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Biblioteca(s):  Embrapa Arroz e Feijão.
Data corrente:  24/04/2020
Data da última atualização:  24/04/2020
Tipo da produção científica:  Artigo em Periódico Indexado
Autoria:  PEREIRA, W. J.; MELO, A. T. de O.; COELHO, A. S. G.; RODRIGUES, F. A.; MAMIDI, S.; ALENCAR, S. A. de; LANNA, A. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; NASCIMENTO JUNIOR, I. R. do; BORBA, T. C. de O.; VIANELLO, R. P.
Afiliação:  WENDELL JACINTO PEREIRA, UFG; ARTHUR TAVARES DE OLIVEIRA MELO, UFG; ALEXANDRE SIQUEIRA GUEDES COELHO, UFG; FABIANA APARECIDA RODRIGUES; SUJAN MAMIDI, HUDSON ALPHA INSTITUTE FOR BIOTECHNOLOGY, Huntsville-AL; SERGIO AMORIM DE ALENCAR, UNIVERSIDADE CATÓLICA DE BRASÍLIA; ANNA CRISTINA LANNA, CNPAF; PAULA ARIELLE M RIBEIRO VALDISSER, CNPAF; CLAUDIO BRONDANI, CNPAF; IVANILDO RAMALHO DO NASCIMENTO JUNIOR, UNESP, Jaboticabal-SP; TEREZA CRISTINA DE OLIVEIRA BORBA, CNPAF; ROSANA PEREIRA VIANELLO, CNPAF.
Título:  Genome-wide analysis of the transcriptional response to drought stress in root and leaf of common bean.
Ano de publicação:  2020
Fonte/Imprenta:  Genetics and Molecular Biology, v. 43, n. 1, e20180259, 2020.
ISSN:  1678-4685
DOI:  https://doi.org/10.1590/1678-4685-gmb-2018-0259
Idioma:  Inglês
Conteúdo:  Genes related to the response to drought stress in leaf and root tissue of drought-susceptible (DS) and tolerant (DT) genotypes were characterized by RNA-Seq. In total, 54,750 transcripts, representative of 28,590 genes, were identified; of these, 1,648 were of high-fidelity (merge of 12 libraries) and described for the first time in the Andean germplasm. From the 1,239 differentially expressed genes (DEGs), 458 were identified in DT, with a predominance of genes in categories of oxidative stress, response to stimulus and kinase activity. Most genes related to oxidation-reduction terms in roots were early triggered in DT (T75) compared to DS (T150) suggestive of a mechanism of tolerance by reducing the damage from ROS. Among the KEGG enriched by DEGs up-regulated in DT leaves, two related to the formation of Sulfur-containing compounds, which are known for their involvement in tolerance to abiotic stresses, were common to all treatments. Through qPCR, 88.64% of the DEGs were validated. A total of 151,283 variants were identified and functional effects estimated for 85,780. The raw data files were submitted to the NCBI database. A transcriptome map revealed new genes and isoforms under drought. These results supports a better understanding of the drought tolerance mechanisms in beans.
Palavras-Chave:  Functional genomics.
Thesagro:  Deficiência Hídrica; Feijão; Folha; Phaseolus Vulgaris; Raiz.
Thesaurus Nal:  Beans; Genomics; Single nucleotide polymorphism; Soil water deficit.
Categoria do assunto:  X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia
URL:  https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/212487/1/CNPAF-2020-GMB.pdf
Marc:  Mostrar Marc Completo
Registro original:  Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF)
Biblioteca ID Origem Tipo/Formato Classificação Cutter Registro Volume Status URL
CNPAF35776 - 1UPCAP - DD20202020
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1.Imagem marcado/desmarcadoVALDISSER, P. A. M. R. Genômica populacional e análise de associação genômica ampla (GWAS) para tolerância à seca e produtividade em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). 2017. 149 f. Dissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Campinas, Campinas. Orientadora: Maria Imaculada Zucchi; Coorientadora: Rosa Pereira Vianello, CNPAF.
