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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Corte. |
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Data corrente: |
27/02/2019 |
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Data da última atualização: |
27/02/2019 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
FERREIRA, R. C. U.; LARA, L. A. de C.; CHIARI, L.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; GARCIA, A. A. F.; SOUZA, A. P. de. |
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Afiliação: |
Rebecca Caroline Ulbricht Ferreira, Universidade de Campinas - Unicamp/Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética; Letícia Aparecida de Castro Lara, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/Departameto de Genética; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; SANZIO CARVALHO LIMA BARRIOS, CNPGC; CACILDA BORGES DO VALLE, CNPGC; JOSE RAUL VALERIO, CNPGC; FABRICIA ZIMERMANN VILELA TORRES, CNPGC; Antonio Augusto Franco Garcia, Universidade de São Paulo - USP/Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz - ESALQ/Departameto de Genética; Anete Pereira de Souza, Universidade de Campinas - Unicamp/Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética. |
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Título: |
Genetic Mapping With Allele Dosage Information in Tetraploid Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster Reveals Insights Into Spittlebug (Notozulia entreriana Berg) Resistance. |
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Ano de publicação: |
2019 |
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Fonte/Imprenta: |
Frontiers in Plant Science, v. 10, February, 2019. |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Urochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster is one of the most important African forage grasses in Brazilian beef production. Currently available genetic-genomic resources for this species are restricted mainly due to polyploidy and apomixis. Therefore, crucial genomic-molecular studies such as the construction of genetic maps and the mapping of quantitative trait loci (QTLs) are very challenging and consequently affect the advancement of molecular breeding. The objectives of this work were to (i) construct an integrated U. decumbens genetic map for a full-sibling progeny using GBS-based markers with allele dosage information, (ii) detect QTLs for spittlebug (Notozulia entreriana) resistance, and (iii) seek putative candidate genes involved in defense against biotic stresses. We used the Setaria viridis genome a reference to align GBS reads and selected 4,240 high-quality SNP markers with allele dosage information. Of these markers, 1,000 were distributed throughout nine homologous groups with a cumulative map length of 1,335.09 cM and an average marker density of 1.33 cM. We detected QTLs for resistance to spittlebug, an important pasture insect pest, that explained between 4.66 and 6.24% of the phenotypic variation. These QTLs are in regions containing putative candidate genes related to defense against biotic stresses. Because this is the first genetic map with SNP autotetraploid dosage data and QTL detection in U. decumbens, it will be useful for future evolutionary studies, genome assembly, and other QTL analyses in Urochloa spp. Moreover, the results might facilitate the isolation of spittlebug-related candidate genes and help clarify the mechanism of spittlebug resistance. These approaches will improve selection efficiency and accuracy in U. decumbens molecular breeding and shorten the breeding cycle. MenosUrochloa decumbens (Stapf) R. D. Webster is one of the most important African forage grasses in Brazilian beef production. Currently available genetic-genomic resources for this species are