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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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Data corrente: |
06/01/2016 |
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Data da última atualização: |
26/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Autoria: |
BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ARAUJO, A. C. G.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; SILVA, A. K.; MARTINS, A. C. Q.; VINSON, C. C.; SANTOS, C. M. R.; BONFIM, O.; TOGAWA, R. C.; SARAIVA, M. A. P.; BERTIOLI, D. J.; GUIMARAES, P. M. |
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Afiliação: |
ANA CRISTINA MIRANDA BRASILEIRO, CENARGEN; CAROLINA VIANNA MORGANTE, CPATSA; ANA CLAUDIA GUERRA DE ARAUJO, CENARGEN; SORAYA CRISTINA DE M LEAL BERTIOLI, CENARGEN; AMANDA K. SILVA; ANDRESSA C. Q. MARTINS; CHRISTINA C. VINSON; CANDICE M. R. SANTOS, CONAB; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, CENARGEN; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; MARIO ALFREDO DE PASSOS SARAIVA, CENARGEN; DAVID J. BERTIOLI, UNB; PATRICIA MESSEMBERG GUIMARAES, CENARGEN. |
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Título: |
Transcriptome profiling of wild Arachis from water-limited environments uncovers drought tolerance candidate genes. |
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Ano de publicação: |
2015 |
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Fonte/Imprenta: |
Plant Molecular Biology Reporter, v. 33, p. 1876-1892, 2015. |
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DOI: |
10.1007/s11105-015-0882-x |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
Peanut (Arachis hypogaeaL.) is an important le-gume cultivated mostly in drought-prone areas where its pro-ductivity can be limited by water scarcity. The development of more drought-tolerant varieties is, therefore, a priority for pea-nut breeding programs worldwide. In contrast to cultivated peanut, wild relatives have a broader genetic diversity and constitute a rich source of resistance/tolerance alleles to biotic and abiotic stresses. The present study takes advantage of this diversity to identify drought-responsive genes by analyzing the expression profile of two wild species, Arachis duranensis and Arachis magna (AA and BB genomes, respectively), in response to progressive water deficit in soil. Data analysi from leaves and roots of A. duranensis (454 sequencing) and A. magna (suppression subtractive hybridization (SSH)) stressed and control complementary DNA (cDNA) libraries revealed several differentially expressed genes in silico, and 44 of them were selected for further validation by quantitative RT-PCR (qRT-PCR). This allowed the identification of drought-responsive candidate genes, such as Expansin, Nitrilase, NAC ,and bZIP transcription factors, displaying sig-nificant levels of differential expression during stress imposition in both species. This is the first report on identification of differentially expressed genes under drought stress and recov-ery in wild Arachis species. The generated transcriptome data.besides being a valuable resource for gene discovery, will allow the characterization of new alleles and development of molecular markers associated with drought responses in pea-nut. These together constitute important tools for the peanut breeding program and also contribute to a better comprehen-sion of gene modulation in response to water deficit and rehydration. MenosPeanut (Arachis hypogaeaL.) is an important le-gume cultivated mostly in drought-prone areas where its pro-ductivity can be limited by water scarcity. The development of more drought-tolerant varieties is, therefore, a priority for pea-nut breeding programs worldwide. In contrast to cultivated peanut, wild relatives have a broader genetic diversity and constitute a rich source of resistance/tolerance alleles to biotic and abiotic stresses. The present study takes advantage of this diversity to identify drought-responsive genes by analyzing the expression profile of two wild species, Arachis duranensis and Arachis magna (AA and BB genomes, respectively), in response to progressive water deficit in soil. Data