Tipo: Orientação de Tese de Pós-Graduação
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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2.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C.; VALDISSER, P. A. M. R. The epidemiology of Bean golden mosaic virus in two transgenic bean lines. In: INTERNATIONAL GEMINIVIRUS SYMPOSIUM, 6.; INTERNATIONAL ssDNA COMPARATIVE VIROLOGY WORKSHOP, 4., 2010, Guanajuato, Mexico. [Programme & abstracts]. Guanajuato: Cinvestav: Conacyt, 2010. 1 CD-ROM.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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3.Imagem marcado/desmarcadoPEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P. Análise em feijoeiro comum da expressão diferencial de genes relacionados à tolerância à seca. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 8., 2014, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2014. p. 30. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 306).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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4.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C. de; VALDISSER, P. A. M. R.; ARAGAO, F. J. L. Epidemiologia de mosaico dourado em feijoeiro transgênico com resistência derivada do patógeno. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S124, 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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5.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; ARAGÃO, F. J. L. Epidemiologia de mosaico dourado em feijoeiro transgênico com resistência derivada do patógeno. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S124, ago. 2009. Suplemento, ref. 449. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, ago. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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6.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; DEL PELOSO, M. J.; ARAGÃO, F. J. L. Linhagem de feijoeiro expressando RNA interferente é resistente ao mosaico dourado e transmite o transgene às progênies derivadas por retrocruzamento. Tropical Plant Pathology, v. 34, p. S268, ago. 2009. Suplemento. Ref. 904. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, ago. 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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7.Imagem marcado/desmarcadoMOTA, H. B. da S.; VIANELLO, R. P.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C. Desenvolvimento de marcadores para sete genes superexpressos em arroz geneticamente modificado. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 15., 2021, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 32. Evento online.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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8.Imagem marcado/desmarcadoVALDISSER, P. A. M. R.; ZUCCHI, M. I.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Caracterização do germoplasma de feijoeiro comum com base em marcadores DArt-Seq. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 8., 2015, Goiânia. O melhoramento de plantas, o futuro da agricultura e a soberania nacional: anais. Goiânia: UFG: SBMP, 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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9.Imagem marcado/desmarcadoSANTOS, F. F. dos; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; MENDONÇA, J. A.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P. Avaliação da expressão de genes candidatos para tolerância à deficiência hídrica em arroz de terras altas na plataforma de fenotipagem SITIS. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 11., 2017, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2017. p. 83. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 316).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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10.Imagem marcado/desmarcadoVIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C. Análise preliminar de dados de sequenciamento por captura (Capture-seq na identificação de marcadores SNPs associados a tolerância à seca em arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 10., 2016, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2016. p. 80. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 311).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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11.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C. de; VALDISSER, P. A. M. R.; DEL PELOSO, M. J.; ARAGAO, F. J. L. Linhagem de feijoeiro expressando RNA interferente é resistente ao mosaico dourado e transmite o transgene às progênies derivadas por retrocruzamento. Tropical Plant Pathology, Brasília, DF, v. 34, p. S268, 2009. Suplemento. Edição dos Resumos do XLII do Congresso Brasileiro de Fitopatologia, Rio de Janeiro, RJ, 2009.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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12.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C. de; VALDISSER, P. A. M. R.; ARAGÃO, F. J. L.; DEL PELOSO, M. J. Herança dos transgenes e associação com a resistência ao Bean golden mosaic virus em populações de feijoeiro comum derivadas da linhagem Olathe 5.1. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. p. 368-371. (IAC. Documentos, 85).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia.
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13.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C. de; VALDISSER, P. A. M. R.; ARAGÃO, F. J. L.; DEL PELOSO, M. J. Herança dos transgenes e associação com a resistência ao Bean golden mosaic virus em populações de feijoeiro comum derivadas da linhagem Olathe 5.1. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 9., 2008, Campinas. Ciência e tecnologia na cadeia produtiva do feijão. Campinas: Instituto Agronômico, 2008. 1 CD-ROM. (IAC. Documentos, 85).
Tipo: Artigo em Anais de Congresso / Nota Técnica
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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14.Imagem marcado/desmarcadoCRUZ, A. C. da; CERRI, R.; NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C. Identificação e Validação de SNPs por Machine Learning relacionados a caracteres de interesse em arroz. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 16., 2022, Santo Antônio de Goiás. Resumos... Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2022. p. 28.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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15.Imagem marcado/desmarcadoMORAIS JUNIOR, O. P.; MÜLLER, B. S. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Genomic prediction for drought tolerance using multienvironment data in a common bean (Phaseolus vulgaris) breeding program. Crop Science, v. 63, n. 4, p. 2145-2161, July/Aug. 2023.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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16.Imagem marcado/desmarcadoMARINHO, J. de S. R.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, C.; PAVANELLI, I.; VIANELLO, R. P. Molecular markers for assessing the inter- and intra-racial genetic diversity and structure of common bean. Genetic Resources and Crop Evolution, v. 70, n. 1, p. 263-279, Jan. 2023. Early access July 2022.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 3
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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17.Imagem marcado/desmarcadoRODRIGUES, L. A.; COELHO, G. R. C.; VALDISSER, P. A. M. R.; VIANELLO, R. P.; SOUZA, T. L. P. O. Marker-assisted selection integrated to the embrapa common bean breeding program. Annual Report of the Bean Improvement Cooperative, Prosser, v. 59, p. 199-200, Apr. 2016.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: B - 3
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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18.Imagem marcado/desmarcadoARAÚJO, R. B. de; PEREIRA, W. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P. Validação de genes candidatos para tolerância à seca via qPCR em um amplo grupo de genótipos de feijão submetidos à deficiência hídrica. In: SEMINÁRIO JOVENS TALENTOS, 9., 2015, Santo Antônio de Goiás. Coletânea dos resumos apresentados. Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2015. p. 111. (Embrapa Arroz e Feijão. Documentos, 309).
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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19.Imagem marcado/desmarcadoPINHEIRO, T. T.; PRADO, G. S.; VALDISSER, P. A. M. R.; FARIA, J. C. de; VIANELLO, R. P. Validação de genes codificadores dos precursores de proantocianidina envolvidos no escurecimento pós-colheita em feijão carioca, visando à engenharia de genoma. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 13., 2021, Goiânia. Conectividade tecnológica, intensificação sustentável: resumos. Brasília, DF: Embrapa; Santo Antônio de Goiás: Embrapa Arroz e Feijão, 2021. p. 16. Evento online.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão.
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20.Imagem marcado/desmarcadoFARIA, J. C. de; VALDISSER, P. A. M. R.; NOGUEIRA, E. O. P. e L.; ARAGÃO, F. J. L. RNAi-based Bean golden mosaic virus-resistant common bean (Embrapa 5.1) shows simple inheritance for both transgene and disease resistance. Plant Breeding, v. 133, n. 5, p. 649-653, Oct. 2014.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 2
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