restricted mainly due to polyploidy and apomixis. Therefore, crucial genomic-molecular studies such as the construction of genetic maps and the mapping of quantitative trait loci (QTLs) are very challenging and consequently affect the advancement of molecular breeding. The objectives of this work were to (i) construct an integrated U. decumbens genetic map for a full-sibling progeny using GBS-based markers with allele dosage information, (ii) detect QTLs for spittlebug (Notozulia entreriana) resistance, and (iii) seek putative candidate genes involved in defense against biotic stresses. We used the Setaria viridis genome a reference to align GBS reads and selected 4,240 high-quality SNP markers with allele dosage information. Of these markers, 1,000 were distributed throughout nine homologous groups with a cumulative map length of 1,335.09 cM and an average marker density of 1.33 cM. We detected QTLs for resistance to spittlebug, an important pasture insect pest, that explained between 4.66 and 6.24% of the phenotypic variation. These QTLs are in regions containing putative candidate genes related to defense against biotic stresses. Because this is the first genetic map with SNP autotetraploid dosage data and QTL detection in U. decumbens, it will be useful for future evolutionary studies... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Allele dosage; Linkage map; Signalgrass; SNP. |
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Thesagro: |
Brachiaria. |
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Thesaurus Nal: |
Polyploidy; Quantitative traits. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/193444/1/Genetic-mapping-with-alele-dosage-information.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Gado de Corte (CNPGC) |
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Biblioteca |
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| Registros recuperados : 617 | |
| 601. |  | VICENTINI, R. P.; VERZIGNASSI, J. R.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; COSTA, J. A. A. da; FERNANDES, C. D.; LIMA, N. D.; LIBÓRIO, C. B.; SILVA, F. A. S.; OLIVEIRA, M. A. S.; ARRUDA, C. O. C. B.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Produção de sementes por híbridos de Brachiaria spp. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. p. 76-77| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Caprinos e Ovinos. |
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| 602. | | VICENTINI, R. P.; VERZIGNASSI, J. R.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; COSTA, J. A. A. da; FERNANDES, C. D.; LIMA, N. D.; LIBÓRIO, C. B.; SILVA, F. A. S.; OLIVEIRA, M. A. S.; ARRUDA, C. O. C. B.; JESUS, L. de; CORADO, H. S. Produção de sementes por híbridos de Brachiaria spp. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 15., 2019, Campo Grande, MS. [Resumos dos trabalhos...]. Brasília, DF: Embrapa, 2019 80 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 264). Comitê Organizador: Marlene de Barros Coelho; Lenita Ramires dos Santos; Rodrigo Carvalho Alva; Lucimara Chiari; Thais Basso Amaral. p. 76-77| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 603. | | MACHADO, L. A. Z.; LEMPP, B.; VALLE, C. B. do; JANK, L.; BATISTA, L. A. R.; POSTIGLIONI, S. R.; RESENDE, R. M. S.; FERNANDES, C. D.; VERZIGNASSI, J. R.; VALENTIM, J. F.; ASSIS, G. M. L. de; ANDRADE, C. M. S. de. Principais espécies forrageiras utilizadas em pastagens para gado de corte. In: PIRES, A. V. (Ed.). Bovinocultura de corte. Piracicaba: FEALQ, 2010. v. 1 p. 375-417| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Agropecuária Oeste; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 604. | | MONTEIRO, L. C.; VERZIGNASSI, J. R.