analysi from leaves and roots of A. duranensis (454 sequencing) and A. magna (suppression subtractive hybridization (SSH)) stressed and control complementary DNA (cDNA) libraries revealed several differentially expressed genes in silico, and 44 of them were selected for further validation by quantitative RT-PCR (qRT-PCR). This allowed the identification of drought-responsive candidate genes, such as Expansin, Nitrilase, NAC ,and bZIP transcription factors, displaying sig-nificant levels of differential expression during stress imposition in both species. This is the first report on identification of differentially expressed genes under drought stress and recov-ery in wild Arachis species. The generated transcriptome data.besides being a valuable resource for gene discover... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
4 Sequencing; 454 Sequencing; Cultura resistente a seca; Differential gene expression; Dry-down; Gene tolerante; Peanut wild relatives; QRT-PCR; SSHlibraries. |
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Thesagro: |
Amendoim; Biologia molecular; Resistência a Seca. |
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Categoria do assunto: |
--
G Melhoramento Genético |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/137981/1/Brasileiro-et-al-2015.pdf
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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| Registros recuperados : 178 | |
| 161. |  | KING, R.; URBAN, M.; BROWN, N.; MACHADO, A. K. F. M.; LEE, W. S.; KANYUKA, K.; SPARKS, C.; WEST, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; TIBOLA, C. S.; LIMA, M. I. P. M.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N. F.; ARAGAO, F. J. L.; NICOLLI, C. P.; DEL PONTE, E. M.; TESSMANN, D. J.; FERNANDES, J. M. C.; HAMMOND-KOSACK, K. Using a bespoke 'Omics' approach to devise a flexible new way to control Fusarium in wheat. In: INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON FUSARIUM HEAD BLIGHT, 5.; INTERNATIONAL WORKSHOP ON WHEAT BLAST, 2., 2016, Florianópolis. Book of abstracts... Passo Fundo: Ed. Universidade de Passo Fundo: Embrapa Trigo; Viçosa, MG: Universidade Federal de Viçosa, 2016. p. 66, sess. 3, abst. K7. 5th International Symposium on Fusarium Head Blight.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 162. | | GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; MARTINS, A. C. Q.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; TOGAWA, R. C.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; ARAUJO, A. C. G. de; MORETZSOHN, M. de C.; BERTIOLI, D. J. Global transcriptome analysis of two wild relatives of peanut under drought and fungi infection. BMC Genomics, v. 13, n. 387, 2012.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 163. | | MACHADO, A. K.; KING, R.; LEE, W. S.; SPARKS, C.; BROWN, N.; KANYUKA, K.; URBAN, M.; WEST, J.; YAMAZAKI-LAU, E.; TIBOLA, C. S.; LIMA, M. I. P. M.; TOGAWA, R. C.; MARTINS, N.; ARAGÃO, F.; NICOLLI, C. P.; DEL PONTE, E. M.; TESSMANN, D. J.; FERNANDES, J. M. C.; HAMMOND-KOSACK, K. E. Exploring NGS, HIGS and si-RNA technologies for the control of Fusarium ear blight in wheat. In: BRITISH MYCOLOGICAL SOCIETY AND BRITISH SOCIETY FOR PLANT PATHOLOGY JOINT PRESIDENTIAL MEETING, 2017, Nottingham. Fungal exploitation and fungal control. Nottingham: University of Nottingham: British Society for Plant Pathology: British Mycological Society, 2017. p. 67-68.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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| 164. | | NESHICH, G.; YAMAGISHI, M. E. B.; ROCCHIA, W.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; FILETO, R.; BAUDET, C.; PINTO, I. P.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. F.; KRAUCHENCO, J. N.; TORRES, R. C.; BEZERRA, G. B. P.; SOUZA, S.; TOGAWA, R. C.; HIGA, R. H. Protein structure analysis and visualization using Java Protein Dossier. In: INTERNATIONAL CONFERENCE ON CHEMOMETRICS AND BIOINFORMATICS IN ASIA, 2004, Shanghai. Proceedings... Shanghai: [s.n.], 2004. 1 p. CCBA 2004. Na publicação: Paula R. Kuser.