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Biblioteca(s):  Embrapa Gado de Leite.
Data corrente:  26/04/2010
Data da última atualização:  24/04/2024
Tipo da produção científica:  Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Autoria:  SILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R.
Afiliação:  MARCOS VINICIUS GUALBERTO B SILVA, CNPGL; PAUL M. VANRADEN, USDA; CURT P. VAN TASSEL, USDA; TAD S. SOSTENGARD, USDA; LAKSHMI K. MATUKUMALLI, GEORGE MASON UNIVERSITY; EUI-SOO KIM, USDA; GEORGE R. WIGGANS, USDA.
Título:  Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey.
Ano de publicação:  2009
Fonte/Imprenta:  In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009.
Idioma:  Português
Conteúdo:  Foi realizada uma varredura por todo o genoma de animais da raça Jersey, nos EUA, utilizando marcadores do tipo SNP, visando identificar QTL associados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas. Os dados usados neste estudo foram provenientes do Animal Improvement Programs Laboratory, USDA/EUA. Amostras de DNA coletadas de 2.380 animais da raça Jersey e as habilidades preditas de transmissão de 2.081 animais, publicadas em fevereiro/2009 (http://greenbook.usjersey.com/), foram utilizadas nas análises. Para a genotipagem dos SNPs foi usado o BovineSNP50 BeadChip da Illumina, com aproximadamente 54.000 SNPs. Todo SNP com call rate (<99%), em desequilíbrio de Hardy-Weinberg (teste exato p<0,01) e com frequência de um dos alelos menor do que 5% foram excluídos das análises finais (30.342 SNP usados). P-values corrigidos pelo teste de Bonferroni iguais a 0,01 foram usados. Para todas as características, SNP significativos foram encontrados em vários cromossomos, especialmente nos BTAs 3, 4, 5, 6, 10, 12, 23 e 25. Os resultados sugerem que as soluções para os efeitos dos marcadores nas avaliações genômicas podem identificar regiões cromossômicas que necessitem ser melhor estudadas.
Palavras-Chave:  Associação por todo genoma.
Categoria do assunto:  G Melhoramento Genético
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/711787/1/Analise-de-associacao-por-todo-o-genoma.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Gado de Leite (CNPGL)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPGL17053 - 1UPCAA - DD
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1.Imagem marcado/desmarcadoSILVA, M. V. G. B.; VANRADEN, P. M.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MATUKUMALLI, L. K.; KIM, E.; WIGGANS, G. R. Análise de associação por todo o genoma para identificar locos relacionados ao lucro líquido, à vida produtiva e ao escore de células somáticas na raça Jersey. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA, 46., 2009, Maringá. Anais... Maringá: SBZ, 2009.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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2.Imagem marcado/desmarcadoO'BRIEN, A. M. P.; HÖLLER, D.; BOISON, S. A.; MILANESI, M.; BOMBA, L.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MÉSZÁROS, G.; AJMONE-MARSAN, P.; GARCIA, J. F.; SÖLKNER, J. Low levels of taurine introgression in the current Brazilian Nelore and Gir indicine cattle populations. Genetics Selection Evolution, v. 47, article 31, 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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3.Imagem marcado/desmarcadoSÖLKNER, J.; PEREZ O'BRIEN, A. M.; HÖLLER, D.; BOISON, S. A.; MILANESI, M.; BOMBA, L.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARVALHEIRO, R.; NEVES, H. H. R.; SILVA, M. V. G. B.; VAN TASSEL, C. P.; SOSTENGARD, T. S.; MÉSZÁROS, G.; AJMONE-MARSAN, P.; GARCIA, J. F. Zebuines kerngenom und taurine Mitochondrien: admixtur von Nelore, der größten brasilianischen rinderrasse. Nova Acta Leopoldina, NF 119, n. 404, p. 69-75, 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 5
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite.
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