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; SILVA, J. I.; FERNANDES, C. D.; JESUS, L. de; CORADO, H. S.; AJALA, N.; GOMES, C. F.; SILVA, M. R.; LIBÓRIO, C. B.; BENTEO, G. L.; CALIXTO, S.; BRITES, E. L. R. Potencial de produção de sementes de híbridos intraespecíficos de Brachiaria decumbens. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 9., 2013, Campo Grande, MS. [Anais da..]. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2013. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 204). Comissão organizadora: Denise Baptaglin Montagner, Grácia Maria Soares Rosinha, Rodrigo Carvalho Alva| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 605. | | BEZERRA, F. C.; VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; SILVA, M. A. da; JESUS, L.; CORADO, H. S.; OLIVEIRA, M. A. S.; LIMA, N. D.; LIBÓRIO, C. B.; VICENTINI, R. P.; SILVA, F. A. S. Potencial de produção de sementes por híbridos de Brachiaria spp., em áreas de segundo ano, em Campo Grande, MS. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 46-47| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 606. | | OLIVEIRA, M. A. da S. de O.; VERZIGNASSI, J. R.; BARRIOS, S. C. L.; FERNANDES, C. D.; VALLE, C. B. do; LIBÓRIO, C. B.; LIMA, N. D.; CORADO, H. S.; JESUS, L. de; SILVA, M. A. da; ROCHA, F. R. M.; CASTRO, G. G.; MARTINS, W. L.; ANDRADE, D. F. M. Manejo para produção de sementes de Brachiaria spp. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 74. (Embrapa Gado de Corte, Documentos, 242)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 607. | | CARNEIRO, V. T. de C.; ARAUJO, A. C. G. de; CABRAL, G. B.; DUSI, D. M. de A.; RODRIGUES, J. C. M.; SILVA, F. R. da; ALVES-FERREIRA, M.; MARTINELLI, A. P.; VALLE, C. B. do; ALVES, E. R.; GUIMARÃES, L. A.; KOEHLER, A. D.; LACERDA, A. L. M.; SILVEIRA, E. D. Molecular analysis of Brachiaria reproductive systems. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [S.l.]: SBG, 2009. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 608. | | CARNEIRO, V. T. de C.; ARAUJO, A. C. G. de; CABRAL, G. B.; DUSI, D. M. de A.; RODRIGUES, J. C. M.; SILVA, F. R. da; ALVES-FERREIRA, M.; MARTINELLI, A. P.; VALLE, C. B. do; ALVES, E. R.; GUIMARÃES, L. A.; KOEHLER, A. D.; LACERDA, A. L. M.; SILVEIRA, E. D. Molecular analysis of Brachiaria reproductive systems. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE GENÉTICA MOLECULAR DE PLANTAS, 2., 2009, Búzios. Programa e resumos. [s.l.]: Sociedade Brasileira de Genética, 2009.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 609. | | ROCHA, F. R. M.; VERZIGNASSI, J. R.; BARRIOS, S. C. L.; FERNANDES, C. D.; VALLE, C. B. do; LIBÓRIO, C. B.; LIMA, N. D.; CORADO, H. S.; JESUS, L. de; SILVA, M. A. da; OLIVEIRA, M. A. S.; CASTRO, G. G.; MARTINS, W. L.; ANDRADE, D. F. M. Multiplicação e avaliação do potencial de produção de sementes por híbridos de Brachiaria spp. em Campo Grande, MS. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 13., 2017, Campo Grande, MS. [Anais...] Brasília, DF: Embrapa, 2017. p. 36. (Embrapa Gado de Corte, Documentos, 242)| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 610. | | VICENTINI, R. P.; VERZIGNASSI, J. R.; FERNANDES, C. D.; BARRIOS, S. C. L.; VALLE, C. B. do; SILVA, M. A. da; JESUS, L.; CORADO, H. S.; OLIVEIRA, M. A. S.; LIMA, N. D.; LIBÓRIO, C. B.; BEZERRA, F. C.; SILVA, F. A. S. Multiplicação e avaliação do potencial de produção de sementes por híbridos de Brachiaria spp. em Campo Grande, MS. In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA GADO DE CORTE, 14., 2018, Campo Grande - MS. [Resumos dos trabalhos]. Brasília, DF, Embrapa, 2018 115 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 258). p. 100-101| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 611. | | GARCIA, M.; VIGNA, B. B. Z.; SOUSA, A. C. B.; JUNGMANN, L.; CIDADE, F. W.; TOLEDO-SILVA, G.; FRANCISCO, P. M.; CHIARI, L.; CARVALHO, M. A.; KARIA, C. T.; FALEIRO, F. G.; GODOY, R.; DALL'AGNOL, M.; PAGLIARINI, S. S.; SOUZA, F. H. D. de; SOUZA-CHIES, T. T.; JANK, L.; RESENDE, R. M. S.; VALLE, C. B. do; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. Molecular genetic variability, population structure and mating system in tropical forages. Tropical Grasslands. v. 1, p. 25-30, 2013. 6p.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Pecuária Sudeste. |
