receptores (PYR/PYL/RCAR), fosfatases (PP2C) ou quinases (SnRK2) da via de sinalização de ABA. Análises filogenéticas permitiram classificar as sequências polipeptídicas nas subclasses e subfamílias esperadas. As estruturas gênicas (éxons, íntrons e UTRs) foram funcionalmente anotadas no genoma de C. canephora (Coffea Genome Hub: http://coffee-genome.org/). Expressão diferencial foi observada in silico para esses genes nos órgãos (folha, semente, raiz e órgãos florais) de C. canephora. Em condições de déficit hídrico, dados de transcriptoma de raiz mostraram diferentes perfis de expressão entre os clones tolerantes (14, 73 e 120) e o sensível (22). Os resultados de qPCR evidenciaram perfis transcriptômicos diferenciais inclusive entre os clones tolerantes sugerindo a existência de múltiplos mecanismos biológicos para a tolerância à seca por meio da via dependente de ABA no cafeeiro. Outros resultados enfatizaram mecanismos comuns de indução gênica para todos os clones na condição não-irrigada. Tais informações podem ser úteis na identificação do determinismo genético da tolerância à seca no cafeeiro e para obtenção de marcadores moleculares visando auxiliar programas de melhoramento.
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650 $aDrought
653 $aDéficit hídrico
653 $aPP2C e SnRK2
653 $aPYR/PYL/RCAR
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
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Registro original: |
Embrapa Café (CNPCa) |
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