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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão. |
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Data corrente: |
03/11/2022 |
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Data da última atualização: |
27/09/2023 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
MARINHO, J. de S. R.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; PAVANELLI, I.; VIANELLO, R. P. |
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Afiliação: |
JULIANA DE SOUZA RODRIGUES MARINHO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; ISABELA PAVANELLI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE GOIÁS; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF. |
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Título: |
Molecular markers for assessing the inter- and intra-racial genetic diversity and structure of common bean. |
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Ano de publicação: |
2023 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetic Resources and Crop Evolution, v. 70, n. 1, p. 263-279, Jan. 2023. |
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ISSN: |
0925-9864 |
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DOI: |
https://doi.org/10.1007/s10722-022-01432-4 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Early access July 2022. |
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Conteúdo: |
The Mesoamerican and Andean gene pools of the common bean are distinguished into specific races. Knowledge of their structure and genetic diversity is an important prerequisite for plant conservation and breeding. The aim of this study was to estimate the inter- and intra-racial genetic diversity of genotypes representative of the six common bean races using simple sequence repeats (SSRs) and single nucleotide polymorphism (SNPs). Ninety-four accessions were genetically analyzed, using 24 SSR and 4.820 SNPs markers with minor allele frequencies (MAF)>- 5%. Based on SSR, 163 alleles were identified (13.8 alleles/marker). For the whole samples, the average values for expected (He) and observed heterozygosity (Ho) were 0.780 and 0.045, respectively, and 5.5 × 10-31 for probability of identity (PI). While for the gene pools analyzed separately, similar He estimates were obtained for the Andean (He = 0.731) and Mesoamerican gene pools (He = 0.733). Population structure and clustering analyses revealed subdivision predominantly by gene pool (K = 2). The overall linkage disequilibrium extension (r2sv) was 58 kb. Estimated He was 0.327 and Ho 0.025, with slightly higher values for the Mesoamerican (He= 0.303) when compared to its Andean counterpart (He = 0.269). Population structure was observed in the Andean (K = 2 and K = 3) and Mesoamerican (K = 2) gene pools. The molecular analyses did not reveal clear differentiation between the bean races. Although sampling may be having an effect on the analysis, our results reinforce that distinction among races appeared to have resulted from selection caused by domestication. MenosThe Mesoamerican and Andean gene pools of the common bean are distinguished into specific races. Knowledge of their structure and genetic diversity is an important prerequisite for plant conservation and breeding. The aim of this study was to estimate the inter- and intra-racial genetic diversity of genotypes representative of the six common bean races using simple sequence repeats (SSRs) and single nucleotide polymorphism (SNPs). Ninety-four accessions were genetically analyzed, using 24 SSR and 4.820 SNPs markers with minor allele frequencies (MAF)>- 5%. Based on SSR, 163 alleles were identified (13.8 alleles/marker). For the whole samples, the average values for expected (He) and observed heterozygosity (Ho) were 0.780 and 0.045, respectively, and 5.5 × 10-31 for probability of identity (PI). While for the gene pools analyzed separately, similar He estimates were obtained for the Andean (He = 0.731) and Mesoamerican gene pools (He = 0.733). Population structure and clustering analyses revealed subdivision predominantly by gene pool (K = 2). The overall linkage disequilibrium extension (r2sv) was 58 kb. Estimated He was 0.327 and Ho 0.025, with slightly higher values for the Mesoamerican (He= 0.303) when compared to its Andean counterpart (He = 0.269). Population structure was observed in the Andean (K = 2 and K = 3) and Mesoamerican (K = 2) gene pools. The molecular analyses did not reveal clear differentiation between the bean races. Although sampling may be having an ef... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Genetic diversity; SNP genotyping; SSR genotyping. |
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Thesagro: |
Feijão; Genética Molecular; Marcador Molecular; Raça. |
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Thesaurus Nal: |
Beans; Molecular genetics; Races; Single nucleotide polymorphism. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
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| Registros recuperados : 327 | |
| 321. |  | NASCIMENTO JUNIOR, C. R. do; SILVA, J. F. da; ANDRADE, D. H. de H.; SILVA, J. de F. X. da; SOUZA, K. S. de; MELO, F. P. de; CORREIA, E. de S.; CASTRO, P. F. de; RIBEIRO, K.; BEZERRA, R. de S. Efeitos de probióticos sobre as atividades das enzimas digestórias do hepatopâncreas do camarão marinho Litopenaeus vannamei. In: AQUACIÊNCIA, 2010, Recife. [Anais...]. Recife: Aquabio: UFRPE, 2010. Ref. R0414-1. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 322. | | SOUZA, K. C. L. DE; BATISTA, A. M. DE L.; DUARTE, E. B.; MARTINS, J. E. R.; MODESTO FILHO, A. N.; DIAS, J. W. G.; DIAS, D. F.; ROSA, M. de F.; FREITAS, R. M. DE; FELIPE, S. M. DA S.; SANTOS JÚNIOR, F. F. U.; CECCATTO, V. M. Physical Characterization of Material for the Development of Orthopedic Orthosis for Diabetic Foot. Processes, 10, 884, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroindústria Tropical. |
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| 323. | | SCHAEFER, C. E. G. R.; LIMA, H. N. de; TEIXEIRA, W. G.; VALE JUNIOR, J. F. do; SOUZA, K. W. de; CORRÊIA, G. R.; MENDONÇA, B. A. F. de; AMARAL, E. F. do; CAMPOS, M. C. C.; RUIVO, M. de L. P. Solos da região amazônica. In: CURI, N.; KER, J. C.; NOVAIS, R. F.; VIDAL-TORRADO, P.; SCHAEFER, C. E. G. R. (Ed.). Pedologia: solos dos biomas brasileiros. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2017. cap. 3, p. 111-175.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
| Biblioteca(s): Embrapa Acre; Embrapa Solos. |
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| 324. | | NESHICH, G.; MAZONI, I.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; BORRO, L. C.; MORITA, D. U.; SOUZA, K. R. R.; ALMEIDA, G. V.; RODRIGUES, D. N.; JARDINE, J. G.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H.; MELO, R. C.; SANTORO, M. M. The Star STING server: a multiplatform environment for protein structure analysis. Genetics and Molecular Research, v. 5, n. 4, p. 717-722, 2006.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Milho e Sorgo; Embrapa Pantanal; Embrapa Territorial. |
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| 326. | | TERNES, S.; MOURA, M. F.; SOUZA, K. X. S. de; VAZ, G. J.; OLIVEIRA, S. R. de M.; HIGA, R. H.; LIMA, H. P. de; TAKEMURA, C. M.; COELHO, E. A.; BARBOSA, F. F. L.; VISOLI, M. C.; MENEZES, G. R. de O.; SILVA, L. O. C. da; SANTOS, S. A.; MASSRUHÁ, S. M. F. S.; ABREU, U. G. P. de; SORIANO, B. M. A.; SALIS, S. M.; OLIVEIRA, M. D. de; TOMAS, W. M. Scientific computing in agriculture. In: MASSRUHÁ, S. M. F. S.; LEITE, M. A. de A.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MEIRA, C. A. A.; LUCHIARI JUNIOR, A.; BOLFE, E. L. (ed.). Digital agriculture: research, development and innovation in production chains. Brasília, DF: Embrapa, 2023. cap. 5, p. 92-108. Na publicação: Enilda Coelho, Suzana Maria Salis.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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