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| 612. | | BARRIOS, S. C. L.; CARROMEU, C.; SILVA, M. A. I. da; MATSUBARA, E. T.; VALLE, C. B. do; JANK, L.; SANTOS, M. F.; ASSIS, G. M. L. de; CRIVELLARO, L. L.; GONÇALVES, T. D. T.; QUEIROZ JÚNIOR, J. M.; CANDIDO, A. R.; MACHADO, W. K. R.; GOUVEIA, B. T.; NOBRE, A. A. A.; ZANELLA, A. L. Pasto Certo® version 2.0 - An application about Brazilian tropical forage cultivars for mobile and desktop devices. Tropical Grasslands-Forrajes Tropicales, v. 8, n. 2, p. 162?166, 2020.| Tipo: Nota Técnica/Nota Científica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 613. | | RESENDE, R. M. S.; VALLE, C. B. do; ALVES, G. F.; MOREIRA, D. A. L.; SILVA, D. R. da; ARAÚJO, D. de F.; FERREIRA, R. C. U.; BARRIOS, S. C. L.; JANK, L.; CARAMALAC, G. R.; NAKA, I. M.; CALIXTO, S.; CARVALHO, J. de. Melhoramento de Brachiaria ruziziensis tetraploide sexual na Embrapa: métodos e avanços. Campo Grande, MS: Embrapa Gado de Corte, 2012. 28 p. (Embrapa Gado de Corte. Documentos, 194).| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 614. | | LIRA, M. T. R.; VIEIRA, R. R. T.; CARVALHO, A. A. A. A. de; FERREIRA, M. A.; DUSI, D. M. de A.; CARNEIRO, V. T. de C.; VALLE, C. B. do; CANÇADO, L. J.; MORETZSOHN, M. de C.; AMARAL, Z. P. de S.; BUSO, G. S. C. Otimização e utilização de marcadores EST-SSR em uma população de Brachiaria humidicola. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: SBMP: Incaper, 2009. 3 p.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 615. | | LIRA, M. T. R.; VIEIRA, R. R. T.; CARVALHO, A. A. A. A. de; FERREIRA, M. A.; DUSI, D. M. de A.; CARNEIRO, V. T. de C.; VALLE, C. B. do; CANÇADO, L. J.; MORETZSOHN, M. de C.; AMARAL, Z. P. de S.; BUSO, G. S. C. Otimização e utilização de marcadores EST-SSR em uma população de Brachiaria humidicola. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 5., 2009, Guarapari. O melhoramento e os novos cenários da agricultura: anais. Vitória: Incaper, 2009. 1 CD-ROM. (Incaper. Documentos, 11). CBMP 2009. Organizado por Romário Gava Ferrão, Frederico de Pina Matta, Maria Amélia Gava Ferrão, João Cândido de Souza, Adelaide de F. S. da Costa, Liliâm Maria Ventorim Ferrão. 3 p. 1 CD-ROM.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 616. | | MATIAS, F. I.; CANDIDO, A. R.; MACHADO, W. K. R.; AMARAL, P. N. C. do; DIAS, A. M.; VALLE, C. B. do; BARRIOS, S. C. L.; VALERIO, J. R.; TORRES, F. Z. V.; VERZIGNASSI, J. R.; ARRUDA, C. O. C. B. de; GOUVEIA, B. T.; NOBRE, A. A. A. Urochloa spp. multivariate performance: Similarities and divergences among intra- and interspecific populations. Crop Breeding e Genetics, p. 1-13, 2020.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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| 617. | | GARCIA, M.; VIGNA, B. B. Z.; SOUSA, A. C. B.; JUNGMANN, L.; CIDADE, F. W.; TOLEDO-SILVA, G.; FRANCISCO, P. M.; CHIARI, L.; CARVALHO, M. A.; KARIA, C. T.; FALEIRO, F. G.; GODOY, R.; AGNOLL, M. D.; PAGLIARINI, S. S.; SOUZA, F. H. D. de; SOUZA-CHIES, T. T.; JANK, L.; RESENDE, R. M. S.; VALLE, C. B. do; ZUCCHI, M. I.; SOUZA, A. P. Molecular genetic variability, population structure and mating system in tropical forages. Tropical Grasslands - Forrajes Tropicales - . v. 1, p. 25-30, 2013.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
| Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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