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 165. | | GUIMARAES, P. M.; GUIMARAES, L. A.; MORGANTE, C. V.; SILVA JUNIOR, O. B.; ARAUJO, A. C. G.; MARTINS, A. C. Q.; SARAIVA, M. A. P.; OLIVEIRA, T. N.; TOGAWA, R. C.; LEAL-BERTIOLI, S. C. M.; BERTIOLI, D. J.; BRASILEIRO, A. C. M. Root transcriptome analysis of wild peanut reveals candidate genes for nematode resistance. Plos One, October 21, p. 1-22, 2015. (Open Access).| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 166. | | SOUZA JÚNIOR, M. T.; SANTOS, C. M. R.; MARTINS, N. F.; SILVA, F. R. da; TOGAWA, R. C.; CASSIANO, L. P.; ALMEIDA, E. R. P. de; COELHO, M. C. F.; CAETANO, A. R.; CIAMPI, A. Y.; MOTA, M.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. DataMusa: banco de dados de genômica de Musa spp. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2005. 24 p. (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletim de pesquisa e desenvolvimento, 107).| Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 167. | | NESHIC, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A. TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. The Diamond STING Server. Nucleic Acids Research, v. 33, n. 2, p. W29-W35, July 2005. Supplement.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 168. | | NESHICH, G.; BORRO, L. C.; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCO, E. H.; KRAUCHENCO, J. N.; FILETO, R.; RIBEIRO, A. A.; BEZERRA, G. B. P.; VELLUDO, T. M.; JIMENEZ, T. S.; FURUKAWA, N.; TESHIMA, H.; KITAJIMA, K.; BAVA, A.; SARAI, A.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L. The Diamond Sting server. Nucleic Acids Research, v. 33, W29-W35, 2005.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 169. | | BARBOSA, A. E. A. de D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. dos S. de L.; FREIRE, E.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; VIANA, A. A. B.; TOGAWA, R. C.; GUIMARÃES, L. M.; MARTINS, N. F.; CIA, E.; FERNANDEZ, D.; LIMA, L. M. de; SILVA, M. C. M. da; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de. Differentially expressed genes in cotton plant genotypes infected with Meloidogyne incognita. Plant Science, v. 177, p. 492-497, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 170. | | BARBOSA, A. E. A. de D.; FRAGOSO, R. da R.; SOUZA, D. dos S. de L.; FREIRE, E.; OLIVEIRA NETO, O. B. de; VIANA, A. A. B.; TOGAWA, R. C.; GUIMARÃES, L. M.; MARTINS, N. F.; CIA, E.; FERNANDEZ, D.; LIMA, L. M. de; SILVA, M. C. M. da; ROCHA, T. L.; SA, M. F. G. de. Differentially expressed genes in cotton plant genotypes infected with Meloidogyne incognita. Plant Science, v. 177, p. 492-497, 2009.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
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| 171. | | ARRAES, F. B. M.; MARTINS-DE-SA, D; VASQUEZ, D. D. N.; MELO, B. P.; FAHEEM, M.; MACEDO, L. L. P. de; MORGANTE, C. V.; BARBOSA, J. A. R. G.; TOGAWA, R. C.; MOREIRA, V. J. V.; DANCHIN, E. G. J.; SA, M. F. G. de. Dissecting protein domain variability in the core rna interference machinery of five insect orders. RNA Biology, v. 18, n. 11, p. 1653-1681, 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 172. | | MENDES, R. A. G.; BASSO, M. F.; AMORA, D. X.; SILVA, A. P.; PAES-DE-MELO, B.; TOGAWA, R. C.; FREIRE, E. V. S. A.; LISEI-DE-SA, M. E.; MACEDO, L. L. P. de; LOURENCO, I. T.; SA, M. F. G. de. In planta RNAi approach targeting three M. incognita effector genes disturbed the process of infection and reduced plant susceptibility. Experimental Parasitology, v. 238, 2022, 108246. Na publicação: Erika Valéria Saliba Albuquerque; Leonardo Lima Pepino Macedo; Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 173. | | MENDES, R. A. G.; BASSO, M. F.; MELO, B. P. de; RIBEIRO, T. P.; LIMA, R. N.; ARAÚJO, J. F. de; GROSSI-DE-SA, M.; MATTOS, V. da S.; TOGAWA, R. C.; ALBUQUERQUE, E. V. S. A.; LISEI-DE-SA, M. E.; SILVA, M. C. M. da; MACEDO, L. L. P. de; FRAGOSO, R. da R.; FERNANDEZ, D.; VIGNOLS, F.; SA, M. F. G. de. The Mi-EFF1/Minc17998 effector interacts with the soybean GmHub6 protein to promote host plant parasitism by Meloidogyne incognita. Physiological and Molecular Plant Pathology, v. 114, 101630, 2021. Na publicação: Leonardo Lima Pepino Macedo; Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Cerrados; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 174. | | ARRAES, F. B. M.; VASQUEZ, D. D. N.; TAHIR, M.; PINHEIRO, D. H.; FAHEEM, M.; FREITAS-ALVES, N. S.; MOREIRA-PINTO, C. E.; MOREIRA, V. J. V.; PAES-DE-MELO, B.; LISEI-DE-SA, M. E.; MORGANTE, C. V.; MOTA, A. P. Z.; LOURENCO, I. T.; TOGAWA, R. C.; GRYNBERG, P.; FRAGOSO, R. da R.; ALMEIDA-ENGLER, J. de; LARSEN, M. R.; GROSSI-DE-SA, M. F. Integrated omic approaches reveal molecular mechanisms of tolerance during soybean and meloidogyne incognita interactions. Plants, v. 11, 2744, 2022.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 4 |
| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Semiárido. |
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| 175. | | BASSO, M. F.; LOURENCO, I. T.; MOREIRA‐PINTO, C. E.; MENDES, R. A. G.; PEREIRA, D. G.; GRANDIS, A.; MACEDO, L. L. P. de; MACEDO, A. F.; GOMES, A. C. M. M.; ARRAES, F. B. M.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; SILVA, M. C. M. da; FLOH, E. I. S.; BUCKERIDGE, M. S.; ENGLER, J. de A.; SA, M. F. G. de. Overexpression of the GmEXPA1 gene reduces plant susceptibility to Meloidogyne incognita. Plant Cell Reports, v. 42, p. 137-152, 2023.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
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| 176. | | BASSO, M. F.; LOURENCO, I. T.; MOREIRA-PINTO, C. E.; MENDES, R. A. G.; PAES-DE-MELO, B.; NEVES, M. R. das; MACEDO, A. F.; FIGUEIREDO, V.; GRANDIS, A.; MACEDO, L. L. P. de; ARRAES, F. B. M.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; ENRICH-PRAST, A.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; GOMES, A. C. M. M.; SILVA, M. C. M. da; FLOH, E. I. S.; BUCKERIDGE, M. S.; ENGLER, J. de A.; SA, M. F. G. de. Overexpression of a soybean Globin (GmGlb1-1) gene reduces plant susceptibility to Meloidogyne incognita. Planta, v. 256, 83, 2022. 16 p. Na publicação: Isabela Tristan Lourenço-Tessutti; Leonardo Lima Pepino Macedo; Francismar Corrêa Marcelino-Guimaraes; Maria Cristina Mattar Silva; Maria Fatima Grossi-de-Sa.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia; Embrapa Soja. |
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| 177. | | NESHICH, G.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; PAPPAS JUNIOR, G.; TORRES, W. V.; CAMPOS, T. F. e; FERREIRA, L. L.; LUNA, F. M.; OLIVEIRA, A. G.; MIURA, R. T.; INOUE, M. K.; HORITA, L. G.; SOUZA, D. F. de; DOMINIQUINI, F.; ÁLVARO, A.; LIMA, C. S.; OGAWA, F. O.; GOMES, G. B.; PALANDRANI, J. F.; SANTOS, G. F. dos; FREITAS, E. M. de; MATTIUZ, A. R.; COSTA, I. C.; ALMEIDA, C. L. de; SOUZA, S.; BAUDET, C.; HIGA, R. H. STING Millennium: a web-based suite of programs for comprehensive and simultaneous analysis of protein structure and sequence. Nucleic Acids Research, London, v. 31, n. 13, p. 3386-3392, July 2003. Na publicação: Paula R. Kuser.| Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
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| 178. | | MYBURG, A. A.; GRATTAPAGLIA, D.; TUSKAN, G. A.; HELLSTEN, U.; HAYES, R. D.; GRIMWOOD, J.; JENKINS, J.; LINDQUIST, E.; BAUER, D.; GOODSTEIN, D. M.; DUBCHAK, I.; POLIAKOV, A.; MIZRACHI, E.; KULLAN, A. R. K.; HUSSEY, S. G.; PINARD, D.; MERWE, K. van der; SINGH, P.; JAARSVELD, I. van; SILVA JUNIOR, O. B.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS, M. R.; FARIA, D. A.; SANSALONI, C. P.; PETROLI, C. D.; YANG, X.; RANJAN, P.; TSCHAPLINSKI, T. J.; YE, C.-Y.; LI, T.; STERCK, L.; VANNESTE, K.; MURAT, F.; SOLER, M.; SAN CLEMENTE, H.; SAIDI, N.; CASSAN-WANG, H.; DUNAND, C.; HEFER, C. A.; BORNBERG-BAUER, E.; KERSTING, A. R.; VINING, K.; AMARASINGHE, V.; RANIK, M.; NAITHANI, S.; ELSER, J.; BOYD, A. E.; LISTON, A.; SPATAFORA, J. W.; DHARMWARDHANA, P.; RAJA, R.; SULLIVAN, C.; ROMANEL, E.; ALVES-FERREIRA, M.; KULHEIM, C.; FOLEY, W.; CAROCHA, V.; PAIVA, J.; KUDRNA, D.; BROMMONSCHENKEL, S. H.; PASQUALI, G.; BYRNE, M.; RIGAULT, P.; SPOKEVICIUS, A.; JONES, R. C.; STEANE, D. A.; VAILLANCOURT, R. E.; POTTS, B. M.; JOUBERT, F.; BARRY, K.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; STRAUSS, S. H.; JAISWAL, P.; GRIMA-PETTENATI, J.; SALSE, J.; PEER, Y. van de; ROKHSAR, D. S.; SCHMUTZ, J. The genome of Eucalyptus grandis. Nature (London), v. 510, p. 356-362, 2014.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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